Os04g0555600
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Structured Information
| Gene Name |
Os04g0555600 |
|---|---|
| Description |
Concanavalin A-like lectin/glucanase domain containing protein |
| Version |
NM_001060053.1 GI:115459835 GeneID:4336621 |
| Length |
8627 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0555600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:28205317..28213943 |
| Sequence Coding Region |
28205317..28205583,28206324..28206656,28207180..28207261,28207481..28207556,28207711..28207825 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:28205317..28213943 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008397:28205317..28213943 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>gccgttgttgccgcggagctcctgccttacctcccctgcggcgatgagccatctccgcgcactcgtatggccgtgggcattcacgccacgctccgcgcctgcacacgcaatcgtgccatgtgctcttcatcgggccttctacccgtcctcctcgattctgctgagaagctactcattggaatgggtcgggcaagtagctgggacggaacaccactgctccattgcatccagctattgggtgggcactcgcttagcgtgaaggacttgcattcgtggcttggtttggttaagaaggcgcttggtacaagctgggcaacaccactgatgctggcacttgagaaagccatggggagtgaggaagcaagaggtcctgctgcgacatttgagtttgacggggagagctctggcttgcttggccctggtgacagcaggtggcccttctctaatggctacgggtttgctacttggatttacatagaatcattctcagatacacttagtacagcaacagctgcagctgccattgctgctgcagccgcagcaacatctggaaaatcatcagcaatgtcagcagctgctgcagccagcgctcttgcaggagaaggaacaacacacatgcctagactttttagctttctctcttcagataatcagggtgtggaggcttacttccatggacagttcttggtggtggaaagtgggggtgggaggggtaagaaggcttctctgcacttcacttatgcgtttaaacctcagcgatggtacttcgttgggttggagcacacaaacaagcatggtttgcttggaaagggcgacagtgaattgcggttgtacgttgatggaagcttgcatgagagtcgtccttttgagttcccacgcatctcaaaaccactagcattttgctgcattggaacgaatcctccaccaactattgcaggcctgcagaggcggaggcgacaatgtccattgtttgcagaaatgggacctatatacatttttagggagccaattgggccagaaaggatgggtcgtctggcatcccgtggaggagatgtactccctagttttggaaatggtgcaggtttgccttggagagcaaccaatgaccatgttaagaacatggccgaagagagttttacattgaaccaacagataggaggatgcttacatcttctttatcatcctagtcttctgaatggacgattatgtccagatgcttccccttctggctcagcaggcactcaccgaaggcctgcagaagttcttgggttggttcatgtttcatctcgtgtgcggcctgcggagtctttatgggccttagcctatgggggtccaatggctttacttccgttgactataagcaatgtgcagatggatagtcttgaacctatgcttggtgaattgtcgattgccactgcttctctttctgccccaattttcaggattatttccctggctattcagcatcctggaaataatgaagaattatgtcggacatgttcaccggagattttgtcacgtgttttacattaccaattacaagcatttccaaagatggaaggtggagagggggaggcagtgactgatgaggagctagttgatgcaattgtatccttgtgccaatctcaaagaaacaaccatgagcttaaagtgcagcttttcagtactttgctgttggacctgaagatgtggagttcatgtacttatggtttacagaagaagcttctgtcctcgcttgcagacatgatatttacagaggctgcttgcatgagggatgcaaatgcattgcaaatgcttcttgatagctgcagaaggtgctactgggcaatccgggaaccaaattcgatcgataactttgcccttactggaacaaagagatccttgggtgaaattaatgctctgattgatgaactcttggttgttgttgaacttctgttaggatcagcatcttccacagcagcttctgatgatgttcgctgcttgattggatttgttgttgattgcccacagcctaatcaggttgcaagggtgttgcacctcatctataggttgattgtgcagcctaacatttctagagccaacatgtttgctcagtcattcatatcttgtggtggtgtggatgcacttctcgttcttttacagagggaagctaaagctggtaacaacagtattttggacaattctgatgcacttttaagtgaaaatgattttttaaggaatgatgattcagacacaaaagctgctagtggtgaagcaaagagccaggatgatcaaattcaatcagttgaacttgaacagcacgaatccatccttcatgaagaacatactgagctgggatctacaagcacaaatgatgtgccttgtgagattttgggatcaagtataggaaggaagttgtccagttctgaaaatcagctgctaaagaatttgggtggcatcaacttctcaattactgctgacaatgtccggaataatgtttacaatgttgacaaaggtgatggcattgttgttggaatcattcacattttgggtgctctagttgcatcaggtcacctaaagtttgcctcaagggctgcaaatccaaatttacctggtggccttctgacgacagttcatgaagaaggaaataccatgtcagaagatagagtgtcactgttactgtttgctctgcagaaagcatttcaagcagccccaaggaggcttatgactgtaaatgtctatatggctttaatttctgctgcgatcaatgtttcttcagttgatgaaaatctaaacctatatgattgtggccaccgttttgaacatattcaactgttgctagtcttgctccgttcgcttccatatgcatcaaggtcattccaatctcgtgctatacaggatcttctgtttttggcttgcagtcatccagagaatagaaccacgatgacctcaatttcagaatggccagaatggatttcggaggttttgatttataatcatgagatgggtgctaagaaatatgctgatggcataagcattggtgatattgaagacctcatacacaatttcctgattatcatgttggagcattcaatgcggcaaaaagatgggtggaaggatgtggaagcaacaattcattgtgcagagtggctttcaatggttggaggatctagcacaggagaccaaagaatcagacgggaagaatcattgccaattttaaaaaggagattgctaggcggtctgcttgatttttctgccagagaacttcaagtccagactgaagtaattgctgcagctgcagctggtgttgcagctgagggtttatctcctgaagaagcaaaaacccaagcggaaaatgctgctcatctttcagtagcactagcggaaaatgcaatagttattctgatgcttgtagaagatcatctgaggtcacaaggtcaacatttttgcacatccagatcacttgatagtgctgtcccttctgcctcaatggtttcgtctgctgccagtcgatcaaattcattgtgtagaagtggtaatgagcctatggatgctgggacctcaagacgatcatctttgtccactgatgctggtggccttccattagatgtgcttacttcaatggctgattcaaacggacaaatctctgctgctgtgatggagcgtcttacatcagcagcagcagctgaaccttatgaatctgtcaaacatgcatttgtttcttatgggagctgcattgcagatcttgctgaaagttggaagtacaggagccgcttgtggtatggcgttggaatcccatccaaatctgatacatttggtggcggtggaagtggttgggaattttggaaatctgttctggagaaggactcaaatggg</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>AVVAAELLPYLPCGDEPSPRTRMAVGIHATLRACTRNRAMCSSS GLLPVLLDSAEKLLIGMGRASSWDGTPLLHCIQLLGGHSLSVKDLHSWLGLVKKALGT SWATPLMLALEKAMGSEEARGPAATFEFDGESSGLLGPGDSRWPFSNGYGFATWIYIE SFSDTLSTATAAAAIAAAAAATSGKSSAMSAAAAASALAGEGTTHMPRLFSFLSSDNQ GVEAYFHGQFLVVESGGGRGKKASLHFTYAFKPQRWYFVGLEHTNKHGLLGKGDSELR LYVDGSLHESRPFEFPRISKPLAFCCIGTNPPPTIAGLQRRRRQCPLFAEMGPIYIFR EPIGPERMGRLASRGGDVLPSFGNGAGLPWRATNDHVKNMAEESFTLNQQIGGCLHLL YHPSLLNGRLCPDASPSGSAGTHRRPAEVLGLVHVSSRVRPAESLWALAYGGPMALLP LTISNVQMDSLEPMLGELSIATASLSAPIFRIISLAIQHPGNNEELCRTCSPEILSRV LHYQLQAFPKMEGGEGEAVTDEELVDAIVSLCQSQRNNHELKVQLFSTLLLDLKMWSS CTYGLQKKLLSSLADMIFTEAACMRDANALQMLLDSCRRCYWAIREPNSIDNFALTGT KRSLGEINALIDELLVVVELLLGSASSTAASDDVRCLIGFVVDCPQPNQVARVLHLIY RLIVQPNISRANMFAQSFISCGGVDALLVLLQREAKAGNNSILDNSDALLSENDFLRN DDSDTKAASGEAKSQDDQIQSVELEQHESILHEEHTELGSTSTNDVPCEILGSSIGRK LSSSENQLLKNLGGINFSITADNVRNNVYNVDKGDGIVVGIIHILGALVASGHLKFAS