Os05g0327100
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0327100 |
|---|---|
| Description |
Armadillo-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001187426.1 GI:297723982 GeneID:9268078 |
| Length |
7165 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0327100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:15159318..15166482 |
| Sequence Coding Region |
15159318..15159360,15159401..15159501,15160726..15160827,15161595..15161642,15162970..15163513 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:15159318..15166482 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggctgaccacgaagtaggaggtctctacccgatcgacttagctagcgacgtcgacgacgacgaggacagcggcaaggcgatatgggatgatctcgcttctgaaatcggcggcggcgccgccaccgtggatactccggcgacgcccaccggtctcataccactgtcgacagacatcactggaaaggaggatggggtggaccactcccaatcgtctcctctggctaccgcaactggaaaccatatggagggggtggcagtggctgatctagtaaccggagcagctaaaggtgaggatatccaatctaaagcagagatccaacctgcttgtgggactctaaaagagcaaccatccaaagctgtttatggaagctgcatttctggtcaaatgtttggactacaggattcacaatatatattggccaagccatcctcatctgaaagattctataatcataactctgatgccattggatccaaccatctgaagcttcatagacaaataagtgctgatggaaacgctgaatctaggttagaactgaacaaagatgctattggagttttatcaggtgaaaagagtccattagccaaatcaggaaagcagattgagcaacttatggtgaatgatctttctgctcatccatacaaccctgtgtgtcctttttctcaaggtgttagttattacagttcatcttcccaacacattgtgagctcatcaggagaagtcaaatatattcgaaattcaggtcaagaaatgcaaattgcttgtgatattgtagaagaaccatcacatatagctttgtatgggagcaagaacccttatgaattgactgggctcgggatgaacttatcaaccaatagtgctaaagaaaataatgaatacaaccaactgaagcttcagaagcaaattgatggttatcagaggtttgaaattggctcaggactgaatatggatgatgctgatggcgatttaactgcaacaggggttccacaaaaagtgcaggatgggaaaaatatgggatttgacaatgttgcggataacaaccctagaatgtccgtgcctcacaacactgttgtttccgccaggaatgcaaggaaccaatctcccaccatgagtggtatggctgcaaggcaaccatcacaaccattcctgcatgctaatgttgcagaaacaaactcaccttttggtcaccagtttgcagacaacttgctcctcaggttacaacacaaccatcaaacatatccctacatgggagctacaaccgcagcctatggattagatctgttgggtgggacaatgataggaaaagatgatttaaaacataaaaatcttcatggacaaattggttttcatgaaaatgttgcatctcactattttggcatgaaccctgagttgccaaggatatcatcttttctacaccagaaatgctctgaattcttacaacttaatagtgatgcaatgagatgtttaaccagggtagaaaaacaagttgagcaatctaccataataggtcctcctttcccttctgtgacagtacccagtcctttgtcagtaaatcatctttcttccatgtccaggggttattgtttaggctataaggatcctaataaccagggtattggtttttctccaatgtacgaaccaagtggattcaatactaattacaccttgcctctgagaatggaagcacatgcaatggaatcctatgacatagatgctctatctaaagccactagacaaagctgccaaaggaaacaatatagacaccttgagagacatcataagaaaatcgttgcatctgaagcacaggcgctacatagcaatgttgagactcctatcaggatgaacaaagctaaggaattcaatgaaatatgtgggagccgctttatacaacaaaagcttcaaaatgcgacacctgaagagaaattcatggtctttgaagaaatcatgcctgatgctattgaattggtgatggatatctatggaaattatgtgctacaaaaggtggcaacaggaaagagtttcaccggttcctggagtagcttcaatgctggtgaggtagtccaaggcagtgcaggagtggttgatggaggcagtggctag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MADHEVGGLYPIDLASDVDDDEDSGKAIWDDLASEIGGGAATVD TPATPTGLIPLSTDITGKEDGVDHSQSSPLATATGNHMEGVAVADLVTGAAKGEDIQS