Os05g0395300
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0395300 |
|---|---|
| Description |
Protein of unknown function DUF21 domain containing protein |
| Version |
NM_001061997.1 GI:115463724 GeneID:4338701 |
| Length |
7553 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0395300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:19239647..19247199 |
| Sequence Coding Region |
19239714..19239739,19239824..19240023,19240969..19241045,19242022..19242105,19242188..19242301 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:19239647..19247199 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggctgcggcggtggggagggcgcgggggttcgcggggctggtcgtgcagggggaggacacgccgttcgggtcggtgtggtggtgggcgtacgcggggatatcctgcttcctggtgctcttcgccgggatcatgtcggggctcaccctcggcctcatgtcgctcggcctcgtcgagctggagatcctccagcgcagcggcaccgatgccgagaaggcccaggctgctgccatcctcccagttgttcaaaagcagcaccagcttcttgtcaccctgctcttgtgtaatgcttgtgccatggaggctcttcctatattccttgacaggatttttcatcctgttgttgctgttatcttatcagtaacgtttgttcttgcttttggagaggttataccacaagcaatctgtactaggtatggattggctgtgggtgctaactttgtatggcttgtacgcatcctcatgatcatctgctatcctatttcttatcccatagggaagctcctagattgtgctcttgggcataatgaatctgcactttttaggcgagctcaacttaaagctcttgtctctatccatagcaaagaggctggcaagggtggagagcttacccatgatgagactacaatcataagtggagccttggacttgactgagaagactgctgaggaggctatgacacctattgagtcaactttctcattagatgtggactccaagttggattgggaagcaatcggcaaaatccttgctcggggtcatagccgtgtgcctgtatactctggaaaccctaggaacattattggtctcctgctggtgaaaagtcttctgacagttcgtgctgaaacagagacaccagttagtgctgtttccattagaaggattccaagggttcctgcagatatgcctttatatgacatactgaatgagtttcagaaaggaagtagtcatatggctgctgttgtgaaggctaagcccaaaattgtaccactccctgacaaaactgaaccaaacagggaagtaagtggggcaccacagctgactgctcccttactatccaataatgaagaaagggtggaaagtttggttgttgatattgaaaaaccacagagcaggcaggttaatggaaacaaaccctgttccatgcagcagaatgagatgccatatgcaatgtctcggtcatcagaggatatagacgatggtgaggtcattggtatcatcacacttgaagatgtatttgaagaactattgcaggaggagatagtggatgaaactgatgagtatgttgatgttcataagaggatccgagtggccgccgccgccgctgcatcttcggttgccagggctccatcaattcggagattaacgggtcaaaagggcacaggtacgcagaataggcaaggacagccaactggaattttgaagaaacctactgaaggtgattccaatccatcaaaacatcaggtgaaccttgttgaacctcttttggaaaataagaggtaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAAVGRARGFAGLVVQGEDTPFGSVWWWAYAGISCFLVLFAGI MSGLTLGLMSLGLVELEILQRSGTDAEKAQAAAILPVVQKQHQLLVTLLLCNACAMEA LPIFLDRIFHPVVAVILSVTFVLAFGEVIPQAICTRYGLAVGANFVWLVRILMIICYP ISYPIGKLLDCALGHNESALFRRAQLKALVSIHSKEAGKGGELTHDETTIISGALDLT EKTAEEAMTPIESTFSLDVDSKLDWEAIGKILARGHSRVPVYSGNPRNIIGLLLVKSL LTVRAETETPVSAVSIRRIPRVPADMPLYDILNEFQKGSSHMAAVVKAKPKIVPLPDK TEPNREVSGAPQLTAPLLSNNEERVESLVVDIEKPQSRQVNGNKPCSMQQNEMPYAMS