Os05g0390100
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0390100 |
|---|---|
| Description |
Dynamin family protein |
| Version |
NM_001061974.1 GI:115463678 GeneID:4338678 |
| Length |
8659 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0390100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:18898813..18907471 |
| Sequence Coding Region |
18898928..18898933,18899303..18899414,18901244..18901809,18901934..18902002,18903186..18903383 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:18898813..18907471 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgttcgccgcgctctcgctcaaggcgtcggtcggggaccgcgcctacctgctcgtcgcggagcgcgtcgacgtcgcctcggcggtcggtgccagcggcgtcgtgctggctgacgacggtattcctgctattgttgcaaggagtatgatgatgaagtccaactcggactccatatacctccctcttgtcgctagaaccatacgttctgcagacactgcaagaagcgccacaagttcagagggggctgattttcttatcatcgataccggcagtgatgatgctattaatgttatgaatggtgttagtggcactcagcatgtgaagatccccattttttccactttgagtgattcgcaaagtgaagggtcttactcagataacacatccaggttgctccaatccggtgcatctggaattgttatgtctttggctggtattcaagtactcgctgatgatattatagaacgggatttttcaaaagtggataccgctgaaagtgtcctacaggctaattactcttcagctagtactttggaagaagcagataatgtaatggtcctaactcgtgagaaggcaaaagttgctggattcacaaaactagatgaaaaagtaatgcagctgatatcgatagaaaagcctattctaagtgaagctgttgctgttatccgcaaggcagcaccaatgatggaggaagttgagcttctagttgatgctgcttctcgcctgagtgagccatttttgttggttactgtgggtgaatttaattcgggaaaatcaacttttataaatgctctacttgggaggaagtatcttcaggaaggagttgtgcccacaacaaatgagatcatgttgctatcatattctgatgttgactctgaaagcgcagaacgatgtgagaggcacccggatggtcaatacatgtgctatttatcggcacccgtattgaaggaaatgaacctagttgatacgcctggaacaaatgttattctccaaaggcagcaacggcttactgaagaatatgtgccccgagctgacctaatactctttgttctttcatcagacagaccattgactgacagtgaggtcggatttctccagtatgttcagcagtggaagaagaaagttgtatttgtactaaacaaattggacctttatcggaacagtaacgagcttgaagaggctactgcatttatcaaggaaaatgcaagaaaattgcttaacacagaggatgtgacattatttcctgtatcttcacgctctgctctggaggccaagcttttgtattcaaaaaatgatggaagagagcatcatggggaagctttgtttaatgaccctagatggagaaacagcaagttttatgatctagagcattacctattgagcttcttggatggatcaacagaaaatgggaaggaaagggtccggctgaaacttgaaacgccaattggaattgcagatcgtttgctaacgtcatgtcaaaggcttgtgaagctagaatatgaaaaggctattgatgacctaacatccatcaaggatcttgtttctggtgcaaacaattatgctgtgaagattgaggctgacagtgattcttggcaaaggcagatttcatcccttattgcgagagctaaaggccgagcaatttcgctcatggaatctacacttcagttgtcaaacattgaccttatttttacatacaccctttcaggggggaaaagcactcccaccaaagttacatcattttttcaaaatgatattctgagcccttcccttgatgacgcagcaaatttgctaagtgaatattctacatggttgagttctaccaatgtccgtgaagcaaatatatatgtggactgcttccatgagagatggggtgcattggttgcccaggagcaaaggattccgccagagaaaaatgaacttgtcaatgaagaagagaaactctgtgtaaaggcactggatggcttcagtgctagtgctgctgctaaggtttttgaagaagaaattcgtgaagtggcttggggaacctttggagggctaggggttgctggattgtcagcttctcttttgacctctgttttgacaagtacacttgaagaccttcttgctctagctctttgctcagctggcgggttctttgcaatatcaaattttcctacccgtcggaaacttgcagtagagaagatcggcaaggctgctgaaaaactttcttctaaagttgacgaagctattcagcaggatatatcccgtagtgctaatcaattagtccattttgttgagactgtcagcaaaccttatcaagatgcatgtcagcaaaagatagattggctgcagggtgttcagggtgagttgtccactgttgagcgtaagctccaaactttgaaagttgaaattcaaaatcttcatgaatcatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MFAALSLKASVGDRAYLLVAERVDVASAVGASGVVLADDGIPAI