Os04g0595300
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Structured Information
| Gene Name |
Os04g0595300 |
|---|---|
| Description |
Zinc finger, RanBP2-type domain containing protein |
| Version |
NM_001060268.1 GI:115460265 GeneID:4336848 |
| Length |
7982 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0595300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:30483988..30491969 |
| Sequence Coding Region |
30484213..30484347,30484434..30484565,30484638..30484877,30485146..30485314,30485608..30486107 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:30483988..30491969 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgccacgcaaggttgtctctgggcctgactacgatgacgagtacgacgatgactatgatgagtatgatgaggactacgatgattacggtgagaccgggcacagtgacgacattcagcaccccgtgaaggaggagaaagagtcatcgaagaagtcctcaagtacggtgcctgtgctttggagatgctccatgtgcatgttcgataatcatgaaagcatggtgtattgtgagatgtgtggggtttttcgagaatcctttatgaaatctgccaaggatggttcaataaaagtccatgggataccaagtgattttgggacaccttcgatgccgaaatctgactgtaccaagatgccagtgaatactcgtactacagactttgatggtgaccctgagataaagaatgctagcatatctcatgagaaagttggttccacgcagtacacatctgctggtagctcatcaggcgctgggaaaaagctgaaggaggaccagagtagtagggctagcagttctgcgcagaatgaggatgtggcccagaaactttcttctgacatacagaagctaggtttagaaaagaatgaagtagatactgcaaaaccttatttacctgaagaatataagcctgagaagtggatgttcgctaatgaggaatcaggagtgctgagccaactaaaccttgcaatagtaggtcatgttgattctggcaagtcaacactctctgggagactgctacatctgttaggaaggatatcgaaaaaagatatgcacaagaatgagaaggaggctaaagaaaaaggaaaaggatcatttgcttatgcgtgggctatggatgaaagcagtgaagaaagagaaagaggcgtgacaatgactgtggccgtggcttatttggagactaagaagtaccgtgtagttttgcttgactctccaggccataaagattttgtaccaaatatgatatctggcgcaacgcaagctgatgcagctattcttgttgttgatgcttgcactggttcatttgaagctggcatggacggtgaaggagggaaaagtgttggccagacaaaagaacatgctcagcttattagaagcttcggcgttgaacagcttattgttgcggtcaacaagatggatgccatcggctactcgaaagaaagatttgagttcatcaaggttcaacttggtagttttctgcggtcatgcaatttcaaagattcatctgttacctggattcctcttagtgctgttgaaaatcagaatttgatcaaaattccttctgatgtccgtttaacttcctggtatcaaggattttgtctcttggatgctatagattccttgcagcttccatctcgggatgtttcaaagcccctcattcttcctatctgtgatgttatcaagtctcagtcaacagggcagtttgcagcctttggaaaattagagactggagctattcgaattggttcaaaggttttaatttcaccttgtggggaagtggcggcagtgaaatccatcgagcgggattcaaattcatgtgacatagcaagagctggtgataatgtagcggttagtttacagggtatcgatgggagtaagctaatactaggtgggattctttgcaaccctggtttcccagtgcctgtctctaacttcttggagctaagggttctagtgttagacgtcaccattcctatccttattggctatcaggtcgaatttcacatacatcatgtgaaggaggctgcgagggttacgaaaatcgtggcattgcttgacaaggctggcaaaccaagcaaaactgcacctcgttttcttaagtcaaagcagaatgcagttgtgcaggttaccttagacgctccggtctgtgttcaagaattctccaaatgccgagctcttggcagggcattcttaaggtcttctggaagcacgatcgctgttggagtcgtaacgcgggtactccggcaagatcagaactga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPRKVVSGPDYDDEYDDDYDEYDEDYDDYGETGHSDDIQHPVKE EKESSKKSSSTVPVLWRCSMCMFDNHESMVYCEMCGVFRESFMKSAKDGSIKVHGIPS DFGTPSMPKSDCTKMPVNTRTTDFDGDPEIKNASISHEKVGSTQYTSAGSSSGAGKKL