Os04g0562000
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Structured Information
| Gene Name |
Os04g0562000 |
|---|---|
| Description |
Zinc finger, DHHC-type domain containing protein |
| Version |
NM_001060091.1 GI:115459911 GeneID:4336661 |
| Length |
5346 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0562000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:28529613..28534958 |
| Sequence Coding Region |
28529799..28529865,28529942..28530056,28531697..28531771,28531854..28531925,28532043..28532177 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:28529613..28534958 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgccacgctgcggagccggaggtccctgcgtgtggatccgggccctatcccagccgcaacgccacgggaggaagccatggcggggcgtgagggtcgtcgtgctgctgctgcacgcgctgttcatcggcgccgtcttcctgctcgatccgacgctccagaggcaaatccacgaggccaagtggtacataattctatatgggttgctggttttacttaccttggtacaatacctatatacagccacttcttctccaggatatttacctgatatgttgacagctggctcaaggatgcatgcaacctttattaatacaacaactctctcaaagcaggccaattccaaaagtggaagcttaaactctgccatgagtcgcagcaaaatagatcagcaaaatccacaatccactacagctttgttactacagcagacgatggatctatatcctcctgggacatccaccagttgtatgcctccattttattttagggatttcacatgctcttactgccggctcatccagcctccacgcaccaagcactgtcatgactgtgataaatgtgtcctccaatttgatcatcattgtgtttggcttggaacatgcattgctaaaaggaactactgcagattttggtggtacatattcgaacaaacagttttaactgtctggactgttgctttctacattcagttcttttatttgggcatcgttgtatcctggtggaagtttgctattggtattgtacttttggtagcattgatattaatcctcgtggtcctgctgcccttgttgatattccatgcttatcttgctcttacgaaccaaacaacatatgaaattgccagaaggaagcggatttcttacctaagggaggttcctagcagggttcatccattcagcaaaggcatttgcagaaatctgtatgatctttgcatctctaaacagaggggattttttctggaagcagtgcccccgctggaggtactacaagccagagctagaccttacacatgccgagatgtaatctcctgccggtgctgttag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPRCGAGGPCVWIRALSQPQRHGRKPWRGVRVVVLLLHALFIGA VFLLDPTLQRQIHEAKWYIILYGLLVLLTLVQYLYTATSSPGYLPDMLTAGSRMHATF INTTTLSKQANSKSGSLNSAMSRSKIDQQNPQSTTALLLQQTMDLYPPGTSTSCMPPF YFRDFTCSYCRLIQPPRTKHCHDCDKCVLQFDHHCVWLGTCIAKRNYCRFWWYIFEQT VLTVWTVAFYIQFFYLGIVVSWWKFAIGIVLLVALILILVVLLPLLIFHAYLALTNQT TYEIARRKRISYLREVPSRVHPFSKGICRNLYDLCISKQRGFFLEAVPPLEVLQARAR PYTCRDVISCRCC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>187..253#330..444#2085..2159#2242..2313#2431..2565#2651..2708#3355..3464#4177..4263#4388..4471#4827..4892#4992..5166#ggtgggcccaggtcgtccccacacgacagcgctccgcctctccttcccgactccaccgaccccccgccgagctttctcgcctcccgcgaagtcgccaccgcgcgctgctcgtccgtcgtcgccgctgcatccgcctcctcctcgtcctccctacggccgtagggtgcggcggcggagggggcgacgatgccacgctgcggagccggaggtccctgcgtgtggatccgggccctatcccagccgcaacgccacggtgcgcgctaccgttgtttggttcgattttggctgtggttccgatttcgctgtgggtcttaccgatttgtgcgcagggaggaagccatggcggggcgtgagggtcgtcgtgctgctgctgcacgcgctgttcatcggcgccgtcttcctgctcgatccgacgctccagaggcaaatccacgaggccaagtggtacgagtacgaccccccccccccccccccttgaaatttctccgaaatgtttccgtcggagttcgtgttattggtttctgtttgagctatatggagtcgatttgctcctagcttcgggtggcaactagggctctttacatgggcaacatttcgtcgggtcgtaattggcaattggcttgtgtcaggtcgcagcctgctttagttgagagcaagcatggtttttatgtatgccttctatctgcaatgccgtctgtgaggatgatgtcgtgaaattactgggctgagagccttccagcatgttataatagtgtaaattgtatttaagtttgatatagaaaaagaaggattgcgtgacatgtttggacaattagcatggtgtcccgcaaatggtgacatgggggctaagggcatattgcttggcactcatttgtttcgttcatcctattcaacacctgaattaatagaagttttaaatggaacaacatgattgccgtatgattttcaccaaatatgttgtctaaaatttgtagtttactatggacatgccagggtaaatctgcttcgaacaatgctgcagtagcattatatcatgaactttataataatattaatggataaagcggcatgttattgaccttgaaaactaaaaacaacatattttgttacttagataacaattcgatattccaaactaagatagtataagccataaagcataccgcatacacctgatggaaactgatggtttttgtttgtaatttagagattgttgtctcagatgttctagtgcacattttatgacttggacaaagtgaccttcataggaactgaataactatgctactagaacataagtgaattataaatgcctattgatcaataattcaatagatacaatgtgttgctcccttccttccttatcaagctaccaaggtattatcggaaccacaaatcactttttactgttaaaagttgatgaaaaacgtgtttatttaaaatattatatagtccatagaccatgtgcatatttctttgttcatcttgttgtccttgagctatatgtgaaaatagagcatcggatcaaaagttgtgcctatatttaaaaaagggaacatgtatgtttaacaaccagtgctgacatgatgatggcatcagcagacctttgcccctttcctataatccacatgcacgtacttcttcttctagcaggtccacgtgtatgtgctcagttctcatgagacccgtgttagccagcttttgaagttttaaaaaccagcagttatgctttattgacacatattttcaatgagggtccactgaatcaatggccagatgtttttttttccttttttgtgagaattcgtgattcttctctcttttcttagcacttctaaaaggcctttgaccaactcttatatgtaatatgtagtttttttttctatttttatcttagcacctctaaaaggcctttcactaactattgtatattatatatactacagctgaatgtcagctgatgctgtccagcctatttggaaactgaaaacactattgtgtcatttctctgtttatatgtatatctagaagaaattccatcacccctctatttaatcttattctacaatctgctttgatggcaggtacataattctatatgggttgctggttttacttaccttggtacaatacctatatacagccacttcttctccagggtaattgatccttgcggatgttgaagttttccctagatgatgacacttatacgttgcgtttacttgactcttgtgctgttagatatttacctgatatgttgacagctggctcaaggatgcatgcaacctttattaatacaacaactctctcaaagtaatgtcttactttatgttgttttgccttatgatatatatgtattttaagtgctgagcctgagtatcgtacaccacttatttatgctaaattaaatgcctttgtgattaagaaaaggcaggccaattccaaaagtggaagcttaaactctgccatgagtcgcagcaaaatagatcagcaaaatccacaatccactacagctttgttactacagcagacgatggatctatatcctcctgggacatccaccaggtacacctgtttatgtttggaatttatgctgctgaagtgtaatattcaatatcttttgtcatgtaatttctgtcctgtgatacagttgtatgcctccattttattttagggatttcacatgctcttactgccggctcatccaggtatctttggttttccaaatttggcatccagagatagtattaactgaatacagtgctccaaaaatatacaaaaacaaagataatttgacttgacataatgtaggtctttcaaggatgtaacaaactaacaatctgcattttgtaggaggtatgcttattatggtgattagtcttgtgttatgccaatgtactgaatgacaggaccagtgtatcttagattatggcatgtgccaatcgccctattttttttgtatctactaagttgaatgttggtctgccaatgtatgacatgaccagttatgactactagcatcctttctcatcagtgtgtccagtcttaagaccccttatgctttccaaagtccaaacgataatgagagtttctctggcttgatttttgagaagtcataaccatcaccagtcacaatctatctaattagaaaaaggtagacactatctgaaaaagagagaaggacacactgaacttcttttccttcatgaacacaccgtgctatgctcgttgttcttctcaattaactttgtaactgctcacatttgtatgcattatccatattttttagttactacaaatttcattcatactagcgtgtctgaagttttttgtcctgtctactaccttttgcagcctccacgcaccaagcactgtcatgactgtgataaatgtgtcctccaatttgatcatcattgtgtttggcttggaacatgcattgctaaaaggaactactgcagattttggtgagttctgaatttatatattgtgcagcttagtttgaacatatgcttctcaggtgcagcataatatcctgtgtggtgtatgtcatgcaatctctacataagcacccgagtgtcctgcttcagttaacatgtgtttattgtgagaaatcaattatttgtgtgctcatccatccattatttctttaggtagtcaatttgtgtcttgtcttaatttttgtactccaagtctctgtggcagaactgtagatcgagaaaacctgtatgaagataccaggttataacggttatatgccttttgcctaattatcaaaccatgccctcacactttcttcatcttgattcttatcaaggatttatttggctgcaattaactgtgcacggaagctgtgctaaatcattgccatgcctttcctttaatattgatctagtaggaattagcaggactgtgtgttcccagcaattcattcaacctatacctcccatcttccatagtccagaattctagaagtctgatgcttgttattgtgttacattttcttgaggaggttggtcagggatcatgttagtcttaattcttaggcatcctaaatggaaaaaaaaaaggagctaacatgcctcattgaaatgtacatataacaatctaatgttgttctattatatgactcatcgaaagtcttggcagctatcctcaggacatattaatgtttttcaggtggtacatattcgaacaaacagttttaactgtctggactgttgctttctacattcagttcttttatttgggcatcgttgtatcctggtatgtattttaccccttttagaccctatatgcacaaagatttttcagttgtgccttttagttggtctccagtttgattcgccagacatctcatctgagtatattggttatttttcatggacaggtggaagtttgctattggtattgtacttttggtagcattgatattaatcctcgtggtcctgctgcccttgttgatattccatgcgtaagcttctagtttatatgcctgacaccaaaatagttgaagatctgaatgtcttatgtgtcataaatacacaaaccaaccgtgatccagggtttactacttcggtatgcacaaagctactgcatgcaggggcgctaggaggggggtgggggctgaaattttggaatgaaaaaagtgaaaactgagcaacttttgactaaatttgaataattcacaaagaaaaacaaatgaaaaagtgaaattttcggacgaagggatgtgaaattttggaaattgcaaaccctaccgtgaaccttctgtacaactcttgctggttctggtagttgtattgatgagcttgtttatatgtctgcagttatcttgctcttacgaaccaaacaacatatgaaattgccaga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|
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