Os04g0337000

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os04g0337000

Description

Peptidase A1, pepsin family protein

Version

NM_001059024.1 GI:115457777 GeneID:4335507

Length

9185 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os04g0337000, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:15865544..15874728

Sequence Coding Region

15869575..15869576,15869894..15869999,15870092..15870254,15872791..15873015,15873636..15873883
,15873969..15874098,15874636..15874727

Expression

GEO Profiles:Os04g0337000

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008397:15865544..15874728 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>tactatttccgcgtcgcgtcgtcggcccgtctccgtctccgtctccctccccccgcatccccgggcggaggaggccaccccaccgccacccggctgtactacacggagatcgggatcgggacgccgaccaagcggtactacgtgcaggtggacaccggcagcgacatcctctgggtgaactgcatctcctgcgatcgatgcccacgcaagagcggcctcgggctagagctgacgctgtatgaccccaaggactcgtctactgggagcaaggtttcgtgcgatcaggggttctgcgccgccacctacgggggcttgctgcccgggtgcaccaccagcttgccctgtgagtacagcgtcacgtatggtgacggtagctccaccacagggtacttcgtgtccgacctcctgcagtttgatcaggtgtccggggatgggcagacacgacccgccaactccaccgtcacatttgggtgtggttctcagcaaggtggggatttaggcagttcaaaccaagcccttgatggaattatagggttcggtcaatcaaatacgtcaatgctatcacagttatctgctgcagggaaggtgaagaagatatttgctcattgtttggatactataaacggcggtggaattttcgctattggaaatgtggtgcaaccaaaagtcaaaacaacaccattggtgcccaatatgccacactacaatgtaaacctcaagtcaattgatgttggtggtactgcactaaagcttccgtcacatatgtttgatacaggcgaaaagaagggtaccataattgatagtggtacgaccttaacataccttccggagatagtttacaaggaaataatgcttgcggtatttgccaagcataaggatataaccttccataatgttcaagaattcctgtgtttccagtatgttgggaggtatactttacaacatactccatccgtttcgcaatag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>YYFRVASSARLRLRLPPPASPGGGGHPTATRLYYTEIGIGTPTK RYYVQVDTGSDILWVNCISCDRCPRKSGLGLELTLYDPKDSSTGSKVSCDQGFCAATY GGLLPGCTTSLPCEYSVTYGDGSSTTGYFVSDLLQFDQVSGDGQTRPANSTVTFGCGS QQGGDLGSSNQALDGIIGFGQSNTSMLSQLSAAGKVKKIFAHCLDTINGGGIFAIGNV VQPKVKTTPLVPNMPHYNVNLKSIDVGGTALKLPSHMFDTGEKKGTIIDSGTTLTYLP EIVYKEIMLAVFAKHKDITFHNVQEFLCFQYVGRYTLQHTPSVSQ</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>5153..5154#4730..4835#4475..4637#1714..1938#846..1093#631..760#2..93#ctactatttccgcgtcgcgtcgtcggcccgtctccgtctccgtctccctccccccgcatccccgggcggaggaggccaccccaccgccacccgctccctttcccccccttcttccctccctccctcccttcccccaccttttccgctcccccaattaacctcaagctcacccgcggaggcggaggcggagccggaggaggaggagggaagggccggtggcataaggcagcagcgattctcgccgccgccgccgcccgccgccgcactcccacgatggaccgcccgcccgcgccagcgccagcggtggcgctgctcctcgtcgtcgtcgtcgtcgcggcggcggtaatgctggcggcggtggagggagcgggggcggaagcaacaggggtgttccacgtgcgccgcagcctccccgccggtggtgcgggggcggcggcggaggcgtaccgagcgcacgacgggagccgcagggggaggctcctcgctgccgccgacatccccctcggcggcctcggcctccccaccgacaccgggtacgcggcgccacctccctccccttcgcttggcctctgctgctgccgtgcttgcttgcttgcttggctgatttggtgctctctcgtctcgccgcaggctgtactacacggagatcgggatcgggacgccgaccaagcggtactacgtgcaggtggacaccggcagcgacatcctctgggtgaactgcatctcctgcgatcgatgcccacgcaagagcggcctcggggtaacacaccatctcgttttcttttcttcttcttttagatttttggattctctcaactgtgggcaaaaccgtgcgttgcgtgcagctagagctgacgctgtatgaccccaaggactcgtctactgggagcaaggtttcgtgcgatcaggggttctgcgccgccacctacgggggcttgctgcccgggtgcaccaccagcttgccctgtgagtacagcgtcacgtatggtgacggtagctccaccacagggtacttcgtgtccgacctcctgcagtttgatcaggtgtccggggatgggcagacacgacccgccaactccaccgtcacatttgggtcagtcgtgctctgtccctgtcttaccgctgtttttgtatgagctaccttcgaatgatctactgttacacttagtattgtttcttagaaatgacatcacgttatgaaatctgcatgtgaatttcagatagcttatgtctgtcacacgatgtataatgaaacttccctatagttaaggaaaaaaaaaccatgaaactgtttcaattcatcgggtggcaatgcctctggcctctaggtagaatttgtatgtagtaatgttttgttggaaaatgcttacatgattcctcccatgtgccagaggttgcgaatattttcctaactattttgttggctatgttttgttttatataaggtgactaagactcaatagccatgttctttgaagaggggtttttttattgcataatctgccattaagaaaggcatcaaatattgtcttggtgtaaaaaatattcattacatgctcttatgaagaatgtggcaatggagtaagcaaaattaacaattaacatggatgcatgacagtaacagaagtgtacagcaatgtggaatttagtaatcaatttagttatatgtgttgaagatgccaatgcaaataaatgcactcctgtcctttgtaggtgtggttctcagcaaggtggggatttaggcagttcaaaccaagcccttgatggaattatagggttcggtcaatcaaatacgtcaatgctatcacagttatctgctgcagggaaggtgaagaagatatttgctcattgtttggatactataaacggcggtggaattttcgctattggaaatgtggtgcaaccaaaagtcaaaacaacaccattggtgcccaatatgtatgtcaacgttgtaccaacacctcattattctgtttgctttttgctcatagtgaaatttcttaagctactttaaatataaatttttgactctatttgaacaattagttagcgaaacatggttttggagatttatcacagttcagtattagctattaagagacatattatatattttaggagattcatcacatcatgtttcaaaccctcaaaaggacatagaaatgtgatatttccctctgcatcattgcattatcttcttatcaaggacgcatggtccaaatctgatgcactatgtgaaacataattgtcctaattaaacgctctactttttgttcatccgtaactgcaatgtagcgtgagctgtccaattagttgaggttttctaaagtcaagcattcaaggttttttgagaaacgctcaggggtcttccggctagctccacaaggtggtgggctagacgacatgggttcgaagcctcaccccttctaattatttaatattaggtccttccctaatattcgcgtcttttttttgggtcaaatttaatccagtgaaattaccatctgccttgaactattgagttgagcacttagggaatgaaactattcggaatatacgaataacagcttcaggaagagataatcgttagaggaattttgtatgctagctgaatgcctgtgctttgctacgaatagaaaatatattataatattgtgaaataaatattttttttccatgaaacgtgttacccatcctcctatgctatagggaatattcacctcactttgttttttatgtggctatccatttatggttgtgttttaatattgagaaattcaagggggtaatttgtaaaatttacaatggaagtagatggatggcagattcactgccaccaccactatcttcttttaaggtagtatatagattacctagtacaaatacctcacactggctgtcagcacagtgtagataacaggaacattgcatgctttattttgaaaaaaagtccattttactccgtcaaactatttcgttgaatcacttaacctataaactattttttggctcatcttccccctaaacttttaaaaatgcttcactttactgcttaatagcatttcccttctttgtttctctttgtactacttatattttaagctgaaattttttagagccatagatggctgtattatcaaagttccaaaatatttttaaattcttttcaagactgtttgcttgaagttaaaatctcaacatttaaattagtcttacatgccttcaatctatgtaaacagtgataaagaaaatcgaaaaaatattcataggtactccttccattccaaaatcagaaattccaaattgattatcatataaccatggtcccttcgtttgacgtgtagtatcattgcatttatgcatgcaaattgagtttgcatgcatgcaggtaggagggtagtaaaggtcccgtttcttgtgtatggtggaagttaaagtgtgcatgtttcttgatttttttctcgtaccacagtcacattaaatgaaatataagaaagttaatacttccttggtcttgatgaaaaaaacttatttgataattaatatggaatagagggagtaagttgtaatgcatctaacaacactaccaaatttcagtgcaaaatacaactttgagaaacaaaaaagagatactattagggagtaaggtgaaccgttttcaatagttcggggtgtaaaatgagctgaaaaatagtttaggggggttaagtgctccagtgaaatagttcgggggagtaaaattgattcttttcttttattattgtcatccctttcttttgactctggctcaaattgccatttccttttggaactgatgaacataccaaataactgtaaatcttgacatagatatcttcgaccttagatgtattgggttcatattttgtataatctctcgtactcatatgctgttagcatgattttcatttttatctgtaaaacttgatgtggaaaatgttgtgattctggtttataatatctactgctacaaatgttgagaagaaaatgatacatggtatgctgtagatgttgaagggatggaatcatgtgaaatttgtcgttgatttatttatctttgccgcagattgaaggatactattttggaattgcttgtcacctaactattttagctagaatttgttacttgatgtttttatggtggaaagttggcttacctttgtagcatgcacatctcatgtgcagaataaatcaatgtgtggtgcagagatgtctttctgccagtatcctactctcttcttcatattttctcctggccagttcaacttaattctattgtctcatttatgaatctctaataacctctttccatggcagttactgatttttagggaatgtacacttttttggcagatagggtacatatgtacctgtgatatgtattgcatgtctgcaactggtttccttttgttccatttacaccattctaatacctatccatgattctactactcaggccacactacaatgtaaacctcaagtcaattgatgttggtggtactgcactaaagcttccgtcacatatgtttgatacaggcgaaaagaagggtaccataattgatagtggtacgaccttaacataccttccggagatagtttacaaggaaataatgcttgcggtatgaaatgagccctgcatttgttttcccatgttatggaggattgcatgcatgcgttctctttacatgttatatttctcaaccaatttcaggtatttgccaagcataaggatataaccttccataatgttcaagaattcctgtgtttccagtatgttgggaggtatactttacaacatactccatccgtttcgcaatgtaagactttctagtattgcctacatacatatagatgtaaatgaacctaaacacatacgtatgtctagattcattaacatctaaatgaatgtgggcaatgctagaaagtcttacattgtgaaacggaggaagtagtatctagctatattgttgagcagcaaaattgttccataatgttatgttcgtgactttcaaataagttgggagaagaatgaattatgagcccaactacaattttattcgttttttcttgaatacgcaggagtgcaattttatttgttacatttctaactatatatttttattcttctatgcagagtggatgatgactttccaaagatcactttccattttgagaatgatcttcctttgaatgtgtatccacacgattacttcttcgaaaatggggtaatgtaacatctcactccagtgatttggtcacctattggtatttctttgccaacttagttgttacaacttatgacacctataaggttataacatgttaaactggaatatgaaatggattcagagcatttgggcagcttttccaggtatatttgcaattttgcacactatttaaagaggattaaatttggtttagtaccatctcaaccgctggtgagtcttaaaataccattgctaacatgaggggttttaaaatactataggtataaaattttggagggtggcattgccctaggctttgcagtccatggcaattgttaacatccaattaggacagagggatttcctgaaatgacgttatcactcctacatcctccttttcttcttctttgtaatttgtgtgatattgcacatgaccttaaaaagggggacatgtccatgcactacttacgtggtgaaagtggctatacatggttgaacccacatcttgctccctggtaaacaaaaaatgagggtagattggccattttacacattttcaacggaaaatggactgtgctggtgttttccaaatctgttcactttacaatggtattctgtagccactcttgtttacgattgtattttgcaacttgcaacaactgtgaaggcgatgacaatgttgcagattttcatatccaaattaattttaaactgtaaacctgtacaaaaacatggttcccttgcatactagttgcattgctgtttgcatctctgttacctttttcccaattagtaatagtcattcccttgcatatgtttattttattttatttattatcccttcccttcttttccaattgttcatgtttaatattggcattctctgttctataagatgcattcagccattctctatgacagaaatatttggatcagggttaagggaacttctgaataaccccttcgaaaccctcatatttgattagcttatacaccaatattcttatgattgcctccagttcttaccctagactcagatattccaaataaaattctaagttatataaaatacaaaaaaagagggtaaaattgcctttgacatggtctcgctgagaagctggaactgaccatattccagttttcccccagaaccaagattgcaaaatgtggaattttttgtctgtctcacaaaaggaatttgtttagttatttgaacatttcatactacattttaaaatagaccctccaaggagttaatttcaaaactgaacaattttgccggccacgccatgggtagtgccatcctgcaacatgcttattgttaccacaacattgttggtgacatgggcaaaccattgccacaacaacacatggtacagttttgctgtgccaacactgatggcatgggcaaaaaaaaaggttctgttatggaaatgacttttctaaggaattatttttaaaacattaataagaaaaggttcaaaaaataaaagaaaatccctacagaaattgctatgggttaacagcatagtactatagcattgcaactgttctcatgggtggcttatacagttgtttgcttcaggataagatagtagttttcttgttagtgaagcattagtttccttggaaatgattaaaatgttaggccaaagcctttgtaacaaaggagcagtatattaatttagatcaagcaaaattcaataaatgaagaatctagtgctcttctcgttaatcaaagagccatatgtattgacagtataggaaagagttccttgctagcctgagcttttgggcttttactaatacacacattataatagaattgttaacacttgtcgcacataaatatttcaagagagttggttctcactcacttgaatggactgacctttggatgcatgtttcgccaggatctgaacctgcgttcaaaggcagatgcattttcaatcccacctgagtcagaaatgccaaaatatgtaacattctaatgactgctgtgtcttgaaaaattgcactaattgtgtcgtaggatgcataaatcagactctaaagctctgttgttttgtccctcttcccaactccattccctcgttttccacgcgcacgattcctacactgttaaacagcgtgtttttttttaaaaaatatattctttttagataatggaattaaaaatccggcctttgcttcaacgaacctacagccaattattacaatattctctcaaaaagagcaaacactcaagcaacaaaaataacttaaaaaaataaagccaacacataaggagtaaacaatttctataggaaagttgtttaaaaaaatcatattaatccatttttcaaaaaaagctaatacttaattaattatatgctaatgagtcgctccactttacgtgcgtgagttattagttcccatcctcatatgccgaacgtagcctaaggctgtgttctttcccctcctttccctacttaccccctcgttttctgcacgcatgcttcccaaaccgctaaatggtgtgttttttgcaaaatttttctatacgaaggttgcttttagaaaaatgtattaattcatttttcaaaaaaaaggactaatacttaattaatcatgcgctaatgagtcgctccattctgcatgtcggagggattagttcccatctccaaccaacaaacgcagcctaaacctgccacattcagtggttcaaagtctaattgttccaatcaacgatcatgatagttaatttgaatttaatggagtactatagtttgaaatgatactataccgttgcattcagtcttgtagtagttgttatgttctgtatataacatcataatatgcaggttcacagatatatgttcatgacacttagatttgtgatttttttttttgtatttaagcaggataacttatattgtgttggattccaaaatggtggattacaatcaaaggatgggaagggtatggtgcttttgggaggtttgtcttgctcagcacatgcaaatcctttactcaatgttatatatctgatgtttttttagaactgttatatatatgatgttcgtgctattacctgttttttttccagatctggtcctttcaaataagttagttgtctatgacctggaaaatcaagtcattggctggactgagtacaactgtaagtttaacacattcaaatttgattgttatgagttcattccatagtactttacatgtttagtctattgttcttgctaatgtcttgacaatccgaaaatatatggcaccaaagttggattgagtttcacttcataaggaaaatgggacgctggaaccatgttatactaagcgttgttcagtaaaagagctttgcatgttgcacgcattgcgtgctccaagttctgaacatcttagtcatgggatggaatatgcaacttttagctacaaacatattctgggatggatgaagtacctaacttgtgtgtcataattggcttgtccgctctttgcaggttcctctagcattaaaattaaggatgaacagacaggggcaacatacactgttgacgctcacaacatctcctcaggatggaggtttcattggcagaagcatttggctgtgttgctggtaacaatggtgtacagctatctaatattctaactccggtgtatgacacggactctagtggaaattcatttgatttaaattcttttcaccaaagagggaaaaagggtaggggtgtttagatggtgttctctgaccactcgagagaactgaaaaggaaacattgtacgctacacaatgtacccgagtgtgtagtgtaatgtaatgtaatgatgtggtgactggtgagaaaatactatggctgaatgtgcttttgggaggttctaggaatgatatcaggcccccatcttttgaatatactctgataatatgccgtacagcatattaaggaaaaaaataatttatattttttt</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os04g0337000, RefSeq:Os04g0337000