Os04g0509300

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os04g0509300

Description

Protein of unknown function DUF283 domain containing protein

Version

NM_001059813.1 GI:115459355 GeneID:4336362

Length

7383 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os04g0509300, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:25872631..25880013

Sequence Coding Region

25872881..25873052,25874123..25874237,25874648..25874984,25875406..25875735,25876197..25876469
,25876578..25877036,25877414..25877623,25877724..25877935,25878411..25878511
,25878691..25879115,25879193..25879467,25879543..25879808,25879916..25880013

Expression

GEO Profiles:Os04g0509300

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008397:25872631..25880013 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>gagaacatttatcaagtggataacaccggtgcttccattagcactgcttgtagtgtatctctactacattgctactgcgacaaccttcctagggatatgttttttactccttccccagtgttcttctacattgatggcatcgagggaataatctgcagactaattcttccaccaaatgctgctttccgtcaagcagatggtcaaccatgtctgtcaaaagatgaagctaagagagatgcatgcttaaaggcatgcgtaaaacttcataaattgggtgctttgacagattttcttctgccgggtccaggttcaagaaagaataaagtatcagtaacaaataattcatcaaacaacaaagttgaagatgatagtctaagagaagagcttcatgagatgttaattcctgcagttctcaaaccttcgggattaaagttggattctttatcgaacttgcatttctactatgttaaatttattcccataccagaagataggcgatatcagatgtttggtctctttgtgatcaatccccttcctgtggaagctgaaacattgcaagttgatttgcatcttgctcgtggcaggattgtgaaagcaggaattaagcatttggggaaaatagcatttgagaaagagaagatgatgcttgcacacaagtttcaagagatgtgtctgaagattctcctggacagatctgagtttacttcaccccatgttaaattgggcaatgatgttacattagaaatcaattcaacattttaccttctgcttcccatcaagcaaaagtgttatggtgatagatttatgattgactggccagcagttgagcgctgtttatcatcaccgatttttaaagaccctatagatgtgtctgtgcatgcctcatattcatcaaatgagtctctgagacttcttgatggaatcttcagtaaaaccgatgtagttggcagtgtagtctttagtccccacaacaatatctttttctttgttgatggcattctggacgaaataaatgcttggagcgagcacagtggtgcaacttatgcagaacacttcaaggaaaggtttcgtattgagctatcacatcctgaacagccacttttgaaggctaaacagatcttcaacctgcgaaatttgcttcataatcggttaccggagaccacagaatcggagggccgtgaattactagagcacttcgtggagttacctccagaattatgctctttgaaggtcattgggttttcaaaagatatgggcagttccctgtccttgttaccttctttaatgtatcgtttggagaatttgctggtggctattgagttgaaggatgtgatgttatcttcttttccagaggcatctcaaattagtgcttctggtatacttgaagcgcttactactgagaaatgtttggagaggatatctttggagcgatttgaagtcctaggcgatgctttcttgaagtacgtagttggacgtcacaagtttattacatatgaaggacttgatgaagggcaattgaccaggagacgttctgatgtagtgaacaattcacatttatatgagttatcgatcagaaaaaaattgcaggtatacatacgggatcaacagtttgaaccgactcagttctttgctccaggaaggccttgtaaagttgtttgcaatactgacgtggaagtgagactacaccagatggatattcatccagataacagagaaaactgtaacctgagatgtacaaggtcacatcattggctgcataggaaagtgattgcagatgttgtcgaatcgcttattggagcatttcttgttgagggtggattcaaagctgcatttgctttcctgcattggattggaatagacgttgattttaataatccagctctctatagggtattagattcaagctccatcaatttatctcttatggactacactgacattgccgggcttgaagaattgataggttacaagttcaaacataagggtctacttctccaagcattcgtacacccttcatttagtcaacattctggaggctgctaccagagactggagtttcttggagacgctgttttggagtatgtgataacttcgtacctctactctacttatccggatataaaacctggtcaaataacagatctaagatcgttagctgttggtaatgattcgcttgcttatgcggcggttgagaaatctatccataagcatcttataaaggattcaaaccatctcacgtcagcaataagtaaatttgagatgtatgtgaagctctccaattcagagaaagacttgcttgaagaaccagcatgtcccaaggctcttggtgatattgttgaatcttgtattggcgcagtgcttttagattcaggcttcaacctgaactatgtttggaaggtaatgcttatgcttctaaagccagtattgaccttcgccaacatgcacactaatccgatgagagaacttcgagagctttgtcagtgtcatggatttgagttaggccttccgaaacctatgaaagctgatggagagtaccatgtcaaagtagaagttaacataaagagcaaaattatcatttgtactgcagcaaatcggaattcaaaagccgctagaaagtttgctgcacaagaaacactttctaaactgaagaattacggttataagcacagaaacaagtcccttgaggagattttgattgttgccaggaagagggaatcagaactgataggatataatgaagatccaatcgatgttgaggctgacatatctgtaaaaatgaagagtccacatatacatgaagagaacataccttttcaaaatacagaaacatctttcactaggagttctaaattccacaatcaaattatagcagggtctggcaaacatgatgtcaataatggaaggaacaatcaacccaagttggcaacacagagtggtcgtctgcctagtgaagcaacagagaaaagcaataaaaaggtgtatcatggtgacatggtacacaaaacagcaagatcattcctttttgaactatgtgctgcaaattattggaaacctcctgaattcaagttatgtaaagaggaagggccaagccaccttcggaagttcacttacaaggtggttgttgagatcaagggtgcttcggcgacccttttggagtgtcatagcgatggtaagcttcagaagaaggctgcacaagagcatgcggcacaaggggcgctctggtgtctcaagcaacttgggcacctaccaaaagaagaggacgttcgtgtatag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>ENIYQVDNTGASISTACSVSLLHCYCDNLPRDMFFTPSPVFFYI DGIEGIICRLILPPNAAFRQADGQPCLSKDEAKRDACLKACVKLHKLGALTDFLLPGP GSRKNKVSVTNNSSNNKVEDDSLREELHEMLIPAVLKPSGLKLDSLSNLHFYYVKFIP IPEDRRYQMFGLFVINPLPVEAETLQVDLHLARGRIVKAGIKHLGKIAFEKEKMMLAH KFQEMCLKILLDRSEFTSPHVKLGNDVTLEINSTFYLLLPIKQKCYGDRFMIDWPAVE RCLSSPIFKDPIDVSVHASYSSNESLRLLDGIFSKTDVVGSVVFSPHNNIFFFVDGIL DEINAWSEHSGATYAEHFKERFRIELSHPEQPLLKAKQIFNLRNLLHNRLPETTESEG RELLEHFVELPPELCSLKVIGFSKDMGSSLSLLPSLMYRLENLLVAIELKDVMLSSFP EASQISASGILEALTTEKCLERISLERFEVLGDAFLKYVVGRHKFITYEGLDEGQLTR RRSDVVNNSHLYELSIRKKLQVYIRDQQFEPTQFFAPGRPCKVVCNTDVEVRLHQMDI HPDNRENCNLRCTRSHHWLHRKVIADVVESLIGAFLVEGGFKAAFAFLHWIGIDVDFN NPALYRVLDSSSINLSLMDYTDIAGLEELIGYKFKHKGLLLQAFVHPSFSQHSGGCYQ RLEFLGDAVLEYVITSYLYSTYPDIKPGQITDLRSLAVGNDSLAYAAVEKSIHKHLIK DSNHLTSAISKFEMYVKLSNSEKDLLEEPACPKALGDIVESCIGAVLLDSGFNLNYVW KVMLMLLKPVLTFANMHTNPMRELRELCQCHGFELGLPKPMKADGEYHVKVEVNIKSK IIICTAANRNSKAARKFAAQETLSKLKNYGYKHRNKSLEEILIVARKRESELIGYNED PIDVEADISVKMKSPHIHEENIPFQNTETSFTRSSKFHNQIIAGSGKHDVNNGRNNQP KLATQSGRLPSEATEKSNKKVYHGDMVHKTARSFLFELCAANYWKPPEFKLCKEEGPS