Os05g0124000

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os05g0124000

Description

Ankyrin repeat containing protein

Version

NM_001061049.1 GI:115461828 GeneID:4337669

Length

6188 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os05g0124000, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:1326536..1332723

Sequence Coding Region

1327017..1327340,1328408..1328469,1328556..1328605,1328703..1328800,1328990..1329370
,1329634..1330140,1330365..1330439,1330538..1330726

Expression

GEO Profiles:Os05g0124000

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgccaatgcaaacaaccgacaaaactgatgctgtgaaatctatgctttccggagagaatagtgaaggctcagatggatcaaagtcatcggacacagttgagtgggacccatgggaccctccgcatcctccttgtcctactttgccacccacagcaagccttatgagccaagtggaaatggtcaaacagcatcattttcaagtactggccgtacttgctgcttccagggccacaaatataattgccccagaccgtactcctcaggaggtgcgccgtaaatttgctgaaatatgcagtgaactggcggacatccttgaaaaggacagtgttcggagattcctcaacttgtacagaagaaatatgcgtatcatgggttggggtctggtcatcacatctcaaacaatggacttcattgtttcattcaatgccctgcgttgtgctaaggttgtcttggagggcaaggcacctaagctttgtcagatccgtgccaaccccaactacatgactagctatgggtacttccccctccacaaagctgctgaaaaattctcagttgacatgattaagttgctgctttgttatggtgcatcggcgaatttacgcacatcaggccaaaaggtcatcgagggcctcctcccactccatgttgccattgagaacacttgcatgcacaagtatctggaggacaatctattaactgaccggaagctcaagcaagtggatcttgacttcatctacaagctcatccatctgctttgtctgcctgagatgaagattttcttggacacgacaagactgcttgcagataacacagataatattgttgatgagctatggaactacatcaaggaggggaggcttgtccatgctgctattttgctccttgcagctcaacgaaaaattcgtacctgtgcttcctctaatagaaacatcagctgtaacctgaatggatttgatattatcagggatcgtgttatgggatccatagtttccatagaaagggaagggcgtggattaacaagtggtaaaaatagcaaggcacataagcagctggaggagaagcggaaattttttcataattcattgatgctcatttttgtaatttcgaaaaccggtgaagctcttgatgagtatatccagtctcattcagaggtctctcatcaggaggtgcttgagggtgtttcatcaattctcgatgatcatggttttgctcctactggaaaagggatcagcataggagacctggaatgccgtccctatgactgcaatgcgtcgaatagtgtgccgaagtgcaactatgaagattctggtacgaccaaggcagttggagaatctcctaatctgaatgttaaagctaaaaaagctgttggaaagcaaatacaaagtagacgagaacttgagcaaacgaggaaaatgttcttcccacattggagatcacttttaacatctcgatatactgtaaaagtattcccattctatgcacacatgatggagcgtgatcatgtttcaaatcttcatatggccggtggtactgagaatggattgaaggataaatggtgttctccagttggcgttagtttgttgggaaaaccaccacaactaacaagtactagttatcaatccagaaccagaaggctatttggtactgctgcacttacactactgaagaccttaaagcgtgcatga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MPMQTTDKTDAVKSMLSGENSEGSDGSKSSDTVEWDPWDPPHPP CPTLPPTASLMSQVEMVKQHHFQVLAVLAASRATNIIAPDRTPQEVRRKFAEICSELA DILEKDSVRRFLNLYRRNMRIMGWGLVITSQTMDFIVSFNALRCAKVVLEGKAPKLCQ IRANPNYMTSYGYFPLHKAAEKFSVDMIKLLLCYGASANLRTSGQKVIEGLLPLHVAI ENTCMHKYLEDNLLTDRKLKQVDLDFIYKLIHLLCLPEMKIFLDTTRLLADNTDNIVD ELWNYIKEGRLVHAAILLLAAQRKIRTCASSNRNISCNLNGFDIIRDRVMGSIVSIER