RAANPNLPGGLLTTVHEEGNTMSEDRVSLLLFALQKAFQAAPRRLMTVNVYMALISAA INVSSVDENLNLYDCGHRFEHIQLLLVLLRSLPYASRSFQSRAIQDLLFLACSHPENR TTMTSISEWPEWISEVLIYNHEMGAKKYADGISIGDIEDLIHNFLIIMLEHSMRQKDG WKDVEATIHCAEWLSMVGGSSTGDQRIRREESLPILKRRLLGGLLDFSARELQVQTEV IAAAAAGVAAEGLSPEEAKTQAENAAHLSVALAENAIVILMLVEDHLRSQGQHFCTSR SLDSAVPSASMVSSAASRSNSLCRSGNEPMDAGTSRRSSLSTDAGGLPLDVLTSMADS NGQISAAVMERLTSAAAAEPYESVKHAFVSYGSCIADLAESWKYRSRLWYGVGIPSKS DTFGGGGSGWEFWKSVLEKDSNG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>8361..8627#7288..7620#6683..6764#6388..6463#6119..6233#5904..6008#4777..4911#3562..4284#2056..2837#3..1239#ccgccgttgttgccgcggagctcctgccttacctcccctgcggcgatgagccatctccgcgcactcgtatggccgtgggcattcacgccacgctccgcgcctgcacacgcaatcgtgccatgtgctcttcatcgggccttctacccgtcctcctcgattctgctgagaagctactcattggaatgggtcgggcaagtagctgggacggaacaccactgctccattgcatccagctattgggtgggcactcgcttagcgtgaaggacttgcattcgtggcttggtttggttaagaaggcgcttggtacaagctgggcaacaccactgatgctggcacttgagaaagccatggggagtgaggaagcaagaggtcctgctgcgacatttgagtttgacggggagagctctggcttgcttggccctggtgacagcaggtggcccttctctaatggctacgggtttgctacttggatttacatagaatcattctcagatacacttagtacagcaacagctgcagctgccattgctgctgcagccgcagcaacatctggaaaatcatcagcaatgtcagcagctgctgcagccagcgctcttgcaggagaaggaacaacacacatgcctagactttttagctttctctcttcagataatcagggtgtggaggcttacttccatggacagttcttggtggtggaaagtgggggtgggaggggtaagaaggcttctctgcacttcacttatgcgtttaaacctcagcgatggtacttcgttgggttggagcacacaaacaagcatggtttgcttggaaagggcgacagtgaattgcggttgtacgttgatggaagcttgcatgagagtcgtccttttgagttcccacgcatctcaaaaccactagcattttgctgcattggaacgaatcctccaccaactattgcaggcctgcagaggcggaggcgacaatgtccattgtttgcagaaatgggacctatatacatttttagggagccaattgggccagaaaggatgggtcgtctggcatcccgtggaggagatgtactccctagttttggaaatggtgcaggtttgccttggagagcaaccaatgaccatgttaagaacatggccgaagagagttttacattgaaccaacagataggaggatgcttacatcttctttatcatcctagtcttctgaatggacgattatgtccagatgcttccccttctggctcagcaggtttgtccccccccccttttgttgacggagtagtttaccccttttcccacattaacatcaacttatatgttttaggtccaatttacacatccttgttggttccagttttagtgaaataggtatagatacagaaatgttatgttactcaaactcctgaacacattatttaaattcttgctctggacaaaacaaattgttatgctcaaagtcatataactaatgtgcctttgaccaataaaaaaagggctctgatttctcttaggacctttaacttttcaatggcccgctttggttcagaaactttcatttaatggtctgtaaatagtatctttaaaaagttttggttgtccagcaattttctcaatttgtttccataatagcatccttgaaaaaaaattcagtctgaacacaaactgtatcctaaagtcgaatgaccaaaatagggcttttcccatagcaaaacataagagttctcaaaaatgaggtgggagctcttgagagcaagctgctaactgtagtttctaccaagaaattgtatttactcacaggtgaatcatatcttcaatgccagtagtttctgtcaattgttgataaatctttgtgatgacactctcttgagtcatctatacccttttcagtgtgcaaagtaattgatatatcatgttccttgttgctgaaatgatgtcagattattgatttttgatatgtactgggctaaccgaatgtcaaaaaattcccaagcttcctcatagtggcactttgacacgttcggtcatgtacatgattttattgatagtatcttcttttgaactgtaggcactcaccgaaggcctgcagaagttcttgggttggttcatgtttcatctcgtgtgcggcctgcggagtctttatgggccttagcctatgggggtccaatggctttacttccgttgactataagcaatgtgcagatggatagtcttgaacctatgcttggtgaattgtcgattgccactgcttctctttctgccccaattttcaggattatttccctggctattcagcatcctggaaataatgaagaattatgtcggacatgttcaccggagattttgtcacgtgttttacattaccaattacaagcatttccaaagatggaaggtggagagggggaggcagtgactgatgaggagctagttgatgcaattgtatccttgtgccaatctcaaagaaacaaccatgagcttaaagtgcagcttttcagtactttgctgttggacctgaagatgtggagttcatgtacttatggtttacagaagaagcttctgtcctcgcttgcagacatgatatttacagaggctgcttgcatgagggatgcaaatgcattgcaaatgcttcttgatagctgcagaaggtgctactgggcaatccgggaaccaaattcgatcgataactttgcccttactggaacaaagagatccttgggtgaaattaatgctctgattgatgaactcttggttgttgttgaacttctgttaggatcagcatcttccacagcagcttctgatgatgttcgctgcttgattggatttgttgttgattgcccacagcctaatcaggtaatttggccattgattggtagacaaactcatggtgagatgcctctagtgtttcctcctgaggcattgtttgaatggaaatacccaaccttctacatattttatacgcagatgttcttgaactaaagatcataatggtactactactacctaatatctagtgagcatatacactgaaaactgtaaagttacaatttgatgtatttatttccatacatcatatcataaggataagtgggtattattttaaccgtgagtcacaacaaatttgatggtgcatcagctctttgctcttaaagcttgtctgtggttactccttccagttccataattcttgacgttttggatgaggttgaggtcaaacaattagaaccttgactatcactaacttttaaaatatttaatttgaagacactagaacatgatgcatatattagtttaaaaatattttttaaaagctaaatatttacttattttttgtatatattataatagaaaatcatagccaaagattttggagatcatgttgttgtccaaaacgacaagaattatggaactggagggagtacgtgctatttttctgttgggatatatttatacttgccttgatcatttgaaagacaatacaaatgtgtagcagtctagggccatcttatctatatagctcatctgacaatatagtctaagctgtttcttgtgatcttaacaatgtccttgttaacaggttgcaagggtgttgcacctcatctataggttgattgtgcagcctaacatttctagagccaacatgtttgctcagtcattcatatcttgtggtggtgtggatgcacttctcgttcttttacagagggaagctaaagctggtaacaacagtattttggacaattctgatgcacttttaagtgaaaatgattttttaaggaatgatgattcagacacaaaagctgctagtggtgaagcaaagagccaggatgatcaaattcaatcagttgaacttgaacagcacgaatccatccttcatgaagaacatactgagctgggatctacaagcacaaatgatgtgccttgtgagattttgggatcaagtataggaaggaagttgtccagttctgaaaatcagctgctaaagaatttgggtggcatcaacttctcaattactgctgacaatgtccggaataatgtttacaatgttgacaaaggtgatggcattgttgttggaatcattcacattttgggtgctctagttgcatcaggtcacctaaagtttgcctcaagggctgcaaatccaaatttacctggtggccttctgacgacagttcatgaagaaggaaataccatgtcagaagatagagtgtcactgttactgtttgctctgcagaaagcatttcaagcagccccaaggaggcttatgactgtaaatgtctatatggctttaatttctgctgcggtatgttgtttatgtgctgtctagataattgtatatgtttttgacttccacgaaatcgatttcctatgattaattaacttaagagtaaattacttagttgcctgttggttaccttatcacctgacctttttctcaactcaggccacatgaaaaactgatatctaagtttctatcaacaaaatctcttggattgtgctttatggtatttcaagtaaaaataagcatgaacgctagattttctctgcccagtcgagtgtccgagtccatgtcagttttggcggactttgcagttatatcctttacttagtttttttttgtccattccatttggaatggcataagcaccacagtgtttcaagtttgattagtattataggctctagactctaatattatcttgaatgcagattagtgtttcttccatttaattattacccaactgtttacaattcgaagtttctacttttgatgttgttatgatcttgaatgcagatcaatgtttcttcagttgatgaaaatctaaacctatatgattgtggccaccgttttgaacatattcaactgttgctagtcttgctccgttcgcttccatatg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