KAEIQPACGTLKEQPSKAVYGSCISGQMFGLQDSQYILAKPSSSERFYNHNSDAIGSN HLKLHRQISADGNAESRLELNKDAIGVLSGEKSPLAKSGKQIEQLMVNDLSAHPYNPV CPFSQGVSYYSSSSQHIVSSSGEVKYIRNSGQEMQIACDIVEEPSHIALYGSKNPYEL TGLGMNLSTNSAKENNEYNQLKLQKQIDGYQRFEIGSGLNMDDADGDLTATGVPQKVQ DGKNMGFDNVADNNPRMSVPHNTVVSARNARNQSPTMSGMAARQPSQPFLHANVAETN SPFGHQFADNLLLRLQHNHQTYPYMGATTAAYGLDLLGGTMIGKDDLKHKNLHGQIGF HENVASHYFGMNPELPRISSFLHQKCSEFLQLNSDAMRCLTRVEKQVEQSTIIGPPFP SVTVPSPLSVNHLSSMSRGYCLGYKDPNNQGIGFSPMYEPSGFNTNYTLPLRMEAHAM ESYDIDALSKATRQSCQRKQYRHLERHHKKIVASEAQALHSNVETPIRMNKAKEFNEI CGSRFIQQKLQNATPEEKFMVFEEIMPDAIELVMDIYGNYVLQKVATGKSFTGSWSSF NAGEVVQGSAGVVDGGSG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..43#84..184#1409..1510#2278..2325#3653..4196#4277..4455#4712..4816#4901..5065#5158..5619#5721..5843#6296..6427#7067..7165#atggctgaccacgaagtaggaggtctctacccgatcgacttaggtcggatggacatgatgaccgcgcttggcttcgtcggcagctagcgacgtcgacgacgacgaggacagcggcaaggcgatatgggatgatctcgcttctgaaatcggcggcggcgccgccaccgtggatactccggcgacggtgagttctaccaatggatgcattcatggtcatgcatgtatctgcttagtggttaatttttgctggctagctggatgtgttgtcagatttattgtgctgctagctgttttttaatcacctatgcgattaaacaggtggtcaggtagccagctatagctaggtaatgtactcctactggaatgaattaatgtgtgctagttttatccttttttcagcgttgcatatttgactgttgtcacatgtatgttatgtatggcatgtacttcatttttttacttcaattcatttattttcttttttggacccgtatattaaatatgtactttaaattttaaaaaatatttattaagggatgcactaaaatgcaccgagaaagcgtaataactaaaacacgtccttcacatagtacttttttactatatgttatatgttttcaaatacatgatagcacaaattttactaataggcttaataggggaatttgtgatgatttcactctcagtaaaaaaaattactaacattgagtgtatatattaaatatgtactttaaattaaaaaaatatttattaaggggcgcactaaaacgtatcgggtaagcgtaataactaaaatacgtccttcacatagttcttttttactatatgttatatgttttcaaatacatgatagtacaaattttactaatcgtcttaattggggaatttgtgaggatttcactctcagtaaaaaaatttctaacattgcatgtgtgttttacctataacatacccagggtatagtataatatgtctatattttttaaatacaattgttcataataatagaatgtactggatgcattgaccactttttgaatgggaatatctggtgcaatttgtggaccatttaggccatgtttggcacacttggttttaaattaaattatagtgttttatacttttatattttctctaaaataggaataaattaatttatccaagagatccagatctaaggattcttggctatcgagcagtggcacaagagcccaataaatcgtcaaagtatctaaatgaaaattccaccagatatttaaaatgctactaagcctttgggccttgctttgtgattacactttggtccaaaatgggcccagaaaaaattgccagagccaaaaggggatagaggttggacttagttgctaagcgcgctgtgcgcgggggtggcattggttacgtgccatagcccaccggtctcataccactgtcgacagacatcactggaaaggaggatggggtggaccactcccaatcgtctcctctggctaccgcaactggaaaccatatggtttgttccttttcggtcccagttcccttatttacgtgccttttattctatttaattacatactattgagtacttgctttgtgggtgcatagatggaattgttttgtgtggtctgccacaggaaaggctctaaccaatttatcattccaaagtgttgtgataattagtatgactaactaaatatttcatatcataaataagaactttcttaatatatttcatcatatatttgtgtttccaaaggtgttttatctaattttgtatatcaactagtaatacctattaaaacatgtctatagtggtttgatatgtctatagtggtttgctgttgtttgtattggtaagacactgggcactgcaacaaaggataaattgcccttcatgaaggcaataaaggataaattgcccttgtcaaagataagtttgcactgtcatcaatttacatttcactttagaaataggatacagatggattggaagctggacacacaaaaagttcccaaaaggcgaaaaccatgattgttcacgactataccagctgtccatgtccacctcttttgatatgcgaaatgactttttttgccctcattttcctatcaagtagtactaagtccaaacctccaaagtattttatttaataggaagcatatctccttctagactgaaagcctagcggtggggcggtggccaggctatggccgccgccccaccgcgggagagaaagagggttgtgggctagtggtggggaggctcatttttgccgtcaggagggggtggcagtggctgatctagtaaccggagcagctaaaggtgaggtaggagtggtaggataggggattcctaccaaagttgaggatggcagtgagacaacagcagtagaagtagtgggggagatggaggttggaggtggtggagagggcttggccggtggatcttgacggtgtcttcgtggtgctggcgtggcaaggtcttatcgtggaaaggagtagtggcggtggggtggtttttgcggagatcaggaggagagagaaaggctaggtgttatatttgttgcatgaatcacaaaaaatccttgatgtctgtgatttaacaacatatcaggtgactgatgattactcaatccttgtaaattgtcttgagacaagtaattagtaactagcaaagataccggctctgatatataagaaaatatagctttgctagagaacataatccctccggttccatattaattgacgtttaagataagattgaggtcaaacttttataactttgaccatcaataactttaaaaatatttagtttaaaggaattagaacaacatatatagatttatttattatatatattatagtagaaaaataagatcaaagatatattttgtagaccgtgttattgtccaaaacgtcaattaaaatgaaaccggagggagtagatccttatttttctgttatggtactaggatttgttgctaatttattgttgttttcattattataacaactacttccccttatttgatttcttttcttatgagtctgttacactatgatcaacaattattttcattgacagtattgctattcaattatattcatcatatttgtattcctgctagataacattttgaagatacaccaataacatattaccttgtgaccattcaaaacatttattacttattcttgttgtgccagatatccttatctctatcaagaggggaaaattatggtcatagtattgtttacctttcttaatatgtttgtctgacttgatttatacaatgttcttgtgttcaactaatgaaaacgttaggatttcttccttttgtgagaaatattaattctagttttttcatctactatctaatcaaatgatattcatacaatgcattgtttcataatatggcaactactccagcatctctaccgcaatcaagagtacaataatgtgcaatatattaaaataaccatttggattatgggattatttaacattgatattttgcatgtcatctatgcaaagaattacatcaatccatttctattaaaacatttctccttcctactcaggatgtctgagatgaacgcacatctactttagatgaaaaggtacctattgactgacatgcacttttctcaggatatccaatctaaagcagagatccaacctgcttgtgggactctaaaagagcaaccatccaaagctgtttatggaagctgcatttctggtcaaatgtttggactacaggattcacaatatatattggccaagccatcctcatctgaaagattctataatcataactctgatgccattggatccaaccatctgaagcttcatagacaaataagtgctgatggaaacgctgaatctaggttagaactgaacaaagatgctattggagttttatcaggtgaaaagagtccattagccaaatcaggaaagcagattgagcaacttatggtgaatgatctttctgctcatccatacaaccctgtgtgtcctttttctcaaggtgttagttattacagttcatcttcccaacacattgtgagctcatcaggagaagtcaaatatattcgaaattcaggtcaagaaatgcaaattgcttgtgatattgtagaagaaccatcacatatagctttgtatgggagcaagaacccttatgaattgactgggctcggtaatcctcatgataaattcaatgccccatctttttttttgaaggagtcaatattagtagcatctctagcacttcatcagggatgaacttatcaaccaatagtgctaaagaaaataatgaatacaaccaactgaagcttcagaagcaaattgatggttatcagaggtttgaaattggctcaggactgaatatggatgatgctgatggcgatttaactgcaacaggggttccacaaaaagtgcaggatgggaaaaatatggtgaacactctttttgttaaagccgtaccaacctgtatttaccgtcttacatggtactagttacagtttatcttcactacacccaaataagttgaaccagttgctagaacatcctgagtaccattcaaggttacattgcatccaaccttcaccgcaaccaatcatcaaagatgtatcaacatcaatgacactctatgttaaagaaccatgctctcaagaaaatttttatttggcggacaattttcctagtcttcagggatttgacaatgttgcggataacaaccctagaatgtccgtgcctcacaacactgttgtttccgccaggaatgcaaggaaccaatctcccaccatgagtggtatggtgcatgctgatgttttagaaatctactactctttggatcagcaga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