Os05g0364600
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0364600 |
|---|---|
| Description |
Similar to ASF/SF2-like pre-mRNA splicing factor SRP31' |
| Version |
NM_001061858.1 GI:115463446 GeneID:4338552 |
| Length |
6966 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0364600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:17452951..17459916 |
| Sequence Coding Region |
17453424..17453510,17454952..17455017,17456480..17456554,17456703..17456802,17456884..17456930 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:17452951..17459916 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MSRRNSRTIYVGNLPGDIREREVEDLFYKYGRIVDIDLKIPPRP PGYAFVEFEDPRDAQDAIYGRHGYDFDGHRLRVELAHGGRGPSFDRSSSYSSAGRRGA AKRTDYRVMVTGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFSDVYREGGATIGIVDYTNYEDMKQ AIRKLDDSEFRNAFSRAYIRVREYDSAKRSRSRSRGRSHSRSISRSRSRSRSISRSRS RSYSRSRSPRSRSASRSHSPVKERSRSASQSRSPVKERSPSRSPPPATSPPREKSASK SPVKSRSLSRSPSPVKSE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>474..560#2002..2067#3530..3604#3753..3852#3934..3980#4052..4109#4276..4325#4532..4588#4676..4818#4908..4949#5198..5239#6354..6387#6457..6525#6617..6631#gaagcttctcgagccctcctcctccgccgccgccgccgccgcctccgcctcgccgccggcgcagagtcgcaggttagctccgtactccgctcccctccccgaaccaagccgacgccgctgctggaatcctagtactcctgcgcgagttctagcgtgctctctctctctcccgtcccgtgccgttgcgtcctcgcgctttagttctctcggttgagcgagtgcgcgagtgttctgcttggttctccggtagatttggtagcccgcgatcatatctcctaggttttttttttccttcggttgagcggggcagcaattgaattcgtggtcgtcagggtttctgagagctggagatgcagtgctatgcttggtttgttttgctgtttgcgtgttatcgttacgtggcttgacgctacggccattgttggatttgtgcgtgctaatttagctgacttgatgtttgtctgtcaggaacgatgagccgacgcaacagccgcaccatctatgtgggcaatctccccggagacattcgcgagagggaagtggaggatctcttctataaggtgagccatgattacattacggattaggcatgtgtgtgccatgtaacagtgttatcctctagtactaaagtggtaggtcagtgcaaattttgttttggtatcagcgagtacatcgtaggctgcttttaggacttaggaggaagatatttgggggcaatactgctttcttatggaattataaatttgctatgttgggccctatggttttctgttgtgtggttggagcatttgttaaatacttcaatgtgaactagatatctaagttgcgtcttcacgcgaccataacctgtcttttatttacaaatatgataatgaattgtttgtaacagttacctatgttaaaatttaattcgtctagttgcagttttcaaattctacaattgaattttgttaaggattgaactttggagagtatttggcccaatttccgagcaattaggttgagatatagttttgcgttatgcatatcagtttgtttttctatttgttggttatggatatatctgtaggtgataggtattttttttatcttaattattcattctggatcatttctataaccgacacatctgaattttagacctgccagtattgtttaggacttttgtgaatatatgatttattatagttctattgacataaaatccatataatacacattattcgttatgtttattgggtctctgtggctatgtaaagatagtagtgataatcatttttatgtgcagtattttcactttatatggatttgatttcgctatatttattcatgtttgtaattgaatttatgaacaaattgagatagcaatcgaggtgtaagtggtggccatggatcgaagtactgacacgggtgatgttggctgaggaaatatatttcaacttgacagaagatttatcttaatatgagtttcacatcttgttagtaaaagagtttattttgcttttcttctaaacttgacctaggcgcacggagaaaagaggatggagtttgggcttgcagctgttgtagttaggatgcataccgatccaattaggcctatttatgtcaccgagttatacatgcaccacagctagagggtactctagaatactcctacatttttaacaactacttaagtttcatccaacggtaaagattgtttcgacttattttgtctttaagcgtatctgacggttcatattagtcagaagaagtggcacatcctggtttctttttgagatttacttttcacttggagagattccaccagtcggttgggcacttgggcacctctttgttgttgccatcttatgtggtgaactggtgataccgaaggatgttactggtagaagggtagaacaatggcatcttgtaattactaaattttctgatatctttattttcttgattattcatacagatagagtttaactttttttttcattacttttgcttctgcagtatggccgtattgtggatattgacttgaaaattcctccaaggcctcctggttatgcttttgttgaggtaagggattaagtatgttatggtgattacttgctatgagcacattttctatctagatttttgctcatctttttatatataagctatcattttatttagtcataaccttgttgttatttgaggatttttttttggggtctgtgagcaaatttagcacatgaaaaccgactacagacattagctttatcaaaatctaacccgaattggttgctattttttttaacttaaaaatggtccacactaaactggatagccaaagaaaactggacctttactaattcttttcgtatggtcaaaagttgccaaattttcataagataaacttcggcttggcgtgaaataaaacaacccctggataacaaactttagaggttctgttagaatgatgtgttaatatgaacccaggagtgttttgagctttgaataggaggtagcgaggtgggtaagcagagtgcttgcattctacccctgaatggacttcttcccaatcatggcaagaggactctaaggccggcaagtagatgcaagttgatgattaaataaatttcttggtttgaaatgaagcattctatggaagcttatatttcaggcatctcttagcaacccatgcgattagtttagagctgaaacaaaggaatatactatcgcaacaatttacccctaacgaactcctcaactggcttgcctgcttgcttattacaatgtgtgactacctctatataccttgctcagggaaaggaataggcaaatctctaaaatggataagctggcaagcacaggtttataaacaggagttaggtatgggttgtgtgatttgaacgatcaagtaacggatacaagacatagaccccctccaggtgcaaacattattgttctcatgctttgccttgctactacttctgttctttttatagaacattttttttatctataatcaatatatcatttttattatttttaggaaaagcagaatgggtagatcttggcgcgcgcgcgtgcacacacacaaaaataataataaaaaactggtttaagaatatctcgcttttgttatgttggacatgtggttctcattggaaactatgatgactaacgaaagtgcataggatgtgagcaaggggcaacttaagggttactatggaggcaagagaatggaaacacccaaatttgtttctttaagctcatgaggaatttgggggtgacggagactgacaaaaaatgtaggggatgagtgaaatttgacatacgatcaatgaatttttccatgtagcataaagacaaaggttagacaaacttgctttagaggaaacttaacaactagcctcaaatccagttttgccaagtgttgctgaactatctaaagaaatgcttgtcaaaattaaccttgtgcaatctgattgtacatatagcaccttagaggctaagaggacttgatactaactaaaagtggttccttatgcagtttgaagaccctcgtgatgcacaagatgcaatttatggccgtcatggatatgactttgatggccacaggttgcgggtaagtggatcttgcatgatatccgttatctttcttgagagaataccaggtggtgaagagggtagttcatatttatttatttttgttgcagcagcaaagaggatagttttgttctttgtcgtaatgttaatcttatacctttatttaggtggagttagctcatggtggcagaggcccttcttttgatcgatcaagtagctatagcagtgctgggcgccgtggtgccgctaaacgtactgattaccgaggtacgtacttctaaactcaagctttacaaacttgattggatacatcagtgttcttatttgctctattcatggaatgtgcagttatggttactggattaccttcgtcagcatcatggcaagacctcaaggtattgatgcagatgaactcccatacaattattcactcttcacgaatcttgagttttacttccattttcaggatcatatgaggcgagctggtgatgtctgtttctctgatgtttaccgtgagggtggaggttagtactgaacacttctatgctcttctgttgctgatattaattttggtatgaattgggcagtagtttgttttgataatacagcaaccatttaagctgtattatctttttccattcatgtttcagtagttcttacttcttaatactgaaatttcatgtgtttcagcaactattggaattgttgattataccaactatgaggatatgaaacaagcggtaagtttgaattagttctatgcattttactttccagaagtgaacactgccatgtgccatctggaaattcatgttttggttggttcctttaataatagaaaaagggcactttgtgatatgccagacacctactttctccccaatcatgcatgttcttatcttcccgtgaagatacacctgacaagcagttttttgttaccttacagataagaaagcttgatgactcagagttccgtaatgcattttcacgggcatatatcagggtatggtcatactggaaatgtttctgcacttcatttaacctaatctcaagttgaagatttacgtactcatggacatgtctgttaaaggtgagggagtatgattctgctaagcgcagccgctctcgttccagaggtagaagccacagccgctctatctccagaagcagaagccgcagccgctcgatctccagaagcagaagccgcagttatagcagaagcaggagtccaaggtatggtttgaatctcataatgctcaaatgaatttgttatggtaacaacaacatgaatattattacaatgtgctgttttttccttccagatctaggtctgcttctcggtctcactcacctgtgaaagaaaggtatgcacagttccattttgattttgaatttttcaaagttaagaaactgagtagctttggcatgtgttatcttcatattggctattgaaaaactgcacatgattttttaagaaatggaccccctccaatgttgattattgaaatttgattatgtaattagcctatgttatcccatatctccctcaaataattgcaagaaaggaaatgtcgttaacttaaatgagtttactgctgttctctgcttccagatctaggtcggcttcacagtctcgctcacctgtgaaggaaaggtatgcgtagttccatttcgattttgaattcataacatattacatagtacatggaatgctttcgattcattgcgatggtgtgatactgagattctcggattaatactatgttacaaagttaagaaactaagtagcatttgcatgcgttatcttcaatttgccaaaaaagaaactacatatgattttctaagaacccctccaatgttgtacattcaaatttgattatgtgattagcctgtgtgatcccatatctatctctaataattgcaatacacgaaatattgtaaaatgaaatagggccggctctttatattctcatataatttgtcatttcctttctggtttgtactttaaatgttatgctttcgagatgcattttttcttctgtacatgcactttgagtttccactctctgatgattaaacatgcagaaaactggatagctgtcatttgttgaaaatttgctcttgtctttcctagatttgggacatgcagctatttgggttgcgttggtaggatattggatgcgttgagaaccaaaggatggtttggaacgttggatagttctgctggctagtgacatactgtatgacaagtggactacaaccagcgataggagcaagatagggctggctctaaacatatttggacttatggagtgcatttcgtggtataattgaagtactattgacttacgcatttctattctcaaatgtaaacctcggccttgcacccctattggttattctcaaacataacctcaccttaatgttgaagtttatttctaaattacactttctgatgaaataagtgtgtttagcgattagctctttaaccaatttgtgatctattgtggcttcaccttcatttggaggactcgtgattttacttataaggtctgtcatagtttttcaaaagatgacatgttacatgtacagtggaaaaaggtggtccctttacctatgctcatccaaaacacttctccacatgtttactgtttattgctctcaatctcatgtgtattgatgttaccatattcacacatattttgatcaaactgttgtaatatccctttactgagtaacaatttcttggcttttggaacattttgcagatcaccatcaagatccccaccccctgctacttctgtaagttttccaaacaagtaacttatattctataaatttgttccatatagtaaccattgtctcgtgcagcctcctcgtgaaaagtcagcaagcaagagccctgtcaagagcagaagtttatcccgatccccatctcctgtccgtgacattaaccaaaaactctgtatttttgtgagcctttaatatgcttgaagtttcccatattgatatggtcaatgcttcctttcaggtgaaatctgagtgaagatggatgcacttgaagcctgccagaaactatttcatgatttgtggagctgagtttcggaaggcagtagattgtggattatggtttatctgtttctgcgttaccattgttgttacttttcagaagagagccgtgttatttcactgttgcttggtcatgtcgtaatatctgtcagaaacattgccttacatgcttagcgttttacttgccatcaccaatctatcagacctcgtagcacatggtgctcgaacttcatgctatacatacagcactatgaactctgctatattctaaagctcaactatctgtagtaactgcaggaagcctttgcgctt</dnaseqindica> |
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