Os05g0519400
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0519400 |
|---|---|
| Description |
Similar to N-ethylmaleimide sensitive factor NSF (Fragment) |
| Version |
NM_001062598.1 GI:115464926 GeneID:4339340 |
| Length |
6801 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0519400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:25842982..25849782 |
| Sequence Coding Region |
25843345..25843488,25843575..25843640,25843813..25843935,25844180..25844267,25844368..25844426 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:25842982..25849782 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008398:25842982..25849782 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggggaggaactaccacggctacggcggcggcggcggcgggggcatgtccatggtggtggcgagcacgccggggcaggagctggccctcaccaactgcgcgtacgtctcctccgccgacatccgccgcttccccaacgccctcgccctcgtcggcgacgccttcgtcttcaccctgcgtgcccatgatgctgtttctgctggaagcatcgcattgaatgccattcagcgtcgccagacgaaggtttcagctggggattcaatcactgttagcagttttgcccctcccgatgatttcaaattggcattgctcacattagaactagagtataccaaggcaagaaccaaccgaaatgaggagctggatgctgttgtgcttgcccaacaacttcgaaggagatttcttgatcaggtcatgacatctgggcaaagagtaccatttgaattttgtgggacaaactatatattcactgtcaatcaagctttgctagatggccaagaaaattccacacctttggacagaggattcctgtcaagtgatacatacatcatatttgaggctgcgcctaattcaggaattaaggtagtaaaccaaaaggaagctgctagcagcaagcttttcaagcacaaagagtttaaccttgaaaagttggggataggtggattaagtgctgaattcacagacatatttagaagggcatttgcttcaagggtgtttcctcctcatgttgttaataaattgggcatcaagcatgttaaaggtatattgctgtatggcccccctggtactggcaaaactcttatggcccgtcaaattgggaaactgctgaacggaaatgaacccaagattgtaaatggacctgaagtcttgagcaagtttgttggagaaactgagaagaatgtgagagatttgttcgctgatgctgaaaatgaccagaagacacgaggtgatcagagtgacctccacgttatcattttcgatgaaattgatgctatctgcaagtctagaggatctaccagagatggtacgggtgtacatgatagcattgtaaatcagctccttacaaagatagatggtgttgaggcattgaataatgtgctcctcattggaatgaccaatcgtaaggatttacttgatgaagctttactgaggcctggacgattggaagttcatattgagataaacctgcctgatgaaaatggccgtttgcagattcttcaaattcatacgaataagatgaaagaaagctctttcctttccccgaatgttaatcttcaggagctagctgcacggacaaagaactacagtggagcagagctggaaggtgtcgtcaaaagtgcagtctcatatgctttgaacaggcagataagcatggatgaccttaccaagcctttggatgaagaaagcattaaggttactatggatgattttgtgaatgcacttcatgaaattacccctgcatttggtgcttccactgatgaccttgaaagatgcaggctaaggggtatggttgattgtggcaaggcacataggcacttgtatgagagaggtatgcttcttgttgagcaagttaaagttagcaaaggtagtccacttgtgacatgcctcttggaaggtcctgctggaagtggtaaatcggctttggctgctactgttggcattgacagtgattttgcttacgtcaaaattatatcagcagagacaatgattggtttcagtgaaagcagcaaatgtgcacagatttgcaaggtttttgaggatgcatacaaatctcagtttggcatcataattctagatgacatcgaaaggttactggaatatgttgccattggaccacgcttttcaaacataatctcacaaactctactagtccttctcaagagggttcctcctaagggcaagaacttgcttgttattggaacaacaagtgaagtaggctttctagaatccattggtatgtgcgacgtgttctccgtgacataccatgtccccaaactgaaaaaggaggatgctacaaaggtgttgcggcatctcaatgtgttcgatgaagcggacattgatgcggctgcagaagcactggacgatatgccaatcaagaagctgtacacactcgttgagatggctgcacaagggccatcaggaggaagcgcggaagcagtctatggtggagaggaaaagatagatatcaaccacttctttagcatcttgagtgatattatccgctattaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAGRNYHGYGGGGGGGMSMVVASTPGQELALTNCAYVSSADIRR