Os05g0240200
| Gene Name |
Os05g0240200 |
|---|---|
| Description |
Similar to CTV.2 |
| Version |
NM_001061533.1 GI:115462796 GeneID:4338187 |
| Length |
8632 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0240200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:8537546..8546177 |
| Sequence Coding Region |
8537798..8537966,8538080..8538252,8538444..8538629,8538903..8538998,8540063..8540191 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:8537546..8546177 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008398:8537546..8546177 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggaggacatcgtcgacacattcttggtgcacgacgatggccctgaccccaccgatccacacatgctcctgcgcctccggaagaagttaggcaagctgttcaagaagagcaaggctcgccgtaagatctctaacctgatccaagacattaacaagaagttcgagcaggtgaaagcaaggcatgtcaagtacacagtcgacagcgttgtcctcaagtctctagcggcaacgaccatcgatcctcgtctccagaatctgtacaaaagggcaacagagcttgttggcattgacgggccaagggacgatctcataaacaagctatccctggggggtgatgttgatgtgtccgacaagaagatgaaagtcatctctgtcgttggatttggaggactcggcaagaccactcttgccaaagctgtctatgaccacttcaaaccgcatttcaagtgcagggcttctgttccagtcgaccagaatcctgacatgaataaagcattcgatgaccaggttgaaccgcatttcgaatgcggagcttttgttccagtgggtcggaatcctgacatgaagaaagtctttagagacattctcattgatcttgacaaggaaaagtacacgaatccgaatatgatggtgttggatgaaaagcagctcatggacgaactcaaggaattcgtcaaggagaagaggtgtttcattgttattgatgatatatgggacaaggagtcatggaaattaatcagatgtgctctgcaagaaagtgattgtggaagtagacttgtcataactactcgtatttctgaagttgccacacatgctggtgaagcttacaaaattcagccactttctcgtgataactctgaaaaattattgtatgcaagaatagttgatggtgaatggaagtatttcgataatccatcagctaaggcatgtgaaaaaattttgaagaaatgtggtggtgtaccattagctatcattacaatagctagtttgttggccagtaaaccaggggaggactggtctgaggtctacaactctgtcggttttgggcatgaagacaatgatgatgtaggtaatactagaaggatattgtcttttagctactatgatctgtcttcacatttaaaagattgcttattgtatctatgtgtatttcccgaagatcatgtgatagagaaaaatagtttgatatggaagtggatagctgaaggtttcatccatgaggaactagcagcagggttaggattatttgagctcggggagaggtgcttcaatgagttgataaatagaagcatgatccagccagtggagacaaaacatgaagggtatgtagatggttgctgcgttcatgatatggttcttgatatgatccactcattatcgagtgaagaaaattttgtcactgtattgaatggtgatgagcgacagaaacttccggggagcattgctcgcaggttagccctgcagcgtgttctagtgcacaaggatggtcagctagctaatatcactctgaagaatgtgagatcccttattgccagtcagtgcttcggttcattatgcctacacactccggttttacgtgtattagatgtgataaactgtgcagaaagtgagacgcctaatgttttggaagatagggacaaaactatgccaagccatcttgggagtttacttcacctgaggtacctcgggttagtagatacatatatcactaagctgcccagggaagtaaggtatctcaagtttctgcagacactggatttaaggggaagtcgcataaaggagctgccagaggaggtgggactgctgacacaacttgtttgcctacgagctgattgggaaataatggtgaagattggtttgatcggtaagttgacctcattgcaagagctttggatagagcctgctgctgctgtttatgatgacgatgctgcttctgttgatgatgatgatgatgctgctgctgttgatgatactacgaagtctacgatgaagtttgtgaatgagctgggcctactgagggaactaagggtgctccggacttattttgaggatttgaatgagagcatggagagagctttgttggaatccctaagcaagctgcacaatatccgggacctgcacattgagggcccacccctagtgacaaggagagtgacaagcagtgcaagatctgtctcctgcctgcatctccgatacctgtgtctgaattgctttgtgttctctggactgccagcatggattaaatcatcgcttgctccgaacctctcctgtctggatgtggttgtgctaattgtgaaagagcaggacatggaaacccttgcgaggttgccagagctccgctgccttgtgctgcgtttgcatgagaccgaattggttagcataaagattcatactgaagatgttggctactttcggaagttgagaatcttaaggatacttggtacatctatctggtttgatctgcacggcagcaagtgcaacatcacagacaatagaagcttagcatctattatcatgccaagtcttgaattcctcgagtttgctgtccatatgcggttcctgaaagatgcaacccagcttggttttgacaagctgcttagcttcgagaagcttggaagaagttcgctccagaaagtcaccatagtactgaaatgtggagatgcccgtctgtcagaggtggaggaagtggctgctgcattgatgaactcagctgcggtccatcccaaacacccaactgttcaaaccaaatggcaagacgaacaagctgtgctctcaccctaccaagaggcatatatgcatgtgagcagaaccccggagttggtaaatgaggcctggaaggcgaacattgttagctctggccgtattcgagcactgcgtatgccagttacagaagcatcttcaagcaaagttatctgtctgctttatagaaaaagtgggaagggacttttagctctcagctcaaatgctgttcataagctgtggaaatgggagagcaatgacaagaatcctgctggcatgtccaccacatctgtcccacctcaagtgtggcaaccggaaagtgacattctaatgaatgacactgctaatggcaaccctgaagaagcagctgcctgcagtctactatccaaaaatgactgctatctaatttctgcatctggtggcaaagtttcgttgttcaacatgttaaatttcaagaccatgactactttcatagcacctccaccctctgcaactttcctcgcattccacccgcatgacaataacatcatagctattggaacggatgactcttcgattctactctacaatatccgtgttgacgaggttaaatgggtgctcaagggccatcagaaaaagataactggactggtattctcgctatcaatgaatgtgcttgtatcttcaggtgctgattctcagctatgtgtttggagtatggaagattgggcgaagaagaaatccagatatatccaacctccatctaatcattctggagctttagttggtgatataatggtgcagtttcactatgaccaaaagcgccttttagtagttcatgagagccaattggcgatctacgatgaggagctagaatgcttgtgctcatggttcccaagtgatccactctctgctccagtttcgagtgcagtatactcatcggatggcttattgatctacgctggattctgtgatggtgcaattggaatatttcaagtggaatctctcatgttacagtgcaggattgcaccttctgcctatataccatcttcagtttctagcggtggtgaaattgtgtatcccatggttgtcgctgcgcatccctggaagcctaaccagtttgcagtcggcatgagcgatggtgcagttcatgtgctggagccgttggacacacccgatgatatcatcagcaattcaattcagcaggggcgttttggtgacagcggatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEDIVDTFLVHDDGPDPTDPHMLLRLRKKLGKLFKKSKARRKIS NLIQDINKKFEQVKARHVKYTVDSVVLKSLAATTIDPRLQNLYKRATELVGIDGPRDD LINKLSLGGDVDVSDKKMKVISVVGFGGLGKTTLAKAVYDHFKPHFKCRASVPVDQNP DMNKAFDDQVEPHFECGAFVPVGRNPDMKKVFRDILIDLDKEKYTNPNMMVLDEKQLM DELKEFVKEKRCFIVIDDIWDKESWKLIRCALQESDCGSRLVITTRISEVATHAGEAY KIQPLSRDNSEKLLYARIVDGEWKYFDNPSAKACEKILKKCGGVPLAIITIASLLASK