Os05g0125000
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0125000 |
|---|---|
| Description |
DNA-binding SAP domain containing protein |
| Version |
NM_001061052.1 GI:115461834 GeneID:4337672 |
| Length |
11525 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0125000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:1404985..1416509 |
| Sequence Coding Region |
1405234..1405260,1405979..1406059,1406301..1406343,1406547..1406625,1406734..1406893 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:1404985..1416509 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008398:1404985..1416509 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggacctggtttccagctgcaaggataaactggcatactttagaataaaggaactcaaagatatattaaatcagctcggcttaccaaagcaaggaaagaagcaggatcttattgatagggtgttggcactcttaacagatgagcaaggtcaaaggcatcatggatggggaaggaaaaattctctcaccaaggaggcagtggcaaaaattgttgatgatacatacaggaaaatgcaaatccaatgtgctcctgatctagccaccaggagccacagcggatcagatttcagtttcaggcctatagaggaagcctatgactctttccagccagaggccaaagttcgctgcatttgcagtagcacaatggttaatgacagcatgatccagtgtgaagatcagcgatgccaagtgtggcaacatttgaattgtgtactcattccagataagcctggggagagcgctgaagttccacccgttttctactgtgaattatgccgactgagtcgggcagacccattttgggtcactgctggaaatccattactcccagtgaaattcgtgtcatctggtgttacaaatgatggaacaagtgtacctcaaagtgtggagaaaagcttccagctttctcgatcagatagagaaactgtccagagacaagaatatgacctccaggtttggtgcatgcttttgaatgacaaagttcagttcaggatgcagtggccccaatatgcagaattgcatgttaatggtatttctgtacgagtagtgactagacctggttctcaattactagggataaatggacgggatgatggtccactgataaccacatgcagtagagagggaattaataaaatttgcttatcaagggtcgatgctcggacattttgctttggtgttcgaattgctaaacggaggactgttgctcaggttttgaacttagttccaaaggaagctgaaggagagtcttttgagcatgctcttgctcgtgttcggcgctgtctcggaggtggagacactgcagagaatgctgatagtgacagtgatttggaagtggttgcggagtctgttacagtcaaccttcgttgccctaatagtggatccagaatgaggattgctgggagattcaagccttgcattcacatgggttgttttgatcttgaaactttcgtggaattgaatcaacggtcccgcaagtggcaatgtccaatatgtttaaagaattactctcttgagagcttgatgattgatccttacttcaataggattacttctctgttgcgcaattgcaatgaggatgtcaatgaggttgatgttaagcctgacggatcttggcgtgtgaagggtgatgctgcaagtagagaattatctcagtggcatatgcctgatggtaccctttgtaatcctaaggaagatgtcaaacctgccatgcaaaatggaaatgaacaaatgatggaaggtacttctgatggacagaaatctttgaaaattggaataaagagaaatccaaatggaatctgggaagttagtagcaaagcagatgacaagaagccttctgtggttggaaatcgcatgcaaaacaatagtgggttccgagctctaaacaacattatgcatatgagcaatagcccaactagtagttatagagacggggaagacccaagtgtgaaccaagagagcaataggcatgttgacttatcattgaacaatggtaataatgagtttgacagtttctctctcaattttggccaagcatgcaatacagatgatagaccacagcaacaacataatgccacagacgtcattgttcttagtgattctgatgaagagaatgatgctatggtttgtccaccagctgtctatgacaatactaccactgcaaatggtagtggttttcctttcaccactaatggtattggatatactgaaaggtaccaggaagatgccggcgttggtacaagtggccttggtttattgagtaacaatgttgatgattttgagatgaataactggcaaatgcattcttcttatcaacaacctgaacaaggcttccagttttttgggaatgatactgatgtccataatacttttgttggttcacacaattcctttggcttagcaccaaatgactattctcttgattgtaatgttggcgtagaggaggcttcggtaactcctgctctttcagtctgccggaatagtaatgaaatgcatggaagtttggttgataacccactggctttggttggcgatgatccatccttgcaaatttttcttccaagtcaaccttcctctgttcctcttcaggaagaacttagcgagcgtgctaatgcaccaaatggggttcagtctgatgattggatatcccttacactcgcagcgggtggaggtggtaacgaagagcctgcacctgctgatgtcaattcacagccacaaattccatcaacagagacagggatcgaaccattgaccgatgctgcttctgcatttctgagcacaaacattgaaagacgtagcggagctgatttaaatccaagaaggatagaaaatatattttctcatcctcgccagcctcggtctgttaggcctcgactctgtttatcaatagatactgattctgagtag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MADLVSSCKDKLAYFRIKELKDILNQLGLPKQGKKQDLIDRVLA