Os05g0279300

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Gene Name

Os05g0279300

Description

Similar to tRNA pseudouridine synthase A (EC 5.4.99.12) (tRNA-uridine isomerase I) (tRNA pseudouridylate synthase I)

Version

NM_001187389.1 GI:297723908 GeneID:9267107

Length

8739 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os05g0279300, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:11658914..11667652

Sequence Coding Region

11666049..11666089,11666233..11666367,11667256..11667388,11667455..11667547

Expression

GEO Profiles:Os05g0279300

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MLGLAPLRFVSPPPRGAAAVSAAAIGGHSISLGDGCHCAVPPPG EKDADKARAETTEGASYKWRMVIAYDGTKFKGWQYQPSPPTIQCSIENALTRITKLDR KELCLVGAGRTDTGVHAWGGAFHHAFFLPLS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1564..1604#1286..1420#265..397#106..198#atttgggaaacggggcggtccttcggcacatgttgtctgtaccccctcttggtgccgtgtgcccgtgtgacagtgtctccccacgcatcggctggagaattggatatgctgggtttagcaccactccggtttgtttctccccctcctcgcggcgccgccgccgtttccgccgccgctatcggcggacatagtatctcggtaaagtgtccttctccttctacactcccttctctccatccagatctaacgtgaagagggtctcagctcggggatggctgccattgcgcggtgccgccgccgggggagaaggacgccgacaaggcgcgggcggagacgacggagggagcgtcgtacaagtggcgtatggtgatcgcctacgacgggaccaagttcaaaggttcttggtctcctcctgcgcagttatatttctcgtttttagggtggtgatggatgatttggaacttttggatgcttcccaaaagcttcctgcattgagtaatgggggaggagaaataggtttcgttgttctccatgaaaacacgctaaaatctgttaaaaaaaattcattcggaagggtgtgattttgggttgtttagggcagggtgacgcttgagatcttatcacattgaaaaaccccagaaaaaaaatggtactcctttttcaggatcttatacctgataggtatataaacaaaggttttcggtacacagggaaaacttttggagaactgatgactgcacatggttgactgcacaatgttcacttctagtttatatcctctttggattcgattgagtttggatcttcttctacatgcgctgtccattccaaacttatctcatttatatcctctttggattcgatttatacctaatttattgcaaaacctaagttcggatttcctcctgttctattatgtcctgtttatatggtcatgtgttgccactgttctggagttctgaagaggtagcggatgtatcatcatcatctcttgtaagcatatttccttttgaataaccaactggagatctgctattctgacatgtttccgtcgaagcaagttcgtaattatctaacacagcaatctgcattcctttgtttaactgagtatataactttttgtacggcttttccttgtcgtaggccatcagttatgttatacttcacttatcatccatctattatataaactaccttgttgacattatgtgtgaacatcactgagactgtgatcagaacttcagaattttgaaatctcaataatctaactacaatcatgtttcaggttggcagtatcaaccatcgcctccaaccatacaatgtagtattgagaatgcgctaacacgcatcacaaagctggatcgcaaggagctctgcttggttggagctggcagaacagatacaggtgttcatgcatggggtcaggttcaattatcttaacatatctgtaaataagtgttcaagttgagatatatagtcccacttatatcttgcaccgcttgttctggtgttttgtaatttttgttttatatggaggggtaacacatcatattttgtatctaggtggcgcatttcaccacgcctttttcctaccattgtcttgatagcatgcactctgcaatcaatgggcttcttccacatgagattcgagtgagggaaattagtgcagcaaagcctgaatttcatgcccggacatccacaaggagcaaaatttatcattacaagatttataatggaccagtcatggatccctttcataatcattatgcataccatagtgcgtataagcttaattcacaagctatgcgggaggctgcaaagcattttgttggaacacatgactttacatctttcgctaatgcagtacacaatgatcgtgtacgcagtcccataaagaagataatgcgctttgatgttattgaaatggtaattgaagctcgcagttcttagttttgccttttcaccctgacaatgcagcattaaggccctctttgtttaggcttataagccaacttataagccgaaaagtctaagactaaacaaacaagcggctttttcgtttggcttttttgaagccataagccactctaacactattaagccaaaagctaggttggagaagcttttttggcttatgtgaggtagatgtatgactccaccattaaacttaggacattaaatccaccggcttataaatcatataagccaataagctgacttaaaagtctaagccaataagcctaagcctaaacaaagagggcctaagtgttgttttcctttcttgtgtggtcattcagttgaccagacattaagtaccattgaattgacctgatatttttttcccttgtgccacacagggtgctatcttacagcttgagattgaaggcactggctttctgtacagacaagttaggaacatggtaattttgttctcacttcaataaattcatgtgtggactttaatttcgtaacatcttacatattctgaccatatgagggtagaaatggtcctaaataatattggaacaaactctctgagttatggatgcatctgataaaaaaataccatcttgcagaactgttcgtatttttttttattttgtctttgataactagaaatgaagacactagttcattcatcttgattaacttggttgctacgtatataacgtgaggtatctcaccatatctatgttatggtcttgggaagttcaaagtagtggatggtgggaggtcagggtctttgaccccaacagggtcattttgatgccttggtataacgagagaaaggaggaggctcattgcgcggtgccaaatagaataatggatatccattattccttcttgatcaacacttagcttaatcgctcttcaagttagagtgtctggctaacaaattttaatacccccatacagtagtagaagcccatgtggctcatattgatccagcatataaacacgtgcattgcaaccataactcctctgggttaacccttctacactaatcaagaacaaaagtgtaagtgagttgtcatgtatacgtgggtctgctccttggaagagcttgactaacgcagattctggaaactggggtgtagtaactaagatcacaccaactaatacgcagaatctgccagctgatcgatggaatgttgctgtatccttgctgggtggcaggctggcagtagccttgctgttgtcattttgctgatgagctgatctcctgcctatttgggccttgacctactcccataacatcaattcccttcctttacagtgttgactacctgactagtgactactgcaaattccgaaagacagttattgtttccacaaagcaggcatttagacaatagacattcaatacttatggttggagccaagatttggatttggggggtgggggtgggcaggtagagagaataatcataaaaacaatgtggccttggcttgcgtgtttgagaaaaaaataatgtgtccttggcaattttttttttctagactccaataatagcaaacatgataaagtatggtggcatatatagagatcccagaactttccatgggaatttctgagtagtgtgcattcgattgtgacattattcaacacttgcctctagatgcacatggacattctccttattcatagcagcatcatgtcaaactttcatgcactaattaatgtcaaactagttctacaaaacaaattggagaggaattggaccacaagattctgtagttaaataggaattattaggtctcaaggtctttttggcagagcttcagcttcaagaattcttggagctggatataagaccctctgctcttttttgggtaccaacaattaagaagccttttccctcttctgataaaaaaatagcagctctagtgagattggtaatatgagtacctttatgctttgctaagatgtaaagggccattttacgattccatttcttatttgggtgagccatcttattcatactttagagtttagactgaaatactggcttttaccacctcattttagcctacaaacttcatgttctgcaagaatccaggagttggagctctgccaaaaaagcgcttaattgtagcatatctgataatctgatttcagtctaccacacaataccttttttttaattgtagtctactagctggatgcctgtgctttgctacggataaaaaatatattataatattaacaggtaccagaaatagcatgcgctttgccatgaaatgtgttacctatcattttgctatatgtggctatcaatttagatttgattgatttttaatatttaatacgcagaagtttatggggtaatttgcaaacctataacgggagtaggtatggaactaccttattttaatgtagtatagattttaatacttagaagttcatggtaatttgcaaaacaacaatggaagtaggtgtggtaggctggtggcagattcattgccgccaccactaccttcttttaaagtagtgtagatataacaaatggaaagagtaaatcacaatcacagaaactgatgtcttaaagtccaatagctcatggcttccaatgattgatttctggctacaagcttgccactcacatggatgagtctatctcctccctcttgccctagaatggccagcgctgcagtagtaaacattggaggaggcggtgtttcccacaatcccatctcgaggtggagtattgagttttttcataacaagagattatatcctgaaagaccatgttgtgaaaagtcaagacgatgcactacctcttcatttcgtgagaccatgttgtgtactgtgttatcacctactagtacaattgatttcatctcatgaggggacccaaattaacataatactacaatgttactgacatattccatcagaaaatgacactagtgtagaagagaacatgctcttgtcagtgtagtag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External Link(s)

NCBI Gene:Os05g0279300, RefSeq:Os05g0279300