Os05g0207900
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0207900 |
|---|---|
| Description |
Peptidase C48, SUMO/Sentrin/Ubl1 family protein |
| Version |
NM_001061438.1 GI:115462606 GeneID:4338081 |
| Length |
14450 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0207900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:6660267..6674716 |
| Sequence Coding Region |
6662435..6662713,6662794..6662872,6662949..6662998,6664266..6664463,6664540..6664597 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:6660267..6674716 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008398:6660267..6674716 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgaatcagcctgaggttaacggtttgttatgtgttggattgcatcaaacagatgggggtgacgaattgtatgcaactgaatgtctaaaaatgaaccagggttcttcacatgaaacaaacaagttggatgcagtaatgtcagcttcaacaatgcacagtgatcataacaatgctaatgcatgcgtagatgattaccaacatacaaagatgatggcaggaattcaacctatggaggaagttggttttggctgtacgcaaccctttgagctgcaatcacaagggatagtacctgattctgaggaagaaagcttgccatctagccctgaaacttcttcaacatccaattatgatatgcctgatttagctgagcaaaacttggagcatatttacaatgttttgggtgaaatggttgataaggaagggccagttgtacttagtccagagtatgtgatgtgcggcacaacttcgcatgtggaacctcgcttaactttctcagcagacggattcaagatcgaatactgggattcttgtgaaaatgatgagatggcagctcaatattggaaaatttctgatattacctgcattgattgtaaatgggcacagagtgttggatctgtcttaataactctccatgttggatccggcacagaaactggaaattctagtcatgatagaatacagttttgtcttattgattcacagtggccaaggaaacagcaaaacatttggcatcttgcatcaagataccaagaaatatggaacaatattccatcgggtgattttgcatcagagaattggaacattgaacccagtttgtttttccctaagcaatacttttctgacactgaagaatttgaagatgttatctatcccaaaggagatcatgatgctgtttccattagcaaaagagatgttgagctgctgctacctgaaacatttgtcaacgatacaataattgacttttatgtcaagcacttgagcacaagaattgaacccgctgagaagcacaggtatcacttctttaatagcttcttttttcgcaagctggctgatcttgacaaagatcaagggagagctccagaaggtagagcagctttcctacgtgtacgcaagtggactcgtaaaataaacatattcacgaaggagtttctgtttattccagtaaacttcaacttgcattggagcttaattgtcatttgttatcctggagaagtggagacatttaaagatggtgacacaaatatctctgcaaagattccatgtatactacacatggattctctcaagggaagtcatagtggactgaaggatatcatccaaagttatttatgggaagaatggaaggaaaggcatcctgaatcagcatcagattgttcggacaagttcttaaacttgaggtttatctccctcgagctccctcagcaggataattcatttgattgtggcttgttcttactccattacgtggaactctttttgatggatactccgagaagcttcaatcctttgaagattgactcgttcgctaactatcttagtgatgattggtttccacctgctgaagcttctctcaagcgttcattgattcgaaaattaatccataagctgttgaaagagccttctcaagattttcccaaactagtctgctgtagtgagcagctggataaaacacatgggagtgagaacgctgagctagaacaaatgagtgagaatgctgagcgagaacaagctaaagagctcccagctcagatgtgcactgatggtgaacctgattcagttggcaccattcttgaaacacagcaaccatccatatcaacatgtttcaattattctgatgaaaacggcccacctgtttctgtacacaacctacataagttggaggtatcgtctgcaaacaaggatgccattgtctgcttgtcaaatcatgatgagaaaaatgagtcacctcctgcagattcttacaatcatcttgatttgagatcatgcgactcagaagaggctgagacagccaagggatcagctggtgttgtgaaagatccgaatagtcataaggagcctttgctggattctctggataataaccaggatatttccatccaagctggagctgagatgcatgacagtatggactccaagttatgttcgatctccaataatgctgacttaatggctagcgaggaacgttcgttagacaagaacaccaatgaaaatgaggagcacaatcgaacctcagaagatatcgtagaatctgtcatgatgcttggcggcagcaaaagtgacactgaacttgatgcagaaccagaaaggactgcaggtgaagctgaggttcggaattgtgatcattctaaggacatagattatattgcattaggtgatatcaacaaagatgctgctaagcaatctttaaataggaatattgttgaagctgaggacattaaatgtgaaggtactcttgtggatcatacagtggtagaagatgcaactccatataatgtgaatgaaactagtgcaagtgccgacaagatcaatgataatgagcataatgtttcatctgagttgaaagaaggaaataacggcaatggtataaccacttcaatttcctgtgaaatggaagatagaagcattgacaatttaatggtaggtgatagcagaaacggaacagatgaaactcgtgcagatggccaagaagctcacgataactctgcaacagctgagacagttccttgcgaagacaatgcaacaaccagcataactgatgctgagatgccacacgaagatagcacatgtagcgtgaagggtgaagcaatttcggataacacagcatctgatgccaaaagacctctgcctgatagcacctacatagaagatatacctgacgacaagtgcttgcagaaagatgatggcgggggtgatgaagcaaaaacagagcggcactacaagcgacggaagtttctggtctctgaagcaacatcttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MNQPEVNGLLCVGLHQTDGGDELYATECLKMNQGSSHETNKLDA VMSASTMHSDHNNANACVDDYQHTKMMAGIQPMEEVGFGCTQPFELQSQGIVPDSEEE SLPSSPETSSTSNYDMPDLAEQNLEHIYNVLGEMVDKEGPVVLSPEYVMCGTTSHVEP RLTFSADGFKIEYWDSCENDEMAAQYWKISDITCIDCKWAQSVGSVLITLHVGSGTET GNSSHDRIQFCLIDSQWPRKQQNIWHLASRYQEIWNNIPSGDFASENWNIEPSLFFPK QYFSDTEEFEDVIYPKGDHDAVSISKRDVELLLPETFVNDTIIDFYVKHLSTRIEPAE KHRYHFFNSFFFRKLADLDKDQGRAPEGRAAFLRVRKWTRKINIFTKEFLFIPVNFNL HWSLIVICYPGEVETFKDGDTNISAKIPCILHMDSLKGSHSGLKDIIQSYLWEEWKER HPESASDCSDKFLNLRFISLELPQQDNSFDCGLFLLHYVELFLMDTPRSFNPLKIDSF ANYLSDDWFPPAEASLKRSLIRKLIHKLLKEPSQDFPKLVCCSEQLDKTHGSENAELE QMSENAEREQAKELPAQMCTDGEPDSVGTILETQQPSISTCFNYSDENGPPVSVHNLH KLEVSSANKDAIVCLSNHDEKNESPPADSYNHLDLRSCDSEEAETAKGSAGVVKDPNS HKEPLLDSLDNNQDISIQAGAEMHDSMDSKLCSISNNADLMASEERSLDKNTNENEEH NRTSEDIVESVMMLGGSKSDTELDAEPERTAGEAEVRNCDHSKDIDYIALGDINKDAA KQSLNRNIVEAEDIKCEGTLVDHTVVEDATPYNVNETSASADKINDNEHNVSSELKEG NNGNGITTSISCEMEDRSIDNLMVGDSRNGTDETRADGQEAHDNSATAETVPCEDNAT TSITDAEMPHEDSTCSVKGEAISDNTASDAKRPLPDSTYIEDIPDDKCLQKDDGGGDE AKTERHYKRRKFLVSEATS</aaseq> |
| Gene Sequence |
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