Os04g0401300
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Structured Information
| Gene Name |
Os04g0401300 |
|---|---|
| Description |
CBS domain containing protein |
| Version |
NM_001059222.2 GI:297602644 GeneID:4335727 |
| Length |
7651 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0401300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:19872374..19880024 |
| Sequence Coding Region |
19872456..19872547,19872663..19872762,19873516..19873585,19873759..19873822,19874946..19875119 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:19872374..19880024 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ttttgtgtattttatttatgctacctaataacttatagtctgttatgcattatttccaattatctcaagcagatgcccccagatcagttatctcaaaactcaggcgtgcagatagcaattttccgccatcgagtctctgagatattattacataataccatatatgatgttgttcctgtttctagcaagatagcagttttggatgctcgtcttcctgtcaagcaagcctttaaaatcatgcatgatgagggtctttctttggttcctctttgggatgatcagcagcaaaccgtaacaggcatgctaaccgcatccgattttgtattaattttgagaaagctgcagagaaacattcgaactcttggccatgaggaacttgaaatgcattcagtgtctgcttggaaagaagcaaaattgcagttttatgggggacctgatgttgctgccattcagagaaggccattaattcatgttaaggattcagataatttaagggatgtggcattggctataattagaaatgaaatatcttcagttcctatctttaagccctcaacggattcatcagggatgcctttgcttggtcttgcaacccttccagggattgtgaaatttatttgctcaaagctgcaagaacagcctgaagggtactcatttctgcaaaaccagattgtcagtatgcctattggtacatggtcaccacatactggcaaggcaagcaatagacagcttagaacttcgcgaccaagcactcctctaaattcatgcctggatttgctgcttgaagatagagtaagctcaattcctatagttgacgataatggcgctctccttgatgtctactcgctcagtgatatcatggctctaggcaagaatgatgtctacactcgtattgagcttgaacaggtgacggtggagcatgccttggagctgcaataccaggtgaatggccgaagacactgtcatacctgcttgagcactagtaccttcctggaggttttggagcaattgtcagctccaggggtgcggcgagtcgtcgttattgaaccaaggagcagatttgtgcaaggaataatctcattgagggacgcatttacatttctcattggataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>FCVFYLCYLITYSLLCIISNYLKQMPPDQLSQNSGVQIAIFRHR VSEILLHNTIYDVVPVSSKIAVLDARLPVKQAFKIMHDEGLSLVPLWDDQQQTVTGML TASDFVLILRKLQRNIRTLGHEELEMHSVSAWKEAKLQFYGGPDVAAIQRRPLIHVKD SDNLRDVALAIIRNEISSVPIFKPSTDSSGMPLLGLATLPGIVKFICSKLQEQPEGYS FLQNQIVSMPIGTWSPHTGKASNRQLRTSRPSTPLNSCLDLLLEDRVSSIPIVDDNGA LLDVYSLSDIMALGKNDVYTRIELEQVTVEHALELQYQVNGRRHCHTCLSTSTFLEVL EQLSAPGVRRVVVIEPRSRFVQGIISLRDAFTFLIG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7478..7569#7263..7362#6440..6509#6203..6266#4906..5079#4664..4805#4066..4197#3905..3994#3458..3517#3195..3383#aggctccaacaccaacccaaagctctctcgaaagcgaacaaaacaaacgcccacacacacacggtgacacgcaccccgacgccccccctcccctttgcttctccgcctccgcctccgcctccctcctcacgcacgccaaaaaatttccctcttttcctcattctccgcctccttataatctcaattcaccaccaccgtccttctcgctctcgctctcgctgctgctcctgcaggtcccccaatcccgtgggcgtggggggggggggggggtgttcggggttcttgctttgctgggatggtcgacgcctaggtgttttgctttgctttgcttttgctagggttcttgaggggggggggggggtggttgcccgggggcttctccaaacatggtgctgcggcgcttcgcgtggccgtacggcggccagcgggcctccttctgcggcagcttcaccgggtgggtttgggattgaggggaaaaaggatcgatcttgggcagggggggttgagggaaaggcgggatctttcctttttctattttttcgggttgatgttttgctgcgggaaatgctgaatttctttgttttctgcgcttgtgctgcgtggttttttttgtgtttgggcgcaggtggagggagtgccccatggggctcgtcggggccgagttccaggtggtgttcgatctgccccccggggtttatcaggtgcgcgcccttccagccgaattccccggattcgggctactccttcgtttcgattatgcgtttttgtttatgccatgttttctttacaccggttgtggtatgggtgtgctaggcttgctagctcttgattgtgtgtttgtgcctgatgagtgtgtagattgcttggggttgggatcgaattacgctaattcgcgatagattagtgcgccgattctgttttgatatctttgatgtgtgactgttttgtcggaagcgcgtttgggcggcaatgcatccaaatgttagttggtagttgccgtcgatggccgccgaggtgtgctcacgcaatgcattggagcttataatgcgtggcggggactggtgtcccttccacagataggaggtagtgtggttgggttcttggagtgacctattttatgcatagcagctgtactaatcgaccttgggtaatacgcttaatggttaaaccctgaattgtgcgcggtatcaagtgccgttgagtgttgatgactagggtttatgtggaccttatccccttactgactatttccattaaatgtattacctcatgaccgccgtatgaaatcctctcgttagattcagtgatgtacatatgtgttgacatgattgatgtcttattcggtaaaatatgtactcattttttcatcattctatgccctgtgcaccaacagattgaatagtgctttagaaaaccatgtactcctacgaggtagtacaaggaagtcaaataaatggatgtatgccacatttttactttggtacttccatgactagctatggtctttttttcttttgactgaaattgaactcattacagagctctatgcaagcaaaggacattatctgggactttgaggggaaggaagccctcccccctatgaatattgaaatgttgaccacctgaaaaagagaaaaatagaggcttggtttgactgcttgtcttggctgtaccgttaattagctttcacacatgtagctttgcagtttgacttatatgataaccgttaaattagctttcacacatgtggctttacagtttgacttaaatgataaccgcaagaattcaaatagcatagcttttgcatgatagagtttgtcctatttgataagcagaactctatgttttcaatttagtccataggaaaactagtcgttaagtcttacagcattcttttcaatttagtccgtaggaaaactagtcgttaagtcttacaacattcttgtacagtaggaacatgcctagtatgtggggaccaggttgccctcccctgtttccatagttccagacaataacttgtaggcgttacatgatggctgctgcacatttgattgtccatacagttgcggcatcaaaattgtcctctaatgccatcataatgagtcgtgaaggcacatgaatacaaatagatctgttttaggttcccacatctccagttattcgtatttcaaaagattgatttattatatttttttcctcaaaacatatgatttgctgcatttatgccagtttccccatattgtttatcttccttttatctactttcttaattaggactccttcattttgttatattttttcgatatcttccgaattcttatctactacatctgtcccatgatataaggggtactaggtttccttgaagtggttaagggggaaggaaaaagactttgatgctctttattaaatgaggggtttgtgggaagtgagaaggtggttggcataaaatgtgaagaaaattgaatgaaggatgattgatgggacaaggagcacttgaaagcccttgtatttagggacaaaatttgaatccttgtatcacttatattatggaaccgagggagtagcaatcaatacagtgttcttttcgtctaaaaaaaaatcaatagcgatagatatcagaaattttcataatcatgttggattttgtattttggatgtttgtagacgtcatttaattctggaaatgtagccaagcatgacgtgcctgatatattactgctagagtataatgcactttccaagtatttggtgttacaccatgcacttctatagagaatccactcactctttattggacactctattgcttatggccactgtgtgattgcttgtttctgttgttatgttagctttagcaaacaacttgtacacttctagtatcaaattatgtgaagatagtcgatttctataccagtgccctgctatttgtatacaactttcttgtgcttagtgttttgctttcaatacattgatgtgttcttttggtgtcacatagtaccggtttttggttgatggtgtctggcgatgtgatgagacgaaaccttgtgtacgggatgaatatgggttgattagcaatgaagttcttgtggataatacacatccggttgtacagccagaaacttccatcagagtagtgagtatggatgagggtactatactgacaacagtatgtatcaaagtttcatttgtaattttgtgtattttatttatgctacctaataacttatagtctgttatgcattatttccaattatctcaagcagatgcccccagatcagttatctcaaaactcaggcgtgcagatagcaattttccgccatcgagtctctgagatattattacataataccatatatgatgttgttcctgtttctagcaaggttagattattcttttgtagttagcactttcgtttaggccatatcaattataacatttggtatatgcatttcagatagcagttttggatgctcgtcttcctgtcaagcaagcctttaaaatcatgcatgatgaggtatgtctttgcaggactatgcatttattttctttcttctttttttacttcctgctgtttgcatattcattaaaatttcctatgtttgtttatcatgttattgaataattgcaatatttgtttatttatatgttaggagcgatcgatttgtttcttcattttacaatcaaacaagaatttctagcagaacaaatttattttttgttgactaataactaacaccattgtttccatcaaagaaaaacactgctaaataagcaaaattttctggtaaattatcatttgtccttgcatattcatgtatgtaggtagtccaaaaattttgattgctccttgtgtgatcaaatactgtaagaattcatcgtaatttcacttctcttgttttagggtctttctttggttcctctttgggatgatcagcagcaaaccgtaacaggcatgctaaccgcatccgattttgtattaattttgagaaaggtgagactaaattgttgtgtttctccttcgataagcacttttacattgtttatcaattcttgggtctgcagctgcagagaaacattcgaactcttggccatgaggaacttgaaatgcattcagtgtctgcttggaaagaagcaaaattgcagttttatgggggacctgatgttgctgccattcagagaaggccattaattcatgtatatctgcatctatttcccagatatcgttcatttgatttgctgtctaaatattactcatggatattacagaaaaaacggtggatattataaaatcaggtttacaatgaccttaataaatatttccttcatcatttcctcaaattgtatgtcatagtgatagtgatatgctgttgtgcatcaaggctgacatacggataactcctgtgttttacgtatgatatgtgattgtacatttcattgttgagattcattcagctaaaataaaggccactttggatatgaggggttgagcctttggttattcaagatcaaatccctatgtctaataagaccatagcagtgtgttttaatcttctgtattgatataagttcaacattgatgggattacctattcatttcatttatttgaacatttctattttctagtaattgatccattattttcctcttatgtttcttcaggttaaggattcagataatttaagggatgtggcattggctataattagaaatgaaatatcttcagttcctatctttaagccctcaacggattcatcagggatgcctttgcttggtcttgcaacccttccagggattgtgaaatgtacggaatcatttttaataatactacaactgttcattctgacagctaaattgatccgagcctcaaattaa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