Os05g0511000
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0511000 |
|---|---|
| Description |
Protein of unknown function DUF887, TLC-like family protein |
| Version |
NM_001062548.1 GI:115464826 GeneID:4339284 |
| Length |
3540 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0511000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:25374010..25377549 |
| Sequence Coding Region |
25374941..25375069,25375374..25375462,25375560..25375695,25375778..25375852,25376003..25376124 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:25374010..25377549 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggatctgccattgatggctgctaaagcctataagtacaaagcagaactacttgttaaggactacctgctagcagattcgtatgttccatacgcttctgtgcttggcggaattctgatgtgcaagttgtcatatgatttcacacgctttatcagttcattctacttcaaaggctatggttctctcacaaagatgcaaaaggttgaatggaataacaggggcatgtccaccgtccatgcaatattcattacacttatgtcagcatacttagtcttcttctcgggtttattctctgaccagcaggatggaccagtaacatttagaagttcgagcctctccaatttcacgctaggggtctcagttgggtatttcattgcggaccttgccatgatactatggttttacccttcactcggtggaatggagtatcttgtccaccatgtattgtcacttactgctgtaacgtatactatgctttctggggaaggacagttatacacatacatgagtctcatctcagagactactacacctggaatcaacctaagatggttccttgatgttgctggaatgaaaagatccaaaagatacgttgttaatggagttgcaatgtttcttacttggctggttgcaaggataattttgttcatgtacttgttttatcagatctttttacattatgatcagattaagcagatggagacctttggttatcttctggtttgtgttgtgcctgccatactgttcgtgatgaatatgatatggttttccaagatcttaaggggcctcaagaagacactggccaagaggcattga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDLPLMAAKAYKYKAELLVKDYLLADSYVPYASVLGGILMCKLS YDFTRFISSFYFKGYGSLTKMQKVEWNNRGMSTVHAIFITLMSAYLVFFSGLFSDQQD GPVTFRSSSLSNFTLGVSVGYFIADLAMILWFYPSLGGMEYLVHHVLSLTAVTYTMLS GEGQLYTYMSLISETTTPGINLRWFLDVAGMKRSKRYVVNGVAMFLTWLVARIILFMY LFYQIFLHYDQIKQMETFGYLLVCVVPAILFVMNMIWFSKILRGLKKTLAKRH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>932..1060#1365..1453#1551..1686#1769..1843#1994..2115#2218..2293#2780..2839#2921..3049#agtttccacctttcccgcatcttccgccgtggggaagggagcaatcggcaagccaatccaatccggttgcttctcctccaatccaacctcgtcggcggcggcggcgacccgcgccgcgcaggtgaggcctcctcgcgctccccctcccgcttccgccgccgccgccgcttgggttgcccgtcgatcatgcgtcccgcggattgggggctcggtttttttgtatttgatctggtttgcgtggagattaggggcgatgtacggggtggatttttggttatgggttggattggatgggagagatcgtatttcgtatcgatgctccgtttggccttaggttttgtatttagtggatggctcgagtccaagcgtagaaaagagagaaagaagtgattcggaagttctatgttgttgtttcgatgtagatggaaaagtgtattgcgcatttattgttttgggattactagcaaaagtttcatgctcatttgtctcttgcttgtaaattttgatggaacaatagagagaagacacagggaccagctaagctgtgcatccttgttggtgatggttttttacaaatgatgaatagccgcctatcagcaaaattctttcattttacagttgctgcatttggaatttgattgaacaattatctccttttgttttggtcaagtcatggaactggtagtgccttgcattctgaaaaggggctctagattactgtacctcatttaagataatttggcagcagtacaatattatcctatatatattgtgatatgttcaattaatactgtaacacttatatgtacaatattatcctatatatattgtgactgttcatgcttgtacattgttcaattaatactgtcacacttatatgcatctctgtttgtgttcctcattaggctgttgagttatcacgtatttgattatggatctgccattgatggctgctaaagcctataagtacaaagcagaactacttgttaaggactacctgctagcagattcgtatgttccatacgcttctgtgcttggcggaattctgatgtgcaagttggtaatgtcacttctgactctcacttttctgttaattatcatcattctactgtgtacctgtgcaataacatgttcatagttgtgcgtatgtgtatactcaaagagaatgccaacatctatgccattgctcttttgcattggaatgtaagacctttttttttcattcactggttttatttgttccattaaaatcatggtcaatgatgatggcacataattaatatagcatattatttccaacatccatttcatagtccttgtaatggttttgttatcttgactattgtgttcttttgctagctcagtcatatgatttcacacgctttatcagttcattctacttcaaaggctatggttctctcacaaagatgcaaaaggttgaatggaataacaggtcagcagcattaaccaacttaattgccaagttcctacatcccactctattattataagcttctgatgatacatcttctgaccctttgttactataggggcatgtccaccgtccatgcaatattcattacacttatgtcagcatacttagtcttcttctcgggtttattctctgaccagcaggatggaccagtaacatttagaagttcgagcctctccaatttcacgctaggggtatacatatgcaattactttattgtcctgtgacttgtgatatttcattatacttagttacttgaatctcatgttttgctaggtctcagttgggtatttcattgcggaccttgccatgatactatggttttacccttcactcggtggaatggagtatgtaagtaaacatttttcatcttatttttaccctctcttcagtttccctcctaactgactaacctaggtccgttgccctccatttgactcctgcaaactgcattatttgtcattagccattaccaacttactcttggctgtcttttgtcagcttgtccaccatgtattgtcacttactgctgtaacgtatactatgctttctggggaaggacagttatacacatacatgagtctcatctcagagactactacacctggaatcaacctaagatggtaactgagtatacaaatatgttgcatagaattttgttttggtatcatcttcaatccatcagtccatctaaactgctattctctcccctttgtgttatcaaggttccttgatgttgctggaatgaaaagatccaaaagatacgttgttaatggagttgcaatgtttcttacttggctggtaagaataaagttctaaactagttgtgttgtggcagaatgtattgttctgcactgactataattaaatgggaattatgtgatctatgcatacattttcgtgaaagcattagtctttaattacatctgaacttttcaactgtaatattgttttatttaaatttttgtgatttcgaatttctgctagccttggaagcagttgtcttgctagttcggatttgtacatatgttcaaacaaatgcttgttttccagtgaggataatattggcacataggtttattggctaccaagtgagatatattgaattattctaagggaaaatgatccttcctaactatgggagttttaagactaaactaccaaagttgtatttgaacactcaggtttacttaaatctgtcgctaaatcgataatatggttttttactatattttggagcttcaagtaccttggtctgctaacaatgaaagaaactcctttgtgcaggttgcaaggataattttgttcatgtacttgttttatcagatctttttacattatgatcaggtacatggtaattcttctggattcaatgtacatgatggctatcaaacacatatttctgacttgatacttgttcgcatacagattaagcagatggagacctttggttatcttctggtttgtgttgtgcctgccatactgttcgtgatgaatatgatatggttttccaagatcttaaggggcctcaagaagacactggccaagaggcattgagtggggcaaggggtatgcatgtacagccacgacaaaccacctatctgtaaattcactcagcaggccagcagcctatagcttctcattagtcacgatggctaatcctggtaatatcagcttggccattaagatccagatttatgattgaatgcccagctttttatgcatggatgatatattaatttgtatatatgttccgctatggctgtatgttcttaatacccatcttctttttctcggtataaatgattatatcttagttttaacttaaacaactatttgccccaatttcagtcacattgtcaacacattgctgtaatttgccatcagctttggccatcattcccaagaatagtttgatcatcaacttttagtctccctggactaaactgcctttctttagatctggcttcacaatgatgcccgagtttttaaaacatgtataggctgaagaattttggaatttggaatttggaatcaagaaagttttc</dnaseqindica> |
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