KEDQSSRASSSAQNEDVAQKLSSDIQKLGLEKNEVDTAKPYLPEEYKPEKWMFANEES GVLSQLNLAIVGHVDSGKSTLSGRLLHLLGRISKKDMHKNEKEAKEKGKGSFAYAWAM DESSEERERGVTMTVAVAYLETKKYRVVLLDSPGHKDFVPNMISGATQADAAILVVDA CTGSFEAGMDGEGGKSVGQTKEHAQLIRSFGVEQLIVAVNKMDAIGYSKERFEFIKVQ LGSFLRSCNFKDSSVTWIPLSAVENQNLIKIPSDVRLTSWYQGFCLLDAIDSLQLPSR DVSKPLILPICDVIKSQSTGQFAAFGKLETGAIRIGSKVLISPCGEVAAVKSIERDSN SCDIARAGDNVAVSLQGIDGSKLILGGILCNPGFPVPVSNFLELRVLVLDVTIPILIG YQVEFHIHHVKEAARVTKIVALLDKAGKPSKTAPRFLKSKQNAVVQVTLDAPVCVQEF SKCRALGRAFLRSSGSTIAVGVVTRVLRQDQN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7623..7757#7405..7536#7093..7332#6656..6824#5863..6362#5665..5775#5348..5554#5223..5275#4619..4753#4368..4517#3409..3547#tcttctcctccctcacgctctctcccaggccgcgccatcaacgccgccgcgctcccccgctccggtcgccggactccaactccggtaaccctccagtacccgctgccgccgcgaatcggttcccctggctcccacgagcctgctcctgctaaccctagccatccgcctcctgctgctgcagcccccatggagatggccggtggaaaacacagcacaactggtggctgcaccctatccccattggtgaacaccccagtgtccaattcttcctctcattcttcctctctcttctgctcctctgatatgatatttgtgctctcctgtgtggtgtgtgtggtaatatactgtggattatggtgtatgggtgatgtttgtgaatttttcctaaataactctcgtgatggtgatatactcatgactgcccttgctggctcttcttgactaattgttttactatggctaaatgatgcctagatgctatgaatggataaaatacccacatacacaagcatacgcttttgcaatataagattaaaaatagaaatcacattatcaggagtggtccttatatatgcttgtattcaatggtgattaaaatattgaaatctgctatatgctaatatgttagcaggatcagctcccctatgctactattcagagcataatacaggaattcaatattaattcctacatgcatgatgcagtatggtagtatgacaaaagtgatcaaatgacctatgaacaatgaatattgatctatatgacaaagtatactgattactaaaagctctgataagtaattttgtgttttatggtattgatcatagcaaggttatattaccaactcctacggttctgattttgatataattctcttctaggtgacttgctgtagaggcccataggtttcggtttatggatttgcattcaaaactaaaaatatacatgtacacctgctaaccatattaatcctatagattcaatattacttattttaagaactccattcgcatgatgattcttgctacagctaattaacataatttggctgataatgcgatgctactatttcttactgcttactaattgataaatgatttatctacaattgaattatcctaattgacagaattgctatagttgtcctccttcatgataacttaaatctatgctagggttcagatactaatttccaagtccatggctaaatctaaaatctgattttatctatatgtcgaaaaaaatcaatatttgtactatggacaaaaatctgcagttagtaaacttgataaagacataagattgatgatatctttatatacattctactgtttcttgatttatcacctgaacacttgtttatctatagtaaaattttagttacacatatataactatactatccagattcttatgatcaaagccaggttcttgcatcaataaagcatcaataatcccatgcatgtactgaaccctgatttcttctattagctacatgatgacataattaatctcagccagaatttatcttctacttgacatttagatgaaaatatttatatcatattagttacacattctgttttgaagctcaaactatttaatatgaatattttactgaatctaagatgctctggttcatcttctaatggatgcaaatgcaacacccaagtcctacgcatactaatatatgcatcacacaagaatcatgccatgatatgattttagttctattctaatctgcagattacctggttaatgactctagtataattatgaaggttgtatgattttctcttctctggtttctacagatactccccctggactccggttcaaggattctcctattggaactctagcttctccccttgcagttgatgtaccaactcagctcctcctcctggagctgaaacccctctcctcttgaagctcaggtacctcctgcttgattgaaaccctgacctgctactgaattatttggtttcttgttccttgctggttttgcctcctaatccaatttacaacagtttccttttctctttcttgatttgaagattcttgcttctcctggatctcaagcatctcctactcatctactttgatttgtctatatgatttcctggccatggtcgctatggttgctctgattgttttgtactaaactaatgaactacaacagcaactatctctctctctctctgagtcaccctagtctcctctgctgctcactctaggctgctacggctgtggtgttgcatgactgaggtgtttactattgatatgctacctatgattatttctctgtcttcagctgagtctctagccgaattgctggctactactgcttgattctgtggttgattgttcttgcgactgaggagtattttactatggctgctgcttgagattggtttccaaccgatgtaaccaagactggttctctagtagctgggttgatatatgggataatttttttcttttgtgactcacctgcttgcatgccggttggataagggcttgctgccacctcaacaaagctggtttggtgtgataatctcaagctatatttacgatcaatagaaattttgtaaagcctgacatgtttagtgcttttgcacttgagtcccacaagtttagtaaaatttaagactactacgaatttagggactgatatgcaattgccctagaactcaagagtttttctgaaaaataaataattattgaatctttgactgagatggttcagtttatgatatgatatctataatcaccatgtatatgcacaatatatagaatgcatactgtataaaatttctagtgtacaattatatgcatgtatgtatgcagacctgtagtggtaaactgtaaataaagaactgtgatttctactgtgcatatgtgtacctcgcttcgtgacgactaatctacactatagtttaaccaaaactaaattatcccactcctcaccaggtttagtctaaataagaataaatcaatgatgcatatggatatgactaaataaataaatgacaaggaaacaatcgagaaaccatttaatatccagaataaaacaacaatcaatatatttataggtcctagccagcatcgtggctcaatcaacaccgctctcagccagtgtgaccaagtcattagcatgactaagactatagctaaatactcgggatgttacacccgcctccggtgagcacccgtgccgacgcacatcctctttctttgccatccctcccgttctacccacaccctttttctctcgaatttgcctcaaccttatcttctcttctagatctggaagctaggttttctctttgcctttttattaaccttttagttttactaataacactaatttttgttccccattaggtacgccgctgtgtcagcaggatgccacgcaaggttgtctctgggcctgactacgatgacgagtacgacgatgactatgatgagtatgatgaggactacgatgattacggtgagaccgggcacagtgacgacattcagcaccccgtgaaggaggagaaaggtattatgtcgaaggtttgaagctagtactagacagtgtacacctcagcttgtaagaatggtgaaatagctattagagtcgcttcatgatgcacacttaacatatctactcgtgtaggttagttacggcggtgtaggttacaaggagcgttcacccggttatcataatttgctcagtggtgttaaatgttgttaatgacattacattgtttccatcctgcattcgtacttgctatcgcatcctctattgcctgaatatgcaaataagaacacggtatgcttaattactctaaaacttccaatagcattgcttgttcaaacaaatgcagtgatcgtgtagcttatgtctgccgattacctggccttgctctaatttccttgcccatttatcccatcatatgcacttcagatatttgttgtctcgaaggcattgttattcaacatgcattttttggaatgagtcaaatatcattcatccagttagtccatcaaaataaaaacttactgcaaatcaaatctacccaaattgggtgagaatcgaaacatagctggctgccagttagaactaccagggttacctactggttgcttactgaatcctggtgcatatgcatattattgttctatatatttgaggccttttgaaataattcatatgcctatacatttaaccgttgctttcctcataagctccatgcactgaatgcttcactttgttgttgtacagtgagttttttttgtgatttattcagcatatcaagctaactgcgcctagtacagctccttgatctctaatattatgtcaccactctattgtgcagagtcatcgaagaagtcctcaagtacggtgcctgtgctttggagatgctccatgtgcatgttcgataatcatgaaagcatggtgtattgtgagatgtgtggggtttttcgagaatcctttatgaaatctgccaaggatggttcaataaaaggtaacatgcttcacccattctaattttctttgaatcacaatttgtattccaacaaggaattctaatgtaatcatagtgtacttataactattaaattacagtccatgggataccaagtgattttgggacaccttcgatgccgaaatctgactgtaccaagatgccagtgaatactcgtactacagactttgatggtgaccctgagataaagaatgctagcatatctcatgagaaaggtactgctggtgcaaatggtagatgctttacaattttgtgtatgcaactctgttctacctttaaactagcttctccttctataacaccttattgagttatgaaaaggataat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