Os05g0556100
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0556100 |
|---|---|
| Description |
Similar to SDL5A |
| Version |
NM_001062813.1 GI:115465356 GeneID:4339566 |
| Length |
5568 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0556100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:27729674..27735241 |
| Sequence Coding Region |
27729962..27730090,27730227..27730366,27730604..27730832,27731137..27731187,27731317..27731542 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MENLISLVNKLQRACTALGDHGEESALPTLWDSLPAIAVVGGQS SGKSSVLESVVGKDFLPRGSGIVTRRPLVLQLHRIDGDREYAEFMHLPRKRFTDFALV RKEIADETDRETGRSKQISSVPIHLSIYSPNVVNLTLIDLPGLTKVAVEGQPDSIVQD IENMVRSFIEKPNCIILAVSPANQDLATSDAIKISREVDPKGERTFGVLTKIDLMDKG TDAVDILEGRSYRLQQQWIGVVNRSQQDINKNVDMIAARRREREYFSTTPEYKHLAHR MGSEHLAKSLSKHLETVIKSRIPGLQSLITKTIAELETELNRLGKPIATDAGGKLYTI MEICRMFDGIYKEHLDGVRPGGEKIYHVFDNQFPVAIKRLQFDKQLAMENVKKLITEA DGYQPHLIAPEQGYRRLIESCLVSIRGPAEAAVDAVHAILKELVHKAINETHELKQFP TLRVEVGNAAFESLDRMRDESKKNTLKLVDMECSYLTVDFFRKLPQDVEKGGNPSHSI FDRYNDSYLRRIGTTVLAYINMVCSTLRNSIPKSIVYCQVREAKRSLLDHFFTELGAR EIKQLSKLLDEDPAVMERRTNLAKRLELYRSAQAEIDAVAWSK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5152..5280#4876..5015#4410..4638#4055..4105#3700..3925#3036..3106#2751..2870#2471..2665#2184..2248#2014..2104#1668..1729#1519..1569#1159..1260#826..930#673..736#185..313#ggcgcaccaccatacacagcccgaggccgcgcagctctcgaccccgacgcggctcggcagtcggcatcgccaaccctcatctccccccctcctctccaccgacctcgatctcgcccctccccccacgcgcgcgatctcgcccagatctcgctgagccgccgccgccgccgcagcagcagcggccatggagaacctgatctcgctcgtcaacaagctgcagcgggcctgcaccgccctcggcgaccacggcgaggagagcgccctccccaccctctgggactcgctgccggccatcgccgtcgtcggaggccaggttcccgtcgtttcccccctacccgtttttatctcgctcggatctggcccctcgcgcctcagctgcgtcgatctggatctcgcgagttgctggtagggcagaaaggattagtagccgatgcggtctagctacgattggatctacgattgctgtgctcgccgaagactagatttggacgcttacatgaaatcgataggttttgtagcaactgaagctactaaactagttgatggaaccatccagctcgatggaattttgtgcggagttgcgcctgttagaaatggtttaagcttatttctgtaccagaatgggtgtacttcggtaacctgacgtttgaactttcctgatacgtttgatagagttcgggtaaatcctcggtgctggagagcgttgttgggaaggatttcctaccaagaggctcaggtatggcggttccaatagcaagtgcttgtataattcagtgttattgctcctgttttatctgatttggaatttttggatttggtttccaggcattgtcacccgtcgtcccttggtgctgcagcttcataggatcgacggagacagagaatatgcagagttcatgcaccttcccaggaagagattcactgatttcggtactccatctaccttttccttcatttttggtcatatcattctgtgattaaaattgcgagattgcatgtttatggagatcatatattcaaactgaactagattgccaatgttggatgatagtcaaacatatatgattacacctgtaattgttggtggaaacagtctttcaagtgctaaacatatattcaactgcatgatggttaatgatgatagtcgtattcttgcagctcttgtgaggaaggagatagctgatgaaactgacagagaaactggtcgttcaaagcaaatatcatcggtccctattcatttaagcatatattctccaaatggtaagataacaataatataaaatgtcagttcgatgtagttgctttatcacagtcaaattggttcattttgattattgtttgctgagatggatatgtggcttaaaagctgttccttttgtctgttgcttacttagtgagatctctgtcattgataagatgaccataccttatttgtctttatatgtgcatgcctgtttatgatttatctggtttctagtatctatttttgttagcgtcttaactcccactcttttgcagttgtgaacctgactcttatcgatcttcctgggcttactaaagttgctgttggtcagtattacccattgtcatttgtgagctattttcttttgtttgttctttttaaagaggtccatttcctgatttaccacttgctatatgctttccagagggtcagcctgacagtattgttcaggacattgaaaacatggttcgctcgttcatagaaaaggtatattttttgctgtaaccttttaatatttgtccactgccattgctgactatgcttgccttatttcggtaccatagctttgtatgcacatatacagtaatttattctatgcatatttgtttcgacattcttatgatttcagccatgtgttagcatatttggaatatgttttttgtatcatgcattatgcttgtagtgtgtgagctatgcttatcttgtcatgtatcatgtctgtaatgttgcaaaagcttatatgtatatcgaccctttttggtttgtttcagcccaattgtatcattctggctgtttctccagccaatcaggatcttgcaacttctgatgcaattaagatttcacgggaagttgaccccaaaggtatgcctttgttgtaagccatttggataaaggatggcaatcatgttttttgagatgtggtttgtcttgtaatgttcaggtgaaaggacgtttggtgtgcttacaaaaattgatctaatggacaagggcaccgatgctgttgatgtaagttttttcccagctaaaattaattgctaaaaactttattatcgatacattttgtccccggagatgtcaacatggattattgttcccttgcttttgggaccttttaaatctcctatgttgaatattcttctgttctatctgttggaagatatacagttgtagaaaatgaaggttatgtttgttctttgagctgtattttcttacggttcttttctgcagatattggaaggcagatcataccggctccaacaacaatggattggtgtcgtcaatcgatctcagcaggatatcaacaagaatgtggacatgattgctgctaggcgcagagagcgtgaatatttttcaactacgccagaatacaagcaccttgctcataggatgggatcagaacatttagcaaagagtctctcgaaggtatgcctttcatttcgtttctaatgtagaatacctgtaactctgtttggtatattgactcttaaatgttttggtgtatatgtagcatttggagactgttattaagtcaagaatcccagggctccaatctctcattacaaagacaattgccgaactggagacagaacttaatcgacttgggaagcccattgctacagatgctggagtaagattagggcttttttattctttaattagatactggtttattgagcctaattctgcatcccctttttatgctaattgctaatgtagtgcccattttttttgtgtatgttcttgatcattgtgctaatggacataattggtttgtacatatttggccatgcagggaaagctgtacacgatcatggaaatatgccgcatgtttgatggtatctacaaagaacatctggatggagtgtatgtttcaaacttaatgtttctgttgctaaatgttctcttagaagttttattgtagctacgtgtgtgcttcctgaattccgagataaaataacattttatcctaaaataacattttcccctctctgatctgtataagccttctaaaatttgtgtggccctaatttgataagctctcctttggtgttagtcttgtgtgtttactccaacgtaagcatacagcctattttaggttcttggcaaagtaacctgttaatttgtcttgtatttttaaacaataaatttctatcaaatgtaataaagatttcaataagcttgcttgggcgtacatgcacctagaatctccagttgtttttctttcagaagaaagggatcgtcgaatttaaccctaaaacctaattacatgatagcacttacaaagttattgctaataaagatttgcatattttcttgctgctgaagtatgcaatttaacacaatttaacttgtagattgttatatgcaattagcatcattctcccttgtgtgcttgttcttttgtgaattgaatgttgctttccctgatgcttacccacaaaaattctaatgtccaggcgtcctggtggtgagaaaatctatcatgtctttgacaatcagtttcctgtagccattaaacggttgcagtttgacaaacaactggcaatggaaaatgtgaaaaagctcataacggaggctgatggataccaacctcatttaatagctccagagcaaggatatcgacggctcatagagtcttgtcttgttagtatcagaggtcctgctgaggcagctgtggatgcggtatgctatctattaatttgatctattttttagtcttaacaaaatagcttgagcgtttctaacttttcgtgtcatatattgttgaagaatgtgcactacaacattatcgtatgtttgttgtactgacaggtccatgcgatactcaaggaattagtgcacaaggccatcaatgaaacacatgtaagtcttcgcactgttgcacaatgttttctgtaacttatactggggaatatgtgcattctgatggtacatgaggtatactgattgtactaggagtttaggaggtaatcaattaatactgttgaaatttttgccttctgttgtttcaatattttgtctttctaataaaatctgaacctggaacttttttgctcgacttaagatgagaagcagcatgataattaatttgcatgcttgtcaaattgtcattactccacttgtaattgtgtaagcgtcctaaaagatgtgagtgagttctctgcaggagctgaagcagttccccactcttcgtgtggaagtaggcaatgcggcttttgagtcattggacagaatgagggatgaaagcaagaaaaacacattaaagcttgttgatatggaatgcagctacttaaccgtagatttcttcaggaaacttccccaggatgttgagaagggtggaaatccaagccactctatttttgatagatataatgattcttatcttagacgaattggtaagtcatcaaccattcttccttgtatatattcaatgtatactgttactgctttgcaatgatggccatttgttgaagttgagaagtggtttatcatattgttgcaaccttgtgtaatattgcccactaatttagtttaatgatgaatatacatgccatcaaggctttgcttggctgccttttaacttattttacctgtattttctgctgaaccttgctacaattcatactcaacaggaacaacggttctggcatatattaacatggtatgttcaaccttgaggaactctattccgaaatctattgtctactgtcaagtgcgggaggcaaagcgctcactgctcgatcacttctttactgaattgggagcaagagaggtgagttcttctttcttaaagcttaataaagcataacataagtttttgggccctgttttacattttttttggtgtgccttttaaagtccaacagaattgatctaactagtaatactgccttttaaatgttatgcagattaaacaactttctaagcttcttgatgaagaccccgccgtcatggaacggaggactaatcttgcgaagaggctggagctatatcggagtgctcaagcagaaattgatgcggttgcatggtccaaatagtcctgatcatctacttatcatactcatgtttctcctttactcccagttggtgatcctcccctatcttggggcatatatagctgattttaccccgttctaggtcattcatagatcaacgcagctgtgaggtgtcatttggtttgtgcttttgttccttgtgcttgaggatctaggagacaccaggctgctgtactttttgtattacgaccaagttcatatatcgtgtttaatttttgtcacagcccattctttcgttccgtttacatatatcgtcttcaatttgttact</dnaseqindica> |
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