FPNALALVGDAFVFTLRAHDAVSAGSIALNAIQRRQTKVSAGDSITVSSFAPPDDFKL ALLTLELEYTKARTNRNEELDAVVLAQQLRRRFLDQVMTSGQRVPFEFCGTNYIFTVN QALLDGQENSTPLDRGFLSSDTYIIFEAAPNSGIKVVNQKEAASSKLFKHKEFNLEKL GIGGLSAEFTDIFRRAFASRVFPPHVVNKLGIKHVKGILLYGPPGTGKTLMARQIGKL LNGNEPKIVNGPEVLSKFVGETEKNVRDLFADAENDQKTRGDQSDLHVIIFDEIDAIC KSRGSTRDGTGVHDSIVNQLLTKIDGVEALNNVLLIGMTNRKDLLDEALLRPGRLEVH IEINLPDENGRLQILQIHTNKMKESSFLSPNVNLQELAARTKNYSGAELEGVVKSAVS YALNRQISMDDLTKPLDEESIKVTMDDFVNALHEITPAFGASTDDLERCRLRGMVDCG KAHRHLYERGMLLVEQVKVSKGSPLVTCLLEGPAGSGKSALAATVGIDSDFAYVKIIS AETMIGFSESSKCAQICKVFEDAYKSQFGIIILDDIERLLEYVAIGPRFSNIISQTLL VLLKRVPPKGKNLLVIGTTSEVGFLESIGMCDVFSVTYHVPKLKKEDATKVLRHLNVF DEADIDAAAEALDDMPIKKLYTLVEMAAQGPSGGSAEAVYGGEEKIDINHFFSILSDI IRY</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6295..6438#6143..6208#5848..5970#5516..5603#5357..5415#5091..5150#4950..5010#4733..4864#4071..4281#3590..3723#3249..3331#3096..3161#2631..2686#2438..2537#1817..1925#1585..1739#1301..1471#1059..1109#893..977#712..807#114..295#accatttcctttcctttcggcatctctcctgcgcgggcgagtcgtcctcctcgtcctcgtcgtcccctttctctgctcccgcgagatctcacccccgctgcggcgacgcggccatggcggggaggaactaccacggctacggcggcggcggcggcgggggcatgtccatggtggtggcgagcacgccggggcaggagctggccctcaccaactgcgcgtacgtctcctccgccgacatccgccgcttccccaacgccctcgccctcgtcggcgacgccttcgtcttcaccctgcgatatccttttgccgatctcgtaaccaaatcggttcgtgtgctctcccccgcgcttagatctctctccccccaaatgagcccgttctggcgattttgatctggtctggtagtggttcccgtatgaatccacgaacgtagagaaaaccagttggtgacttggtgtgatggttagtagcgtgcctaagcgcaaatgttattgtgatttgttatcctccagtgttgatgtttagtttagtgttctgtgctggggttgctgggctcaccgtaatgtggcttccagttattattgctctcaaatctaccttcgatgagatcatgatgtctcagctttgagatgctttgatgatatttcgtgcctacttcccaattgaattataagtttctcttctcatgtgtgatccttaatgaatatccactgcccatgatgctgtttctgctggaagcatcgcattgaatgccattcagcgtcgccagacgaaggtttcagctggggattcaatcactgttagcaggtaggaagttcaagtggcgtgctgatcaatattttgaatgattatgtgttgccttactgttttcccctgataatatttgcatcagttttgcccctcccgatgatttcaaattggcattgctcacattagaactagagtataccaaggcaagaaccaaccgaaatgaggaggtaagttcgttgttctgtttatgatgcaaatatttagtgcttggtcagtgtaatctcatctgcatgagcttggtttcacagctggatgctgttgtgcttgcccaacaacttcgaaggagatttcttgatcaggtatgccatagtcaattaacattgtttctctgagtagggtttattcctttgattctttcagtcaattggatttaatgtgcatgatatacataaaatgtctcatttgcacaattagattctggattcatgtaaattaacagtactatgtccttgtataccctaaatggtgatgatggtgttatctacaacaggtcatgacatctgggcaaagagtaccatttgaattttgtgggacaaactatatattcactgtcaatcaagctttgctagatggccaagaaaattccacacctttggacagaggattcctgtcaagtgatacatacatcatatttgaggctgcgcctaattcaggaattaaggttcatttgagtaccttctatattgttgtcagcttcttttaatagtgtatttgacaagaacattacttatagcttgtgaaacaccacaaataagacctattactctactgcaggtagtaaaccaaaaggaagctgctagcagcaagcttttcaagcacaaagagtttaaccttgaaaagttggggataggtggattaagtgctgaattcacagacatatttagaagggcatttgcttcaagggtgtttcctcctcatgttgttaataagtaagaacagtatcttctctatttttactatcataaaaaaaaatagatgatgtgctgctaatggctgaatattgcagattgggcatcaagcatgttaaaggtatattgctgtatggcccccctggtactggcaaaactcttatggcccgtcaaattgggaaactgctgaacggaaatgaacccaaggtatggtatggaatctattattgaatatggagtaaagtttctagatatttgttaatggcttcctttgtatattacctatttctttctgatatgtactagtaggatactcaaatctgtacaaatattatatttaaaagtagggtttcaaacggtttagtcaccagcacagatatacatcgataagtgataatatgctataacattattttaaaagtagacctcaaattgttggatcttaagttatgttatttggaatactaatccaatgaggaagccctcaagtctcgaaggattcaaccagagaagctctgtgtcacactccattttatgctgtgaaagtgtcatgaattataaaacattttttatgaaatcgttgtgtatcatgacacaaatttatgcagtacaacttcccagagtcagtaatatgtgattgttaaaaactagaaatcaagagcccagtaacctatgcagatagctcatacttaatgtttaatacctttctacaagctcagattgtaaatggacctgaagtcttgagcaagtttgttggagaaactgagaagaatgtgagagatttgttcgctgatgctgaaaatgaccagaagacacgaggtatgattcctcatcgataaaagcttttccatatttttatgtggagtggaccctttttaacaattaatcgcggtaccttgttttcaaatacaggtgatcagagtgacctccacgttatcattttcgatgaaattgatgctatctgcaaggtggagttctttttccttaaataaacatcatgcatatttctacttgactatatctttctctcaagatgtaaaacatctttttttgtgtttcttcctttgttaatttcataaggttagtttgagaatgtcaccgaagagaatggttgaagtacccttacattaagtgagttggaaatatgagagcaaatagtttgactgattagtcatgcataagttcttagggaataacagagcataagtacttcagatcaaactcttttaccccttctagaagttcaacttgcaattttgtccagtgtatatttcagtgtgctatgtttgattacatcagttgtagcattgcttcagctttatttatagtaactgctaacttctcctgaattaattaaactctgattgtgctgtgcagtctagaggatctaccagagatggtacgggtgtacatgatagcattgtaaatcagctccttacaaaggtatcttttcctagaatttgaactttggactcacgtattttctttctgcatatacactaagttctcgtcaaactttctgcattttagatagatggtgttgaggcattgaataatgtgctcctcattggaatgaccaatcgtaaggatttacttgatgaagctttactgaggtaacttctgaccctctagaaatgcactcaagctagatcatgaaatgcatcagacctcctaaaattgttaccatttcattttatgtacattttaatatctaaacataactctgtgctgcatttactgtgtaattcagaaaattatgcttgccttgattattttagatattgcaggcctaaaccattggggaatcttctttttgtatttttgttttactatttgcacgtatccattgacatttgacacatctgttacaggcctggacgattggaagttcatattgagataaacctgcctgatgaaaatggccgtttgcagattcttcaaattcatacgaataagatgaaagaaagctctttcctttccccgaatgttaatcttcaggagctaggtatattctttgataattcatatttgttttcaggcattcgttcattataacaaatgttgtaaatgatctcttaaaatggactgattagctcattctagtcttattactcaagcttcaaaggttttagtttcccatttccaaaaattgctgtcttagcaatgcttcttacttcaacacccattttagtatgactgagtaggtgcctgtgggaatttcttgttctaaaagatatgtgctgcatgtgatcttggctgtgtacatccatgttggttgtagaggctgggttttaatcgattatctacaaaaataatgtgattgatggttgtgacatgctcttctgaatgaagctgcacggacaaagaactacagtggagcagagctggaaggtgtcgtcaaaagtgcagtctcatatgctttgaacaggcagataagcatggatgaccttaccaagcctttggatgaagaaagcattaaggttactatggatgattttgtgaatgcacttcatgaaattacccctgcatttggtgcttccactgatgaccttgaaagatgcaggtctgtgctatgataccccgagcattgctttagcaaaatgtttaatgatcagtttcttcttagggtgtttctgggctcatctttcaaatttatattttttattttcctgtgtcccatgggactatctaattcttatgccgtttgatacggcacaatgcaattcctaattcatagtcattgttggctatgggcatgtcattcttgtgtagtagttgatagggctttttcctttgcattaatacatcttttttattaatgataactcatgtcaatttaatattttgctaaacagatcacttggttatttatcataatttattgttttggatgacctaatgcattatgccctttcattcattaatttcatgtgttctatttactctttactgtttgtctgaatatttggtagaagtttaatgctattttccatacctttgtgcaaaaattacaggctaaggggtatggttgattgtggcaagg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