LLTDEQGQRHHGWGRKNSLTKEAVAKIVDDTYRKMQIQCAPDLATRSHSGSDFSFRPI EEAYDSFQPEAKVRCICSSTMVNDSMIQCEDQRCQVWQHLNCVLIPDKPGESAEVPPV FYCELCRLSRADPFWVTAGNPLLPVKFVSSGVTNDGTSVPQSVEKSFQLSRSDRETVQ RQEYDLQVWCMLLNDKVQFRMQWPQYAELHVNGISVRVVTRPGSQLLGINGRDDGPLI TTCSREGINKICLSRVDARTFCFGVRIAKRRTVAQVLNLVPKEAEGESFEHALARVRR CLGGGDTAENADSDSDLEVVAESVTVNLRCPNSGSRMRIAGRFKPCIHMGCFDLETFV ELNQRSRKWQCPICLKNYSLESLMIDPYFNRITSLLRNCNEDVNEVDVKPDGSWRVKG DAASRELSQWHMPDGTLCNPKEDVKPAMQNGNEQMMEGTSDGQKSLKIGIKRNPNGIW EVSSKADDKKPSVVGNRMQNNSGFRALNNIMHMSNSPTSSYRDGEDPSVNQESNRHVD LSLNNGNNEFDSFSLNFGQACNTDDRPQQQHNATDVIVLSDSDEENDAMVCPPAVYDN TTTANGSGFPFTTNGIGYTERYQEDAGVGTSGLGLLSNNVDDFEMNNWQMHSSYQQPE QGFQFFGNDTDVHNTFVGSHNSFGLAPNDYSLDCNVGVEEASVTPALSVCRNSNEMHG SLVDNPLALVGDDPSLQIFLPSQPSSVPLQEELSERANAPNGVQSDDWISLTLAAGGG GNEEPAPADVNSQPQIPSTETGIEPLTDAASAFLSTNIERRSGADLNPRRIENIFSHP RQPRSVRPRLCLSIDTDSE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>250..276#995..1075#1317..1359#1563..1641#1750..1909#2024..2151#2593..2661#3255..3342#3975..4050#4226..4299#6094..6201#7242..7403#7638..7742#7906..7986#8062..9262#10113..10258#aaaccacaacgaactaccccctcctcgtcgagccgacgcgagagaggaaagtgggttgcggcttgctgcgcgtgtggagtcgccattccccaattcgctgcgccgcccgccggatctcgtcttgccccctgcggcggcggtttgggcccccccttccgatcggtttcccccccgcacatggtcgtggcggcggcggaggtggtggtggtgcgggagtagggaggcgggcgaaccgaggcggcggcgccgatggcggacctggtttccagctgcaaggtagactcgcgttcccccgcccgccggtaaattcgaccccgatctccgccgattccgcggcgtaattcggcgccggggggggggaggggattcgttgcgtcgcgcgcgtctgttttggggcggggaaggttgcggcgtgcctggccccgcccttgctcgccgtgtttgcctgtagatgatgagatgattagttagttttgtcgatagttttagttttttttttccagtggttgctgtggagtttattagtgcctagctctctggcgtttagggttgcggattaatcggtgatttcagtatagcacctggcgaggggcttcactgggcagttcaattgcttaggctggcgctttcgcttgttggcaaatcccccacatttgcttgatccgtagtttgtcccatgctgtatggttttgtatcatacgggaagcatccagatgtttcatgtcatactaatcactaaataagttgctcagaaaattgctaattttcactttcttcagtttggtagtttgggtccttgtgttccatgacagttaatttagcatggttagttgcgtcatgcttaattccaggcaagagtatctctgctttgatttggaattgatcccagtatttagtccatggatcaaacgccagttgtaccttatgtatgtgtcatgccaaatgaattgctttggtaactttagcattgacccctttgcctttttcattgcaggataaactggcatactttagaataaaggaactcaaagatatattaaatcagctcggcttaccaaagcaaggaaagaagcaggtcagcaaattttgttcctgttaatcttttttacatcaccatctatcagacggcagtttcaactaaatgagaatatgagatgtaagcttttgaggtgaaccggtagtatagactctcataatacagcattggtgggatctttggtggtaatggtggtctgatatgaagagctcatttcaatgagctatttcttagctcgttgtcttttgttttctgatatacttctcttatattctcacaggatcttattgatagggtgttggcactcttaacagatgagcaaggtatgcatttgtctgttgtttctgcttccctggtctatgttagtaccttacatatcaagtcatgtactgacatgctaaaatttgcactgtttcattccctgtatttgtttcagtggtgtctaatccatcagcatgaacggatgatgccttttctattttctagtcttaaaaacctaaatttgtgtgttcttttcttgttgcaggtcaaaggcatcatggatggggaaggaaaaattctctcaccaaggaggcagtggcaaaaattgttgatgatacatacaggttaaatttcattgtttcataaaattgaccatgtggcataatagtgtggatatttgagatgaaatcagtggtgcttctcttttgagatctttatgccttcattagcaggaaaatgcaaatccaatgtgctcctgatctagccaccaggagccacagcggatcagatttcagtttcaggcctatagaggaagcctatgactctttccagccagaggccaaagttcgctgcatttgcagtagcacaatggttaatgacagcatgatccaggtattataacattttttatttcttacattcctttctttttgaaagatcgttacggcatgtgccatccctctttttattattattatttaaatcatgtatcatgtctttctgcagtgtgaagatcagcgatgccaagtgtggcaacatttgaattgtgtactcattccagataagcctggggagagcgctgaagttccacccgttttctactgtgaattatgccgactgagtcgggcagacccgtatgtctttctactatttgatttttctttgggtggggttaagcaggtaaatctgtggtggaaaccactgcattttttaaagaaaaatcaaaacaaaaacatatttagggaaggtgatagtacatgctcttgtaattccatgtgcaaacttgattttgcttgtgagatatgaaaatggaaaacagtgaacgaaaagacaaacatcaagaattcaagatgtgtggcttttaccttgttgtttctcaatttcatatctcattaatgaaattagttttgatcttctgatttcacacagtttaataatgtatcacctcctctgtgcatgagattacttggggattttttgaaacttgtacaaaatggtttccagtttatcaccatatattctacaaaatgggattaagttttgatttgctgcagctacatgctttgaatttgcagattttgggtcactgctggaaatccattactcccagtgaaattcgtgtcatctggtgttacaaatgatgggtgggtataaatggattcttcttactggcaacattttaactgataataatccgtggctgactatttatttattattgatgctcttctttctctatttcgtctttgcaaaaatggcagtttttccaacacctttatttacattcactggtagctcgctaggctctccctttcagtcactccttcaaatagaaaaacagttcatgacacttttttcatcatgcctcttaaatttttttcattgttgcacaatcatagaatgtttacagttacactacggctcataattacatacgtaggtaaaatccattgttgatacttgatagtcatgagtttactttgtcacatgcctctccatatattgtacaaggctcttcttagtagttacttgtcacattataataatccttgtaacatatggtaaattctccagttaacgttatctgtgactatacaacattttgtctagcacatttatggacaacagtatgcttagaaggttcaattgctattctatttactctaaattgtctcgtttaatgatcatgtgttacttgtgatgtatgacatccttattaatcctctcatatctttagaacaagtgtacctcaaagtgtggagaaaagcttccagctttctcgatcagatagagaaactgtccagagacaagaatatgacctccaggtttgttctattctacaaagctaagttaaatatgcttgagttttggagtcctcagttcaacttaatattgcgtcaatattgtaatatcataatgctcttgagtaccaagtaagaaaccatatgggtttatgccactcagttgtttaggacgttcataagtttttttgttgattttaggcttatatgaatagctcttatcaatggtgaaggcaaacctttgaccaattcattttccttttgtaacatggaattcacacaatatgagtaatgcgtctattgtgcaattgttttcattggttgtattgtgaagacaaagcactgtggataagttatgttctctatgtaacatgaaatattcttaatttgttctgttacaagccaactgtatttactttgtgttgttgcaaattttcatctgtaccatgtggatgctacttgctagcattgtacaaagaaattttctttgtgcaaaagtttgaatttatgtggaccaggctgatttcgaattcattttgtccaatgatgaaacatggtttaattcatttcgtattgtttttttccttgcataaatctaagatatgcatgcatatattgtttgtttatactatctgaagcagtgaatgtgttgacaggtttggtgcatgcttttgaatgacaaagttcagttcaggatgcagtggccccaatatgcagaattgcatgttaatggtattgttgatgattttgtagcacaatttgattcactttcatatttgaattgcatcccagcttaaatattgtcttatatgttgtgcagttatgctgttgttggttaatacttcacgttggtctttctttaaaataagttactatctgtgtaacattagtttcattttatgttcaggtatttctgtacgagtagtgactagacctggttctcaattactagggataaatggacgggatgatggtccactggtaagttcaatttccttctgtcacattggtaagatctagatactaattggcagagatttggctatcctatttgatattcctgtatgttattctattttaagttgtgccatttttgttgttctccggttgacagaacctaacgttattgagtggagttacaaccttaaaatggaaccatgttatgttacaaaacctttgggcttgttttcattgatctgtagttaaaatttgctttatcttctagtggcggcctgtaaaaatttgcttctgtatttttaatgctcctatgaaatctcctaaaatcatattcgcagtaactcttaggtggaaagtctcattgagaatcttagctggatgtgtttagtatgagaaaaatttactgcccagtttgaaacagattattgactagattattgtcatggattatttacatgatcatagatatagattaaatatttgataaataaacttaacgaatacagcatagaacaagggatctaaataatgcagta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