PGEDWSEVYNSVGFGHEDNDDVGNTRRILSFSYYDLSSHLKDCLLYLCVFPEDHVIEK NSLIWKWIAEGFIHEELAAGLGLFELGERCFNELINRSMIQPVETKHEGYVDGCCVHD MVLDMIHSLSSEENFVTVLNGDERQKLPGSIARRLALQRVLVHKDGQLANITLKNVRS LIASQCFGSLCLHTPVLRVLDVINCAESETPNVLEDRDKTMPSHLGSLLHLRYLGLVD TYITKLPREVRYLKFLQTLDLRGSRIKELPEEVGLLTQLVCLRADWEIMVKIGLIGKL TSLQELWIEPAAAVYDDDAASVDDDDDAAAVDDTTKSTMKFVNELGLLRELRVLRTYF EDLNESMERALLESLSKLHNIRDLHIEGPPLVTRRVTSSARSVSCLHLRYLCLNCFVF SGLPAWIKSSLAPNLSCLDVVVLIVKEQDMETLARLPELRCLVLRLHETELVSIKIHT EDVGYFRKLRILRILGTSIWFDLHGSKCNITDNRSLASIIMPSLEFLEFAVHMRFLKD ATQLGFDKLLSFEKLGRSSLQKVTIVLKCGDARLSEVEEVAAALMNSAAVHPKHPTVQ TKWQDEQAVLSPYQEAYMHVSRTPELVNEAWKANIVSSGRIRALRMPVTEASSSKVIC LLYRKSGKGLLALSSNAVHKLWKWESNDKNPAGMSTTSVPPQVWQPESDILMNDTANG NPEEAAACSLLSKNDCYLISASGGKVSLFNMLNFKTMTTFIAPPPSATFLAFHPHDNN IIAIGTDDSSILLYNIRVDEVKWVLKGHQKKITGLVFSLSMNVLVSSGADSQLCVWSM EDWAKKKSRYIQPPSNHSGALVGDIMVQFHYDQKRLLVVHESQLAIYDEELECLCSWF PSDPLSAPVSSAVYSSDGLLIYAGFCDGAIGIFQVESLMLQCRIAPSAYIPSSVSSGG EIVYPMVVAAHPWKPNQFAVGMSDGAVHVLEPLDTPDDIISNSIQQGRFGDSG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>8212..8380#7926..8098#7549..7734#7180..7275#5987..6115#5656..5832#5459..5569#4993..5112#1887..3987#362..1047#gatctggccggcgagcggcagggacagcagagctgcgcgtccctcctgcttcaggccaagaggaggcggcggatctggggcgggcgggccttccttgctgtctacgacaggcttgttcccgacccccagtttgcaagcatggagctggcgacgggggcgatgaggagcctgctgcccaagctgcttcagctgctcgagaaagagtacggcctgcaaacgggcgtgagggagaagatcaagtctctcacgggagctcgatgtcgtgcacgccgtcctccgcaagatcggcgatgtgccatcggagcaggtcgatgagctggtcaagctttgggcgcgcgatgtcagggaggcatcctacgaaatggaggacatcgtcgacacattcttggtgcacgacgatggccctgaccccaccgatccacacatgctcctgcgcctccggaagaagttaggcaagctgttcaagaagagcaaggctcgccgtaagatctctaacctgatccaagacattaacaagaagttcgagcaggtgaaagcaaggcatgtcaagtacacagtcgacagcgttgtcctcaagtctctagcggcaacgaccatcgatcctcgtctccagaatctgtacaaaagggcaacagagcttgttggcattgacgggccaagggacgatctcataaacaagctatccctggggggtgatgttgatgtgtccgacaagaagatgaaagtcatctctgtcgttggatttggaggactcggcaagaccactcttgccaaagctgtctatgaccacttcaaaccgcatttcaagtgcagggcttctgttccagtcgaccagaatcctgacatgaataaagcattcgatgaccaggttgaaccgcatttcgaatgcggagcttttgttccagtgggtcggaatcctgacatgaagaaagtctttagagacattctcattgatcttgacaaggaaaagtacacgaatccgaatatgatggtgttggatgaaaagcagctcatggacgaactcaaggaattcgtcaaggagaagaggtatgagtgtaatcaccaatccaatgactcactgcttacgttgtgactttgaattccagtatctgtacaattccttccttatatctatttactttattaaataaaggatgaaaggagcacattttacatctcaagtctagaaaatagtacaacgctaatcgatgcagattgatttaatacagtcatgcataaaaatgtaaatgtgttttcagcaagcaaaaacagttgtataatattcagatatattttctcatacaaatgagtattattaatttattatctagccacgcaatcgcaagaaaatcatgctagtcatattattcaaacaaatttaaacatatcaagctcatttgctcccaagagttgcaaaaaacaaccacattaatgagaaaagagagacattcatcatgtcgattttggtaggcccaagctatataataaattaatgatgtaggttaactggttatttgttagagctactgcaaattatatttatataacaacatgcagttgtattttagcactaagcacaagacatacatcacatacaaacattggagatgtaagtacatgtcagttatcctgcaaaaatataagtgcatgattcaattcatgatgtacaaccagctaatatagccaagcccaattcaaaccgactccaatactaactgaattgtagtctgaacaaacttcaaagaacttagccaaatcagattcaaactctaaactcaattttaactgaatttgattctgacccctaactctgactgaaccaagattaactttgaactgcactggttttcctcctgctctgatacttctatccaatcatgacataggtgtttcattgttattgatgatatatgggacaaggagtcatggaaattaatcagatgtgctctgcaagaaagtgattgtggaagtagacttgtcataactactcgtatttctgaagttgccacacatgctggtgaagcttacaaaattcagccactttctcgtgataactctgaaaaattattgtatgcaagaatagttgatggtgaatggaagtatttcgataatccatcagctaaggcatgtgaaaaaattttgaagaaatgtggtggtgtaccattagctatcattacaatagctagtttgttggccagtaaaccaggggaggactggtctgaggtctacaactctgtcggttttgggcatgaagacaatgatgatgtaggtaatactagaaggatattgtcttttagctactatgatctgtcttcacatttaaaagattgcttattgtatctatgtgtatttcccgaagatcatgtgatagagaaaaatagtttgatatggaagtggatagctgaaggtttcatccatgaggaactagcagcagggttaggattatttgagctcggggagaggtgcttcaatgagttgataaatagaagcatgatccagccagtggagacaaaacatgaagggtatgtagatggttgctgcgttcatgatatggttcttgatatgatccactcattatcgagtgaagaaaattttgtcactgtattgaatggtgatgagcgacagaaacttccggggagcattgctcgcaggttagccctgcagcgtgttctagtgcacaaggatggtcagctagctaatatcactctgaagaatgtgagatcccttattgccagtcagtgcttcggttcattatgcctacacactccggttttacgtgtattagatgtgataaactgtgcagaaagtgagacgcctaatgttttggaagatagggacaaaactatgccaagccatcttgggagtttacttcacctgaggtacctcgggttagtagatacatatatcactaagctgcccagggaagtaaggtatctcaagtttctgcagacactggatttaaggggaagtcgcataaaggagctgccagaggaggtgggactgctgacacaacttgtttgcctacgagctgattgggaaataatggtgaagattggtttgatcggtaagttgacctcattgcaagagctttggatagagcctgctgctgctgtttatgatgacgatgctgcttctgttgatgatgatgatgatgctgctgctgttgatgatactacgaagtctacgatgaagtttgtgaatgagctgggcctactgagggaactaagggtgctccggacttattttgaggatttgaatgagagcatggagagagctttgttggaatccctaagcaagctgcacaatatccgggacctgcacattgagggcccacccctagtgacaaggagagtgacaagcagtgcaagatctgtctcctgcctgcatctccgatacctgtgtctgaattgctttgtgttctctggactgccagcatggattaaatcatcgcttgctccgaacctctcctgtctggatgtggttgtgctaattgtgaaagagcaggacatggaaacccttgcgaggttgccagagctccgctgccttgtgctgcgtttgcatgagaccgaattggttagcataaagattcatactgaagatgttggctactttcggaagttgagaatcttaaggatacttggtacatctatctggtttgatctgcacggcagcaagtgcaacatcacagacaatagaagcttagcatctattatcatgccaagtcttgaattcctcgagtttgctgtccatatgcggttcctgaaagatgcaacccagcttggttttgacaagctgcttagcttcgagaagcttggaagaagttcgctccagaaagtcaccatagtactgaaatgtggagatgcccgtctgtcagaggtggaggaagtggctgctgcattgatgaactcagctgcggtccatcccaaacacccaactgttcaaaccaaatggcaagacgaacaagctgtgctctcaccctaccaagaggtaggaactgatcatgcatgcacattgatagaccaacgttggttcatcttattaattcattcccatgttgctttttgtagtaaaggtaattacttcccctatattatgcctcacaaactaggagtcgaatctagccacttctagtttctcttcttttaattagtcctatatccattcctttcccttcttttatacgagtagaaaaattcatgtcctgtctatcatttgatattgcaaaaaacgtacctagatgcatgtttggccttcaatttgattacaatatctttatgaggtacaggcctcttgagggcctatgctactagttgcaccatgtttatattcgagttaagttaccaatggtccttaaacttattccttcttgatttgagttcacgttctcgtgaatcaatatacacatgagcgagcaaaccggaggtatgctactttagcctgcagtagcaagtgtgcactggtgacctggtagtgactccatcggtttaaactgtcagtgggtgccgggccgattcctcagagatacaccaccatgcaaatgtttctaacttggctgatgcctcagttattgttctctcccacagaataacaatttccgaaattgaaaactctgagtatctctggcttgactgtgttctctagtactggttgacgtctccccaccatcactgtcctctgtgccaattcatttcactgcagatttcttcatgacgtggagatgcttcgacacccatctactgccgtgtcctgccacaggaagaccgttgctgctgttgagcttggttggccgttggatgaagaaactgggagaaagaggaaaaataaccactgttttttttaccatgcagcccctgattgtgaatgcccttggttccatttggaatgtgtgtactgtagttatagccaggaactcatgagtggccagctgagtttgctgcactttcttgttcgtttgctgttcaatattatttgctaattgtattgaaaatgcaggcatatatgcatgtgagcagaaccccggagttggtaaatgaggcctggaaggcgaacattgttagctctggccgtattcgagcactgcgtatgccagttacagaagcatcttcaagcaaagtatgttcagcgatgtttgcacgtgcatcttttcgtattagtacgttgaccatgaaatatcaagttatcaacctgaaacataggaccttacattctatttaatgcaaggaagatcacagtatctgttgatatttgcatgtaaatatttcacaagcgtctatatttgttgatattgacattggatgtgatttctcatttttgtgatgtagcacactagaattcaaagcgatagtggtataacttataagctgtattcagagcggtatacaattctggcagttcactagaatattcagatcggtatacaattctgataagcattgtgttttatttcttttctttataggttatctgtctgctttatagaaaaagtgggaagggacttttagctctcagctcaaatgctgttcataagctgtggaaatgggagagcaatgacaagaatcctgctggcatggttagacaggagaactaaattattttgatttcaacagcgcagttctgtttggttgttttcttaaaaccatcactactttttgttagtccaccacatctgtcccacctcaagtgtggcaaccggaaagtgacattctaatgaatgacactgctaatggcaaccctgaagaagcagctgcctgcagtctactatccaaaaatgactgctatctaatttctgcatctggtggcaaagtttcgttgttcaacatgttaaatttcaaggtatgtcttcttcagtcatgtaacacaataatctggtaatttcatgattgatctctcacaggtcatgactacttccggaaaatattttttatttcatagttgcatcgatcatggcctttcttttacttaactgattttgtggaatcactcacagaccatgactactttcatagcacctccaccctctgcaactttcctcgcattccacccgcatgacaataacatcatagctattggaacggatgactcttcgattctactctacaatatccgtgttgacgaggtgagtgttagccgtgcatctcttgtcccctgtttgcataaatctcaaaagtattggcaaaactcactatctatgattcccactggaagtgcagtacccattgtgaaataatatgttctcgtttcagactatatatctcctcatcttttacttatgtatcaggatctggtgagattctaaatgttgttttacatatgttcttttttacataataaattgtgagccttttatggtctttgaggagataccacaaggtacacgcattctatagctattttgtggtatctcttggcaacagtatgaagaaagtggtacccagtatgacccaaaaacctcatatattgtcagctcgacatttgaagatatgggaagtcataatgattgtagatttcataatctacttaagattcataatatgctaagcctaaaagatcacctaatgcggaatattaggggcgctaaccattgtttgaagccattgcacttgttgcgatttcctctcttggaaccggagtgaaagaagaggatggagtctcttgaactgctctggtgttcgttggcggcgtagtagtttaagcagagatgatgtggcaggctggcagcgtcctccggcctccacctgcatcggcctggactgtaccatgtttcccctccagcggtttagcttgatcgggattacgttatttttgtgttggtgagatttgagaccgagagaaaaagttgtcaccttcctctagggtcggcctcccattttattttgcactgaggggaatcgggggctttccaaaaacataaggttttgggcgctaccaatcaatgcacgtgattgcataattatggtaataatcatgagttaaaacatgttaatcacgcggcaatgggtggaaaacggcagtgcgcaattgcctcaaagttttcatgccgagagtcaattttcccaacaatggtaattgattgttcggttcttcctatgtggagtcctatacttaatatactaattaccgtttgtttatatttggcagcaacatgacaaaatattgacttatcttaatcgaattgcacaggttaaatgggtgctcaagggccatcagaaaaagataactggactggtattctcgctatcaatgaatgtgcttgtatcttcaggtgctgattctcaggtgtaaattctaatatatatcaaagatttttggactggcaattttgttgtttattgaatggatgctgagttaaatgtaagctcggtgcatataagcatagcttcaaaatccatatttatatgagtcccatttcaggccattctttagtccattttccaaaagataagaaattaaaaaaaattacatgcttgattgcatggaaaactacgtatattatacttgtttttttctgaatcatttttttttgtgtgtgcaatgaaatggaatttgcagctatgtgtttggagtatggaagattgggcgaagaagaaatccagatatatccaacctccatctaatcattctggagctttagttggtgatataatggtgcagtttcactatgaccaaaagcgccttttagtagttcatgagagccaattggcgatctacgatgaggagctagaatgcttgtgctcagtaagttgttcacaaaatttatatatcaatgtatttgcatctatcacttgctatatgcagtcttgattcggtcttgagtaaacatgttacatcatgctagcagtgagataaatatttatgatgctcctaaccttcacaatatattgtaatcatcactgatatttaacctttcattgattgacaatgtgcagtggttcccaagtgatccactctctgctccagtttcgagtgcagtatactcatcggatggcttattgatctacgctggattctgtgatggtgcaattggaatatttcaagtggaatctctcatgttacagtgcaggattgcaccttctgcctatataccatcttcagtttctaggtatatgcagtgtccaactccaacagtttaattctgtttttgtttcgagtctggtaattttaatgctggtgacctgttaatgctgccctcttgtttcatcttatcaactccagcggtggtgaaattgtgtatcccatggttgtcgctgcgcatccctggaagcctaaccagtttgcagtcggcatgagcgatggtgcagttcatgtgctggagccgttggacacacccgatgatatcatcagcaattcaattcagcaggggcgttttggtgacagcggatgatgtgtggacagggtgctcaatacggttggcaggctggatggcaatacttgcttggcctatggtgatagattatttttttcgccagccggttaagaaagcagaccaaatttcatcaagggaagaagtacttactacaaactagaaagcaaactggaaaggtagcccgcgtgaatgcgcgggcatgcttgttattttgtttaaaaacaggtctaccaaaataagtttaaattaatgttaggtatttcccttttt</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
