Os05g0219300
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0219300 |
|---|---|
| Description |
HAT dimerisation domain containing protein |
| Version |
NM_001061477.2 GI:297604065 GeneID:4338123 |
| Length |
6310 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0219300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:7313375..7319684 |
| Sequence Coding Region |
7313375..7313510,7314175..7314199,7314305..7316076,7316459..7316505,7316620..7316736 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:7313375..7319684 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgtcagtcgcattactgctgtcaaaggatctcgttctcacgctcatcccatgcatccacatacatgacacgacgtgcatctatgacagtccagtactctccaaacctagcgtcatcagtcgtccatggctccactccttccgccgccgccgctccctccccttgcttcgcctcctccacctctccgccaccgtccgcgaatccgccgccaagccgtcgccggtgcaggtgaagcagaagaagaggaaggtgcgtgcgccgccgggcgctggcgaggatgtcctcctctggcggtccggccgcgtcgccaatctccctgagaagcccaagtaccacgacgagttccaagatttcaagaagaagataaggaggtatagtgaatgcagcttaagattgacagccaccaaaaagtcaggaacaagtcaccttattaatcacatagccgaatcatgtccagctattgatggtgatgctagaatcaacttccttgcaacaattaagaaacagactggggaaggtttcgtgtttgttcccaagagaagccgggagctaatggtcagattcttcattcatgcagaggtgccattcaagaaaattgaggatccttattttttggagtgggtggagtccatgcagccaactttcaaagttgtggggtgtcaaacacttcgtgatgatgcctttaacttgtatgagcgaatgagggaagacttgcatgctgaattacataatcttgattcgcacgtatgtctaacatctgatatgtggacttcaattcaaaatataggctacatggttgtcacagcacactatattgatagagagtttaacattaagaagaaaattataagctttaaggaattgaagtatccccacacgggattcgccattgaagaagctataatgagttgcttgacatattggggcattagaagcaaactgtttactataactttagataatgccagtaataacaattctgcatgtcaagagttgataaagaatcacaagaatgcattgatgtttgagggtcagcatttgcatgttagatgttgtgcccatatcctaaatattttggttcaggatgatatgaagataattaaacctacaatacacaagctacgtgagttgttgaagcatttagattcttcagtatcaagaatgcaagatttcaattctatggcaaactcgaaaaatcttccttcgaagttgagtttttcttttgatacaccgactagatggaattccacctataaaatgattgtagaaggattaatgtacagatctgtcctggatagctatgcaaatcaacatggtgaagttgcacctactgaactagaatggcagaaagttgaatcaatttgtgcttttcttaaagtttttgaagaagccacattatcggtgtcagcagataggaaaccaacagcacataggttcttgcccttggtgctacaaattcgtcatgcattgaatgaccctgattggcagactagtgatattttaaaggtattggctgcagctatgctctcaaagtttgtcaaatattgggacagtgggtttaactctgcacttgtcattgccacaatgttagatccaagaagaaaaggagattatttgaatttcttttatgagaaaacatctaacagtgtgacagagattgtagaaaaagtgggttctgctgaagattggttgaaggattattatgaaaaatacgaagggtttgtaagaagaaatgatgaacacatgctttcacattctcgtgaaggcagcagcagtgttggatcacctgttcttgggaaaagaaaactcgaggaagagtttgctttatacaagtctcgaaggaggactgcacggcaaacgaaatcagaatttgccatatatttagaagaagatgttgaggaggatagtgagagtttcgatgttttggactggtggaagagacatgctcaaaaattcccggtattgtcatctatggccagagatttcctagcaatacccctcagcactgtatcttccgaattagcattcagttgtgggggcaggatacttggtgacacacgaagttcgttaacacctgaaatgcttgaagctctcatttgtgcgaaagattggttaattaaagccaacgatcctttgatcaatattccaggcgctgaaggtggtgaagtgaagaagatggaaagtgtgagtgttcgccggctgctctgctctgctttgcttcctgccgtggattgggtatgggttggaaaatggattccacccgtggattgtgttgaatttggactgagcaactttgtgggttgggttgggtggggttag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSVALLLSKDLVLTLIPCIHIHDTTCIYDSPVLSKPSVISRPWL