Os05g0163000

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os05g0163000

Description

Arginyl-tRNA synthetase, class Ic family protein

Version

NM_001061267.1 GI:115462264 GeneID:4337898

Length

7440 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os05g0163000, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:3668058..3675497

Sequence Coding Region

3668660..3668716,3668825..3668949,3669077..3669152,3669326..3669427,3669517..3669732
,3670659..3670739,3671594..3671677,3671847..3671951,3672780..3672958
,3673123..3673207,3673331..3673532,3673607..3673676,3673795..3673864
,3674187..3674276,3674462..3674530,3674962..3675060,3675246..3675356

Expression

GEO Profiles:Os05g0163000

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MGDETSTSVATQSQEPAAVGAGSVKQQLSKLVIASLRTTVPEVE VDPMVEVCTAKFGDYQCNNAMGLWSRIKGSGTSFKNPNAIGQAIAKNLPPSDIIESTS VAGPGFVNIVLSNSWVAKRIQDMLVNGIKTWAPILPVKRAVLDFSSPNIAKEMHVGHL RSTIIGDTLARMFEFSNVEVLRRNHVGDWGTQFGMLIQYLFEKFPNWEEIGSQAIGDL QTFYKASKNRFDGDAEFKDRAQQAVVRLQGGEERYRAAWNKICEISRNEFDMVYKLLN VKLEEKGESFYNPFIPQVLEELNNKGLIKESEGAKVIFIEGHQIPLIVVKRDGGFNYA STDLAALWYRLNVEKAEWIIYVTDVGQQQHFDMFFNAARMAGWLPDPKEKKYPKTNHV GFGLVLGSDGKRFRTRSTEVVRLIELLDEAKSRSKSELLQRLTENGKIVDWTEEELEK TSEAVGYGAVKYADLKNNRLTNYTFSFEQMLSDKGNTAVYLQYAHARICSIIRKSNKD VEELKMSGAISLDHPDERVLGLYLIRFAEVVEEACTNLLPNVLCEYLYNLSEMFTRFY TNCQVVGSPEETSRLLLCQATAVVMRQCFELLGITPVYKL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>603..659#768..892#1020..1095#1269..1370#1460..1675#2602..2682#3537..3620#3790..3894#4723..4901#5066..5150#5274..5475#5550..5619#5738..5807#6130..6219#6405..6473#6905..7003#7189..7299#agatgcgagctctcgcggcggcggcggcaacggcaacagcgactgcagcggcggcggcggcgccttcccccgcgcgcttccctctccgcctcgtcgtcaccccgcgcgcctcggtgaggcctctccctcccccccaatccgttcattcacctgccgccttatccgattccgcggcagtaattttggggatttttctcggtggttttggtgcggtttagggtttaggtcttcatgtttaggggatttcgcgggcacgcggcgtgttaaaccagtgggcttattattttggtgggtttactagaatggactagtacgatgatgctcaaatttggttgcgcgagggcgttgctttgaattcgtttttgctgaggaaaattggtatatgatgcgaatttgtgtagtttgtaatggaagagggtgtagatttgttctccctggctcgcaactgaactagctggagttaagatttgagtttagagctccatatgtttgttgcttgattgggaccgtttgctcattttggtggtgactatctctagttaggtcattgtagagcatcttcctccgcaaggtctccgaggagggcctgctacgcgaccaccatgggggacgagacctccacctccgtcgccacgcagtcgcaggaacctgcagcagtggtgagttttggattgctgggtctggacatgactgtattttttgtgcttcccactttgctactcgcttgagctcgttaaatctggaaaatgtgttggttgtctgcacagggagctgggagtgtgaagcaacagctctccaagttggttattgcatcactccggactacggttcccgaagtggaagtcgatcctatggttgaagtctgcacagcaaagtttggtgactaccagtggtatgttattggtttcttgctttagccactgttttgcatctcatgaacgatatttttgcttgctactactcttagctagagtcccttttacaagctaatcaagtgattctttgtaaatcgtgttcagcaacaatgcaatgggattatggtcaagaattaaaggatctggaacaagtttcaagaaccccaatgcaattggacaggttagaatgatcttcacttgttgaagtatggtgttttgcctcaagaaaatttcatagacaaagaaaattctcccataggctctgttactactatttccttgctttttccctctctttctatgcatgctgaaactctgttagacttaacatactggaccattacatttttccaggccattgcgaagaacctgcctccgtctgatattattgaatccacatctgtcgctggacctggttttgtgaatattgtcttgtccaacagctgggttgcaaaggtctggtgtcttttatctgtgaagtatcctggcattactggattactcattccattcctgctaagcatcagtgaactacaatattgcagagaatacaagatatgcttgtgaatggtatcaaaacatgggcaccaatcctgccagttaagagggcagtgcttgatttctcatcccctaacattgccaaggaaatgcatgttgggcatttaagatcaacaatcattggagacacccttgcccgcatgtttgaattttccaatgttgaagttctccgccgtaatcatgtcggggactggggcacacaggtaacaggccttgttgtgacttcaaactgctttactacttctcgttgttgcaaatgttgtttatgatgctttagtttgttgatcctgtttgtttgatgctgcttggattatgcacagtctgccctaattttttttccctgatgggaccgtttcttttgcttctatcttcttactccctccacatcgcaatgtatgtttgtggagttgagagtagttaatataacttcctaccatttagccctaatttcgtgcaacaaaataggctgggtaattgtggcatgccttatggtaggggtatgttggtcatctgcattaacattttcttatagttagtgcattgttggcgtgtgaatgatggccatggagatatattgtgaactgaagggagtacctagatgttcttcatgccttcaatttctctacatcctgatgcacttaaggtttagctattgctatctgttgtgcctgcaattagttgaatagttccgctgacattattttccatgaaatcttacgtaggagggtagaacactttagtttactttatttattgccaaagtatgcactatttctgtactctggtacaatttaactttcttacattttataacccaattttgatttctcgacctgattattgttgtgttttcctttagctgcgtaactgaactttataaccttgcagtggctaggttatactgtcaatatctagatttcctttctatggatactgaaaacatgcttataaagtacttatggcatggtattagagccctgatatcttattttagtggaaacttctactacttgttattcctagaaactaggtactacaattatgcttattctcttggaggtgttcaaaactgagacagtgtactggttttgtactgcatactaaactgtgccgatctttgtttctgcagtttggaatgctcatacaatatctatttgaaaaatttccaaattgggaggaaattggtagccaggctattggtgaccttcaggtaaggctgttccctgcactgatgctagactgctatatatcacttgccgtctggcatgaaaacatagaaatgcatgatgaaaagtaaggcatgctcaattaaagtatataaatgtgtatttagttcgatacgggatatccatgtcaaaacctatatcataaaaatattgacatttgagtacgtaattaattgtataaaaataaattacagtgctgagttattgtcttgttcatgttaggactcatacggtgcttcgcttgtctatatcatttatttggcatcttaaacttctcaagcttaacctgtgcatacaatattgttaggttttagtgttctatgcctatgaaagtgcaaaaggccaataactgatggatgaaatttgtgaatcatgtgatgttattttgcgcaccaaattgcattgcatcgcattgccttttttccccatatctttagctcaagtagtgtgggccaggaggttgatttgaaaactcaatgcatcgaatcttgcttgtagctgcttatttcctattttggtggttgcctacttcccttcctagtaatccatcacaatattttggaactttaaagctgtgctcaaaattatttctgaatatgtatgtcattcaacatacactccttacactgtaatcatacagaaaccatgcacacattatctcatttagttactaccatttgcatgttcagttgtgtacaaatgtatttgtcttcatcggacaatgttgcttccttgtgtcccaattagacttaatttcttcgtgttatgtatttatctttgccaaaggtgcaaagtagcacttagtttgtatcatgtacaatttggtcatctgttacagactttctataaagcgtccaagaaccgctttgatggtgatgcagaatttaaagacagagctcaacaagcagtcgttagacttcaggtcagtgcaccttcttggatctggaatatgttaatgtttttttttttttttgggggggggggagacatggaaacactttgcgtgtcattccattagagatagaaaatgagtatgttaaaattgcatcttatcatcctcatacaatgcctaagaaatatattaactgtagggaggggaagagagataccgtgctgcttggaacaagatttgtgaaatcagcaggaatgaatttgacatggtttacaagctcttgaatgtaaagcttgaagaaaaggtagtgtcacactctattggacgcgacttatatttctttagaaggttgcttatcaataacatgaatttgctacctgaaatttctgtttgttgttttagtagaatatttgcgcaaccatcatccctttccttttctatataggatctgagacttaaacttttactgtatcaatttttatgatatttttggatagattgttctttctcttgttcccatctgagccattttgaaaagtctctgataactaaccactagttttacatgactcaacaaggtgtacctcatcttcatatgaagagtggaaacattttgctgccaaaattttacaaattagtcagttgctgattggggtccttttacttgatatttctctgttgcatagcttgtgattcctattggaagatgtattgacgttcatattccagggatgttagaaacacattcaatttgttgaacttctgtctttttagctgaatccattagtcaatattttcaggagatatttatagggcttcacttatctgttttgtcgatatgtatttgttgaagtttccgatggcactaatattaatttagttggatttctggatttctttcttattagtaaaaacatcagtttgtctgtttatgatctgttacagcttgtatggctgcattttatcttaatccattttgacaatagcacctgtagctgtgtgtacttgctttcaaccaacttttggctattggtatcatgaaatgcttatgtttgtcgttttcttccctgagcatccaagcagcttgttgatttatattttgtagtgttgagaagagagctattcttttcagggagagagcttttataatccttttattccacaagtcttggaagagttgaataacaaaggtttgatcaaagaaagcgagggtgctaaagtgatattcatagaaggccatcaaatccctttgatagtggttaaaagggacggtggctttaactatgcctcaacagacttagctgctctatggtgagttgctaatcgataattttggtgtgttcctacagtgcaattactcttatattagctataatttgcagaaacaaagtgaatatattttcgtagttgattcagtctatttccacaggatcagaatttgtgaatgtaatcgttctatttgtgcttttatgcaggtaccgtcttaatgttgagaaggcagaatggataatatacgtaacagatgttggacagcagcagcactttgacatgttctttaatgtaagaatgcgccctttgtcttcataacatgttacataatcttggtgcaagcaattcttatcagataatcaattagatatattatttcatttccctttgctaaaacttttgttgtgttaacaggctgccagaatggctggctggcttccagatccaaaagaaaagaaatatccaaaaacgaatcatgttgggtttggtcttgttcttggatcagatggcaagcgtttccgaactcgtagtaccgaagttgttcgattgatagagctacttgatgaggctaaatctcggagtaaatcagaacttctccagcgactaacagaaaatggtaaacggtcattattttctagtttctctctcttttgtttgcctgaggtaaaatatgttcatgaatttatttaggtaaaattgttgattggactgaggaggaactggaaaagacttcagaagcagtaggatatggcgctgtcaagtatgtacaagatttcttctttcaggaagacaaatatgttgaactgaaatatgataacaaagctttttaaatgcttatccaattagtactcttatgtttttctgcctgataaacacaggtatgcagatctgaagaacaatcgtcttaccaattacacatttagctttgaacaaatgctgagtgataaggtatttctagactccactatttgtttacttgtataaaagggtgtttttctccattaattttatttgtgttaaaacttttatgcgccacatatttgcttatgatgtattccagtatttgtggaaggatctgttgctctatgttctgcattggatattgaaaatcacagtctatagtggtcgctcttttgcataaatgaaaaaatatgttcttgagtagtttctgggcagattctttatattagtaagtagttggtgaacccattcaccttcttgcttactctcattacttgttattgacaagctcattcctttttgtcaccagggaaatacagctgtttaccttcagtatgctcatgctcgcatttgctctataatcaggaaatccaacaaggatgtagaagagctgaaaatggtaatacttgtgttatttctatgcactgattctattgttgattttataaagtcctgctgttgttattttagagttccatcatctttttttttttacttgagttccatcatcaattattcgttctctttcagctatcagacatggatttaaacacgttgactctgttttcctgtttttcttctcagagtggtgccatttctcttgatcatccagatgagcgtgtcttgggactgtacctgatccgatttgcagaggtatcattggcgctattaactgaatcttttttcttaaagatcttttttcagacctatattttcataaggcctaggaactaaaaatgagctaaaaagggtagtccagtttattcttgaacagcaaacagccgcagtggtctgacagcatgttgattgtgtgctcttgtttggagttgtttgtgcttagcccacaagtaggtgcatgttactgagattttcctgttcaactttaggtgtggttagtgcaagaacaatggaaaaactagaagtcatacattacatcattcagataatagtatttcattcagataattcctacgaggtgtaacaaacaccgataattctatttcatagtttagtcaacaatatggcttaattcacaactaaagcttttttcccctcttctgatttacgtttgctgtgtctgtcaggttgtggaagaggcgtgcaccaacctacttccgaatgtcctgtgcgagtacctgtacaacctttctgaaatgttcacaagattttacaccaactgccaggtatacttccatctgtttacatcattttcccctggtgaatcttactttcttccagaacttgaaaaaaagtttctgacatgttcaccaagtgaattttgtttctcttataaactagagaataattataccaaacattcaaaagaaatgatttttactgcgggctcactttacgttgaacccatcaggtggttggatcgcccgaggagacaagccgactgctgctctgccaagcgacggcggtcgtgatgcgacaatgctttgagctgctcggaattacaccagtttacaagctgtgattgacatttcgatatccatttttcatacaaactttctttcatggttgcagtttttgttatgtaacctagatgatgcttctaacatattctagtcttggttgctgtattcgaagacaccaaagaaagattttatttgatctc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os05g0163000, RefSeq:Os05g0163000