Os05g0436400

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os05g0436400

Description

Peptidase A22, presenilin signal peptide family protein

Version

NM_001062183.1 GI:115464096 GeneID:4338901

Length

5129 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os05g0436400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:21378130..21383258

Sequence Coding Region

21378139..21378266,21378365..21378450,21379055..21379182,21379323..21379373,21379630..21379716
,21380474..21380543,21381390..21381526,21381911..21381988,21382968..21383054

Expression

GEO Profiles:Os05g0436400

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgcggtttcctttggtgggaagtgctatgcttttgtccctcttccttctattcaagtttctctcaaaagatttggtcaatactgttctcactgcctactttttcattcttggcatcgctgctctctgtgcaacattgctgccttccataaaacgatttcttccaaaagaatggaacgataatgccattgtttggcgtgctccacttttccactcgctctcggtggagtttaccagatctcaagtcgttgcatcgatcccaggatttttcttttgcatatggtatgctgcgaagaagcattggctagcaaacaacgttctggggatttctttctgcattcagggaatcgagatgctatcacttggatcattcaaaactggtgctattctcttgagcggactctttttctatgatattttctgggtcttcttcactccagttatggtcagtgttgccaagtcatttgatgctccaataaagcttctatttcctacaggtgatgctgcacgcccgttctctatgcttggccttggtgacattgtaatacctggtatatttgtggcacttgcgctgcgttttgatgtctcaagaggaattaagaaccgctattttaatagtgcatttttgggttataccgtgggtctgactgtgacaataatagtgatgaactggttccaagctgcacagcctgctctgttgtacattgttcctggtgtgattggttttgttgctgttcactgtttgtggaatggtgaagtaaagccgctccttgagtacaacgagtccaaagcggaagaggaggaagcttgtgaagaagatacagatagcaagcaaaacaaaaagaaagagtag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MRFPLVGSAMLLSLFLLFKFLSKDLVNTVLTAYFFILGIAALCA TLLPSIKRFLPKEWNDNAIVWRAPLFHSLSVEFTRSQVVASIPGFFFCIWYAAKKHWL ANNVLGISFCIQGIEMLSLGSFKTGAILLSGLFFYDIFWVFFTPVMVSVAKSFDAPIK LLFPTGDAARPFSMLGLGDIVIPGIFVALALRFDVSRGIKNRYFNSAFLGYTVGLTVT IIVMNWFQAAQPALLYIVPGVIGFVAVHCLWNGEVKPLLEYNESKAEEEEACEEDTDS KQNKKKE</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>10..137#236..321#926..1053#1194..1244#1501..1587#2345..2414#3261..3397#3782..3859#4839..4925#gaacatgctatgcggtttcctttggtgggaagtgctatgcttttgtccctcttccttctattcaagtttctctcaaaagatttggtcaatactgttctcactgcctactttttcattcttggcatcgctgctctctggtaagttcaaatcctattattagaagagtttttccacacatgtaacttcttaatactgtttttgtgaaattaagaatgtttatgtttttctcttgcagtgcaacattgctgccttccataaaacgatttcttccaaaagaatggaacgataatgccattgtttggcgtgctccacttttccactgtatgactcacacctcattattgccatcatgtatcatgtcagatcaatacatctatgtaatcctatctattagtagtctactatatgagggaactatttggttgcatctctagtattgccaatttgccatacatcaaaacaatgttgtggcgacataatccatatacttattgtgtgtcatagctagaaaggatttggttttatttttgggaacatggtgtctttttccagtagaccaattcatcctagagcagaactttaaactgtctgtactgtattacaaaatcataaatacatgatatcgcttaatacaagcaagtaacacaacttattcaaaagacgttaagagtaaagttaagtatttaaattgttcctaaacaatttagtggcatctaaatatgctttcattaacagcatgttgtatggatatggtatccagttttcctgagtgaaccatataggtgctgttagtatgtcagttccttttgttaggaaattattgaaatggcaaaaaaggatcctcctttcaataacattgaaattgtatcatgcaagtcacttctttgtttactggtcttttaagttcattcacttcttatttcagcgctctcggtggagtttaccagatctcaagtcgttgcatcgatcccaggatttttcttttgcatatggtatgctgcgaagaagcattggctagcaaacaacgttctggggatttctttctgcattcaggtttgatcttattgctatttttgagatataatgttaatatgcatgagtaaattaattacggtatgaaagtttcgtagatatgttttttttcccaccaacttgtagagaaacctgaatccctgattctctttgccatccagggaatcgagatgctatcacttggatcattcaaaactggtgctattctcttggtatggattgtttgtattgaactgaaacttatattttctggtggtacttgtcaaagcaccttttattatttcagccatcaaaatcattactagttgagcatggcaatgataatttgaattttctgatatgctataatttatggttgcctttcttttgcttgcgaaattaaagtccatatttgtatacaccaccgtattgtgtaaagcatttttaatttgtaacttttgtgtatcgtggtattcccttttaattcagagcggactctttttctatgatattttctgggtcttcttcactccagttatggtcagtgttgccaagtcatttgatgctccaataaaggtaagtattccttgatttcactcttgttgcaatagccattcatttctatacctaatcaaaaaatacgtaaggtttccagtagttattttcgtctgtttcttttttttcgccgctttttcctttttttgtgccgtccagttgcaagaaaggctaaggatgagccatcgggcccataacaataccggcccaagggaccccttacagaaaccctagaaccacctgattttcatcacaaagacccctactgtcttcgcccttcgttgctccccctctcccagatccgaccgcctccgcctccggcccgccaccactcgccctgaatatctggcttctcaatccgcggaaactactccctgttgttcgtcgacctctttgtcgccggagacctctaggttttctccctctctatgttactgtatgtttgtatggtcgtctcaaactctttggatgtttctttatgtgctcggtggctaattagccaatcacacactgcagccgccatggcagcaaccttaaccctgtgtgaatggtcagtaagctcacctacattgatccgctttgttgcgtcgattggaggaacggctcttcttgtacgtgcttccttcattgatgcatcaacgcacgctgctatatgacctagctctaagtttaatccatcccgtgtgaattcgttttctaggttgcaaatatactgttttagaaatactagttttctaaaaaaaggttaatctagttctactcatttttttttgcacagcttctatttcctacaggtgatgctgcacgcccgttctctatgcttggccttggtgacattgtaatacctggttagtaataaaatctttagattatttatttcaacttttatttggcctgtgatttctggttgaatagggtcattcaggctgtcagctgcattagattgagaacttgtttgaatttatgatctatagcaagctgttagttcaactgggttgtttgttaaaaatagtaacccgattcaaaactgtatctgtttgctacatcatttgagttcctatttttttctcctgtggctctaaaggtgcgtaggcatgtagcagagaatcaaatcaactatatcataaaataatgtagatataattttagttccatttgctggtaataggagtacagttgtgtgtattgccagaaaataattgtaaattcagcatttcagctgctttgagttgcttgtaaaaatgtactccgagtctgaattctggctctgttatccagatgaagccaacaaggttggctatttgtcttcaaactacttagttttataatgaggatatatgttggtttttggctatgatattactttctatacttgaatctaaataaaatgaatagcagaatcatttgcactaccctggttcgttaatttttttttccagggattagtttagttggttggttagggtatgcatgtggatgccttctactgaataatgcattaaactccttgttgtctttattagcactaaagctcgaagaatttgttgttgctagttgctacttgccactgatcgtttgtctttccttagcagtcttcacaccattcaatagtgtaaatcatgaaattgacacatattctgcaaggtgcaactcttgtattgacacataatatgctcttctacttttggttccaggtatatttgtggcacttgcgctgcgttttgatgtctcaagaggaattaagaaccgctattttaatagtgcatttttgggttataccgtgggtctgactgtgacaataatagtgatgaactggttccaagctgcacaggtgagttctgttactaaggattctcgccatcgtgttgcctctttttttcccaagggaaacagtgagggagagcctactgtatacagattattttaaacaaaatgaactgttatacatacataaataaaaggggaaaaagaaggtaattatgttggtgcatctgccacctctacaccaccagaccacctccaccctgtataaacttgtagtagtacaaaggaagctataaaccttgtaaaaggaaaaacaaggaaataaaattacatcaagatccaaccgggactccagttataacaggaaaagaaagttgcctctgatttctgtcatctctgaaatattaatgcccctcttctttcattgtctttattttctcatcatatgcagcctgctctgttgtacattgttcctggtgtgattggttttgttgctgttcactgtttgtggaatggtgaagtaaagccggtaagtttgttaactctgaccatggtatttcccaacctgtccattgtcctgaaacttgagagtacgctgcgtaatttattctgttgaaggggcccctttttttgttacattactaaaaactcaaagttaatagccttcgttcatgatgcttaattgctactgcaaagacgtgggagttttatgtacaataggatggttgatataatttgttggaagagtcgctgtatttattttgatgttagtgttagaatggtgttgctatggttaagttattatgtaccacacgctgttaaatatttgattttctaagctgtgagcaatgcccgtaccatttatgcatgaaatggctttgtacgcatcgttagagattatgcgattccggtgctgaaaggctgagaacatgatgaagttttgaacatggatgatattctttgttgctaacatcaaattatttttttagctaaaaatgactagattattttccttctatcttttgatcactagataaaaatcacttggtttgctggttcgcagtggagtgaacagccaggcatgggctcaatccttatcactgaaatctgtgcgtcagtggggaacttttttcctactccctgggattgcctctatgggttaatcctgggacatttaacttcttgccacttttaagatgtggcaattaattatttgccattcactgtctatgacatgtgggtccagtggcaaataatttagcaccacttgtaagagtggcaaatagttaattattccgttaatcctagctaggacttgatacaccagtagggctcgcctcccacgtataatatatgtatctagtgtgtatgtgaaagctgatgcttgctggcgtgggagtgggagtggccgggtagtttagtttctgttatgcgtatccttagttttacctttattgttttcgtattttattatgattatacttgctgacattttattacattgccagctccttgagtacaacgagtccaaagcggaagaggaggaagcttgtgaagaagata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External Link(s)

NCBI Gene:Os05g0436400, RefSeq:Os05g0436400