Os04g0628600
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Structured Information
| Gene Name |
Os04g0628600 |
|---|---|
| Description |
Conserved hypothetical protein |
| Version |
NM_001060496.1 GI:115460721 GeneID:4337084 |
| Length |
10115 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0628600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:32380887..32391001 |
| Sequence Coding Region |
32381172..32381476,32382247..32382403,32382490..32382708,32382803..32383089,32383248..32384553 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:32380887..32391001 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggagtcgatcatagcgcgggcgctggagtacacgctcaagtactggctcaagtccttctcccgcgaccagttcaagctgcagggccgcaccgcgcagctctccaatctcgatatcaatggcgacgcgttgcacgcgagcctggtgctgcctccgtcgctcgccgtcgagaccgcgcgagtcgggaagctccagatcacgcttccatcagtgtcaaatgtgcaagtagaaccaattgtggtgaacattgataagcttgacctcgttcttgttgagaaggacaattctgaagatctttcaagcactagcagtgctttatcgccatcaccagctaaaaacagcggatatggatatgctgataagattgcagatggaatgacagtccaagtcggtattgtgaaccttctattagaaacacatggtggtccacgtcatcaaggaggcgcaacttggtcaccaccgctagcggctatcacatttcgtgatcttgtactgtacactacaaatgaaaaatggcaggctgtaaatctgaaagaagcaagggatttttcgaacaataaaggattcatttatatttttaagaaattggaatggcaatcactgtcagttgatctgttacctcatcctgacatgttcacggatgctcggtttaactcttctagcagtgaagatggaaaacgagatgatgatggtgcaaaacgaatgttttttggtggtgaaagatttttggaaggaatatctggggaggccaacatcacagtcaaacgaacagagcaaaacaatcctgttgggcttgaagttcagctgcatattactgaagctctctgtcctgccttaagtgaacctggtttgcgggcttttcttcggttcatgaccggggtatctgtgtgcctaaacaggggtgatgtggatccaaaagctcaacagcttgcagaagctgcaggatcttccttggtatccattattgtagatcatatattcctctgcattaaggatgctgagtttcagcttgaatttctgatgcagtctttattcttctcacgggcaagtgttcccgatggggggatttcaagaaacttgtcttgcataaagattgccgggctctttctgagggacacattttctcgtccaccatgcacattgatacagccctctatgcaatctgttccacaagaacctccacctgtgcctgactttggtcaaaatttttgtcctcaaatccatccatttgagaatcagcaattggaattcacgtcaggaattcctttattttccctctattgtcttcagctcactccttccccattacctccaaagtttgcttcaaaaactgtcatcacatgtgaacctcttatggtaaccctccaggagcaatcctgcttaagaattgcctcattcttggctgatggagttgtggccaaccgcagtgccatattgcctgattcttcaatcaacagtatgtcattttatattaaagaatttgatctctctattccattagatgctgaggaaatcacgaggtacagtggaactaagaatgtttgcccgcaatcatcatttatgggggcaagacttcatgtggaaaatctatacttctgcgagtcaccatcagaaaagtgtctgttgctaaaccttgacaaagatccagcttgcttccttctctgggggtaccaacctgttgatgcaagtcagaggaagtgggctactcgagcttctcatctaagcctctcacttgaaacctctagcacttcgaatgaacagagaacagttaggggctcctctccaagtttgtggaaatgtgttgagctggatgacatccggtttgaggcagctatggttacagctgatggtagccctttgttgattgtgccacccccagagggtgttgtgaggattggtgttgcttttcaacagtttacaaccaatacttcagtagagcagttgttttttgtgttaggtctctacacttattttggccaggttggagaacggatttcaaaggttagcaaaggtaactgctctgcgacaaagacatcagctgacaaacgtgagagaaaactgcctagtgacacagcagtgagcttaactatgaatagtctccaactcaatttcttggaatctttatcatcaaatgacttacaattgcccctggttcagtttggtggtgaggatctgtacctgaaagtttctcatcgcactcttggtggtgcctttgcagttacaactaacttgacatggaaaactgtctcagttaattgtttggaaggagaaagtgctatatttggtgagaatggcactgcagttactggtgaacctaatattttgttgcatgaaaatgggcatcccaatatgagagctgtgttttgggttgaccaccggaataagaaccagtctaaagaagctcgatttattgacatagacatcactcacgtaatgccttatgacatgcgggacatggagtgccatagcttgagtgtatcagctaaggtatctggtgttcgtcttggtggtggaatgagttatactgaatctttgctgcatcgatttggtatccttgggcctgatggtggtccaggggaaggtctcttgaggactctgaaagatttatcctctggtccacttgcgaaactattctcgccatctcacctcaccgacaaggaagatggaatgcccaattccaaagacaatgactacaattcgaagtttgacctggaggtgccagatgatcttgatgtgtcaattgagctacgaaactggctcttcgcccttgaaggcacagaagaagtaggagattggttatcgcctcatggcagtgatcatatcagtagagaagagaaatgttggcataccacattcacgaatctacatgtgtcaggcagaagtagtgatcggcctggatctgcggagaaggtgattcacaaaagggcccttccaatagaacgttttacggctggaattgaaggtttacaggcaataaaaccttgcctgagagatcaactaattggaaatgcaacatcaaataatcttcaaacaggcagtgtttttgataacacaagtagcattggtgaccaaggtgtcgatgttgaagcgaccatggtcatttgcgaagatgagattgaaggtcccaagtggacaatggataatgtcaagttttctgtaaaagaaccgattgaggcagttgcaacaaaagaagaattagagcatctcaccatgctttgtagatctgaagctgatgcaatggggaggatcactgctggaattctccgtctccttaagcttgataagtctcttggccaggggactatagaacaactcaggaacctaggaagcggaggaatcgacaatactttttcacctaggaagttgagcaggcagaacagttttggcagcataggtactcctaggactcctaatctgcactcaactacagatgcaggaacgaaagagttactggaatcaacagttgcttcattacaaatcgaaatcttagaatccaaggccaaatgtacagccctcgtttcccaggcgagcggtgtggaggatcagaaatgcgccgaagacatcaggcaattgaatgacaagctagagagcatgcaatccttggtgacaaaattgagaactttgatctaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MESIIARALEYTLKYWLKSFSRDQFKLQGRTAQLSNLDINGDAL HASLVLPPSLAVETARVGKLQITLPSVSNVQVEPIVVNIDKLDLVLVEKDNSEDLSST SSALSPSPAKNSGYGYADKIADGMTVQVGIVNLLLETHGGPRHQGGATWSPPLAAITF RDLVLYTTNEKWQAVNLKEARDFSNNKGFIYIFKKLEWQSLSVDLLPHPDMFTDARFN SSSSEDGKRDDDGAKRMFFGGERFLEGISGEANITVKRTEQNNPVGLEVQLHITEALC PALSEPGLRAFLRFMTGVSVCLNRGDVDPKAQQLAEAAGSSLVSIIVDHIFLCIKDAE FQLEFLMQSLFFSRASVPDGGISRNLSCIKIAGLFLRDTFSRPPCTLIQPSMQSVPQE PPPVPDFGQNFCPQIHPFENQQLEFTSGIPLFSLYCLQLTPSPLPPKFASKTVITCEP LMVTLQEQSCLRIASFLADGVVANRSAILPDSSINSMSFYIKEFDLSIPLDAEEITRY SGTKNVCPQSSFMGARLHVENLYFCESPSEKCLLLNLDKDPACFLLWGYQPVDASQRK WATRASHLSLSLETSSTSNEQRTVRGSSPSLWKCVELDDIRFEAAMVTADGSPLLIVP PPEGVVRIGVAFQQFTTNTSVEQLFFVLGLYTYFGQVGERISKVSKGNCSATKTSADK RERKLPSDTAVSLTMNSLQLNFLESLSSNDLQLPLVQFGGEDLYLKVSHRTLGGAFAV TTNLTWKTVSVNCLEGESAIFGENGTAVTGEPNILLHENGHPNMRAVFWVDHRNKNQS KEARFIDIDITHVMPYDMRDMECHSLSVSAKVSGVRLGGGMSYTESLLHRFGILGPDG GPGEGLLRTLKDLSSGPLAKLFSPSHLTDKEDGMPNSKDNDYNSKFDLEVPDDLDVSI ELRNWLFALEGTEEVGDWLSPHGSDHISREEKCWHTTFTNLHVSGRSSDRPGSAEKVI HKRALPIERFTAGIEGLQAIKPCLRDQLIGNATSNNLQTGSVFDNTSSIGDQGVDVEA TMVICEDEIEGPKWTMDNVKFSVKEPIEAVATKEELEHLTMLCRSEADAMGRITAGIL RLLKLDKSLGQGTIEQLRNLGSGGIDNTFSPRKLSRQNSFGSIGTPRTPNLHSTTDAG TKELLESTVASLQIEILESKAKCTALVSQASGVEDQKCAEDIRQLNDKLESMQSLVTK LRTLI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>9526..9830#8599..8755#8294..8512#7913..8199#6449..7754#6205..6362#6048..6133#3210..3277#3043..3086#2893..2965#2699..2778#2516..2609#2232..2402#2000..2062#1854..1920#1603..1691#1255..1306#1050..1159#399..487#200..311#ggccccacattttctttcaccttctcttccattccacctctccatctcgccggaatctcacctccgatccggcggcggcgccgccaccgacaccgagaaggggcgtcccctccctccgccaccgcgcgcgcggcacgaagagccaccggagcattcaggggaggggcgttgtagaagcgcgggcggggggaaggcggggatggagtcgatcatagcgcgggcgctggagtacacgctcaagtactggctcaagtccttctcccgcgaccagttcaagctgcagggccgcaccgcgcagctctccaatctcggttgggatccgcttctccggttgaggatgccaatttggtcgcctccgggtgctaactttttttttgggcgtgatttgggtgatgcagatatcaatggcgacgcgttgcacgcgagcctggtgctgcctccgtcgctcgccgtcgagaccgcgcgagtcgggaagctccagatcacggtaatggcgggagccctgacccggtgcctttgtatatgtcagtgtgcttactcttcccggcttctccccctgaaggcttaaggggtgcatttagtgttagatttcttattgtttggtttccaaatttagatgattttcgggagagcattgttttgcactttacttgcgcctctgcgtggtagaaatctgtgatgaacttgtgatttcgctctcatgtgatagattatagctctgggtttgaaacgtttgtgtgggaggctaagtgaatgatgattaggaagcagctatttgtacctgtcttgacaatgccatgaaatttggactcccattaatttttatcatgtggccatacctgtgaaaaatctagagaaataaagctgcccttggtattccttgcgcatctggttattgcaagttttggttgggtggtgatctcaggtaaatttggaaaattaaaatctatactccattagcattgacctcaaagcttcaggcaattattgaatagccattgggtacttgcaacttttggtgataagcttatttcgtttccttgctacagcttccatcagtgtcaaatgtgcaagtagaaccaattgtggtgaacattgataagcttgacctcgttcttgttgagaaggacaattctgaagatctttcaagcactagcaggcaaattcattcttctggctctggtctcatatggttgaatgagcacagtcatttactgatttcagtcttctctgtcattttgttttggtttgcagtgctttatcgccatcaccagctaaaaacagcggatatggatatgctgataaggtttatttctttgaccttgatgttcaacgtaaacacattccaaacttttactctgtaaaaaattcaatatgctgtctaaaaataaaaattgtcacttccagttatccatgatggttgcatccaatgcacctattttgctatctgatttgataattcttctatattcttatgtgatcttgtctgatattctgaaaagcaattctctgctcttttattacaatatatacaattttgaaaaaaaatacgtgcagaaaattgaactatggatagggcttaatttgctataccgtggttagattgcagatggaatgacagtccaagtcggtattgtgaaccttctattagaaacacatggtggtccacgtcatcaaggaggcgcaacttggtattcatctttgtttgaatgatttttggccctttttcttatggcttagctccatatctcagttcttgttcatttctcttattaatatctgtttcatgatgtagcttttccctgcaatgtttttctgcaaacaggaacattcattccatctttccttttcaggtcaccaccgctagcggctatcacatttcgtgatcttgtactgtacactacaaatgaaaaatggcaggtactcttgcaaattagattagcattaaatatagtaaatgattgcacttcagtacctgattagaatgccttttatataggctgtaaatctgaaagaagcaagggatttttcgaacaataaaggattcatttatatttttaaggtttggtactctccttttctctccagaagattaatgtttatttatgttgctaactgttctattgacatttcttaaaaaaaaaactgttctattggaaacataatgaactgagaaatgctacacttgaaaggatttatgaccacacacatttcttctttcaaattcacagaaattggaatggcaatcactgtcagttgatctgttacctcatcctgacatgttcacggatgctcggtttaactcttctagcagtgaagatggaaaacgagatgatgatggtgcaaaacgaatgttttttggtggtgaaagatttttggaaggaatatctggggaggccaacgtgagtgcttttgaacttcaggacatatcatatggaactcgatgtttttcttttcagtttctcttgaacttccctctttgtgtgcttggcttacacattgctttgaacatcagatcacagtcaaacgaacagagcaaaacaatcctgttgggcttgaagttcagctgcatattactgaagctctctgtcctgccttaagtgaacctggtatttggttacttttcatgatgcttgatcccttccctttctgaatgctgtttgaagtggtatttgagcttgaatgctattttattcaggtttgcgggcttttcttcggttcatgaccggggtatctgtgtgcctaaacaggggtgatgtggatccaaaagctcaacaggtttgccttttccatcatgcattttaatcactgcattgcatgcagtacagaagtaggatgtttattggttttctttgtgtccttatttcttttctgcttttcttttttgaccagcttgcagaagctgcaggatcttccttggtatccattattgtagatcatatattcctctgcattaaggatgctggtatgtaccagctctggaaaacttcaaatatgctatgtttactattctattctgactttaaaccattttgtcaacagagtttcagcttgaatttctgatgcagtctttattcttctcacgggtaaatttctttaccttccaatttattgtactgatgtcatctgctgatgatatgattgatttaggttatgtaatttatcttattgtactgatgtcatgacaatcgtttttaaatttgttgaaggcaagtgttcccgatggggggatttcaagaaacttgtcttgcataaagattgccgggctctttctgaggtactatatgttactccctctgtaccctaatgtcgtgaccgagaaaaattaccttttcccaaacgctagtgtattaatccccgtctcaggaaaagccggggtacaccacacaaacatgatacaaaaggcacatctttattatatcaataatatttacattattacaaaggcactttaggcctgacaatcaaaaataaacagcagcggactagcgggcctacggctccatcttcacaggcgctcaactggggtataagccaggactccacctaggacatcttctccaaagcttctcttactgaaggggggaaagatagagcaaggatgagtacaactacagtactcaacaagccacaccgggagatgcacgattaatgcaagggggtacaaggggtaataatataggggttaagttttgcagtaaacagcatttaaaagacacttagttgctcaaagctattttgtaaagacgatcctagagatacacaatattattaatcaagaccgtgaacccacacgaacctgccttaacccaaggcgtacgatgattcagaccgaactggcaacccgacctgggtcccagctcgtcccaagccaatccgggccaaccattccacattttagttgttaagcaagttttaagaattaaaccactaacttgggtacattgctaggcttgcccataatcgagggcgcggctattcgaatagattatactctgatcagaggtgtacatctttacccacaagacacatctttactccgcattccatggccgtggaacccgtcataaagaatgtgacataacccctttacccatcctagccatgacaaaagcaccgacccaacctcgcctacggccagaatcccgggataggtaggctaggattgaacccctagcagcagaacaccggccctgtgccatgacatctcgactaccgagccgcagcccgtgtagccttcatttgccctagagatgtccatcgagccccgatttcgtccatctctatccgtgtcctcttgccaggactagactgagcaccgagttaagccttacccattagacatgtggttagtacagtagtgctttgcaatagaggcccgaagactggtccttacggtggccgaggtgctcctaggaaaaccatgcacctcgagcccaacctaaaaccattttgggaggtttgaatagaggggggaggtgtgtgttcggagacctccggaatgacagaagctacgcgaagcacacaagcaaagctacaaccctgtaaagaagcaataacaatacataaaaagaaagcacatggttctttaggttataacaaacattaagagacttgaacgggtcgattcggagttcgtatggccaaggcatggtcatccgaagtttaatgctgttatatggagatttgcggattattataattaagctttgcaactataaaacatgtgtaagctctagcctggaaaagacaagaaggctgcgctgctga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|
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