HSFRRRRSLPLLRLLHLSATVRESAAKPSPVQVKQKKRKVRAPPGAGEDVLLWRSGRV ANLPEKPKYHDEFQDFKKKIRRYSECSLRLTATKKSGTSHLINHIAESCPAIDGDARI NFLATIKKQTGEGFVFVPKRSRELMVRFFIHAEVPFKKIEDPYFLEWVESMQPTFKVV GCQTLRDDAFNLYERMREDLHAELHNLDSHVCLTSDMWTSIQNIGYMVVTAHYIDREF NIKKKIISFKELKYPHTGFAIEEAIMSCLTYWGIRSKLFTITLDNASNNNSACQELIK NHKNALMFEGQHLHVRCCAHILNILVQDDMKIIKPTIHKLRELLKHLDSSVSRMQDFN SMANSKNLPSKLSFSFDTPTRWNSTYKMIVEGLMYRSVLDSYANQHGEVAPTELEWQK VESICAFLKVFEEATLSVSADRKPTAHRFLPLVLQIRHALNDPDWQTSDILKVLAAAM LSKFVKYWDSGFNSALVIATMLDPRRKGDYLNFFYEKTSNSVTEIVEKVGSAEDWLKD YYEKYEGFVRRNDEHMLSHSREGSSSVGSPVLGKRKLEEEFALYKSRRRTARQTKSEF AIYLEEDVEEDSESFDVLDWWKRHAQKFPVLSSMARDFLAIPLSTVSSELAFSCGGRI LGDTRSSLTPEMLEALICAKDWLIKANDPLINIPGAEGGEVKKMESVSVRRLLCSALL PAVDWVWVGKWIPPVDCVEFGLSNFVGWVGWG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6175..6310#5486..5510#3609..5380#3180..3226#2949..3065#2689..2825#1..85#atgtcagtcgcattactgctgtcaaaggatctcgttctcacgctcatcccatgcatccacatacatgacacgacgtgcatctatggtttacttttcctattgtagctcagatcttggtcgccaaggaattaaggtcaagtagaaaggtagagttcaatatagtttcttaattaataaatatcgagaccattcttctataatagttgagacaatataaatgagaccattcttctataatagttgagacaataaaatttatatgtgctaatgatagtttaattagactcaaaagattcgtctcacggtttgcaagcgagtaattatgaaattagttttttcattcgtgtccgaaaaccccttccgacatcccgtcaaatatctgatgtgccaatccaaaaattttttttcgtgaactaaacacaccctgactgaagataatcttatgtacactctgtcagttagaggtgcaaaatctattactctaagtcttatagtccccaaaagaatccctaaatatacttagacttgtttaaaggtcttataatataaagttccgtttgatctaaaccaacaccactaatacaagtgagctacctcacagactcctgaggcaaggtgaagtgaatagcaattcaagtcaagtgataatctagtggactggtcgcctagtctctcttcacctgttaattcttggaaacttgttctgaaaattaggatgagaagactttgaggttttctacattcaaggaaaaagcaccctagaacatgacccacattatggtctgactagtctattgtgttatcctctttttccctttagtgagtggagctgttgttcctcacataaggattttaacgaggcaacaacgtgtaatgtatgagcaacaactattttattcccattaggttttggtaggagttatgatgaggcataggttagtcgtggatacatccaaggggaagtgttacggaacaatatctcctacggagataaattactttcttctggaccaatccgaaccggagtgaagataaaatctatctcctttctaagacccctatatatacaagagtagagtgagatatctaaggttggcttatactcgagatcagatctataatgaagagatagcttcacctaaaatctgtatttgttgtgtacttctgcattgttcttaagggtaaagggatgggatgggtgttgtacatcttctcacaccttaattaatgttgcggaaaggataaagaacggattcgatgatccacacagcaagacttaggttgtgttcgtgaggatgggttgggaaccatgcacgcaaaacgaagcgaccgtttaatacataattaattaagtattaactaaaaaatggattaatatgatttttaaaagcaactttcctatagaaaacttttaaaaaaactcacattttaggaatttgaaaagcttgcgtgtggaaaaatgagggatgtgagttgagaaaaaaggggaaagaacacgaccttacagtttgatcccatttttctcctcgtcttgctccatagcagcggcggagctagggcccggcaactctgggcagttgcctaggctccggcgccgcatgtatcattagattagtgctaaatcttagtgcttagccacatcatgcagcagtatacttggttgggacacttaataatctgtgtaagtattagagagcatgcttaaccacagcatgcagtagtacatgtaagagcactcgcaatggtaaagtatggtgctcttaaaatatgtgcatctcagcaatagactagattaatagtaaaccacctcaatggtatgtctacatgggtatctatagctctctaatgcattgcctcatttttctctatagactatctctaggttagtagatagttttgctctccctcttcatttaatctcttccaagtaggaaaatatgctgacatggatctctattgtgagtgccctaagtacgtttttatattctgttaatagatgttagagacaaaaccatttagaataacctgaagcaccataattgtttattagatcagtgtacccattacttaattgcaaactattagatgtctgtaacataaagacagtaaattttctagcactcatgttgattttttttcttttcaagataataaatttctaagtcccttagtctgtaaaaacacaaccattgttttcctctaaattagaatacgataaaaaattgttgtatggtacactctatagagttacatgaatttgttatatatccgttggcgttattaattagacttgcttaaggtaacaaaaatttctagatccagcactgctctatggtgcattttctcatgaaggcgccttccaccgtcaccgtgtacatttccttcatttgaacttgctgtttctgacgggccggcggccggcctcagagatgattgctgttccgactttctcttcggctgctgtcttagcccattggacctaagcctgccaatgggctggattgaaatgggcccaatggattggtttcaggtttgggtgttgtttggatggatggaaatggattgaggagtttaatgggctggactggttagggtggaggtggaaacggtttggattggattggtttttggtttctgatttttggatccaaattggattcagtccatggatttctttggatgcactagacagtccagtactctccaaacctagcgtcatcagtcgtccatggctccactccttccgccgccgccgctccctccccttgcttcgcctcctccacctctccgccaccgtccgcgaatccgccgccaagccgtcgccggtcagattccctcccccaccaccattgcttttctttttccctggtttttctcggtctttgatctatcctggttgttttgtttgtgtttttttttgggtctcttcctgatcttggtggttgcaggtgcaggtgaagcagaagaagaggaaggtgcgtgcgccgccgggcgctggcgaggatgtcctcctctggcggtccggccgcgtcgccaatctccctgagaagcccaagtaccacgacgtatgtgaacagtgtgattggtgtgatagtttctataagattttgttttttttgttggttttactgagaagttaacttgctcaagattacaatcttcgatgggtttatgtgcaggagttccaagatttcaagaagaagataaggaggtatagtgaatgcaggttcccttcatctcccaatgcaaattatttaacatatcattacagattgagtcctgatatgattttgagatgcaaattaattctatggtcaatcgaattttagtgtgcaatttttagattgtagcacgtgtacaatgtgtgaaaaaaataattatagaccatgttctttcaactatcttgattttagatttcttcctctatgcagacaattgaacaaactcaataataaatatgtccatacaaatgtcagagagttcaggtactaatagtccaaataataatcaatcttcaagaacacgtaagagagctaaagtatgggaacactttcagcaagaggttgtaatgatagatggtgtcccaagactcaatgcaaatattgtagcttaagattgacagccaccaaaaagtcaggaacaagtcaccttattaatcacatagccgaatcatgtccagctattgatggtgatgctagaatcaacttccttgcaacaattaagaaacagactggggaaggtttcgtgtttgttcccaagagaagccgggagctaatggtcagattcttcattcatgcagaggtgccattcaagaaaattgaggatccttattttttggagtgggtggagtccatgcagccaactttcaaagttgtggggtgtcaaacacttcgtgatgatgcctttaacttgtatgagcgaatgagggaagacttgcatgctgaattacataatcttgattcgcacgtatgtctaacatctgatatgtggacttcaattcaaaatataggctacatggttgtcacagcacactatattgatagagagtttaacattaagaagaaaattataagctttaaggaattgaagtatccccacacgggattcgccattgaagaagctataatgagttgcttgacatattggggcattagaagcaaactgtttactataactttagataatgccagtaataacaattctgcatgtcaagagttgataaagaatcacaagaatgcattgatgtttgagggtcagcatttgcatgttagatgttgtgcccatatcctaaatattttggttcaggatgatatgaagataattaaacctacaatacacaagctacgtgagttgttgaagcatttagattcttcagtatcaagaatgcaagatttcaattctatggcaaactcgaaaaatcttccttcgaagttgagtttttcttttgatacaccgactagatggaattccacctataaaatgattgtagaaggattaatgtacagatctgtcctggatagctatgcaaatcaacatggtgaagttgcacctactgaactagaatggcagaaagttgaatcaatttgtgcttttcttaaagtttttgaagaagccacattatcggtgtcagcagataggaaaccaacagcacataggttcttgcccttggtgctacaaattcgtcatgcattgaatgaccctgattggcagactagtgatattttaaaggtattggctgcagctatgctctcaaagtttgtcaaatattgggacagtgggtttaactctgcacttgtcattgccacaatgttagatccaagaagaaaaggagattatttgaatttcttttatgagaaaacatctaacagtgtgacagagattgtagaaaaagtgggttctgctgaagattggttg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|
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