Os04g0629300
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Structured Information
| Gene Name |
Os04g0629300 |
|---|---|
| Description |
DEAD/DEAH box helicase, N-terminal domain containing protein |
| Version |
NM_001060501.1 GI:115460731 GeneID:4337089 |
| Length |
6868 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0629300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:32408075..32414942 |
| Sequence Coding Region |
32408395..32408499,32408915..32409124,32409214..32409720,32409981..32410202,32410673..32410803 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:32408075..32414942 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggatattattgacttgtgttcagacagtgaagagtacttcagcccgtactcagatacagaagacaatcttgattttgacgatcccaatgatggtgttaaccaggtggttttgcacaacacagcatttggcaataatagttcagaactactagtcgggctggatgacgataactggttaaacaacactcatgctttatcctctcatagacctgctgagaatagatcagacattattgaaagcagcagcggtgtcaacactgactgtcagaatagtgcttggcaatacaggactcttccacataccttcatgagcagcagttacaagtctcgtccactttctctaacaggaggtaacaatgttgaaagtacacaccccactgtgaagcctaacactgtgcactataatggaattgggttcccttcacctgctattgcaagtggctacaagccatatgttagttatggccagggtgtttcaattgatgatgatgacgatgatgtctatgaggttctgcatcaaccatttccgttcagtcattcgagtttaggtgacaagaagatcgaggaagaatccacttggaagtacaatggttttcaaacaagttctgcctatggaatcgagatgcctacatctgcaatgtcaacaggtggtgtctctgcatatggaggtctaaactcacataggatctttcctccatcagtgccatacaacaattctgttaacaattttggagtcaatggccttggcactcagagccacttaaatatagaaaagaggctttttggccgtgatgagagggtggtgtatgatgaagccctgaagcaaatcagtcaagaaacaacggaagaaaatttgcctgaaggtgttatgtcagtatcactccttaagcaccagagaatagcattagcttggatggtttccagggagaatagctcacattgttcaggtggaattttggcagacgatcagggtcttgggaagacaatatcaactattgcccttatacaaaaggagagggttgagcagtctaagttcatgtctgctgatgtgggcagcatgaaatctgtagctaaccttgatgaggatgatgaagtagtgatagtcatggacaagaagcaactgaagggtgaatctgtgaatatgctacaggattcaacactgtttccatcatcagaagcagcaagtgatgccgcagatctgaagccctgggctagtctaccggggtctgctgttgatagaatggtaaatgctgtcaaagttgaacccaagaagaaggctagagtgagaccatcgccttcgtcaactttgaggtctgctaatagatcaactgcgggaacactagtggtgtgtccagccagcgttcttagacagtgggctagtgagttggctgccaaggttactgaaagttctaaattgtctgttttggtttatcatggaggttcaaggactaaagatccaactgagttgacaaaatatgatgttgttgtcaccacatacactattgtagccaatgaggtacccaaacaaaactttgatgaggatatggaggaaaagaacagcgaaacatatgggttatgtccagcattttctattggcaataaaagaaagaaagacagcgaaccaaagaagaaaaagaaacccaaaaattcagatgctgaccttgatggtggaccacttgccagagtgcgatggttcagagttgtgcttgatgaagctcaaacaataaagaatcacaatactcaagtggctagagcctgttgtggactgagagcaaaacggagatggtgtttatcaggaactcctatacaaaatacaattgatgatctgtatagttatttccgtttcttgaagtatgaaccatattctgtgtatggttcctttcgctctatgataaaataccaaatttctagagatgcaactcgtggatataagaaactccaagctgtcttgaagatagttctgttgcggcgcacaaaagaaacactaatcgatggagaaccaatcataaaattgccaccaaaaacgattcagctgagcaaaatagacttctcaaaagaggagcgaactttctatatgatgcttgaagaaggttctagggaaaagttcaaggaatatgcttctgctgggacgataagagaaaattttgcaaacattcttgtattgctgctgcgacttcggcaggcttgtgaccatcctcttcttttgaagggaaaggaaaaagatttgattgatactggttctgtagaagtggcaaacaaacttcctaaggaaacagtgataaatttgcttggacagctggaaggagactatgcaatttgttccagatgcagtgacccacctgaggatgttgttgtagcaacatgtggtcatgttttctgttatcagtgtgtgcataagagcttaacaagtgatgagaatgtctgtccctccccttcttgtgggaagaaattaagcgctcaaacagttttttcacctggagtgttaaggttttgtatagctgataaattggagtctggtgcaacaactagtagttctgtagaagcagatggctctccatcaatctgtgaaagcagttacatatcttctaagatcagggcaaccactgacatacttaactcaatcgtgaatacacctgctctaacttggagtgatactatggaatcaagtccaagtgaagtagccccttctaaggcgatagtattctcccagtggactggcttgctggacttgctggagctttcgctggatagcagccgtataaaattcagaaggcttgatggtgcaatgtctctcaacttaagagaagcagcagtgagagaattcaacactgatccagaggtgagagtgatgctcatgtcacttaaggctggaaatcttggtctcaacatggtagctgcttgccatgtgattatgattgatccatggtggaacccttatgctgaggaccaggcagttgatagagcacacagaattggtcagacccgtcctgtaaccgtttcccgcttaactatcaaagacacagtggaagatcggattttagctctacaggagaagaagagaaagatggtccaatctgcttttggtgaggacaaacctggcggcagtgcaactcggctcaccatagatgatctccaatatctattcggaatatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDIIDLCSDSEEYFSPYSDTEDNLDFDDPNDGVNQVVLHNTAFG NNSSELLVGLDDDNWLNNTHALSSHRPAENRSDIIESSSGVNTDCQNSAWQYRTLPHT FMSSSYKSRPLSLTGGNNVESTHPTVKPNTVHYNGIGFPSPAIASGYKPYVSYGQGVS IDDDDDDVYEVLHQPFPFSHSSLGDKKIEEESTWKYNGFQTSSAYGIEMPTSAMSTGG VSAYGGLNSHRIFPPSVPYNNSVNNFGVNGLGTQSHLNIEKRLFGRDERVVYDEALKQ ISQETTEENLPEGVMSVSLLKHQRIALAWMVSRENSSHCSGGILADDQGLGKTISTIA LIQKERVEQSKFMSADVGSMKSVANLDEDDEVVIVMDKKQLKGESVNMLQDSTLFPSS EAASDAADLKPWASLPGSAVDRMVNAVKVEPKKKARVRPSPSSTLRSANRSTAGTLVV CPASVLRQWASELAAKVTESSKLSVLVYHGGSRTKDPTELTKYDVVVTTYTIVANEVP KQNFDEDMEEKNSETYGLCPAFSIGNKRKKDSEPKKKKKPKNSDADLDGGPLARVRWF RVVLDEAQTIKNHNTQVARACCGLRAKRRWCLSGTPIQNTIDDLYSYFRFLKYEPYSV YGSFRSMIKYQISRDATRGYKKLQAVLKIVLLRRTKETLIDGEPIIKLPPKTIQLSKI DFSKEERTFYMMLEEGSREKFKEYASAGTIRENFANILVLLLRLRQACDHPLLLKGKE KDLIDTGSVEVANKLPKETVINLLGQLEGDYAICSRCSDPPEDVVVATCGHVFCYQCV HKSLTSDENVCPSPSCGKKLSAQTVFSPGVLRFCIADKLESGATTSSSVEADGSPSIC ESSYISSKIRATTDILNSIVNTPALTWSDTMESSPSEVAPSKAIVFSQWTGLLDLLEL SLDSSRIKFRRLDGAMSLNLREAAVREFNTDPEVRVMLMSLKAGNLGLNMVAACHVIM IDPWWNPYAEDQAVDRAHRIGQTRPVTVSRLTIKDTVEDRILALQEKKRKMVQSAFGE