Os04g0432300

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Structured Information

Gene Name	Os04g0432300
Description	Double-stranded RNA binding domain containing protein
Version	NM_001187018.1 GI:297723166 GeneID:9267691
Length	11721 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os04g0432300, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 4
Location	Chromosome 4:21455923..21467643
Sequence Coding Region	21455923..21455931,21456694..21456831,21456911..21457009,21457938..21458021,21458145..21458201 ,21458471..21458560,21459838..21459990,21460091..21460192,21460280..21460438 ,21460915..21461098,21461212..21461267,21461294..21461332,21461399..21461464 ,21461612..21461669,21461779..21461879,21462145..21462231,21462939..21463061 ,21463161..21463240,21463733..21463942,21464035..21464146,21464585..21464803 ,21465232..21465602,21465742..21465841,21466420..21466628,21467108..21467213 ,21467311..21467643
Expression	GEO Profiles:Os04g0432300
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008397:21455923..21467643 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008397:21455923..21467643 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atggcgccgaagaagaagcagcagcagcaggcgccgaagcagaagcagaagcccaagcactcctccacctcctcctcgtcgtcctcggccggcggcggcgccgcctccgccgcgccgcggctccagatctcgtcggagaacgagcgccgcctccgccgcctgctcctcaactccggagcgaccgcggcgccagcgcccgcgccggcggatgctcccgcggcgcgtgccgagtcgagggagcagaaggcgcggcggctgcgcggggtgtacgacaagctctccctcgagggcttctcctccgcgcaaatcgagcaggcgctctccgcgctatcggattcggctacgttcgagtcggcgttggattggctgtgctttaatctgcccggcgatgagctccccctcaagttctccagtggcaccgcttcctcttctggggctgggcctttagggacagaaggctcagttaaggtagtatcaacagcgaaagacaattgggtgccacagagtcgtgagtcagaggaggtgcaggggagcaatgagaggttggaaattataattagcaggcggcgagaagaagatgtgacattggatgacgggcaatcatcacaagctgcatggattcggcagtacatggaacaacaagaggaggaagatgatgtgaattctaatgattcctacacatgggaagatcactgcccaccaagtttggaaactgctgaggcaaagccaagtaggcgaaagaagaagggtaaacaagcgaaatcctcatctggaaactcaaaggaagatctcagcagttcagataatgtctttccaaattctgatattgcaaatgctgagggtgatctagttgactctggtgcaactggaaagaaatgtgagagtcctgtccatatggatggaggatccagtttggagaaaaaaatgtccaaggatgttgatgaaaccagcacaaaggaggtagaagaagaggaagtagaacttgataacctgttttttgaagactcttctgcttgggaggcagtggctccagaaatactaaaacagcaaaaaatagagaaattatcacatgatggttatgggcatcttcttggaaacatagatgatatatggaagaagggagattctggtaaaatgccaaaggctgttctgcaaaaattctgtcagaaacttggttgggaagcgccaaaatacagtaaaatatctgaaaaggatcgtaaattcatatatgctgttaatgtactgcgtggctctactggtcgtggtaaaagtcggaaggctggaggcttgacaaaagtcgagttaactgaacaagataaagaatatgcatctgttgaggaagcacaaaacagagtggcagcttttgctctatatcaatttttcgctgatctttcattgcgccaattgcttattgaaccatatgcatcacttgttttaagatggcaagaaggggagttatcatcatcatcttcaagggttatggatactgaggatagtcgaagagctggttttgtggataagttgttggatatggatgcgaatacaactccacatcaagttgaggatgcgtcagatggtgctacatctgttgactctaggagcatcgaggacagctactctgttcatgagaagaaagagacctatctggtgaatcgtacaggatcgagatccgcagagcaggtggaaagcacagtgttgaaaaaacatttggaaaataaaatgaagcagtcgagctatttgaaaatgctggaagcaagagcttctctaccaatctctagattcaaagatcattttctacagttactgaaagagaatgatgtgattgttgtttgcggagaaaccggatgtgggaagacaactcaggtgccacagtttattttggatgatatgattgaatctgagcttggtggttactgcagcatagtctgcacacaaccccggaggatagcggccatttcagtggctgaaagagtgtctagtgagaggtgtgaatcttctcctggatctaaggattctttggtcggatatcaagttcgtcttgacagtgctcggaatgaaaggacaaagcttctgttctgtaccaccggtatccttcttagaaaattatctgggaacaatgatttaagtgatgttactcatgtagtagtagacgaagtacatgaacgtactattttgaggaagtccatgaatgatcctgatttcccagttttcaggagtcttgttgagaagcgttctaatcaaccaggaaggaagttgaaagtgattctcatgtctgctactgttgattcaagcctatttgctcggtattttggagattgccctgtaattaatgttgaagggagaacacatccagtttcatctcacttccttgaggatgtttatgagaaaatggagtactgtcttgctttggattctcctgcatcaggagcatactttcaacagcatggagaaaagtggaagaatgctagtagcacagtgaataatcgacggggaaagaagaaccttgttttatcctcatggggggatgagtcagtgcttactgaagattatgttaatcctcattatacaactgattgctatcagtcatacagcgaaaggaccaaccaaaatctgaaacgcttaaatgaagatgtgattgattttgatctgttggaagacttgatatgctatattgatgagaactgcccccctggcgctgttcttgtttttcttcctggagtcgcagagattgatatgttgattgatagattatctgcttctgttagatttggaagggaatcatctgattggattcttcctttgcattcactgcttgcacccactgatcaaaggaaggtgttccagtcaccaccagaaaacattcgcaaggtgcctgagatgctgcggatgccattgactgagctgtgtttgcaaataaaatcacttcatctgggtggcataaagtcatttcttttaaaggccatagaaccccctaaagaagaagctatctcctctgctattgacttgttatatcaggttggagcatttgaaggacatgaggaattatcacctcttggctatcatttggccaaattgccagttgatgttttgattggaaagatgatgctctatggtgctatctttggctgcttatctcccattctttctgttgctgcttttctgagttataaatccccattcatctctccaaaagatgagaagcaaaatgtggagaaggcaaaggcttcattgatgaatgaaaaccttgatggatctgcttctacagcagataataaacaatctgaccacctgttaatggttattgcatacaataagtggtctcgcatactaagagagatctgctag</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MAPKKKQQQQAPKQKQKPKHSSTSSSSSSAGGGAASAAPRLQIS SENERRLRRLLLNSGATAAPAPAPADAPAARAESREQKARRLRGVYDKLSLEGFSSAQ IEQALSALSDSATFESALDWLCFNLPGDELPLKFSSGTASSSGAGPLGTEGSVKVVST AKDNWVPQSRESEEVQGSNERLEIIISRRREEDVTLDDGQSSQAAWIRQYMEQQEEED DVNSNDSYTWEDHCPPSLETAEAKPSRRKKKGKQAKSSSGNSKEDLSSSDNVFPNSDI ANAEGDLVDSGATGKKCESPVHMDGGSSLEKKMSKDVDETSTKEVEEEEVELDNLFFE DSSAWEAVAPEILKQQKIEKLSHDGYGHLLGNIDDIWKKGDSGKMPKAVLQKFCQKLG WEAPKYSKISEKDRKFIYAVNVLRGSTGRGKSRKAGGLTKVELTEQDKEYASVEEAQN RVAAFALYQFFADLSLRQLLIEPYASLVLRWQEGELSSSSSRVMDTEDSRRAGFVDKL LDMDANTTPHQVEDASDGATSVDSRSIEDSYSVHEKKETYLVNRTGSRSAEQVESTVL KKHLENKMKQSSYLKMLEARASLPISRFKDHFLQLLKENDVIVVCGETGCGKTTQVPQ FILDDMIESELGGYCSIVCTQPRRIAAISVAERVSSERCESSPGSKDSLVGYQVRLDS ARNERTKLLFCTTGILLRKLSGNNDLSDVTHVVVDEVHERTILRKSMNDPDFPVFRSL VEKRSNQPGRKLKVILMSATVDSSLFARYFGDCPVINVEGRTHPVSSHFLEDVYEKME YCLALDSPASGAYFQQHGEKWKNASSTVNNRRGKKNLVLSSWGDESVLTEDYVNPHYT