VARSMMMKSNSDSIYLPLVARTIRSADTARSATSSEGADFLIIDTGSDDAINVMNGVS GTQHVKIPIFSTLSDSQSEGSYSDNTSRLLQSGASGIVMSLAGIQVLADDIIERDFSK VDTAESVLQANYSSASTLEEADNVMVLTREKAKVAGFTKLDEKVMQLISIEKPILSEA VAVIRKAAPMMEEVELLVDAASRLSEPFLLVTVGEFNSGKSTFINALLGRKYLQEGVV PTTNEIMLLSYSDVDSESAERCERHPDGQYMCYLSAPVLKEMNLVDTPGTNVILQRQQ RLTEEYVPRADLILFVLSSDRPLTDSEVGFLQYVQQWKKKVVFVLNKLDLYRNSNELE EATAFIKENARKLLNTEDVTLFPVSSRSALEAKLLYSKNDGREHHGEALFNDPRWRNS KFYDLEHYLLSFLDGSTENGKERVRLKLETPIGIADRLLTSCQRLVKLEYEKAIDDLT SIKDLVSGANNYAVKIEADSDSWQRQISSLIARAKGRAISLMESTLQLSNIDLIFTYT LSGGKSTPTKVTSFFQNDILSPSLDDAANLLSEYSTWLSSTNVREANIYVDCFHERWG ALVAQEQRIPPEKNELVNEEEKLCVKALDGFSASAAAKVFEEEIREVAWGTFGGLGVA GLSASLLTSVLTSTLEDLLALALCSAGGFFAISNFPTRRKLAVEKIGKAAEKLSSKVD EAIQQDISRSANQLVHFVETVSKPYQDACQQKIDWLQGVQGELSTVERKLQTLKVEIQ NLHES</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>116..121#491..602#2432..2997#3122..3190#4374..4571#5037..5168#5904..5990#6091..6534#6890..7057#7375..7605#8139..8254#8371..8653#actcccccctctcctctcctctcctctcctccacctccactctccgctgtccacacgcgcccgcgcgcgcgagaggcgagagctcgctctcccagtcccatccctgtcgctccccatgttcgccgcttccacctcctccaccggcctccccttgccgcgcgcgggcggcctcctcctcctccccacctcccgctccctcctcctcccgcgccaccgccaccgcctccgcctccgcgatgttggcgccgctgcggccgccggagggggagtgtccggcgggggcggcggtgctgcttcttcgagggagccgccgaggacgctgttcccgggcgggttcaagcggccggagatccgggtcccggcgctcgtcctccgcgtcggcgccgacgaggcgctggcctccggggacgcggtggtcgcggccgtggcgcggggcgtggggatcgtcgtgctcgaggccggggaggagggcggcgggcgcgtctacgaggccgcgctctcgctcaaggcgtcggtcggggaccgcgcctacctgctcgtcgcggagcgcgtcgacgtcgcctcggcggtcggtgccagcggcgtcgtgctggctgacgacggttggtgactgctttttttctccccagcttcgtatttcgtacgagtagttgcttgttgtggtaggtagttgcttgtttgaaacaaagccattgaaaaatatgtttcagggtgatatttattcggtttgaaagttgaggccgaacgccaatcgattttatagttcatggcgaaaaatggatttcgagcaaagtttaagggccataattggactttaccctttagaatatgccatatggtttcgtataatttagtaccacctctatcccaaaataagttcatttttcatcaatcacacgcatatcataaaaaacaaaaaaaaaactagaatactcctattttatcaaatcccaatgcaactattcatcactttatctactccaaataccatcctttcttcctttatagttggtacccactacaagtcatttatgctataaagcttaaattctgtgagaccacatcatcaagattatattaaccattagatcatcttgcgtctatgcaaatcaaccattagatcaagttcttctcagccgatggcatttgagaggaccaatgctttttgtcttccgcttaattacctcacgcatcattatatatccctttatcactaaccactaaccaatacatctcccacctaaagcctacaccactacatttgtgtctacctttttatcattccttttaatttttctaatgcatctactagccatatctaggttgatccaatggattttcttggaatatttatgcttgaacaggcttcctcaatcatctaaagaggaaatgtcaatggtccaatgaaattttggtttgtcactgtcatagatgacatcgaaaatttgttggacagattacaacactcgatgatttttaccaattgcaaggatgtgtatctatgcctatctcctatggtgattggtttttggtactctatcatgatcttgcttcttttcatatctgatttcttcgtgttaaaaggttgtgccaaatctttgtgtttttaagaccgcaatcactaaatttgtttctccacagttcctccaatttacttataggtgaacatgtttcttgaaattactagattcatgcacccaatagttgtttttttttaagatcatataccaacatatgcatgcaacattatccgtattttctctttgttttctcacaaaaagaaatattttattagttatttaaaatatctgaatgagatcttaagccaatttagtacataataaaaatagtgtcatgtttgcttaccgtttatggttcttcgaaatgggagtatcttaattggaatcatgtcatttctattcatatagcaattcaatgtacagatcgaacgttcaagcatgttgatcatgtaattatgataaatttataactatatggtcccttctatgtaatgatactataccaatagtcaaaagttctagaattattcagtcaaaaaaaaagttctagaattatagcttacaaattcatgatataactgtcccgcagcaacgcgtggggtatcaactagtcattcacaatgattactccaaaaatgaacttattttgggacaaattgaagggctaaaaatgaacttaatatgggacgaaggaagtacattttttagtcacttgtcttacctgctccttttcccagttttcagtacttgtcatgtcaataactttgaccagatttcgctagatattgttctctgtcgtggtgctaaccaataatcagtcagtttctttagaagtactaaaaaagaaactactagtatgtagcaacaaccaagcatttttctaaggaggttccttctgtactttgatgcaggtattcctgctattgttgcaaggagtatgatgatgaagtccaactcggactccatatacctccctcttgtcgctagaaccatacgttctgcagacactgcaagaagcgccacaagttcagagggggctgattttcttatcatcgataccggcagtgatgatgctattaatgttatgaatggtgttagtggcactcagcatgtgaagatccccattttttccactttgagtgattcgcaaagtgaagggtcttactcagataacacatccaggttgctccaatccggtgcatctggaattgttatgtctttggctggtattcaagtactcgctgatgatattatagaacgggatttttcaaaagtggataccgctgaaagtgtcctacaggctaattactcttcagctagtactttggaagaagcagataatgtaatggtcctaactcgtgagaaggcaaaagttgctggattcacaaaactagatgaaaaagtaatgcagctgatatcgatagaaaagcctattctaagtgaagctgttgctgttatccgcaaggcagcaccaatggtgatcatctaatgttacatatttggtagttgaagttgccctggaatgaattcagtttttcttcacatcatcatttctagcatatcctcgacttgaaatataattttctgttttgtggcaacagatggaggaagttgagcttctagttgatgctgcttctcgcctgagtgagccatttttgttggttactgtggtaatttggtttacattaaatgttgatagcttgctttatacttcatagacagatgattttttagacatgattcttctgttgtttgcataaataatgaaattgtattatgtggttcatggaaatgctgcttctcacgctggataacactgacagtcctgccatggattttctcaaagcaatttatattatatgattatttctcaccccaaggatttttttatgagaagttatgaccatgttggatcaatgcttagcagcaattatatttttaggcggttcagataaacctgtagcatttaatgttgattttggctgattttacatcatgaactctggctaaaaaatttaaaaaactaaaattctttttaagaggagaaatattgttcacactatgctcgtatgatgctgacatacactatgtttttctgaaaaaatccatttacagcccacacctttgcaaagtgttgaaatcaactatctcaacctccaaccttggaacttaaaaatggatcactcccaacctgaattcctggagtagagaattggacattttgcgaccacaaactctaaaatcttgttcactttttaaaccctcaggctggtttggttgatgtctgctcacatgctgatgaccacactgatgttttagctcacatgccagcccacctagcaaagtcttttttaggtctggcactgacaaaatctcaagggggtggcatgcaaatgccacataaacaaaagcaatccagttttgctgtgagagggttgagagtttgatgttaaaaaatatctggttttgtagtttagagttcatataaactaccagaagagtcgctattaaatggacatttcttaaaacaaaactcatttatgtccacatcctcatttatgtaactggaagcatatatgccgacatccttgatggtgatccatttgcatcagctgacataaagccccttgcttttctctttcatctttcattataattaatcagattataactccaccaaacataggtcctgttctacaaaggcataaactgaactgctgtgcttgttgtcctgatgaaatcaatttattttattaaaaagttgaactgttcttcagactgttatacattatattggtcaatctatcttctcttacatttatgtttcttaattagtctctaaatttatctcagggtgaatttaattcgggaaaatcaacttttataaatgctctacttgggaggaagtatcttcaggaaggagttgtgcccacaacaaatgagatcatgttgctatcatattctgatgttgactctgaaagcgcagaacgatgtgagaggcacccggatggtcaatacatgtgctatttatcggcacccgtattgaaggaagtaagtacatagttgatgtcttgatgctaccctttcaccctttactgtatttggttgaacaagctagctacgccaggatggttatcatgatgtaaggaaacataatatttttcaactacttgaaggctgctttctctatgaatctcaaagaaatatttgttctaaggaagcattcgagttaatgaatatgtatgaaatagaggaatacaactctttcctctacaaaatgctgtagttttagcatgtacaacctgtctgttagctgtttactgactttttatgggtct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|
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