Os04g0336942

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os04g0336942

Description

Peptidase A1, pepsin family protein

Version

NM_001186948.1 GI:297723026 GeneID:9270617

Length

5715 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os04g0336942, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:15831693..15837407

Sequence Coding Region

15831693..15831792,15832503..15832573,15832656..15832821,15833649..15833873,15836555..15836787
,15836944..15837073,15837166..15837407

Expression

GEO Profiles:Os04g0336942

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggcagctcctttgttgttatcaacaatcattttggctctagtggtggtagcatcctctactcatggtaccatggccaatggggtattccaggtgcgccgcaaattccatatcgtggacggtgtgtacaaggggagcgacataggtgcattacaaacccatgatgagaaccgccatcgtcgccgtaaccttatggctgcagagctcccacttggtggcttcaacatcccatacggcactgggctatactacacggatatagggatcgggacacccgccgtgaagtactatgtgcagttggacaccggtagtaaggcattttgggttaatggcatctcctgcaagcaatgccctcacgagagcgacatattgagaaagctgacattttatgaccctaggagctcagtaagttcaaaagaggtgaaatgtgacgatacaatatgcacttcgcgaccaccatgcaacatgaccttacgttgtccgtacatcacggggtacgctgatggtggcttaacaatgggcatccttttcactgatcttctgcactatcatcaactgtatgggaatgggcagactcagccaaccagcaccagtgtcacatttgggtgtggtttacaacaatctggaagtttaaacaattcagcagtagcgattgatggaattattggttttggcaattctaatcagactgcgctatcacaattggctgcagcagggaagacaaagaaaatattttctcattgccttgattccacaaatggaggtggaattttcgctataggagaagtggtggagccaaaagtaaaaacaacacctatagtaaagaataatgaggtatatcaccttgtgaacctcaagtcgatcaatgttgctggcacaacacttcagcttcctgccaatatttttggaacgaccaaaacaaagggtacattcattgatagcggttcaaccttggtgtaccttccagagattatatattcagaactaatacttgcggtatttgccaagcatccggatataaccatgggtgctatgtataattttcaatgttttcattttcttggaagtgttgatgataaatttccaaagataactttccattttgagaatgatcttaccctggacgtgtatccatatgattaccttcttgaatatgaggtaacatga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAAPLLLSTIILALVVVASSTHGTMANGVFQVRRKFHIVDGVYK GSDIGALQTHDENRHRRRNLMAAELPLGGFNIPYGTGLYYTDIGIGTPAVKYYVQLDT GSKAFWVNGISCKQCPHESDILRKLTFYDPRSSVSSKEVKCDDTICTSRPPCNMTLRC PYITGYADGGLTMGILFTDLLHYHQLYGNGQTQPTSTSVTFGCGLQQSGSLNNSAVAI DGIIGFGNSNQTALSQLAAAGKTKKIFSHCLDSTNGGGIFAIGEVVEPKVKTTPIVKN NEVYHLVNLKSINVAGTTLQLPANIFGTTKTKGTFIDSGSTLVYLPEIIYSELILAVF AKHPDITMGAMYNFQCFHFLGSVDDKFPKITFHFENDLTLDVYPYDYLLEYEVT</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>5616..5715#4835..4905#4587..4752#3535..3759#621..853#335..464#1..242#atggcagctcctttgttgttatcaacaatcattttggctctagtggtggtagcatcctctactcatggtaccatggccaatggggtattccaggtgcgccgcaaattccatatcgtggacggtgtgtacaaggggagcgacataggtgcattacaaacccatgatgagaaccgccatcgtcgccgtaaccttatggctgcagagctcccacttggtggcttcaacatcccatacggcactgggtatgcttcaatcatctctgcatttggtcatgtctgtgtttgcttggttggttggtttggttattagggttaaaaaatggatcttggcataggctatactacacggatatagggatcgggacacccgccgtgaagtactatgtgcagttggacaccggtagtaaggcattttgggttaatggcatctcctgcaagcaatgccctcacgagagcgacatattggtaggtttccttgtagtgtttctttagtttcagtcccttaatttgcttgcaaaattcttttgcaatttagggtttttattcattatagaagttgaaattctggattgtaatatgtttttgtttttgtcgtgggtacgtgtatttgcttgtgtgcagagaaagctgacattttatgaccctaggagctcagtaagttcaaaagaggtgaaatgtgacgatacaatatgcacttcgcgaccaccatgcaacatgaccttacgttgtccgtacatcacggggtacgctgatggtggcttaacaatgggcatccttttcactgatcttctgcactatcatcaactgtatgggaatgggcagactcagccaaccagcaccagtgtcacatttgggtgagttattaaagaaagagcactgctacacgtactatgtttttcttactaaatttttactaacaatcatctcaactgtttgattttgctaaatggaagttataaaaaatctagatacactcatagcatgacatatcaatgtattacaattcgtatgtgaaatttattgatttacaactgaagtgatctattgtaaaatgccattgataagcaatagttcaacaatatgttttccatacgtgcaatactctttcttttttaccatcacatcatggttaacctcaaattctgtctctagtttttacaaaatgaccaaaatatcattgagaacacacatatacccttgacagacttcttttattttttacagtgaccaaaacacctttgataactctgttaaaccctcgacagactttcgcgagtgcctgttgcagtttatggtgaaatgaactttccattagaggacaacaaaggccccttaatggttagttcacagcaatggagaaaaggtagaaaaataacatgtatgatggcataacatataactcatatttataaaatcgaaacacaataaccaaatctaccagagagttgtgaatggtacgaacaccaaaaaccaaaatggaataaaaataatcctctaaccttacagagtccacgatgaagtctggtgtgcaccggtctgaccgctctgatgctgtcggtctgaccggtgtagagtcgccggtccaatagccttgcttctccctttgcctgacactgctggtccaaccatctagaagtcacctgtgtgaccactgtgccgccgccggtcagacctcaaggatgctaccagtctaactaccgaaacaaagtaaaatacaaatcaaagaactctttagaagtaaatcaactttattgtttctaattgtgctcacaaagtgtaacaataacactcatttctcaacttttgactatactcaaaatttaggctaaacccttttttttttcaaaactgttatctcacagaatggtaccaagaggctcaacccctcttttatttataccttgaagtggctgcacaaagccacgaattcaacttggataagtagttctaatctcatagaaaacctacccgaacaagtatacaacttatcgctttacaaatcaaactccaatcttttcaaatttggattccttccaaatttgagtcatatttgttgatggcatttcatagagtcgagtggctgcatgttgatggcattttatagagtcgagcacttgcatgctgatggcacttacaatgttccttttcataccaaaggcattccattgcacaagtacacagtaggcaatcactgccggtctaacggttgctataggctagcagtgattaactatatataatgccggttcatgctggcttggatatttttttccctaccaacccatgtgtatgggctatgatagacctagcatctctgtcggttcagcaactggtagtgataggtgaggccaccactgctggatgacctcatctagttcaaaaactgatagtgatgcattagttatgaatcgatggtgatcggagtttccgtactggtattgttttattaaatctgaagcattattttactgcatcacatggcaacaattaaaccatacatatattttttgttcactattgtctataaggtgggtatgctgtattgattgtcttttattgtagatattctttttgagaagccatgctatataagtttgcccacttaggacctgcttgaaattgattattgactgtatttttttcatggattatctgctttgattatatggatagacaaaatattttcagaaatatattcaacagatagcttagaacaagtggtccaataagtatacatgcaatagaagaatgttcaattttagaggcgttgagcaaatccatggctataatccagcgaagtagcagaagagacatggcataagttaatgctcctgtggggggctaccattggatgttgcatcacacaacacactagttctttttcatatgaatggtattttattgcactagcacacatgagctaatcactaccacccatcactactggttgccatgcatagtgccaacaattattgactattaatgccatttcatgccagccgggttgggcatttaccaaatctatgtgaattcactatgatagcctgagcatcgctgtcggttcggccaccggtagtgatagccgagatcactagtgtcggctggcctctgctggtttagaaattagcgtagatgccggtgatgggttttgtgtaagtatttttatttgcttttcatgtaaatctctgatgaactcatcacatgacaataaccggttatggcggttataggtatattttgatattttctatgccttgttctccataaggtgggcaggctgtattaattgtgttttattatagctgtgctatctaagaaggtgtgctatatatgttggcccactaaggccatgtttgaaacaaattattactagtttatttttgtggattacctacttgagaaacaatcttaacaaatggcttggaaagtaatctaacctatgcagtagaagaatattttttagcaaacatatttttagggacgtggagaaaatccgtgacaataattcgatgaaatggctcccctgtgcttctaggtgtggtttacaacaatctggaagtttaaacaattcagcagtagcgattgatggaattattggttttggcaattctaatcagactgcgctatcacaattggctgcagcagggaagacaaagaaaatattttctcattgccttgattccacaaatggaggtggaattttcgctataggagaagtggtggagccaaaagtaaaaacaacacctatagtaaagaataagtgagttaaccatgcactttattatgtttcttttatggtcacaatttaatttggctctactttaaatacatatatttttaccctggttatagcatcttccggtatacttgtttaagaagcatttatcaacccccctaaaataagatgcatttatccacttaaacatgaactgtgtcaagtggtacatctctggtacaaacgttgtgaaaaaaatgtatgtgttgttgttcttgagtgttcttattaggcacaatgtttcaaagttttgaatgcacatagctatgtgaaaatttatgttggctgtcttcaacatggactgaagggtgctcttaggctggaatcgcttgaaccttaaactataatttttaaaaaagctatttatatactttagtacatgatcttggctctccaccagtccctgttggatgttaggtttatgacaagtagggatatatgcatataatatcaatttgtattgtagtgcacgtatgccttcttacatgttgtaaccttttgagaatacatgtctttctgcgtgtaatccagactcgtggttccaacacaaagaccataaccaaccttgtttggttctattctcgtttccaccaaactaatgctattgtatccattttgaatctgtataataatcactggacccaaagcatggatttacaaatttgagggaatatgcatagttttttatagaaatacttatcatgtttatctgcatcttctgaaaattaaaagcaacaaggcatttggaacttttgagcccactcacacaccacgcacactaactcacatcaattcacgattctatcacatagtgaggtatatcaccttgtgaacctcaagtcgatcaatgttgctggcacaacacttcagcttcctgccaatatttttggaacgaccaaaacaaagggtacattcattgatagcggttcaaccttggtgtaccttccagagattatatattcagaactaatacttgcggtatggcaaaagtactgctattcttttctagtggtagaattgtttgcaattacgtttacatataactctcaaccaattgcaggtatttgccaagcatccggatataaccatgggtgctatgtataattttcaatgttttcattttcttggaaggtatactctata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External Link(s)

NCBI Gene:Os04g0336942, RefSeq:Os04g0336942