Os05g0335401

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os05g0335401

Description

Similar to Cation-transporting ATPase

Version

NM_001187434.1 GI:297723998 GeneID:9270939

Length

6780 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os05g0335401, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:15659749..15666528

Sequence Coding Region

15661142..15661172,15661985..15662125,15662240..15662262

Expression

GEO Profiles:Os05g0335401

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>acaaatgttcgatcgggaaacatcacaactattagtgaagaccttggacaggttgagtatattttgagtgacggaactggaacactgacagaaaacagaatgattttcagaagatgttgcatgagtgatactctatggagaaaacaatggggatgctttaaaagatgccagacttctagatgctgtttcgtgtaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>TNVRSGNITTISEDLGQVEYILSDGTGTLTENRMIFRRCCMSDT LWRKQWGCFKRCQTSRCCFV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>5357..5387#4404..4544#4267..4289#atcccgcgccctccctctcctctcacgccgccgccgccgcctccccctcccgccgccgctgtgcccgccgtcgccgcccctccctctcccctcctccctctcccgtcctcctcctccgcggccggtccactctccgcccttcgccgcctccgccggccaccaccgccccagtccacgcctcgcgtcgccgccccccacccccgtcctcggcccgtcgcgagcgacctccgcctccggcctcctccgacggtcgacgtccggatccggcctccgtgtggtcagggcacgcggatctgaccacccgcgtcccctcctcgcctcaccctctccctctccctcttccctccctctctgaccgcccccgtccaaatccgacttcggccgccgctgctcctggtgctgcagatcgagggacggctcaagatgccgagcttcgtggtggcacacatcggtggcggtctgggcgtatgacatccatgatggcaggggctactggcctcgccgccctcgtcgccgtcctcaacctgccgtcatcgtcaccgttgtcttcaacttgccggtctaggtaatagtctatgctcagaggtttttaaatatacatcacagatacatgtacagcattctgaacgattcagtactgttcaaataattatataaaactggaattttaatacgatatgctgacaattaaaattttggatgtctaccacaatacatctagaccaccttattgtatctgcatactggatatataatatttgcaggggaagaatttcacatggttgaaagggtcaatttagcagtgatacatagtattttcggttgaattggttaaggtgtcgctttatatgttttcaactcgcatatagttctttcatgttagtttttaaaaagtttatttcttgtgacatgtctgtgacttaaaaatgatcacatgatgacaatgtgtttggatgaaagtaatcatagaggctcatattttggatgactgcagcacagtgaatgttgtttctagaagtaattaaatattgactgcaaaaaatagaggtatgaaactttcattttgttattcaatatctctgaaattcctgttcgtccaatcaggaaaagcatgttgttgccttgttggctgtgtgcatgattgtgtgtttgtagtgtcgaattcatgtaaaatatggtcacacttgcttttacattttaatggataaataatagtcttgcatacaagtaatccgatacaatgagatatggggtgctgttggactttatacaatgatcgacgccaatgggttggcgttggcggtgaggagcacggtgacgacgcgctcgagtatatgcgtgtggaaaccagcggaagttgcaatcagcggtggcggtagtgaggaccacctcagcgcatggttattaccatgctcattgagttacatggtggcctacttctctaccacagcggcggtgtcggcaaccagatctgagaggtaaaaaaaaatcacttcttatgttggcttaccgtcatatttgagaggaaaatggcaagatgatgcagttcgatttcaccggctttcctgcttgccgtatttgtaatctcaactttcatttcaagtgattgtcggggccaaacctatggtggctcgtcgctgagctggtgtcgttcatggaggcatcgagtggaaagcggtggccagagcagaaggacctggcgtgttgcatgtgcgccagccactggcggtgcgaggccatggcaaccgtcatgctgccgctgtccaggtatggctgctaaccaatttcttccctgaagtaggtgaggtgagcccgataggaacacatagcacctatattgtgatatttggagctaggacacatccagtcatgttattcgatctgtagcatcaaggttttaaaaatatcaattttgtggaggatttttggtcatcaaattggagttgctaatattctttgagacactgaattaactcaatagtatcagatatataatttggatttcccttcaactcaaagctggttgtcttgttgtctgtgtgcatgcaggggtggctcttctgcaggcgatgaaaagggcagtggcaacatcaatgtatcgacgaacgtaatgtgcttgctggcctagtagacatgaacacatatcactaagagggagtgaaacggtgttgacgagtagcctgcttttgggttagttcttgatcaagctaaaatgcacttctttttcttcatcggtataaagggcacccttttttccttgcaacattttcatatgcaccctatattggccacaccaccatcatccatagccaagtagtatgctcatgtgcaaattctgcagggatcaaataaatgtcatttcccctggccctatccattatttggctatctcgtgtacttgatgcagatttttaatttcttattgctgcctgaactatttcttttggacagtcagtctcaatccttgccatcattaaccgggaatcttttttttccatgattcttactatttcaggtgatagagacatctgattattatgggtattttgctactaccattgtagtagggtggtaatagcaagaacaactagcattaatcaatgctaatccaacatatgtatcatctcccagattagagctgaacaagagcccaagaaaaacctatatgacatcctttggagcacaggacttttttccctgattcctgtgtgaaatgaactacatcatctgaaattcctgtgttccaaaggacactgcacattttttttaacattgcctgtaaggccacatgcaattccttacaaatatgttggaatgccaaaacccgagttatttaatattagccatcaggcccagtgtaaattatacttgaaatagaatagatgtccagctttgtatttttagagtagtatatgtaataaaattgatcctagacagcattgtcatccagcctcacaagtaccctgaattcattaaattacccttgctcctcagccaaccgtaagctattttatcttctgttaatttcttcttccaagggcagggccaaggtgatcatgtagttatgttattgtaagtttgtgacataactttatcaaaataaaccaaaagaagcttttgtactcataaatctctcttcagtgctgcatgtaataattgtatataaacagagcaggggcagggtgaaatgttgtgtaatttactatttgatttgtaacttcggaaacacccaaccctagcctgcgaaaagagaataaaattataggttcacttacagttctgaaaaaaggtgtctttccacataatttgtacatgattggatgcaattataaatagcctttctcttgcatgatgcggatttatctacctagacataattaaaaggtgagtatctattggtcactgagcttgacaactttgatgattgtattgtaccattgtttcagttgtagtggccattgttcctgttaaatgcaagttgatactaataaatccatcgaatagaggccttcatataattcaatgtttaagagaaaccaaccatggactggagttctcagattagtttattcaaaccacttttttctagcatgcatttatttcgtgtctcattgcattccctacaattttcattgacttagatagttagattaaaggaaatataagaagagtttattagatatttctttacaagttcctgtttgtaatatgtgattgaacatatataattgatggccaatgcaactccagtaccttgttgactcctttggcagcagggacctcctctagatagccacctattgggccctgtacttgcctggaagacttgtttgaaaaacctcaaatgctcacagcctggagaaatcagtaaactattgagatagcatcactgatgtagatgttcgctatacaatggtctctgtgaagtgattgttgtcgattatttgttaaagggacttgacaagggttttcttcaccgcccacccccgcgccatgcatcatatggatgaagcgtgccagaatgtgtacactgaacaaacacatacaatcccaaaaaaaaaaaatttccctttgttggatacttggtttgattttaggcaatccatttatccaggcagtgaaaacaagctattttggtgttcggttatgttcttgacagtatttcctgcaatccatgtaatttttaaaatgttcttttatgcactggttgtaggtaactcttgatctggctaaaggtgtatatgcaaagttcattgactgggatgaacaaatgttcgatcgggaaacatgtacgcctgctcattcagctaattatgtgccatattatttccatatatgtgaatttagatttttcatccaacctatttattttttagtacagcttacataagtgtctctttcagcacaactattagtgaagaccttggacaggttgagtatattttgagtgacggaactggaacactgacagaaaacagaatgattttcagaagatgttgcatgagtgatactctatggagaaaacaatggggatgctttaaaaggttatccacttatgttctagctaccaggagaaattctcttttctctgggcttagtgtaatacaatgttatttgtttgcacatctggtcatgaactgtctgactttcttcagtggcatgtgaaatgttgattcacgagtgttgagttaaataggaatttgcaaacagcaacaatagatgctccccatttgttaagtccttacaatgcattgtaaactcaatcaaccttctgtttctggctcagcttatgtgaaggtgtcagggataataaagggggtgtttggttcattccctcactttgccacaccacactttagtcatgccacggtttcttaggtgtatatttgtttcattctcacaattgtgtcgtcccacacttcattagccttaggtcccacttgtcatactcag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External Link(s)

NCBI Gene:Os05g0335401, RefSeq:Os05g0335401