Os05g0179000

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Gene Name

Os05g0179000

Description

Zinc finger, RING-type domain containing protein

Version

NM_001061337.1 GI:115462404 GeneID:4337973

Length

4749 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os05g0179000, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:4690022..4694770

Sequence Coding Region

4692823..4693415,4693765..4693890,4693979..4694255,4694358..4694585

Expression

GEO Profiles:Os05g0179000

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggccgtccctcctgttgaatcagaaacaagaagtgaagaaacagataatttccctttacttgcagaccacatggaaaatactggacatcatgcacatgcagttgatatcccatgggattcttcaccatcgacatctcgccgagataatcataatggatttgatcaattacctcgtatcttagaaggttctcctgggacatctactccatctaactctcagaatggtcctctagcaagaagagatgataatcgtggtcgtcgtcagcctagtcccttgaattctggttgctggatctcagttgagctagttgtaaatgttagccagatcatagcagctatttgtgttctgtcagtatcaaggaatgagcatccacactctccgttatttgagtgggtcattggttatacagtaggttgtactgccacgctgcctcatctttactggcgctatctccatcgcaacctcccaaccactgggcaagagccaacagttcagaatatccctccaaacaacacccctgaagctaattcatatggagtaaccggcacaaatggagtctcaagaaacaatgaggcaacagtaaatccaaggttccaagcttttgctgatcacttcaaaatggctctggactgtttctttgctgtgtggttcgttgtgggaaatgtatgggtatttggtggacattcttctgctcacgacgcgcccaacttgtacaggttgtgtattgccttcctcacattcagctgcatcggctatgctatgcctttcatcctctgcgcattgatatgttgctgcctaccctgcataatctctatcttgggatttcgggaagatctaaaccaaaacagaggagctagtgcggaaacaatcaatgccttgggaacatgcaagttcaagtcaaagaaaactcgtgatggagatggaaacgaagttggtgtcggtgttgtggctgctggaacaaacaaggagcgagtcatttctgcagaagatgctgtctgctgcatctgcttggccagatatgtcgataacgatgatctccgagagctcccttgtgcgcacttcttccacaaggattgtgtggacaaatggctcaagataaacgcgctgtgccccctttgcaaggctgagatagatggtgtctccacaagtgctccagccattggctttgggcgtcgccacagcgacaacagggtaggaaacgacattgaatcacaactataa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAVPPVESETRSEETDNFPLLADHMENTGHHAHAVDIPWDSSPS TSRRDNHNGFDQLPRILEGSPGTSTPSNSQNGPLARRDDNRGRRQPSPLNSGCWISVE LVVNVSQIIAAICVLSVSRNEHPHSPLFEWVIGYTVGCTATLPHLYWRYLHRNLPTTG QEPTVQNIPPNNTPEANSYGVTGTNGVSRNNEATVNPRFQAFADHFKMALDCFFAVWF VVGNVWVFGGHSSAHDAPNLYRLCIAFLTFSCIGYAMPFILCALICCCLPCIISILGF REDLNQNRGASAETINALGTCKFKSKKTRDGDGNEVGVGVVAAGTNKERVISAEDAVC CICLARYVDNDDLRELPCAHFFHKDCVDKWLKINALCPLCKAEIDGVSTSAPAIGFGR RHSDNRVGNDIESQL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>2802..3394#3744..3869#3958..4234#4337..4564#gagtcaagtcgccgacttttggagttctcctcgccccagctcggtaaattccttcgctttttctccgctggttcggagatttccatgttcacttttgtttttttttttaattaagggctttgctttgatggaagggttgggtactggttccttccctccggatcaatcttgcttcttgcgctcacccaacctagtaattttttcctctcccgatttgtttaatgctaatctaggtggttgatgatgcttgcgagccaggcattgattcggctttaagcttgcctgcttgcttcgccgtcttgttctttgagttcttggttttcatggatccttgatccgatttaggggttgctgctgctagccgtggttggtgagacggttcttggagaagggggatttcttgaggtaggtggtagcggtagatttcctttctgttctatgccctcttcaattgaatttttggaagtctccagcgttttatttttggaagttttgtagtttgtgaaactaattgatgaatgaatgtgaggggaaattggtagatttcgtgttgtgctgctactagaccatttcctgacccatgtggcatgggagccatttgattgttattctcattgtggaggttatgagttgatatttccagattttgtgcatgaatgttcaaaatgtttagttctgtttcgttaggacttcaaataggtagaattagttagtgtcttggggctgcatggaagaagattggaagaatttaatttgttacattagaacttcaaataggcattgttgttgtaggctcaaacttttacattgtactgttatcttcatctactctgactgatgtccaaagaatgcacatgcccagctcgtccctgtctcttgatgctttcggtttgttcatagtttatataaattcttgggtctcattagctatgtactataatttaatagctagtgaccaccctgatgtttctgtagcatgctatcagtgggtatatcgacctgtttatgttgcaattgatgaccatttcacatcttgttctgtcatgtgcattccacgatgtttctttcattgtgatgaagatgaatacagtaacaagatgcaaatcaaaacattgttttctgtgtgaatcatatatcctctctatagtggtttacaaacacccctgggtcattaggaaagcacccaaagttttacttgctattgaatatggtttaaacatagctttttcataccagtttcaggcataagtgtatattatgtatgttcggtaaaaataagtgtatatatttattccgtatgtgctaatcttaggagcttgtgatcccagagaatttattctaatattcgataagtagtatatgcatatggttaggggtgaaaacggtaacggtaattaccggccgaccggcgttcattttcgactttctaccggccgagccatatggaaatggtaatcgaccgaaacaaaaatggaaatggtaaaaaatatggaaatgaaaacggaaatggttttgctgttataccgatcgtttccgtatttactgtattcttgcggaaattaccgtttcttataatatggtaattaccgtattctaaatatgtcgatattataggacatgtttatacttgacccacagcttatagattgaatgactcttcaataaaatctctaacttttgtacatggctaaaatgaagttaatttataatttatatagtataagcttgaatttatgtatatatataacatacttatgtaaagttaaatatatgtttttatagtttaatgtttccgtatttgttaccgatttccgatctgtaccgacatgtttccgtccgtattgttccgtttccggttttccgatatttccgatatcgttttcgtttccgactttaccgtttccgatttcgtttccgagaaaaatatggttacggaaatggttgaggctgttttccgatcgtttccgaccgttttcatccctacatatggtatagaatttatttgagaatcttctccatatttttgggtggtgcacatgtattgtacggttgagtctaacaatgatgttatggcacacatttatacacagacttgcttgtcctcacaaatcaagccattagtatgaatcaccaggtcagagctcagagcataaatttctaagcctaagagcacctgtcagataagcaggatttagtcttttacgctagctcaatcgtatcttagtgacaatttaggtctggtttggattggcatcaatctgcggcctactaatattctggttgctttgatggtaccttgttgatatttggattgaagccaatttttgcctacaatacgaaaatttgactaatagctagtaacaaatctactctaccaaatttgctagtgccaaaacttgcctaggtttcggcactaccaacattttggtagggctttaaaccaaaccgacccttaaagtcatgtcaagatgctgaaacaaacaaaccatccctttttcctaatgcttttgataggcttctgtataccacattgaccaaaaggcaatcaacaaaatcacgtttggcttattatgtttgccatgtcttactacagaagataacaggcttggtttaagggggctagataaatatgtaattgatctccagtgttttttttgttcaagttgagtgaagatgacctgatcctgttgggaaaataaattggattaagtggatttgatagagtgatattaattttaatttgatgcaggtgcttttctgggaggtgtaaccaactaaattcctatgctaccttctggttgatggccgtccctcctgttgaatcagaaacaagaagtgaagaaacagataatttccctttacttgcagaccacatggaaaatactggacatcatgcacatgcagttgatatcccatgggattcttcaccatcgacatctcgccgagataatcataatggatttgatcaattacctcgtatcttagaaggttctcctgggacatctactccatctaactctcagaatggtcctctagcaagaagagatgataatcgtggtcgtcgtcagcctagtcccttgaattctggttgctggatctcagttgagctagttgtaaatgttagccagatcatagcagctatttgtgttctgtcagtatcaaggaatgagcatccacactctccgttatttgagtgggtcattggttatacagtaggttgtactgccacgctgcctcatctttactggcgctatctccatcgcaacctcccaaccactgggcaagagccaacagttcagaatatccctccaaacaacacccctgaagctaattcatatggagtaaccggcacaaatggagtctcaagaaacaatgaggcaacagtaaatccaaggtaaccgattcttccaactgaagtcttttttttgtttttgaaattgatttgtctgcatatatctagtatctagactctatggtacaaggcatgttaaccaactgcactagtaattatcacaatttaagatattaggcctacacaggaataactaaattctgttggttgatcacaactaaattcgtatagaaatatttgatcactgcactcctatcagaagttctgttattcaggttatatttcatatgcaataaactacgtatggtcttccagagatttaagtttcccatgttttattaacttttcctttagtccaagttctgagctacagtcttaccatttgttttaggttccaagcttttgctgatcacttcaaaatggctctggactgtttctttgctgtgtggttcgttgtgggaaatgtatgggtatttggtggacattcttctgctcacgacgcgcccaacttgtacaggtatgatgcttgcctacattgtgttgtagatctgtgacttaaccaaaaatttatttggatgtttcatcatgcaatatttcttccccaggttgtgtattgccttcctcacattcagctgcatcggctatgctatgcctttcatcctctgcgcattgatatgttgctgcctaccctgcataatctctatcttgggatttcgggaagatctaaaccaaaacagaggagctagtgcggaaacaatcaatgccttgggaacatgcaagttcaagtcaaagaaaactcgtgatggagatggaaacgaagttggtgtcggtgttgtggctgctggaacaaacaaggagcgagtcatttctgcagaagatgctgtgagtttttctcccagactcttttatacttcacaactaaaatctagttatctcctcttggtgctcttagtttaaaattaaggggtgctcttggaattgcaggtctgctgcatctgcttggccagatatgtcgataacgatgatctccgagagctcccttgtgcgcacttcttccacaaggattgtgtggacaaatggctcaagataaacgcgctgtgccccctttgcaaggctgagatagatggtgtctccacaagtgctccagccattggctttgggcgtcgccacagcgacaacagggtaggaaacgacattgaatcacaactataactctcttcccacttcgttggcagcgtggatcacgcctttgatgaggccttccacacatcaacctgtaaattatagaggtagacatcaagatgtaaagggtcctcttacgatccaacaaagttcttttctgaatgactactgcctccactgtcagtatatattgcttccagcatttgtttcttctc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os05g0179000, RefSeq:Os05g0179000