Os04g0660200
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Structured Information
| Gene Name |
Os04g0660200 |
|---|---|
| Description |
ABC-1 domain containing protein |
| Version |
NM_001060677.1 GI:115461083 GeneID:4337281 |
| Length |
5725 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0660200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:34096414..34102138 |
| Sequence Coding Region |
34096864..34096983,34098114..34098269,34099252..34099521,34100200..34101532,34101622..34101632 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:34096414..34102138 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgatgtcgaggtttatgcaaatagggaagagcagaaaactagttcatgatgtattggttaactcgaaacccaatagtttcactgcacataacattggatccaactttgcgttcggtttggcacatacaggcagggcctgtttgcacgggaaggttccgcatggaccgggcacgtcatccatgcttggaagagcaaaggagagtttataccggaatccagctgcaagaaacttttcagttctctcaacatgtagccagaatgcatttcatggtcaacttgcttggaagcaactcatgacaatcggttctcatgtaccaaaggcatctccgattttaagtagggttgcttgtgccattagcttggctgccactagatctaatttagttccttacctctttgctttcgttgctggggagataatgctagctcagaagaccagtgcagacggagagtacttaccaattcgtgatagtctttacacgcgtgctcaagatggtcgtatctatgtcacctccttgatattttcagcagtagagctggtcatcataatcttcagatcaatatatttggcattgttgttcactccaagtatactcatggccccatttgcagatactcttggcagtaagtacaggaaaacatggctccgtcttgtgcatcgtaccctggagaaagcaggtcctgcatttattaaatggggccaatgggctgctactcgccctgatttatttgaaagtgacctctgtgctgaattgtcaaaactacacacaaaagcacctgctcacagctttgcttataccaagaagactgttgagaaagcttttggtcgaaagctatctgatctttttgagaattttgaagaagagcctgttgcttctggaagtgttgctcaagtgcaccgagctggtttgagattccggtatcctggccagcatataaagcgtgtaacagttgctgtaaaagtaagacatcctggcgtaggagaatcaatacggagggatttcactatcattaatgcagtagctaaaatttctagatatattcctacattgaattggttgcggctggatgagagtgtgcaacagtttgctgtctttatgatgtctcaagttgaccttgcaagggaagctgctcatttgagccggtttatctacaacttccgaaggtggaaggatgtgtcttttccaaaacctctttacccacttgttcatcctgctgtattggttgaaacttatgagcaaggtgagagtgttgcacactatgtcgatgacctcgatggacatgatcgaattaaaagcgcccttgcacatattggcactcatgctctcctgaaaatgcttctggttgataactttgttcatgcggatatgcaccctggaaatattttggtccgtgttatacaaccaaggaattcaaataacacccttttgaagtctaggccacatgtagtattccttgatgtaggaatgactgctgaactttcaagtaatgatcgtgtgaatttactggaatttttcaaggctgttgcacgccgagatggtcgtacagctgcagaacgtacactgaggttatcaaaacagcaaaactgcccaaatccaaaagccttcattgaggaagttgaacggtcgttttccttttggggaacctctgaaggtgatgctgtccacccagctgagtgtatgcaccagttgcttgagcaagtacggcgccataaagtaaacattgatgggaacgtttgtactgttatggtcactacattagttcttgagggctggcagcgcaagttggatccagattacaatgttatgaaaacattacaaactttactttttaaggaagactgggccaagtctcttcagtacacaatcgaagggcttatggcaccttag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MMSRFMQIGKSRKLVHDVLVNSKPNSFTAHNIGSNFAFGLAHTG RACLHGKVPHGPGTSSMLGRAKESLYRNPAARNFSVLSTCSQNAFHGQLAWKQLMTIG SHVPKASPILSRVACAISLAATRSNLVPYLFAFVAGEIMLAQKTSADGEYLPIRDSLY TRAQDGRIYVTSLIFSAVELVIIIFRSIYLALLFTPSILMAPFADTLGSKYRKTWLRL