Os05g0305300
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os05g0305300 |
|---|---|
| Description |
Protein prenyltransferase domain containing protein |
| Version |
NM_001061683.1 GI:115463096 GeneID:4338363 |
| Length |
3053 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0305300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:13773013..13776065 |
| Sequence Coding Region |
13773013..13775508,13775644..13775669,13776029..13776065 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:13773013..13776065 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008398:13773013..13776065 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggacatttacagtcacatgctcaggtggataatttctatgcttttgaacttgcctaaggcgataattgcttctggtcttctttctttgcccacaccattattgtcagtctcactgccagcattgccatccgaaccatttatatctccaagatctctgggtactggtgtcgtagcttcttatcttgcttgtggtgctaccgactatgctctcttggtgttggaacgtgttacaccgtcaccagctgtgtggtggaatctacttatccgagaacacatcaaacaaggccgccttgacagtgcaattaatgtctcttgccgcatgctgcgtgctggaactaggctggaccattttactctaccacatgtattaaaagcatgtggagagctaccttcataccgttgtggtagtgcattccatggattgatatgctgcaatggctttgagtccaatgtcttcatatgtaatgcgttggtggcaatgtattcccgttgtggttctttggaggaagccagcatgatctttgatgaaataactcagaggggtattgatgatgttatctcatggaactctattgtttcagcccatgttaaaagtagtaatgcttggactgcattggatctgttttcaaagatgacattgattgtccatgagaagcctacaaatgaaaggtcagacatcattagcattgtcaacatactccctgcatgtggttctctaaaggcagtacctcaaactaaagaagtccatggtaatgctattcgtaatggcacatttctagatgtttttgttggtaatgccctgattgatgcttacgctaagtgtggtttgatggaaaatgcggtaaaggttttcaacatgatggaattcaaagatgtggtttcttggaacgcaatggtggctgggtactcccaaagtggcaactttaaggcagcctttgagcttttcaagaacatgcgcaaggaaaatatcccattagatatggtaacatggactgctgtaattgcaggctattctcagaggggatgcagccatgaagcactcaatgtatttcgtcaaatgatattttctgggtccttgccaaattgtgtcacaatcatctctgtgttgtctgcctgcgcttctttgggagcattttctcagggtatggaaattcatgcctactccctaaagaactgtcttctaaccttggataatgattttggtggtgaggatgaggatcttatggtgtacaacgcgctaatagatatgtactcaaagtgcagaagcttcaaagctgcacgctccatatttgatgatatacctctggaggaacgcaatgttgtcacctggactgtcatgatcggggggcatgcacaatatggggactcaaatgatgccctcaagcttttcgtggagatgatttcggaaccatatggagtagccccaaatgcttatacaatttcgtgcattttgatggcctgtgcacatttggcagccatacgtataggtaagcagattcatgcttatgtgcttcgtcatcaccaatatgactcatctgcatactttgtggcgaactgcctcattaatatgtactcaaagtgtggggatgttgatacagctaggcatgtattcgatagcatgtctcaaaagagtgctatttcttggacatcaatgatgacagggtatggaatgcacggtcgtggtagtgaggccctggacatatttgacaagatgcggaaagcaggctttgttcctgacgatataaccttcctggttgttctttatgcttgtagtcattgtggaatggttgatcaaggtctatcgtactttgacagcatgagtgcagattatggtttgacacctcgggcagagcactatgcctatgctattgacttgctggcccgctttgggcgattagataaggcatggaaaacagttaaggatatgccaatggagcccaccgcagtagtttgggttgcattactgagtgcctgtagagtacattcaaatgttgaacttgctgaacatgctctgaacaaactggtcgagatgaatgctgaaaatgatggatcttacacgcttatctccaacatatatgccactgcagggcggtggaaggatgtagcgaggatcaggcacttgatgaagaaatcaggaattaagaagaggccaggatgcagctgggtccagggtcaaaagggcacagcatctttctttgtcggagatcgatcacacccactatccccacaaatttatgctcttctggagagtctaattgatcgcatcaaagctatgggatatgttcctgagacaaacttcgcattacatgatgttgatgaggaagagaaaaataatcttcttgttgagcacagtgagaaacttgctcttgcatatggtctcctcacaactttccctggttgcccaataaggatcacaaagaacctgcgtgtatgtggtgattgccatagcgcattcacctacatttccaagattgtggaccatgagatcgtagtgcgcgaccccagtcgttttcatcatttcaagaatggttcatgctcatgtggtggctattggtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDIYSHMLRWIISMLLNLPKAIIASGLLSLPTPLLSVSLPALPS EPFISPRSLGTGVVASYLACGATDYALLVLERVTPSPAVWWNLLIREHIKQGRLDSAI NVSCRMLRAGTRLDHFTLPHVLKACGELPSYRCGSAFHGLICCNGFESNVFICNALVA MYSRCGSLEEASMIFDEITQRGIDDVISWNSIVSAHVKSSNAWTALDLFSKMTLIVHE KPTNERSDIISIVNILPACGSLKAVPQTKEVHGNAIRNGTFLDVFVGNALIDAYAKCG LMENAVKVFNMMEFKDVVSWNAMVAGYSQSGNFKAAFELFKNMRKENIPLDMVTWTAV IAGYSQRGCSHEALNVFRQMIFSGSLPNCVTIISVLSACASLGAFSQGMEIHAYSLKN