Os05g0498300

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Structured Information

Gene Name	Os05g0498300
Description	MutS III domain containing protein
Version	NM_001062483.1 GI:115464696 GeneID:4339215
Length	11441 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os05g0498300, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 5
Location	Chromosome 5:24570055..24581495
Sequence Coding Region	24570338..24570388,24570950..24570981,24571073..24571167,24571361..24571441,24571514..24571586 ,24572153..24572216,24572814..24572965,24573203..24573304,24573379..24573406 ,24573481..24573512,24573596..24573653,24573754..24573840,24574377..24574433 ,24574651..24574752,24574893..24574937,24575965..24576042,24576699..24576749 ,24576824..24576905,24577232..24577305,24577373..24577469,24578033..24578129 ,24578222..24578311,24578429..24578493,24578579..24578637,24578729..24578805 ,24579041..24579127,24579203..24579262,24579358..24579421,24580218..24580271 ,24580376..24580458,24580553..24580584,24580663..24580686,24580978..24581093 ,24581172..24581252
Expression	GEO Profiles:Os05g0498300
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008398:24570055..24581495 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008398:24570055..24581495 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atggacgaggaagaggaggaggagatgtccgagagggaggtcgactcccaggttcatatggcttgtgtaatgcaaggacgcagagttggaatagcatactatgattcaagtatgcaccagctttttgtattggaaatctgggaagacataactgaagattttcctttgattgatcttgtgaaatatcaatccaaaccgagcacaatatacacaagtactaaaacagatgaggcacttttgttggcgttacaacgaaatgattgtaatgatgaggcccctgctgtgaagctcatgaaaagctcaaccttcagctatgagcaagcctggcacagattaatgtacttgaaagtcgcagctatggacgaagggttaagtgtaaaagaaaggatctgttttcttaattccatgatggatcttggaagtgacgttcaagttcgtgctgctggaggtcttcttgctatattagacaacgagaggcttcttgatacccttgatcagatggaaggtggagcatccattgctattgattctgtggcacagatatcattggacaagttcctgaaacttgatgcaacagctcacgaggcgctacagatttttcaagtagataaacaccccagttacatgggaattggaagggctaaagaagggttctcagtttttggtatgctcaataagtgcgtcactcctatgggaaaacatctcttgaggacatggtttttacgtcctataatcgatattgatgtcataaataatcgcctcaatacaatatcattctttctttgctgtgaagatgtaatgtctgcactgcgtgggactttgaagtctgtcagagatattccccacatgctcaagaaattcaactctccaagttcattctgtacaagcagtgactggcatgcatttctgaagtgcatttgctctcttctgcatataaacaagatttttgaagtaggaatatcagagcatttggcaatcaaattacaacatatgaacattgacttggttggaaaggccaattcttccattacagaagagctggattatgtatcagatctggtagttggtgtgattgatgtgcaacggggtaaagaaaaaggctacgacacactggtgaaagacggattatgtgaggagttagacgaactgaggatggtctatgaagaattgcctgattttttggagcaggtgtcagccaatgaaattgcctccttccctttctcatttgaatgcagaaaagctcctctaatcgtctatgtacaccaaataggatatttaatgtgttttttcgatgagaagataagtgatgccttgttgataggacttccagattttgaatttgcgttttctgaggaaggagaggagagaaggttctactatcatactcaaaagacgagagaacttgacaatcttctgggcgatatttaccataaaattcttgacatggagagagcaattataagggatttagtgtgtcgtgtttgccagtttatacctcaactgacgaaagcagtaaactttgcagcagaacttgattgcatattatcgttggcaattgttgctcgccaaaacaattatgtgaggcccatcttaactgaggattccatacttgagatacagaatggcagacatgctttgcaggaaatgactgttgataccttcgttccaaatgacactaaaatccgcagttcaggacgaatcaacataataactggacctaactactcagggaaaagcatttacatcaagcaggtggctttggtggtttttcttgctcatattggaagctttgttcctgctgattctgccattgttggattgacagataggattttctgtgcaatgggcagcaaatccatgacaagtgaacagtcaacttttatgattgatttacatcaagttggaacaatgctcaggcacgcaacatcgagatccctatgcttattggatgaattcggaaaaggcactctaacagaagatggtattggtctgcttggaggaactatcagccattttacagactacgattgtcctccaaaggtccttttgtcaacacatctgacacagattttcacagaaagctacctgccgcagtctgaacatatcaaatgttataccatgagtgttctgaatcctgatgaacaaacagacaacgaagatgtcatattcctttatcgacttgtacctgggcaagcgctcttgagctttggactacactgtgcacagcttgctggtgttccgagtgaagttgttcagagagctgttactgttttgggggacatccactcaaagagacctataaggcgcatggtctgggagaagttagcagcaaaggaccaacaataccaggatgcagtgactaaactgttggccttcgacccacacaaaggtgatctggtcaacttcttccaggaagtttttccgtcctag</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MDEEEEEEMSEREVDSQVHMACVMQGRRVGIAYYDSSMHQLFVL EIWEDITEDFPLIDLVKYQSKPSTIYTSTKTDEALLLALQRNDCNDEAPAVKLMKSST FSYEQAWHRLMYLKVAAMDEGLSVKERICFLNSMMDLGSDVQVRAAGGLLAILDNERL LDTLDQMEGGASIAIDSVAQISLDKFLKLDATAHEALQIFQVDKHPSYMGIGRAKEGF SVFGMLNKCVTPMGKHLLRTWFLRPIIDIDVINNRLNTISFFLCCEDVMSALRGTLKS VRDIPHMLKKFNSPSSFCTSSDWHAFLKCICSLLHINKIFEVGISEHLAIKLQHMNID LVGKANSSITEELDYVSDLVVGVIDVQRGKEKGYDTLVKDGLCEELDELRMVYEELPD FLEQVSANEIASFPFSFECRKAPLIVYVHQIGYLMCFFDEKISDALLIGLPDFEFAFS EEGEERRFYYHTQKTRELDNLLGDIYHKILDMERAIIRDLVCRVCQFIPQLTKAVNFA AELDCILSLAIVARQNNYVRPILTEDSILEIQNGRHALQEMTVDTFVPNDTKIRSSGR INIITGPNYSGKSIYIKQVALVVFLAHIGSFVPADSAIVGLTDRIFCAMGSKSMTSEQ STFMIDLHQVGTMLRHATSRSLCLLDEFGKGTLTEDGIGLLGGTISHFTDYDCPPKVL LSTHLTQIFTESYLPQSEHIKCYTMSVLNPDEQTDNEDVIFLYRLVPGQALLSFGLHC AQLAGVPSEVVQRAVTVLGDIHSKRPIRRMVWEKLAAKDQQYQDAVTKLLAFDPHKGD LVNFFQEVFPS</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>284..334#896..927#1019..1113#1307..1387#1460..1532#2099..2162#2760..2911#3149..3250#3325..3352#3427..3458#3542..3599#3700..3786#4323..4379#4597..4698#4839..4883#5911..5988#6645..6695#6770..6851#7178..7251#7319..7415#7979..8075#8168..8257#8375..8439#8525..8583#8675..8751#8987..9073#9149..9208#9304..9367#10164..10217#10322..10404#10499..10530#10609..10632#10924..11039#11118..11198#aacaacttccttcccgtacaagccagtgcccgagccacgctcccgccgcacttcgcccctcgccgcctagcttgctccatcctccgcgcccgcgcagctgcgctcgccgtcgccgtcgctgcctagcttcctccagcctccgcatctgcgctctatttgtaccgcattctcggaggaggagcaggaggcgaggagccgccgagtagaggagagggggaggcgaagtcggtgctctcgccgggggttgacggtggaactccgggcgagcgatcgagccggcgaaatggacgaggaagaggaggaggagatgtccgagagggaggtcgactcccaggtgcgtattggcccgatccttccgagttcctcgcctcttattgcgccacacggagtagatttctctgcccccccctcccccaccccgctgcaatccgatcgaatcgtgttgccgaaaccccagttccgcgcgatgccgggttctattttattttaaacgaaaatgtcgtgttctagtctggaatgtagcttagtagttgtagacatcagctgtactgcttttacggcaccttcccgagcgtcacacattttccttttatctgatgcggatgcggcgccatgctcagatttggttcaggtgatgcttaggaaaggcgaatcaaacattgctagtttagttgatgatttctgtaatgttgttcattgtacaagcctcaaaccaccttccgaccagatgcacattttgatatgcaaatgcattcctctgtatttctcatgatgagacgaatcgatgtattgagtttaagaggaacagccgaacaggtcctatagctgtagaaaattttgcacgtctttgttctaatgcactgtacgtactgagtgtcaaaggattacatttcaggttcatatggcttgtgtaatgcaaggacgcaggtaaaattttgatgcatacttgatttgttgagtctgagataccactgtttctctatctaacattaatccatgctactttaatgattctcagagttggaatagcatactatgattcaagtatgcaccagctttttgtattggaaatctgggaagacataactgaagattttcctttgattgatcttggtatggtgctcatatgaccacacttataccaactaatttctctatctatatgaaacggaaatttacttgtaatataatgcatttttggtaacaaacaatttacatcatgtccactgtcaactattttgaacacttcgaatagaggaaacatggttatatagctgacaatctgtggtgttttttgctgtcacagtgaaatatcaatccaaaccgagcacaatatacacaagtactaaaacagatgaggcacttttgttggcgttacaacgaaatggtttgaactgcaacaatttctttaaccaatatcttcagttctcctttaatgattttggttaaaatcattcagattgtaatgatgaggcccctgctgtgaagctcatgaaaagctcaaccttcagctatgagcaagcctggcacaggttagcagctctgttaaagtgatacatgcgatttccacaccacataatatgctttacctgattcgcaagaattgataggacttaatacacaaatgctaaattgtgtcgcatgttgcatctgcatatgaaatcaaccacattgatcaagtgagcaatcaaagctaaatgtgcatggtttggaaacttctaaagtactacttcctccgttccacaatgtaaaactttctagcattgcctagattcatatatatgttaatgaatctagatatatatagaaaacatatacattgatcaatggataaatctaggtaaggccaaaaagtcttacaatatgaaacagagggagtattcattaacagaggtgtttggtaacttatgttacataccgcgatcttgtgatgcatagatgttggccgatcccttttcaatgaggaaaccaagaattatcaattccgggaaaaattcattacaagcaacaaccttgtaggctaatagtaccttcacctgtcaatcattatatttctgatgatgtgatgatgaaatatcattgtgtttgtaaatttcagattaatgtacttgaaagtcgcagctatggacgaagggttaagtgtaaaagaaaggatctgttttgtaagtgatttaagtgagattgcctctactcgtttgtacttatatgttttagatcatctacattggcacgagcttaagcatttatgaattattgttcaaactactgctaaagccatatattccttttctgacatttcttcattgtcacatatagcatgcacaatttatgaatattagcatattgcccatgcgttgcaacagaattaaaaaaaataacgtcatcaacccgtttttctatcacttacatatctcatctcttaatttctgatacacctttgagctgataggtggaaccttcggacccacactctcatttacggtgaagaaagtacatgtccattatgctcaattgcatagttagaaacagatcttttatcttcattgtaatgagctgttgagtagcattttctgtgtgaagatctgtttgcatcttccactggacatcctttatttgtctcacacaagttgctgttacactctttctatttccttttctatcactcgcccttctggctcaattttttgtttctgtcactcagatttgtctttcaagttttgttattatgcagtggtaataattttaggatttgtttacagcttaattccatgatggatcttggaagtgacgttcaagttcgtgctgctggaggtcttcttgctatattagacaacgagaggcttcttgatacccttgatcagatggaaggtggagcatccattgctattgattctgtggcacagatatcattttatccttttatccgtaatgatattatacggactaaatgtgctaatgtactgatcagcatgtttttgtggttttactttggaaacaagttagaaagctatttatgtaggattgtaggtactcttcagggtaaagttatatcttgacaatttgttgcatagtgttcgatgcattcttaacaggctggtattctcatgtttttgtgtatttagtattatattccttgacacgctctcagggacaagttcctgaaacttgatgcaacagctcacgaggcgctacagatttttcaagtagataaacaccccagttacatgggaattggaagggctaaagaagggtaaggattttgtctaaaccttgtactttctcatagccatggttctgatttgtaatagtaacaaaaaattacaggttctcagtttttggtatgctcaataaggtaaatgagatatttctcttctattcttcgtttctaccagtttactgattatgttgtggtcttgtggattgtagtgcgtcactcctatgggaaaacatctcttgaggtcactgttactttctataatcatgattgcagatttgcagtaagaatggcattcgtcttaactaattttatgcttcattccaggacatggtttttacgtcctataatcgatattgatgtcataaataatcgcctcaatacagtatccttaatttgttgaatacacatttctcaatttccccaatgctcaataccaaaaaggtaccagtagatttctgaactgtttctcctagacatgctagatatcattctttctttgctgtgaagatgtaatgtctgcactgcgtgggactttgaagtctgtcagagatattccccacatgctcaaggtgctattatctttactctgtatgttacttgtacctccttttcttatcattccccatgttataaaaagagaggtgtgctgaaataaagtaaacaaatgatagtatctcacagtcctctgttgaaaaacagaggttaaacctgccttttgtgttgagtatgttggtgttgcttgtgttttacccttcacataaatgtataaattctgtagttctcttttagtatttggtcattgctcatggctttgttttcttggactcgcacacattgtgagttttgttctcaatgatatatatgttgtcgttgttgtacatataagaaggaacaaagccttgctttttttaagttagcaattattctatttgaagtagaagagactcaagagtaatgttaactgtgaaataattgaatcaacggatcatgataattatatgcttatcataacatgtcgtggttattcttattctctttgagcacacattattcttcttcacagtttttctaatgtgcataactgacattttatatttttctgaagaaattcaactctccaagttcattctgtacaagcagtgactggcatgcatttctgaaggtacctacctgtaatgatgcatatggatctggctattactttataaatgcacaatcactttgaatatgctcctgcgttttccttctcccacttagctattccatatttgaagctctgccctaagtgcaagatacgaagcacccatacgtgcatgattttcttttctttcatttctcttgctgataatatcccttttctttcacttctcttatttca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External Link(s)	NCBI Gene:Os05g0498300, RefSeq:Os05g0498300