TDCYQSYSERTNQNLKRLNEDVIDFDLLEDLICYIDENCPPGAVLVFLPGVAEIDMLI DRLSASVRFGRESSDWILPLHSLLAPTDQRKVFQSPPENIRKVPEMLRMPLTELCLQI KSLHLGGIKSFLLKAIEPPKEEAISSAIDLLYQVGAFEGHEELSPLGYHLAKLPVDVL IGKMMLYGAIFGCLSPILSVAAFLSYKSPFISPKDEKQNVEKAKASLMNENLDGSAST ADNKQSDHLLMVIAYNKWSRILREIC</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>11713..11721#10813..10950#10635..10733#9623..9706#9443..9499#9084..9173#7654..7806#7452..7553#7206..7364#6546..6729#6377..6432#6312..6350#6180..6245#5975..6032#5765..5865#5413..5499#4583..4705#4404..4483#3702..3911#3498..3609#2841..3059#2042..2412#1803..1902#1016..1224#431..536#1..333#atggcgccgaagaagaagcagcagcagcaggcgccgaagcagaagcagaagcccaagcactcctccacctcctcctcgtcgtcctcggccggcggcggcgccgcctccgccgcgccgcggctccagatctcgtcggagaacgagcgccgcctccgccgcctgctcctcaactccggagcgaccgcggcgccagcgcccgcgccggcggatgctcccgcggcgcgtgccgagtcgagggagcagaaggcgcggcggctgcgcggggtgtacgacaagctctccctcgagggcttctcctccgcgcaaatcgagcaggcgctctccgcgctatcggttcgtgctcccaagcactcgttgagcacccgccgtgcgatggaatttggtcgtttctgttgttgatgatgatttggggtttaatttttgggtgcaggattcggctacgttcgagtcggcgttggattggctgtgctttaatctgcccggcgatgagctccccctcaagttctccagtggcaccgcttcctcttctggggctggtatgcggtttcgcgggtttagggcttagcgcttcgtgtctactgtctagtctcatttctgtttgaactgtgaactctgccatctctgcgtgtgcatttgccagcatcaacatgtttgtcagatcatatgcatgaagttgcaatatatgcttctgcgcatacaatgatttgcctgcgttctgtgctttactggttccaagtttgaagtagtgctttacatattttgctgcatttgtatttgcgctgcagttattctgcattttaggttctgcacgtatgcacacacccatgaactgcagggttggtgtgctcatgcttgtgttttctcatagaggcatggattggttcgaaacttttaagtgttgagtgttaagtctatcatgttttggctgtgtatgctttagagtctgcgttttataaatccattatctaaaaaagaagtctatcatgtttaaatcagctgttcattacttttctagggcctttagggacagaaggctcagttaaggtagtatcaacagcgaaagacaattgggtgccacagagtcgtgagtcagaggaggtgcaggggagcaatgagaggttggaaattataattagcaggcggcgagaagaagatgtgacattggatgacgggcaatcatcacaagctgcatggattcggcagtacatggaacaacaagaggaggtataggtgacagatgttcaaacaagtgattttgttccttggattgctgcatcaaatattgaatatcgatactcttttaatgactgtttaaatttttaatcttgtgcaattttgctttatctgacaagtattctattttcactccttgaaaatatcttgtattgttttaatatcaagctggtaacacaagatagtaatactttgggactctctctccgtcacaccaatttaaatattttatcatcttttaactcttcattaattaaaatgctctccaatatgcgtgttcgactgtttattttgcagtaatatgtttgtaaacatgataggaagcgttatgttgcgaacgtaattatagtgacataccttattacatttgtgattgaaatattctaatgtactgaatgccgtttaaagttagtgacaaacatcttatgcatttcaatccactacgaattggatggtgctccgctaaacttcgagattaagcttattcaatgtatctctcttctttttcttttaattcctgtttaatgtatattggtgcaattattcctttttcttgctgctgatgttaggaagatgatgtgaattctaatgattcctacacatgggaagatcactgcccaccaagtttggaaactgctgaggcaaagccaagtaggcgaaagaagaagggtacacataatacttgttgaaggatatcgattctatagtgaaccatatgaattttctcttctaattgtgactaggttttgaatgcttatatgtagttcaggcaggtttatattatgccttcttgtttgattgttttcaggtaaacaagcgaaatcctcatctggaaactcaaaggaagatctcagcagttcagataatgtctttccaaattctgatattgcaaatgctgagggtgatctagttgactctggtgcaactggaaagaaatgtgagagtcctgtccatatggatggaggatccagtttggagaaaaaaatgtccaaggatgttgatgaaaccagcacaaaggaggtagaagaagaggaagtagaacttgataacctgttttttgaagactcttctgcttgggaggcagtggctccagaaatactaaaacagcaaaaaatagagaaattatcacatgatggttatgggcatcttcttggaaacatagatgatatatggaagaaggtcatgtgcatctgcaccactttatattaacgcccctcctcctattgtcatatttatctttagaattttggaggtgtttttgctgtcttggttcttgattataatgccgcttctctcaattttgttagagaaaccttgttgtatacggagtaggatagttggggtggcctttatgtgctgcaatgttccatgctacttgctcctaaaagctgcatataaaccattcaagtttcagtaaattaccgtactagacagtgagaagagaacacaactaacatatctcacttgtaacgatatttgaggagatccattatttgggcaatgggcagaatgtaacaattcgaaatattgctaaataaacaatgaaccaacaaagctgtttaatctctggcgtgcatttggttctaactatttattgtggtctgcagggagattctggtaaaatgccaaaggctgttctgcaaaaattctgtcagaaacttggttgggaagcgccaaaatacagtaaaatatctgaaaaggatcgtaaattcatatatgctgttaatgtactgcgtggctctactggtcgtggtaaaagtcggaaggctggaggcttgacaaaagtcgagttaactgaacaagataaagaatatgcatctgttgaggttagtattgacaaaatgaacactctgttactttctaaaatatctcaaaaataaaaacaattcgtttttatttcaatgagaaatgcaagtcttcatatatacagatgtcaatggctccatgcactatcctatgcatccaaagtgctcaatgttctgtgcaagaacatcaaaattcttagaagatggggcgttgctttaattttggaggcacaccaatccccaatgcgcattggatggatatgatagtgcatgttaatctgtttgggaagctatcccatttccactgcttattcagatttatttcttcatttttacctttcatgcttgttagtattaactattctgatttcataatactgagaaaagaatatacatatcatcattccttgtctagaattgtatttctgaacaataaacatttgctgaattggtcgacaggaagcacaaaacagagtggcagcttttgctctatatcaatttttcgctgatctttcattgcgccaattgcttattgaaccatatgcatcacttgttttaagatggcaagaaggttagataaattgatcttgctttcttctgtgatgaatcacgatttgttggggcctttgggctacatattacatggttttggcaaaaaagcaggggagttatcatcatcatcttcaagggttatggatactgaggatagtcgaagagctggttttgtggataagttgttggatatggatgcgaatacaactccacatcaagttgaggatgcgtcagatggtgctacatctgttgactctaggagcatcgaggacagctactctgttcatgagaagaaagagacctatctggtgaatcgtacaggtaagctttgaataaaatcatcatttcagttttttgtctttatgaataatgtgtgaaacaatcatgatttggatggtgaccattttttaccttccataaccttttaatctgtcactgatgacagacttatcttctccattctatcaactttctcgacaccaatgaggtttctcctatgtagaatctattttcacagaattataacaccttttagctatatttccatttggaatcttgctttatttctcttgctcacaacatgcatgccgtgtattttgacctcattagttctctgagatattcatgctatatctttctttttcttctaattgaaataatcttttttttggttttaactgaataatgatcaaacgaatgtattaagtatttttcctttatagattattccttcttgcctctactagactgctaataatgtaagtgtaagtataattcctgtcaggatatctaatgtggcttttctatgatcaggatcgagatccgcagagcaggtggaaagcacagtgttgaaaaaacatttggaaaataaaatgaagcagtcgagctatttggtaagagtgatatacattctactatactgttcttctaatttaataccttttcttttgcctttgactctttgtgacgaattgcctcatctttgtattcagaaaatgctggaagcaagagcttctctaccaatctctagattcaaagatcattttctacagttactgaaagagaatgatgtgattgttgtttgcggagaaaccggatgtg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External Link(s)	NCBI Gene:Os04g0432300, RefSeq:Os04g0432300