Os04g0492300

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Structured Information

Gene Name	Os04g0492300
Description	Similar to DNA-directed RNA polymerase II largest chain
Version	NM_001059710.1 GI:115459149 GeneID:4336254
Length	10874 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os04g0492300, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 4
Location	Chromosome 4:24991781..25002654
Sequence Coding Region	24992143..24992213,24992328..24992457,24992619..24992768,24992855..24993010,24993156..24993338 ,24993471..24993583,24993680..24993779,24994434..24994634,24994710..24994858 ,24994933..24995074,24995160..24995300,24995407..24995595,24995931..24996144 ,24996507..24996600,24996980..24997214,24997551..24997742,24998228..24998326 ,24999018..24999221,24999303..24999578,24999815..24999962,25000254..25000405 ,25000762..25000917,25000995..25001111,25001187..25001266,25001482..25001686 ,25001794..25001996,25002191..25002242
Expression	GEO Profiles:Os04g0492300
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008397:24991781..25002654 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008397:24991781..25002654 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atggcgcggccggaggagaagctgcggtgcacgaaggagcccttcatcgaggatgtcggcacgcggaggataaagagcatccggttcagcatgttctcggggaacgaggtgcgccaatccgcggaggtgcaggtttggaacagccggatctacaaccatgagatgaagccggtgcccaatggattgctcgacacgcggatgggtgcggcaaacaagcttggggagtgcagtacttgccatggttcatttgctgaatgcccgggtcattttggttacttgaagctcgcccttccagtttttaatgttggattctttaactgtattttggatgtattgaagtgcatctgcaagagctgcagcagggttcttcttatggagaaagatcggctagagtttttgaagaaaatgagaaatcccaaagcagatccgctacagaaaagtgctatcatgaaaaaagtgagggacaaatgcaaactatcccgttgcccctggtgtggattcataaatggtgttgctaaaaagggcagagcagggttgattattcttcatgattgtagcaaaacattggatggaagcacagaagagcttcgggacgcactatcacataagaaagagaaactatctattagtgctgttcgcatgctagaccctgcaattgttctatctcttttcaaaagaatgaccgatgaggattgtgagttgctaaacctcggtgataggcctgagaaacttattgtgacagagattgcagtgccacctgtacctatacgtccttctgttttcgtggctggtggaagaatgagcaatgaagatagcattaccgtcatattgaagagtattgctaatactaattccatccttaaggagaaccttcaaactggtggtcagttcatgaagtgctttgattgctggcaacaccttcaacttcaagttgttgaatatatcaacagtgacgcaccctctcttcccgagtcacaacatcgaggccttgttcagcgactcaaagggaagacaggccgatttcgtggtaacttgtctggaaaacgtaccgagtacactggaaggactgtcatttctcctgatccaaacttgagaataacagaggtggctattcccatcctgatggctcgagttttgacttatcctgaaagagtttcatactataacatagagaagctgcgtcagtgtatacggaatggtccacacaaacatccaggggcaaatttcatcatacaacctgatggaacaaagctgcacttaaagtattgcgatagaagaattgctgctcgagatttgaagtatggctgtgtagtcgaaaggcatttagaagatggagacattgtcctcttcaatagacaaccgagcttgcatagaatgtcaattatgtctcacagggctaggattatgccctggagaacactaaggtttaacgagtctgtctgtaacccatataatgctgattttgatggcgatgagatgaatttgcatgttcctcagactgaggaagcccgcactgaagcgcttatgctcatgggggttcagaacaatttatgtaccccaaagaatggggaaatactggttgcatccacgcaagactttttgacttcctcttttctggttacaagaaaagataacttttatgacaggtcgtcattttctctcttatgttcatatcttggtgatgcaatggaaaacattgatttgccaacacctgctctgattaagcctattgagctttggactggtaaacaactcttcagtgtgttagtacgtcctaacgcatgtacaaaggtgtttctgaatcttactgttaaagagaaaatttataagactcctaagggttcaactctggaacctgaagcaatgtgtcccaatgatggttttgtctacttccgaaacagtgaacttctatctgggcaagttgggaaggccactttaggtaatgggaataaggatggcatgttctccactcttgtaagagattataattctcatgctgcggcaagctgtatgaaccgcttggcaaaatttagtgcaagatttatagggaaccatggtttctcaattggtgtggacgatgtccaaccgggagaacatttaaaccaagagaagaaaatgaaaatagatggagggtacaaagattgccatgatcttattgcttcctattccaaaggtgcactccgtttgcagcccggttgcaacgcagcccaaacattggagcaaagtataactcgtgtactgaatgaaatcagagaagaagctggaaaagtctgtatgaatacacttcactggaggaacagcccattgatcatgtctcagtgtggatctaaaggttctccaatcaacattagtcagatggttgcatgtgttggccaacaatcagttggagggcgtcgtgccccgaatggcttcatagatcgaactcttccccactttcctataaattcaaagactcctgcagccaaaggctttgtcgctaattctttctatactggcttgactgccaccgaattcttcttccatacgatgggtgggcgagaaggtcttgttgatacagcggttaaaacagctgaaacaggatatatgtcccgcagattaatgaagggattggaagatctctcagttttctatgatcagacggtccgcaatgctagtggtggtattgtacagttcctctatggagatgatggcatggatcctgcaaagatggaagggaaagatggaaagcccttaaatttggatcaattgtttatgaaagtcatggccacttgtcctcaaaggggacagaatacattatctccaggtgaaatcttacaaattttaaatgacaagctctctgaacatgatgcctcctctgatgatggttgtagcgaaaagttcaagcaactgttaacgtattttcttgaggatcgtataaaattgctgaagagcacaaggagagcgcttctcctagatgaagatcatgttggagagaggcactccagctttgaagaatccattgctgctaatatttctggtatatctgtgaagcaactacaggttttcttggacacatgtttatctcgttaccacttgaagaaaattgaagccggagcatcaattggggcaattggggctcaaagtattggagagcctggaactcagatgacattgaaaactttccattttgcaggagtagctagcatgaatgttactcttggtgttcctcgcatcaaggaaattatcaatgctgctaaaaagataagcacacctattatcactgctgagttactttctgagaaggatgtgttgtctgcacgcattgtgaaaggctctatggaaaaggcagtgctgggtgaggtggctgaagccataaagattgtgttgaaatcaagtcaaccaaacttggttgttaaactcgatatgcaacgtatagaagccctgcacatgggcatctctgctgactctgtgcagctgtcaatattgaatcatccaaaaataaagctaaaatctgagcatgttcgtgttattgataaatccaagttgagaatttatccagctggaatagataagtccaaacttctatatgagttacatcatctcaaatccatgcttccaaaagtgatcgtgaagggtattccaactgttgaaagagctgtgatcagcgaaactggtgaagaaaatgacaaaagatacaagttgttggttgagggaacaaatctcttggcagtaatgggtactccaggagttgatgctatgaaaacaaaaagtaaccacatcatggaagtgaaccgaacactcggaattgaagctgcgaggagatctattattgatgaaattcagtatacaatgaaaagtcatgggatgaacattgattcgagacatatgatgcttctggcagatttgatgacatacaagggtgaaattcttggcattactagatatggtattgcaaaaatgaaaagtagtgtgctgatgctggcttcgtttgagaaaacagcggagcatctctttaatgcatcatacagtggtcgtgaggatcagatagagggagttagtgaatgcattatcatgggtatacccatgcaacttggcactggtattctcaaagtcagacaaaggcttgaccatttgcctgaatttaaatatcagcctgatccaatattggcgtga</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MARPEEKLRCTKEPFIEDVGTRRIKSIRFSMFSGNEVRQSAEVQ VWNSRIYNHEMKPVPNGLLDTRMGAANKLGECSTCHGSFAECPGHFGYLKLALPVFNV GFFNCILDVLKCICKSCSRVLLMEKDRLEFLKKMRNPKADPLQKSAIMKKVRDKCKLS RCPWCGFINGVAKKGRAGLIILHDCSKTLDGSTEELRDALSHKKEKLSISAVRMLDPA IVLSLFKRMTDEDCELLNLGDRPEKLIVTEIAVPPVPIRPSVFVAGGRMSNEDSITVI LKSIANTNSILKENLQTGGQFMKCFDCWQHLQLQVVEYINSDAPSLPESQHRGLVQRL KGKTGRFRGNLSGKRTEYTGRTVISPDPNLRITEVAIPILMARVLTYPERVSYYNIEK LRQCIRNGPHKHPGANFIIQPDGTKLHLKYCDRRIAARDLKYGCVVERHLEDGDIVLF NRQPSLHRMSIMSHRARIMPWRTLRFNESVCNPYNADFDGDEMNLHVPQTEEARTEAL MLMGVQNNLCTPKNGEILVASTQDFLTSSFLVTRKDNFYDRSSFSLLCSYLGDAMENI DLPTPALIKPIELWTGKQLFSVLVRPNACTKVFLNLTVKEKIYKTPKGSTLEPEAMCP NDGFVYFRNSELLSGQVGKATLGNGNKDGMFSTLVRDYNSHAAASCMNRLAKFSARFI GNHGFSIGVDDVQPGEHLNQEKKMKIDGGYKDCHDLIASYSKGALRLQPGCNAAQTLE QSITRVLNEIREEAGKVCMNTLHWRNSPLIMSQCGSKGSPINISQMVACVGQQSVGGR RAPNGFIDRTLPHFPINSKTPAAKGFVANSFYTGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKT AETGYMSRRLMKGLEDLSVFYDQTVRNASGGIVQFLYGDDGMDPAKMEGKDGKPLNLD QLFMKVMATCPQRGQNTLSPGEILQILNDKLSEHDASSDDGCSEKFKQLLTYFLEDRI KLLKSTRRALLLDEDHVGERHSSFEESIAANISGISVKQLQVFLDTCLSRYHLKKIEA GASIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINAAKKISTPIITA ELLSEKDVLSARIVKGSMEKAVLGEVAEAIKIVLKSSQPNLVVKLDMQRIEALHMGIS ADSVQLSILNHPKIKLKSEHVRVIDKSKLRIYPAGIDKSKLLYELHHLKSMLPKVIVK GIPTVERAVISETGEENDKRYKLLVEGTNLLAVMGTPGVDAMKTKSNHIMEVNRTLGI EAARRSIIDEIQYTMKSHGMNIDSRHMMLLADLMTYKGEILGITRYGIAKMKSSVLML ASFEKTAEHLFNASYSGREDQIEGVSECIIMGIPMQLGTGILKVRQRLDHLPEFKYQP DPILA</aaseq>
Gene 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External Link(s)	NCBI Gene:Os04g0492300, RefSeq:Os04g0492300