RSSEDIDDGEVIGIITLEDVFEELLQEEIVDETDEYVDVHKRIRVAAAAAASSVARAP SIRRLTGQKGTGTQNRQGQPTGILKKPTEGDSNPSKHQVNLVEPLLENKR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>68..93#178..377#1323..1399#2376..2459#2542..2655#3273..3359#3448..3519#4055..4122#4456..4543#4637..4710#4866..5229#5436..5482#5566..5647#7110..7229#ggggcctggtggtggtcggggctctgacgcggcggggcggcggaggtggtggtggggagggcgagagatggctgcggcggtggggagggcgcggggggcggcgagcctggcggcggcggtgagggtggcggcggcgacggcgaggccggcgtcgagcgtcgccgcggcggccgggctggggttcgcggggctggtcgtgcagggggaggacacgccgttcgggtcggtgtggtggtgggcgtacgcggggatatcctgcttcctggtgctcttcgccgggatcatgtcggggctcaccctcggcctcatgtcgctcggcctcgtcgagctggagatcctccagcgcagcggcaccgatgccgagaaggcccaggctggtatgatccggaaccctagccgcgttcttctctcctcccccgtgtcgtgatcgatctggttgcggtttgaggagccatttctaggagggtcttatgttggaacagcccacttgtgctcgatctgatcgcaattttgcgggcgattcttatggggtgttgagttgggatagcaggtgctatgttacgtcacattggggattcacgatatctgtaacacgccatgattagtttctgctattttggaatgaggatctattgctgttattttgctaaggatttgctgactctgatcgtgccggtcatactctagatcctctgtttgttgtaccagttgtatttattttctattttaagttaacagaagcgaatatacatcaataatgctgataatcagaaaaagtagaacacacaaaagggtagtaaggttcctctgccaaaaaggtagtaaggtgataagaaaaggagacgttggtgggagttggctttattcaagattcacctctttctgggggagatataaaatgatcctttggtcagtgagaattggaactatgcaacggataggcatagagatgtacgcgctagaagttcctgggcctgccatgttgcttgtgggtagcgtgcagctgagccttttcacacataagatatgatccatagttttttggtgcttttgtttgtactactaattttctgtgaaatgatctagttctgtctgaaatgcaatatgggcattttagatgttcaccatttgatctaatgtatatgctaaaattgataacttgatatggtagtagtgatggtgcttgtgtagtattattacaggcactttcagcacctcaataactcgttttcactttttagcagatgctactgttgctactgtattttcatggatagttctgttgttgatcgtttggctacttgtatgtcatctttttgtagctgccatcctcccagttgttcaaaagcagcaccagcttcttgtcaccctgctcttgtgtaatgcttgtgccatggaggtatgtaactctggttgcatttcttttttatcatttaccacactattttgtactgcgaacatgcaaatataaagggtattagcagatgggcatatttgatagtatgttattgttttgacacattttaactcatagcttgtttggagagaagaatgctatatgctgaagttgcctctattggttcagttttgtctgtactgcggcatgatttcctttgttagcatctgtggaaatccacaaacgattttacttgaattgtaatatctaatttggaagagtctagtgtctttaattctttgttaggtccctgaatgtaaggtcatctacacttgatgattaatgctactggcctactgctacaagtctatttgtcattgtaatgtgcattaatatatctgagcatgtaccataaaatccaacaaagtggctatattgaagtttatatatcaatattatataccttatttaaatatctagttccctttaatatttgaagttctattaggttttgcttgttaactcgttatgtccataaaaaaaaatatgttcaatctgctcacctactcattaaatttgctaataatataacgcatttggaaaattggaattgatttcacacattagaagttctggtatatgattaggctcctataaagtataaagtacgaatgtacggcataagtggactgctaagtgctataacattttctaggatcctgagttcttaacatgttctctagatatattattttctgctatgcacaaaggatgcccgagacaaatatttgtaaacttctctttgcacatagtatggtatattagcttattttacatggatatgttttaccttcccccaaccatggacttcctttcagaattttatcagtagatacaccatgcattctattcatataccttttacattgttttgtttagccagtgactcttccaatttgtttctttggatcgtttgcaggctcttcctatattccttgacaggatttttcatcctgttgttgctgttatcttatcagtaacgtttgttcttgcttttggagaggtattatatattatgtccaaactctatagtttctctatggtcttgcagactgtctgattgattatttaatttttaacgccaggttataccacaagcaatctgtactaggtatggattggctgtgggtgctaactttgtatggcttgtacgcatcctcatgatcatctgctatcctatttcttatcccatagggaaggtaagtccgcaaaattaaattgacttagttcaagtgtccctactataatgaagtcttttggagcttctctaatggcagggacttttaattgtcaatttgtcatgaattagatattgtaacagttgtgcttccgagtcatctcttcattcagttttggtaccatagttgatgaaccctattacaaagtgaaaacaatatgccttcacaaaatgacctgtgtatatgtctttcgatttgagaatttgttatcagcttatactatattaggttaatcaatgcccttagcttgtagtgctatggaagcttctattactaaaacaccatgcagcatgcaagctcatgtgattacaaatttgtgtttcatgcattatgctataatgcagtgcatatgtttaaatgcacgcttaacttggtgtacaaacagtgtattttctttcagattttaatatgttgtcttaggtttaatgaaaacagacttgatttttgtactatagaataacatgtatattttattttgttttgaaatattttttgtttaagtcttccaaatttacttgatatgatttaaggactagttactaaaagtgattgaaatatatattgtccatctgtcgcagctcctagattgtgctcttgggcataatgaatctgcactttttaggcgagctcaacttaaagctcttgtctctatccatagcaaagaggtaacatgaccttactatgtaacttattaataagttaacatcttctttgaaggttatatcacagttcaatgcttttctgccattgcaggctggcaagggtggagagcttacccatgatgagactacaatcataagtggagccttggacttgactgagaaggtgcgcgtcattttaaaatttgacttctaatttataatgaataatagaatctggagaatcgttggcaatcaaaatttaagtgaacttgttacaaagttagatgttgtttgacttgttttctagatatgacttgttttctatcttttggttttaggggattgaaacattagactccctattgtcttttatgtattaatttgtattaatatttaactatgagatagcttctagagtgattttgatgtatatgatactgatatatttaatggcttcatgctttatggttgtcttcctatttttgtttagtatttaacagctttcagcttcacatcagaaatgacttaatccatgctgcaaatattatatgacaaatgcctacatttgttcttgtgtgttgaatctctttttgactctttattgagcaaaagaagtctgtttcttactttacaaacatagtgctcacagactagcactttgatatgaacaatcattttttgttgtcttcagcagaaatttcattgttatttgtgtgcagactgctgaggaggctatgacacctattgagtcaactttctcattagatgtggactccaagttggattggtaactataaaaaaaaatacaatcacactttagacaccgtagctcttggtcatgttccatatttattatcgatcctattcactgcaaaagttcttgttgattctatgtttgtcttatgtctttctttcttattagttgaactcattcgtcaaacgtaaacaatcttctgtcttagttatgtatttgtggaactaagttcagacaatgtaatcttttgtgttttacctacatagtagttattaaacattagcaaatagtacgcaaatttcccccccttttttttttgataaggctcaatgctctgccaatcttcttatgtacttttatttacagggaagcaatcggcaaaatccttgctcggggtcatagccgtgtgcctgtatactctggaaaccctaggaacattattggtctcctgctggttggtgtcgaattgtcaatgctgtcatggagtatttaataacccagtgacttgtttgtatgattcaccatgtcttattttgaatttttacaggtgaaaagtcttctgacagttcgtgctgaaacagagacaccagttagtgctgtttccattagaaggattccaaggtcgtggcacaaatctattaaattatacattagaatgtcttctcaacatgggataaaatgttcatagttgaagtatcttttttgctgtattaatacttgcaatctccgtaatttctgacgaataatca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