VHRTLEKAGPAFIKWGQWAATRPDLFESDLCAELSKLHTKAPAHSFAYTKKTVEKAFG RKLSDLFENFEEEPVASGSVAQVHRAGLRFRYPGQHIKRVTVAVKVRHPGVGESIRRD FTIINAVAKISRYIPTLNWLRLDESVQQFAVFMMSQVDLAREAAHLSRFIYNFRRWKD VSFPKPLYPLVHPAVLVETYEQGESVAHYVDDLDGHDRIKSALAHIGTHALLKMLLVD NFVHADMHPGNILVRVIQPRNSNNTLLKSRPHVVFLDVGMTAELSSNDRVNLLEFFKA VARRDGRTAAERTLRLSKQQNCPNPKAFIEEVERSFSFWGTSEGDAVHPAECMHQLLE QVRRHKVNIDGNVCTVMVTTLVLEGWQRKLDPDYNVMKTLQTLLFKEDWAKSLQYTIE GLMAP</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5156..5275#3870..4025#2618..2887#607..1939#507..517#aggctgccgcccgtccgtccgcccccgcgcaccacgcggcgtctcgtcctcctctcatcggaccaccaaatttgcagctcgcctccacctccacctccacctccacctcctccgcctccgcctccgcctccaaaccctagcgcctcgccgcccaccgacccccgcgcttctcctccatccatgcgcccccgtctcgtcgccgccgccgccgccgccgatcatggctgcctctagggtttcccgggcccagccatggtgatctcatccccgccaacgaaccnctcttctgcatcggtaagtccccgttggccccccacccccgcccacctctcgctcgcttctatgacctcgaggggattcgatctcctcgcccctcgctcgcggatgcgcggagcccaatcgcgttgctaaatccgaacctctaatgtgagtgtctctccagctttgtacgattcgcccgagcctggatcccgccttcattgacgcgcccgctgtccgggaacaccatgatgtcgaggtcagctccgcagctcaaaatctactgagcttattggtgcttaatttggtgcaatgtagaagtgtaaatggttttcctgttgcttccaggtttatgcaaatagggaagagcagaaaactagttcatgatgtattggttaactcgaaacccaatagtttcactgcacataacattggatccaactttgcgttcggtttggcacatacaggcagggcctgtttgcacgggaaggttccgcatggaccgggcacgtcatccatgcttggaagagcaaaggagagtttataccggaatccagctgcaagaaacttttcagttctctcaacatgtagccagaatgcatttcatggtcaacttgcttggaagcaactcatgacaatcggttctcatgtaccaaaggcatctccgattttaagtagggttgcttgtgccattagcttggctgccactagatctaatttagttccttacctctttgctttcgttgctggggagataatgctagctcagaagaccagtgcagacggagagtacttaccaattcgtgatagtctttacacgcgtgctcaagatggtcgtatctatgtcacctccttgatattttcagcagtagagctggtcatcataatcttcagatcaatatatttggcattgttgttcactccaagtatactcatggccccatttgcagatactcttggcagtaagtacaggaaaacatggctccgtcttgtgcatcgtaccctggagaaagcaggtcctgcatttattaaatggggccaatgggctgctactcgccctgatttatttgaaagtgacctctgtgctgaattgtcaaaactacacacaaaagcacctgctcacagctttgcttataccaagaagactgttgagaaagcttttggtcgaaagctatctgatctttttgagaattttgaagaagagcctgttgcttctggaagtgttgctcaagtgcaccgagctggtttgagattccggtatcctggccagcatataaagcgtgtaacagttgctgtaaaagtaagacatcctggcgtaggagaatcaatacggagggatttcactatcattaatgcagtagctaaaatttctagatatattcctacattgaattggttgcggctggatgagagtgtgcaacagtttgctgtctttatgatgtctcaagttgaccttgcaagggaagctgctcatttgagccggtttatctacaacttccgaaggtggaaggatgtgtcttttccaaaacctctttacccacttgttcatcctgctgtattggttgaaacttatgagcaaggtgagagtgttgcacactatgtcgatgacctcgatggacatgatcgaattaaaagcgcccttgcacatattggcactcatgctctcctgaaaatgcttctggtaatgctttcagccatctcttagaattgtcattattgttttgcgtttggagatgagagcatgtatttcatttgagtgaaacaatgaaatgttatagcatacccttttgatgaatgatgactcttgtgtcttatggtctatttctgggttactgtttatgctgtgagcccgtgagttcaattgagcattgttgcatttaacctctaaattgaactgcctgtttataaaagttcagtgcttgtttagaaacatctctggttcatattgatataggttagcaaagacattcagcacaactgtcacttcacttctctagacaaaactaatccaaatatatctttacacaagtttgaaaccaaggatttgaaaatatgcaaaatgtgacatattttggaaagataaagggtttcaatattttgttttatgcatataatatcactttagctccttcgttcttagtttcttacagaactattgtgtatgcaattcaacacaatattaaaagatcattatttttattattattttggtccaaattgatgaacctcactggaccttgaccatctctctttagtacattctatttgctagttacacataggcacttaacattttagggcttttaattatggttagttttcaccacgttgcagcattgttaacatccaccttttgcaggttgataactttgttcatgcggatatgcaccctggaaatattttggtccgtgttatacaaccaaggaattcaaataacacccttttgaagtctaggccacatgtagtattccttgatgtaggaatgactgctgaactttcaagtaatgatcgtgtgaatttactggaatttttcaaggctgttgcacgccgagatggtcgtacagctgcagaacgtacactgaggttatcaaaacagcaaaactgcccaaatccaaaagccttcattgaggtaattattatttcttgtcactggtctgtttcttggcagtaacacctctgcttttccttgttgaggtcctcggtgcaccctttagtcaagataattatattgctgctataataggtggtatatgcatctttaagatatgaattgatggcaagatgtatttgggcactgtaccttgctggaaagcacctgggatgtttaaattttgagtaaatttcataaaaccccatctatatggtccaagatgcagaaaactatagtgcttttgacaagtggcacataacctcgtgtaggtactaaagtttcacaaaaccacaccgttaaccattttggcatactcctatatcaaaattttaaaaaccggatataacagttatacgatggattaaaaaactcataaatttgagatgtgattgtataaccccatcaagtgtggttttgtgaaactttaggaccataatacctggggttacatgccacgtgccaaaatcactgtggttttgtgcaacttggacaatattatgtgggattttatgaaatttactcttaaatcttaggtgttctctttactctcttgttgacaaattgcgccactacattaaattgaattgttataatacctgatattaattaatttgctgatgcattatgggtttgtgcttatatttaatgtgagtcctgtgagtttttggtcaactatttggtggtttgatactaacatgaaatatagttaccttatatttggtgttagtaaagtatacattttagatgcatgcatttctaggtccaaactttcggtgcacttgaatatttgcctcaactcatcaacatgaactaatctatcacaagttcacaatgtcacattttatgtaaatgcatttagctacaaattaattaaaacaatgttgtgttggtacaatgcctttttatatatttgatagttacaaattacgacaagtcctacatgtcttgtttttgtcaacaggaagttgaacggtcgttttccttttggggaacctctgaaggtgatgctgtccacccagctgagtgtatgcaccagttgcttgagcaagtacggcgccataaagtaaacattgatgggaacgtttgtactgttatggtcactacattagttcttgaggtatgcttcaactgcttgtctcatgctccagtcagtcacttattatggtgtaacttaggccctgtttgtttcaacttaagattattgtaatctagattattgaaccagattactataagctggattataataagccggcatagaataagctgttagctgtttgtttctctggattattagttgttagccgcccaataatctaaaaaagcacctttagagtggattaccagattatagtaatctggtttatagattgtaatacagtattatctatcataataagttatatgtttgtttcagcttactcctaataatccagattataataatcctaagctgaatcaaacagggccttagatgtctctgtcatatgtccaatagatcacgatgagctgtttctcaagattatagtatgtgctgtattgccaacgagaaaggtatatggagatgtatttaggacctaggagttaggagaactcgacccctagaattcagtcacaacgttttctaatggcatagtcagatgactgaacatgcactccctagatgtcacaatatgacaaaagacttcaggggtattaggtttatgcatatttgtaccctgaccttagaccttgatggaaatgcatgaatatgagaattttcatcttcattgaatggtctcaagagcttcggattcgttgataatgcctactagttgcctaaggataaaagtgtcttgacatagtaggtcacagttaaagtgattctttgttggttgcagaattgttttcaaaaaaagtagtgggaaaaggtgctttatagcagaacatctttagcaacatatttaaaactggagaaatggtgtaaataaccaaactaccatagcggaacctcatgaaatatcatatatatgactcttatagctta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|
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