HLRKFTYKVVVEIKGASATLLECHSDGKLQKKAAQEHAAQGALWCLKQLGHLPKEEDV RV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>6962..7133#5777..5891#5030..5366#4279..4608#3545..3817#2978..3436#2391..2600#2079..2290#1503..1603#899..1323#547..821#206..471#1..98#gagaacatttatcaagtggataacaccggtgcttccattagcactgcttgtagtgtatctctactacattgctactgcgacaaccttcctagggatatgtatgtcaagattttttttttttgctcttcagtctgtcaccaactcgccatgacaatgatttattgattagttctttgcgatgctaatataactcctttttatgaaggttttttactccttccccagtgttcttctacattgatggcatcgagggaataatctgcagactaattcttccaccaaatgctgctttccgtcaagcagatggtcaaccatgtctgtcaaaagatgaagctaagagagatgcatgcttaaaggcatgcgtaaaacttcataaattgggtgctttgacagattttcttctgccgggtccaggttcaagaaagaataaagtatcagtaacaaataattcatcaaacaacaaagttgaaggtattttcacttgttcatacagtaccataagcgcataatgctggctctggcttaactcttgtttccttgtttcagatgatagtctaagagaagagcttcatgagatgttaattcctgcagttctcaaaccttcgggattaaagttggattctttatcgaacttgcatttctactatgttaaatttattcccataccagaagataggcgatatcagatgtttggtctctttgtgatcaatccccttcctgtggaagctgaaacattgcaagttgatttgcatcttgctcgtggcaggattgtgaaagcaggaattaagcatttggggaaaatagcatttgagaaagagaaggcatcatcctgctcatctgttcaattgataacacatgattgtttgttggatattatttaatattcttttattttcagatgatgcttgcacacaagtttcaagagatgtgtctgaagattctcctggacagatctgagtttacttcaccccatgttaaattgggcaatgatgttacattagaaatcaattcaacattttaccttctgcttcccatcaagcaaaagtgttatggtgatagatttatgattgactggccagcagttgagcgctgtttatcatcaccgatttttaaagaccctatagatgtgtctgtgcatgcctcatattcatcaaatgagtctctgagacttcttgatggaatcttcagtaaaaccgatgtagttggcagtgtagtctttagtccccacaacaatatctttttctttgttgatggcattctggacgaaataaatgcttggagcgagcacagtggtgcaacttatgcagaacacttcaaggaaaggtaataagtcaattattatccgtgctcaccttcctggtttacatgtttttttaatgggattttactaaataaagtacaacattgcaatacctctattgagcattctttaaggtagatatagcaacacaatcaagtttaagagctttatacatgtcctgatgaacttatgcattaattaggtttcgtattgagctatcacatcctgaacagccacttttgaaggctaaacagatcttcaacctgcgaaatttgcttcataatcggttaccggagaccacaggttattccgttgtcccaccgtaacaagacaccttattcattacttctgattattatgacatgataaaaaatgtaatcagtatatcattatgctaccaagaatgttttgtcatccattagaccacagctcagaaagagcataataaattttatataactacatatatgtcgcggagaagttgctttgtaaacttctattatttattgtttcaaaattattgaactgcttgtggattgctttagagtttggaaactgcttgggaatcagttggatctgttatttttcctatttccttctccggcttttgtatactgggattactatagtagactagtagtacatttataatcttgggacccaatgcattactgaatcctattttgaatatcttactctgctgtgaatctttgcatggttctgatccaggtatagtacttctaatgttgttacatcttttgttattattatttttaagaatcggagggccgtgaattactagagcacttcgtggagttacctccagaattatgctctttgaaggtcattgggttttcaaaagatatgggcagttccctgtccttgttaccttctttaatgtatcgtttggagaatttgctggtggctattgagttgaaggatgtgatgttatcttcttttccagaggcatctcaaattagtgcttctggtgtaagttgcaccatcttttgtacctttgatcctgaacatctagtttgaatttgcttatccatgccgaaaatagttgtgatcttagacgggttcatttcagatacttgaagcgcttactactgagaaatgtttggagaggatatctttggagcgatttgaagtcctaggcgatgctttcttgaagtacgtagttggacgtcacaagtttattacatatgaaggacttgatgaagggcaattgaccaggagacgttctgatgtagtgaacaattcacatttatatgagttatcgatcagaaaaaaattgcaggttagttaaccttgaacccatttttttattgctaagttgtatgatctacaattctaccagaatcatcatattctgcactatctggctctttcattatgatctactacctcggtaccaaaatataagcatttctggctctgaatctagtgtccagattcagagctagacatgcttatattttggggcggaggtagtagcaatattgacaaacattttgtgacacttgtgatctattaattttgtctgcttatttatacaacggttccctttccgtttatttttagatggattccttttatcgctgtagaagatacaactttcctgtcaagtatttattgcaaaattcttaatcagcaatgctttctcgtgaaatttaggtatacatacgggatcaacagtttgaaccgactcagttctttgctccaggaaggccttgtaaagttgtttgcaatactgacgtggaagtgagactacaccagatggatattcatccagataacagagaaaactgtaacctgagatgtacaaggtcacatcattggctgcataggaaagtgattgcagatgttgtcgaatcgcttattggagcatttcttgttgagggtggattcaaagctgcatttgctttcctgcattggattggaatagacgttgattttaataatccagctctctatagggtattagattcaagctccatcaatttatctcttatggactacactgacattgccgggcttgaagaattgataggttacaagttcaaacataagggtctacttctccaagcattcgtacacccttcatttagtcaacattctggaggctgctaccaggtcagagttgcccctctctctctctctctctctctctctctctgattgcacaggtgctgtgattcttgatagttgctcacctgctatgttcttttcatttctggtcagagactggagtttcttggagacgctgttttggagtatgtgataacttcgtacctctactctacttatccggatataaaacctggtcaaataacagatctaagatcgttagctgttggtaatgattcgcttgcttatgcggcggttgagaaatctatccataagcatcttataaaggattcaaaccatctcacgtcagcaataagtaaatttgagatgtatgtgaagctctccaattcagagaaagacttgcttgaagaaccagcatgtcccaaggtattgacgttattgcagagatttttttccatctgcacctttgtagtaacccttttttagccgagaggaagaaagaccatggtcttgtggttgctccctctgtcccacaaaactcaacctagtacttgatgttgatgcatcatagtactacaaatctggacatgtctctgtctagattcctagtactaggatgtgtcaatatccaatactaggttggctttttatgggacggaaggagtactcctcaaggatactgtttaatattcaatatgataggggagatttataagttctacaaaatgagcaaaagtgttatcaataattgcaagtgtattagagaattattaatcatagctcattaccatgattgtgatcttttctgtaagcaattagttatatgtaattgattgattgattttttttatggcaaaagcttataagttttatctacaacaatacaggctcttggtgatattgttgaatcttgtattggcgcagtgcttttagattcaggcttcaacctgaactatgtttggaaggtaatgcttatgcttctaaagccagtattgaccttcgccaacatgcacactaatccgatgagagaacttcgagagctttgtcagtgtcatggatttgagttaggccttccgaaacctatgaaagctgatggagagtaccatgtcaaagtagaagttaacataaagagcaaaattatcatttgtactgcagcaaatcggaattcaaaagccgctagaaagtttgctgcacaagaaacactttctaaactgaaggtacaattttgttcccttagcattttcttctgcaattaccatgcaacacgaatgctttgctttcagttagctgcacgaagcactctctgtagtctatacagaagatatattttttgtgatttttccatttgctttacttttttgcgggaacactatttattttattattagaatgtgagtatcagaacctcagccattacaacgatctattttattttgcttaattgttgacatgaatgtgaaagatcattgatttaatagattggaaagaaactattcattgtgttcattgctttccagtccaacttgccaaatttacacaatatctctttgttgtttgtgttaatctgtccattcaaataccctgtttcttaaaatgcatgccacaaccagcttactggtccttttgtaaattatgcagaattacggttataagcacagaaacaagtcccttgaggagattttgattgttgccaggaagagggaatcagaactgataggatataatgaagatccaatcgatgttgaggctgacatatctgtaaaaatgaagagtccacatatacatgaagagaacataccttttcaaaatacagaaacatctttcactaggagttctaaattccacaatcaaattatagcagggtctggcaaacatgatgtcaataatggaaggaacaatcaacccaagttggcaacacagagtggtcgtctgcctagtgaagcaacagagaaaagcaataaaaaggtgtatcatggtatgctaaaatttcttactttaaagtgctaccattagaaaatttgaaacctggtggaagtctaaacagttacctacatattcagatttacagttacaatattgtggtgtagctcaaactaagcaattacatattccattcaactttgtagtgtacatttgacttaattttgttgcgtgtacgcgaaaaataacttaattttgttctgttgggcacaaccgcacaagtggacacataatatatgttatctctttttaactttatgtgctaaaatgtacgagattggcaaccgtgtcgttgtactaacatcattttaaactatgtgtttaccaaatactgggttcacacttcacagttttgattgtttaattttagaggaaatgccttaacactgtcaatcatcttggtaggtgacatggtacacaaaacagcaagatcattcctttttgaactatgtgctgcaaattattggaaacctcctgaattcaagttatgtaaagaggaagggccaagccaccttcggaagtaagttcatcttcttactgagagcacccgcaatagtaaagtaaggtgctatctataaaacatgtacatctcagcaataggctagattaatagtaaaccacttcaatggtatgtctatatgggtatatataactctctaatccattgcattgtttttctctatagactatttctaggttagtagatagttttgctctctctcttcatttaatatcttccaagtaggaaaatatgctgacatggatgtcttgtagagagcctatagcaggtacaatagcaggctattagccagctgtaaacatatttgtagccagctacagcacggactctaagacgcaatgtgtatataataggtgggaccatatattagtagtatagtaagcaactattgtatgaattggctattagattgactatagataaattggagctaatagtgggctatactattaaacttgctctaagggtgaaataataacctttacgtgttacgatgaaacttacgtcctacctgtactgtttcctttcctttgtgcagtaatatatacatggcctacccagagtagtagatgctcatatttaagttctttatagtctatccagaacgcaaattagcttgtacattttatgatcagaatttcgatgatgcaccttggcttttaggttaaacatggtgttctaaaatgtggattatacataatgccattctcatactaaagcttggtataagctggagcagcaatcgtttaactgacaagcagaactattaagcacgattctgtcatataataatttctatgcctagggaactagatgacacatggcttatacattttttagtaatattgtacttcctccgtttcacaatgtaagtcattctagcttttcccacattcatattcatgttaatgaatctagataaatatatatgtctagattcattaacatcaatatgaatatgggaaatgctagaatgacttacattgtgaaacggagggagtacacaactatctctgttgccacttgcatatgtacacatgcttgctaacttccctggaggaatgatacaggttcacttacaaggtggttgttgagatcaagggtgcttcggcgacccttttggagtgtcatagcgatggtaagcttcagaagaaggctgcacaagagcatgcggcacaaggggcgctctggtgtctcaagcaacttgggcacctaccaaaagaagaggacgttcgtgtatagcaacattgtcatgttttgggggtcacagtgcgaaagtacagtgatatttgtttgtccagagataaacgtgcctttctctcttttgctctgatgtccaacctcccttattaagggacgtgtataaattttcacttctccagtgccctttgaatggctagagttgtatagctagtccattattttccatgagacgtatattggtatatagttttattcttcaatagacgcatatagtattctttcaagttcc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os04g0509300, RefSeq:Os04g0509300