DKPGGSATRLTIDDLQYLFGI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6444..6548#5819..6028#5223..5729#4741..4962#4140..4270#2579..3587#2420..2494#2258..2329#1996..2171#1678..1830#1090..1585#gagagagtttttccgattcggccgccgcgcggccgtcacgaaccagataaaatctccacgcagttcccctcaaaaagaaatttggttgattttgatttgatttgattcgtgtgctccccgccgccttcgatccctccaacggataatcgccgccgacgacgacgattcggaggaggtaacttctttactactctctcttgcaagactggtttctttctttggggttattagcggttttggttcaaatggatggaatgcttttgtgagatgttttgtttcggggaggtgtgagagggttgttgcgatttgcgggagattttgattgcggcggatcatttttgaggaggagaaggcggtggctttgggcggatttcgcttaggtagggttttggtggattgggcggttttggggggaagttttaagcgatcgtgggcttgattagggttgtgcattcctgtagtcgaattgtttgattgttgtggagttggctttgccgttccttgtcgaaggcgatgcttgcgtgatggcacactcagttcatgttgtgacaattcttccttctttcaaaattttggcccttggattaatagttaatctttcatttgtgattttctttgaatagggtgctgcattttgatcaatacacttagcctaggaatgcattagtgtttacttccttaaatagttttatgtatcagtttattgcacatcactgtgcctggtttaggcaaatattgttcttgatgtaaaaaagtgttttttttaaaaaaatatttttaggtgttatttgcaacccttgtatgcaccaagttgaaattgtatttcctatctgggctattgcagtgccccttgaagaattaaaccacagttactgctgcaaattactgaatgcatcatttgttcagacttctgacttccaattcacaaattattttgcagaagatagtattcaagtgggttcatcaagataatttgtttgcagtgtgctggagatagtgtggtctgaccaggcttgttggggattagtgaagctaagcatcgcagatatctgacaacagagagttgatgcccatgtttgctagcacaatatggatattattgacttgtgttcagacagtgaagagtacttcagcccgtactcagatacagaagacaatcttgattttgacgatcccaatgatggtgttaaccaggtggttttgcacaacacagcatttggcaataatagttcagaactactagtcgggctggatgacgataactggttaaacaacactcatgctttatcctctcatagacctgctgagaatagatcagacattattgaaagcagcagcggtgtcaacactgactgtcagaatagtgcttggcaatacaggactcttccacataccttcatgagcagcagttacaagtctcgtccactttctctaacaggaggtaacaatgttgaaagtacacaccccactgtgaagcctaacactgtgcactataatggaattgggttcccttcacctgctattgcaagtggctacaagccatatgttagttatggccagggtgtttcaattgatgatgatgacggtgagtagaactatccttgattaacttgaaaagtatactgctgtaacttgcgattagtacaactaaagtttttcccttttgaaacctgtcagatgatgtctatgaggttctgcatcaaccatttccgttcagtcattcgagtttaggtgacaagaagatcgaggaagaatccacttggaagtacaatggttttcaaacaagttctgcctatggaatcgagatgcctacatctgcaatgtcaacaggttggaagctacctattaatagcaactgaaaagttaaaactgataatgatgatgttcatgtaccataattccctcaaatattctgatgggtgatcacataaaaatagttttactagtataaaatgcgatattagtaatttttttctctctgtttgaaacttgcaggtggtgtctctgcatatggaggtctaaactcacataggatctttcctccatcagtgccatacaacaattctgttaacaattttggagtcaatggccttggcactcagagccacttaaatatagaaaagaggctttttggccgtgatgagagggtggtgtatgatgaagccctgaaggtatagaatataattgtgtggtgattcaattttattgtacttactgtggattatacctttttaaaacaaaaaaatatattgtgcagcaaatcagtcaagaaacaacggaagaaaatttgcctgaaggtgttatgtcagtatcactccttaagcaccaggtaaagtttatattttgaaaatcttggttgtgtgataattctatttattctactgatcctgttcactgctatgttcttcattattgaaagagaatagcattagcttggatggtttccagggagaatagctcacattgttcaggtggaattttggcagacgatcaggttagttctattttctaccttgataactgttacttgttttactggatcccctatcttatagggacataactttatgtgacgcagggtcttgggaagacaatatcaactattgcccttatacaaaaggagagggttgagcagtctaagttcatgtctgctgatgtgggcagcatgaaatctgtagctaaccttgatgaggatgatgaagtagtgatagtcatggacaagaagcaactgaagggtgaatctgtgaatatgctacaggattcaacactgtttccatcatcagaagcagcaagtgatgccgcagatctgaagccctgggctagtctaccggggtctgctgttgatagaatggtaaatgctgtcaaagttgaacccaagaagaaggctagagtgagaccatcgccttcgtcaactttgaggtctgctaatagatcaactgcgggaacactagtggtgtgtccagccagcgttcttagacagtgggctagtgagttggctgccaaggttactgaaagttctaaattgtctgttttggtttatcatggaggttcaaggactaaagatccaactgagttgacaaaatatgatgttgttgtcaccacatacactattgtagccaatgaggtacccaaacaaaactttgatgaggatatggaggaaaagaacagcgaaacatatgggttatgtccagcattttctattggcaataaaagaaagaaagacagcgaaccaaagaagaaaaagaaacccaaaaattcagatgctgaccttgatggtggaccacttgccagagtgcgatggttcagagttgtgcttgatgaagctcaaacaataaagaatcacaatactcaagtggctagagcctgttgtggactgagagcaaaacggagatggtgtttatcaggaactcctatacaaaatacaattgatgatctgtatagttatttccgtttcttgaagtatgaaccatattctgtgtatggttcctttcgctctatgataaaataccaaatttctagagatgcaactcgtggatataagaaactccaagctgtcttgaagatagttctgttgcggcgcacaaaaggtaaaatagaaaatcatgactgcatatgtgtctgcaactttgtaccttttagttatctgctatatgaaacccacatcccattgcctctgatgcttactaattcctgacaataatcgttggtattactcacaactatgaaaatttaaaaatattgatattgattcattcattatatatgtgtgtgctggagctaatatatatgataatacgatatcatggcaaaatcaacttttacttggaaaaatgcaacctcttatcttggatctctagcattttatggaagtcatgaaatacatctgaaaatctggaatttgtgaaggtgggaaacataattgaaagagtactatctttttgggtggaatcatattgagtaccccgtaacattctgtttatttatatgttgcttgagttgatgttttcagcttcaatacttggttgcatatcttaaatttgtaagatgtgctttcagtttcagtgcatatggctgtttttttgttttcactggttctgatgttgtctaattaatctattttttggactgttcaaatacagaaacactaatcgatggagaaccaatcataaaattgccaccaaaaacgattcagctgagcaaaatagacttctcaaaagaggagcgaactttctatatgatgcttgaagaaggttctagggaaaagttcaaggtatggccacttcaattttgcctctttttttttctatcgaaaatattgcattactatgtcaactattagatcttaaatgaaaaagcgatcggcagttatggtgcatagatagatactgtccgttctctagatactcattatttgaacttagatatgctcggttttgatttattcctaactcagttgttgctgcaaggtcttagaatagcaccatatcaatactccatacattttgttttctactcttgtcttatccgatgaacacttagctgtattgtgcccacagcaattgtgaaggttttacttttaatgaacagaagccaagtttttacatttatcttcgtaagcacaagtaggtttgctagtcaatagtttaccatgttcagtgtgattacttttctttttcaaaatatttgcagtagttcagaaatttcaatgcaaaatgtttatactccatgttcatactacaggaatatgcttctgctgggacgataagagaaaattttgcaaacattcttgtattgctgctgcgacttcggcaggcttgtgaccatcctcttcttttgaagggaaaggaaaaagatttgattgatac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|
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