CLLTLDNDFGGEDEDLMVYNALIDMYSKCRSFKAARSIFDDIPLEERNVVTWTVMIGG HAQYGDSNDALKLFVEMISEPYGVAPNAYTISCILMACAHLAAIRIGKQIHAYVLRHH QYDSSAYFVANCLINMYSKCGDVDTARHVFDSMSQKSAISWTSMMTGYGMHGRGSEAL DIFDKMRKAGFVPDDITFLVVLYACSHCGMVDQGLSYFDSMSADYGLTPRAEHYAYAI DLLARFGRLDKAWKTVKDMPMEPTAVVWVALLSACRVHSNVELAEHALNKLVEMNAEN DGSYTLISNIYATAGRWKDVARIRHLMKKSGIKKRPGCSWVQGQKGTASFFVGDRSHP LSPQIYALLESLIDRIKAMGYVPETNFALHDVDEEEKNNLLVEHSEKLALAYGLLTTF PGCPIRITKNLRVCGDCHSAFTYISKIVDHEIVVRDPSRFHHFKNGSCSCGGYW</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>558..3053#397..422#1..37#atggacatttacagtcacatgctcaggtggataatttgtaagcatcgcaatgctttagtgctacatagtacaagctttgggcatgaatattgtcactgggagttgacaattgatcttgcatgatgttaggttgttaaaaccccaataatccagataagaaggattttacaggatggtaggatactacaaactacctttgattctgcaaccctgatggatagcatgcctattcccctttgtgatctttgacttattcttcctttacattacattgttttgcattagattgatgtaatatgtatgatggcttttgctaattcagttatttttggtcatacagtgatgcaatggctgtttctttgaggattcattatgcataatggtattctactgcagctatgcttttgaacttgcctaaggcggtaaaaccaattggagtacggttcctttaaggtgcaagggcagcatgcgttggtgtagatgtttatcctagtcactttgcatccctattgaaggaatgcaagtctgcaaatacagttcatcaaattcaccaacagataattgcttctggtcttctttctttgcccacaccattattgtcagtctcactgccagcattgccatccgaaccatttatatctccaagatctctgggtactggtgtcgtagcttcttatcttgcttgtggtgctaccgactatgctctcttggtgttggaacgtgttacaccgtcaccagctgtgtggtggaatctacttatccgagaacacatcaaacaaggccgccttgacagtgcaattaatgtctcttgccgcatgctgcgtgctggaactaggctggaccattttactctaccacatgtattaaaagcatgtggagagctaccttcataccgttgtggtagtgcattccatggattgatatgctgcaatggctttgagtccaatgtcttcatatgtaatgcgttggtggcaatgtattcccgttgtggttctttggaggaagccagcatgatctttgatgaaataactcagaggggtattgatgatgttatctcatggaactctattgtttcagcccatgttaaaagtagtaatgcttggactgcattggatctgttttcaaagatgacattgattgtccatgagaagcctacaaatgaaaggtcagacatcattagcattgtcaacatactccctgcatgtggttctctaaaggcagtacctcaaactaaagaagtccatggtaatgctattcgtaatggcacatttctagatgtttttgttggtaatgccctgattgatgcttacgctaagtgtggtttgatggaaaatgcggtaaaggttttcaacatgatggaattcaaagatgtggtttcttggaacgcaatggtggctgggtactcccaaagtggcaactttaaggcagcctttgagcttttcaagaacatgcgcaaggaaaatatcccattagatatggtaacatggactgctgtaattgcaggctattctcagaggggatgcagccatgaagcactcaatgtatttcgtcaaatgatattttctgggtccttgccaaattgtgtcacaatcatctctgtgttgtctgcctgcgcttctttgggagcattttctcagggtatggaaattcatgcctactccctaaagaactgtcttctaaccttggataatgattttggtggtgaggatgaggatcttatggtgtacaacgcgctaatagatatgtactcaaagtgcagaagcttcaaagctgcacgctccatatttgatgatatacctctggaggaacgcaatgttgtcacctggactgtcatgatcggggggcatgcacaatatggggactcaaatgatgccctcaagcttttcgtggagatgatttcggaaccatatggagtagccccaaatgcttatacaatttcgtgcattttgatggcctgtgcacatttggcagccatacgtataggtaagcagattcatgcttatgtgcttcgtcatcaccaatatgactcatctgcatactttgtggcgaactgcctcattaatatgtactcaaagtgtggggatgttgatacagctaggcatgtattcgatagcatgtctcaaaagagtgctatttcttggacatcaatgatgacagggtatggaatgcacggtcgtggtagtgaggccctggacatatttgacaagatgcggaaagcaggctttgttcctgacgatataaccttcctggttgttctttatgcttgtagtcattgtggaatggttgatcaaggtctatcgtactttgacagcatgagtgcagattatggtttgacacctcgggcagagcactatgcctatgctattgacttgctggcccgctttgggcgattagataaggcatggaaaacagttaaggatatgccaatggagcccaccgcagtagtttgggttgcattactgagtgcctgtagagtacattcaaatgttgaacttgctgaacatgctctgaacaaactggtcgagatgaatgctgaaaatgatggatcttacacgcttatctccaacatatatgccactgcagggcggtggaaggatgtagcgaggatcaggcacttgatgaagaaatcaggaattaagaagaggccaggatgcagctgggtccagggtcaaaagggcacagcatctttctttgtcggagatcgatcacacccactatccccacaaatttatgctcttctggagagtctaattgatcgcatcaaagctatgggatatgttcctgagacaaacttcgcattacatgatgttgatgaggaagagaaaaataatcttcttgttgagcacagtgagaaacttgctcttgcatatggtctcctcacaactttccctggttgcccaataaggatcacaaagaacctgcgtgtatgtggtgattgccatagcgcattcacctacatttccaagattgtggaccatgagatcgtagtgcgcgaccccagtcgttttcatcatttcaagaatggttcatgctcatgtggtggctattggtga</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
