Os05g0215600

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os05g0215600

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001061468.1 GI:115462666 GeneID:4338114

Length

6553 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os05g0215600, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:7143688..7150240

Sequence Coding Region

7143803..7144221,7149444..7149927

Expression

GEO Profiles:Os05g0215600

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgggcctcctcgtccacctccccaacctcgccggcgcccgccgcccatcgccgtgcggcggccaccggagggcccgcggcggcgcgcggttctcggtgtccgccgcggcgcccggcgggggcgtcaaggaggaagaggaagaggaagaggaggaggaggagaaggggacgagggggaaggagagaatagtgattcgggtgtcggacccggtgcgggagaggcggctcccgccgccgctcttctcgtccccggacgccccctcgccggcggcggggcggcggcggaggaagggggaggacgaggacgacggggaggaccggcggcggcggtaccacgtcaacgtcggggacgccatccgggcgctgcgggaggagctccccgccgcgttctaccgggagcccagcttccatatctacagagatgatattgtcttcaaagatcctatcaataatttcacgggtattgataactacaaaaggatattctgggctctacggtttactgggcaaattttcttcaaagcactatggatcgacattatcagcatatggcagcctgtcgaggatgtaatcatgatccgctggattgtccatggcattcctagagttctctcggatggccctggcagatttgaaggcacctcagagtataagtttgacaagaatgggaagatctatgagcataaggttgataatgttgccaagaacacaccaacgaaatttaaggtcttgccagtcgtagagctcatcagatcacttggatgcccatctactccaaaaccaacatattttgagacgtcgtccctacagctaatatcgctcttgccattctggttcaaattgacttggatgagatgctacttgtcattgtaccttatcctagcaaatttatcaaaaggatga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MGLLVHLPNLAGARRPSPCGGHRRARGGARFSVSAAAPGGGVKE EEEEEEEEEEKGTRGKERIVIRVSDPVRERRLPPPLFSSPDAPSPAAGRRRRKGEDED DGEDRRRRYHVNVGDAIRALREELPAAFYREPSFHIYRDDIVFKDPINNFTGIDNYKR IFWALRFTGQIFFKALWIDIISIWQPVEDVIMIRWIVHGIPRVLSDGPGRFEGTSEYK FDKNGKIYEHKVDNVAKNTPTKFKVLPVVELIRSLGCPSTPKPTYFETSSLQLISLLP FWFKLTWMRCYLSLYLILANLSKG</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>116..534#5757..6240#attctactccagaagtccagaatcgaataagtaaaagacaaaatcaaaaattcagaccaaaaaaaaaatcagagaaatgaaaagaggctgagcaacaactcacctcacggcggcaatgggcctcctcgtccacctccccaacctcgccggcgcccgccgcccatcgccgtgcggcggccaccggagggcccgcggcggcgcgcggttctcggtgtccgccgcggcgcccggcgggggcgtcaaggaggaagaggaagaggaagaggaggaggaggagaaggggacgagggggaaggagagaatagtgattcgggtgtcggacccggtgcgggagaggcggctcccgccgccgctcttctcgtccccggacgccccctcgccggcggcggggcggcggcggaggaagggggaggacgaggacgacggggaggaccggcggcggcggtaccacgtcaacgtcggggacgccatccgggcgctgcgggaggagctccccgccgcgttctaccgggagcccagcttccatatctacaggttcgtgaatcgtgagtcgtcgacctagattcccatgctttcccttgtcgggggatgatgatgattgttgatttgcgttgacggtgaaactgtggcgtagatttgacccttttctcagcgcacgagtggcactctaatgtgctctcttaagtcaaaaattggggagagaaaaatggtgatttctagtatactttatgaggtgttcttaggccgaattggagagatgatttgcaaaatttttgatgttttagtcgtgtcgtggccatagctaaaggattgttatcaggacttagataacatagtcaagtgcgatagagtctttctcagtggtttagtggtgtggttagaaaggctatgagttataaaaagtcaatcactcattatcttgttggtaaaagtactggcctcattatttttaattattaatttaaactaggaaggtagcccgcgcagatgcgcgggcaccttatttagtgatatttgaaattttgtaacgaatgtttatatataggattgtttttaaaaaatattttttactcttctaaatctatgtttatcaatatttttttggattgttttgaaagtcggtttcaatcactggatgtacggacacgcgttaagaaggtacatgctcctggacatttgtctatatgcttatgtgactatggaggtaaggtggaccaacatggacgtcgggtcctttaagggggtttatgtgacatcctagtgcaattaggatgtggtctatgttttttttatttaaaggatatgatctgtgttgtccataagcattgtgtgcacttgtgtccataagaatgaaagtgtaagtgatgtgatagcgtaagtgagcgtgccagttggatgcatgctgagctgccttgttttgaaggacgggttgttacaaattgtaaacaaattaaatcacttaaatttataagaaaaatgtctcaacaatagagttggttcatatgaaactatcattttatactactgtgtttttttaatttaaacttttaagtaatattttttccttgtatactaaacatgtctttgtagattttaggacaataatttaagaaattttctattaaaaatatgataatatgacttctttatctaattaaagacatactcacgtacttatatttacttctactacctacatccataaatcgaaggattcaaattttatcctaaaatataagagatttttaatactactcatttcatccaaccatttttcatttaattgttatccaacattactctaaccatcttctaactctttaaataccccttatttaatgatggatatcttagttttttttttcattcctccttaattcctataaaattttagaatccattataggatggagatatatagtaataaaaaagagcttcattcatagacatatttatttgtacctttgagattgatttagctttacatatttgtataggtaaatagacttcgtatgcaagttgagaaatataattaagttggtagaaagtcgttagatatctaatggtataaagtaattagtacacaaattttattaaaacattaaggtggattttttggggggtaatttttaggatcttttggttaacaattgttgtaaggaaaacaaagaggcgttggattcgtctcgtccatgaggagggaactgtatacatgtgttgtacatacgcactctgacgaactgatcgtttggtagggtttttttaagatatagatctaacagtttataacggtttaaaataagatccatcggtttgggtaaaataattttttttccttagaatttcttatacttactttaatttattagagcgtcgtgtggtagcttagaaatgtttataggaagccatgtatacagcttaagagcatttgtaagatatctaatggacttttagtatataataatagataattcatgtcatattaattaatatatcaattaataattaattttttttataatttttttatgggttcgccactgaaaagaaatggtatatatcaaagtgatatccggataattttttcttacttcgtcactgaagggtatattcatccaagtgacataataatttctatatagaaacatatgtaccaagagattatttttatatactgtgtatttggttgttagcttaaaaaataggaaagaactcggagagacacagaagggaagagtcagagggagggggtggaatggggtacgtacatacatgtgaacgcattatgttttcttttcggaacatataatacctattgaaacgggaacgtgcagatttttttcttgaagataagatttaatggtgaaaaaatttaattgtttaaaatattgggtctaccggtctaaatgaaagtgccacgtagcgatgtaggagcttttacaggagtgccaccggacataaattaagtacaatgagatagataatcgtacatatgatgcctataatgtctatccacttaccataattatcaccgttttcactctatattagttagaaaccatagttaataaatagctaatttttatcggtttaagtcattggattatttatagtttatagttaaagaaatatgttattttgaattttattgtgactttttagtatcatttaaacaaatattaaaaaaatgaaaaaaatgatatatatttgaccggctgaaaaactacatatcaaatatcatatgtcgtattctattgtgcactaaattaattatagccaaagtaagtcatgaatgtaaaatcacaacaaaataaatgataattacgtattttcttttagtcaaacgaatgataaaagatactatcaaatataaaaaggtcaatagtgtaaagaccggaggtaatataaatatattatgagggaaataaaaaaaagagggtgaatgaggagaaaagaaatgaggagtccggtacctacggtacctgtgtacgtacgtgtgaggttcacgtacacgagagagagagaggagagggagagattaaattctgtttttaatctaattaaatctaatggtctaaaataatggacccaccaatttaaatgaaaatcgatggctcgatattcctaatctattagaacgccacgtggcgatttaggagcgtttataggaatgccacatggcggtatgagagcgtttgtagtatgtttaatggacttttagtatataatagacttgtggaactatgagagaattattggtgtggatgccaaaaacacaaaatgtcacaataaaactttggtatcaaggtgttcttcttgctactactaattgagcaaagcaaaatttcaattttattcttagccacaaaatattatggttttcttagtccacacatgctgtctgtgaagcaccaagtatggaaccagcacccgattacttcaatatcctttaccccaactttgccgcctgtatttcttattcaaagttattatttccagactacaaaaaaggcccattttgtttgttataaaccacgctcaagttaagtttagcattaatcctcagcttattttgaatggattcaaattttcctaattacatttgatatacctctagagggtatcagaatccatacgcacattaccaataaggtaaggagacattacaaattgtaaaatacagaacgaaatgtttggcatcaatagcattatttcctctctttttttttttgcctgaagaagatacacttactcattaagaaatgtatggaggccattgcttatatcaacaaaataatgtggtaacttcttagattagcatgttatttgtacacaaactggttgtgtcaaggttttctgcagccaaatgagggttgatgatgtcagattgtcagatgcagcccattatggtaccatgaaagttacaatatgggattccatggggcagcagctacatacaacttgctagctcatcaacagatggccaacaaatgagaactctctgcctgttttcatttacttcgcacgttaacttactactccctccgtttcatattataagtcgttttgacttttttctagtcaattttttttctagtttgacttagtttatataaacatatagcaacatttttaaaacaaaacaagcatactgtcaaaatatattctatattgcatttactaaaactaatttggtgttgtagatgttgcttttttttttacaaatttaatcaaacctaaagaaatttgattaggaaaaaagtcgaagcgacttataatatgaaacggagggagaattaaattgtgactactactaatttcatatttattctgtttagatgaatggaagtcaccgttggatttgtgatgcaatgcactttagtactattggtaaaagaacaacatatggtttacatagcaaaaacaagtgtcaagtatttggaaacggaggtcaagtatttggaaa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External Link(s)

NCBI Gene:Os05g0215600, RefSeq:Os05g0215600