EGRGLTSGKNSKAHKQLEEKRKFFHNSLMLIFVISKTGEALDEYIQSHSEVSHQEVLE GVSSILDDHGFAPTGKGISIGDLECRPYDCNASNSVPKCNYEDSGTTKAVGESPNLNV KAKKAVGKQIQSRRELEQTRKMFFPHWRSLLTSRYTVKVFPFYAHMMERDHVSNLHMA GGTENGLKDKWCSPVGVSLLGKPPQLTSTSYQSRTRRLFGTAALTLLKTLKRA</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>5384..5707#4255..4316#4119..4168#3924..4021#3354..3734#2584..3090#2285..2359#1998..2186#aaaaggccaaattggaggagggtagggaagcttcggtctcttcgttcgtcgtcagtggcgattcccccaccccccctccctccggccgccaaaggtcagtgacgatttccctcccttctctccctctcctccgccatcgtccccgccgacgatccgtgcacgccacggcccaacacatacggccaaaccctaggtggtgcgattcctctccccctccctcctttgcagctatgcacccactcgatctgactttactttttaattgtcactcggaaaggaagtttttttttttaaaaaaagtttttctccctcaacaagtttccacatcccctatccgggagatttttgaaatttgtgatgtttagtactagtatttaccaatcccacactctctgttactaaggcgttgtcctgtattattttacatgctctggttttatctgagagtagttgttttgctgccctcagattccaagttagtattcatcatgccaagtctgaaacctttacttttcacttgagctatatgaattacattggttcctgtccttgccagttaactttaggtactctccatgtttcatcatagtgctatactgtggcttggttgttcatgttctaagtaatccacgttatacacatagttcatagagtcatacaatatctgcggtccaatttataatgtgactaacatagtatctacagatgtggtatatcgagtggatataataaaaaaagttccaaccttgaaaaccggtaattggaaaatccgcgtgcttacccaccttgtaacacctgtatagcttaactggcagcttatgcggcttaattagtaactactccctccatctacttttgatagtcatatctcatcttggcacacagaccaaagataagtaattctacttattatctatttaaacatgctactagtcattcctcgtagataagcgattcattaatatttacgtttctcaatacccatgtagccaatcatgtgtggaagaatggagagtcacgcattaaatccgagaaagttattaagatgataagttgttggattaaaatatgactatcaaaaataaatttttcagatttgaaaatatgactatcaaaagtagatggagggagtacaaggttatgccatccattccttatatgtggcttcctacaacttctctacaacactgctaagttctagacttctagaaagatgcaccttttcatctgttgcacgcacacatgttcagaggatacaactttttcaaaaacaacacacacgtcttagtacattcatccacaagagatctttctaaagtgatggggggtgggtgtaagctgtagagtgcacaatttcaaccacaagctctttctgttaaaggattaaagaatagttggcagcctggttctgaagacaccacaggaaacatatacttttacgtaccccatccattctgtaatggttgtctattcgactgagatgtcttgtcttacattgtttatccatttcattcctttttcactcttgatccccttattttcataaagtccaagcgtctgtccagcatataatttaataatgggcatgcatggtttctttagttgctacttgttttctgcacatggtgatcttggatagatattgtgaagcggtggaatatttagtgaagaatctggatcatgtaaattaaatgggatagcatctagcaattgaactgttcagtggtaagccaataaaatggcacactaaaatgaatgtctactaagtgctaggcgatttacatgtttgcaacaattgtttgcttgagtagtctgaaagacttgtatggtagatgactttccattatctaatagcctctctgaattttgagctttctcacgcattctatgtccttttattttgcttagcagaaatgcactaaaaattgaagatccaagcagcctatcaaattggtttggtcttgtaattccattttacttgtttttcgttgcagtcaatgccaatgcaaacaaccgacaaaactgatgctgtgaaatctatgctttccggagagaatagtgaaggctcagatggatcaaagtcatcggacacagttgagtgggacccatgggaccctccgcatcctccttgtcctactttgccacccacagcaagccttatgagccaagtggaaatggtcaaacaggtacaataactatcttctcatacgatatcccactccatccctttccatagaatttacctatttttgttgtttcttgactgaatgttcctcctttttagcatcattttcaagtactggccgtacttgctgcttccagggccacaaatataattgccccagaccgtactcctcaggttctctattcttttcatttagcatatctgtcggatcatttagttatcttaatatttttcttgtttacaggcaactcgttctataactaccttgtgtattgcaacattacaatttcttttactaagatagatctgtagaatgcttttttctgttctgctacactattgaataactgaattgaactttcctttaatcctttctcaaacatggattgattatctaggaggtgcgccgtaaatttgctgaaatatgcagtgaactggcggacatccttgaaaaggacagtgttcggagattcctcaacttgtacagaagaaatatgcgtatcatgggttggggtctggtcatcacatctcaaacaatggacttcattgtttcattcaatgccctgcgttgtgctaaggttgtcttggagggcaaggcacctaagctttgtcagatccgtgccaaccccaactacatgactagctatgggtacttccccctccacaaagctgctgaaaaattctcagttgacatgattaagttgctgctttgttatggtgcatcggcgaatttacgcacatcaggccaaaaggtcatcgagggcctcctcccactccatgttgccattgagaacacttgcatgcacaagtatctggaggacaatctattaactgaccggaagctcaagcaagtggatcttgacttcatctacaagctcatccatctgctttgtctgcctgagatggtttgtttgaaatccctttctgcaattactactttggttatgtaacaacagtaaagaagttgaactcatgccatgccaaatatctaaacctactgctataacacttaagaacatccaatttgtgtatttctgcttgagaaggagacaacagttattccgtgatagttaattctctattgcttgttgataaagtttgaagcaaaatgacaacacatgctaggagatcagaagttaaatctgttctgtattgatggtctttgcagaagattttcttggacacgacaagactgcttgcagataacacagataatattgttgatgagctatggaactacatcaaggaggggaggcttgtccatgctgctattttgctccttgcagctcaacgaaaaattcgtacctgtgcttcctctaatagaaacatcagctgtaacctgaatggatttgatattatcagggatcgtgttatgggatccatagtttccatagaaagggaagggcgtggattaacaagtggtaaaaatagcaaggcacataagcagctggaggagaagcggaaattttttcataattcattgatgctcatttttgtaatttcgaaaaccggtgaagctcttgatgagtatatccagtctcattcagaggtacacattttttgtcaggtcacaacatgaatatctcttttgtttgatttactccttgcatttaaaaaaaatggcgcttttcctatagactccgagtccatagcttaattattatcacaaaagattcctaaatgtgatgtgtttttatttttgctcactcttatctaaacagtaaaatgtataatgcaggtctctcatcaggaggtgcttgagggtgtttcatcaattctcgatgatcatggttttgctcctactggaaaagggatcagcataggagacctggaatggtttgactctatccagcttatgcttcgatcacaattttttatcaatagatgacttgtatgcatatattttaattgtttcttctacatgctcttgaagccgtccctatgactgcaatgcgtcgaatagtgtgccgaagtgcaactatggtatgcatttgttctcacaggacagaatatgagatatttttctcaaatttcctactatgccctaataattttattttgtggaacagaagattctggtacgaccaaggcagttggagaatctcctaatctgaatgttaaagctaaaaaagtaagtatattgaaactgggtacctctattttctgccgtttatttttttctgcggtgttcattattggttcttattaagctggtattccccagggtttatttttggctatttgcatgttgaagttgtctggggcaaaggtctctaaagtctcaattcttttggatgagaacttttttttggaccagtgaagttacattttgctgactggtggacttaaggactaaaacactttttttttggttctgtttgaaatctgaattggtcaaaagatttaaggataatcctgatttggtaaactctaggatctgtggtttgtacagtctgcaccagtagttatgctttatggatttggctgacctgtctaatttaaagaacatccaatgggtttgctatcatttggtcatcgttgagttagtaatctgcctgcaggtttttacacacacctgagaggtagggggttttgctatatatggttgcaattagatgaaggaggaatagagatattagttggattcagattttaattttatttgcctgtgtttgatcctgaccaagcaatatttgtagcaaaccatcaagtc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External Link(s)

NCBI Gene:Os05g0124000, RefSeq:Os05g0124000