Os05g0558900
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0558900 |
|---|---|
| Description |
Similar to Frsb-prov protein |
| Version |
NM_001062832.1 GI:115465394 GeneID:4339585 |
| Length |
6480 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0558900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:27882529..27889008 |
| Sequence Coding Region |
27882616..27882673,27882775..27882830,27882930..27883039,27884055..27884184,27884367..27884482 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:27882529..27889008 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgccgacggtgagcgtcggccgggaccgcttcttcgtcgccctcggaaggacatacacgcaggaggagttcgaggtgctctgcttcgagttcggcatcgagctcgatgacgtgaccacggagaaggccatcatccggaaggagaagcacctggaggatgatgacggcgaggtggatggtgatgacgacgaggtcatctacaagatcgaggtcgccgccaataggtatgatttgttatgtcttgaaggattggcaagggccctccgcattttcactgggactgaagcgacccctatgtacaaaatttcttgcatccctcgcgattcaatgcttctgatgcatgttaaacctcagacttcacaaataaggccctatgtggtctgtgctgtccttagaggggtaactttcgatgaagcaagatataacagcttcatcgatcttcaagacaaactccatcaaaatatttgcaggaagagaactctggtggccataggtacccacgatcttgacactctgaaaggacccttttcatatgaggctctaccaccacaagagatcaactttgtcccattaaagcaggaggaaagcttcagggctgataaactgatggaattctataaatcagacatgaagttgaagaagttcctgcatataattgagaattcgccagtatacccagttatttatgatagcaacaggaccgtattgtctttaccaccaatcatcaatggtgcacattctgctatcactctgaagacaaggaatgtgtttattgagtgtaccgctactgaccttacaaaagcaaagattgttctcaatacaatggtcacaatgttctctgagtactgcgaaaacaagtttgaagtggaaccagttgaagttgtgtcacatgatggaagcaaaaccatttaccctgacctttcatgctataaaatggaggtctcactatctgaggttgttggacccattggcatctccctagatgagacaaaggttatttcccttctgaacaaaatgcagttgcaagctgaaagttgtccatcaaaaggggaaccacgtatttcagtttctgtccctccaacaagaagtgacattctgcatgctcgtgatttggtggaggatgttgctatagcttatggttacaacaatgtgccaaaatcaaagccaaagtgtatgacaataggaggaaggcaaccattaaaccgtttctctgataaacttcgtgctgaggttgcaagagctggttatatggaggtgctcacatttaccttgtgttcacgtgaagaaaactttgacatgttaaataggacacaggatgtaaataaagcagttattattgcgaatccacgcacttctgaatttgaggtggttcgaaccagtctgatgtcatgtttattgaaaactttgaagcataacatagaccatccaagacccataaagatatttgaagttggtgatgtagtgacattggatgggtcacgtgatgttggtgcttctaataatcgtcgactcgcagctttgtactgtaataagcagtctgggtttgaggaaattatgggtttggtagatagaatcgtgaatgttgtgagagctccccacatcaaatttggccagaattactatgttcctacaaatgaacctgaattctttccgaaaagacaatgcaaaattgttatgagtgatggaaagcagattggctacttaggaattgtgcatgccgaggtcctaaggaaattcggcattccagacccctgcactttcgttgagattgacgttgaggctttgttatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPTVSVGRDRFFVALGRTYTQEEFEVLCFEFGIELDDVTTEKAI IRKEKHLEDDDGEVDGDDDEVIYKIEVAANRYDLLCLEGLARALRIFTGTEATPMYKI SCIPRDSMLLMHVKPQTSQIRPYVVCAVLRGVTFDEARYNSFIDLQDKLHQNICRKRT LVAIGTHDLDTLKGPFSYEALPPQEINFVPLKQEESFRADKLMEFYKSDMKLKKFLHI IENSPVYPVIYDSNRTVLSLPPIINGAHSAITLKTRNVFIECTATDLTKAKIVLNTMV TMFSEYCENKFEVEPVEVVSHDGSKTIYPDLSCYKMEVSLSEVVGPIGISLDETKVIS LLNKMQLQAESCPSKGEPRISVSVPPTRSDILHARDLVEDVAIAYGYNNVPKSKPKCM TIGGRQPLNRFSDKLRAEVARAGYMEVLTFTLCSREENFDMLNRTQDVNKAVIIANPR TSEFEVVRTSLMSCLLKTLKHNIDHPRPIKIFEVGDVVTLDGSRDVGASNNRRLAALY CNKQSGFEEIMGLVDRIVNVVRAPHIKFGQNYYVPTNEPEFFPKRQCKIVMSDGKQIG YLGIVHAEVLRKFGIPDPCTFVEIDVEALL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>88..145#247..302#402..511#1527..1656#1839..1954#2049..2115#2347..2388#2531..2572#2734..2810#3108..3234#3331..3498#3737..3862#3953..4063#4154..4288#4918..4992#5205..5312#5393..5479#5565..5651#6140..6208#acctcagtcagacatcgtcctctccatcgccgctaaggtcttcgccgccgccaccgccgccgagaggggaggccgccgacttcagcgatgccgacggtgagcgtcggccgggaccgcttcttcgtcgccctcggaaggacatacagtaagcgaccctctgctcttgcgccgcccccccaccccactaaacccccatcacgcgagaaaccctatctgacctcggtgttcttttgctggttgctgcagcgcaggaggagttcgaggtgctctgcttcgagttcggcatcgagctcgatgacgtggtgcgctagcgctcggatctggctgagacttcggccttcgtgcttttcgtgctttggtttcgagttgtgtctgatttgggttgttgtgtgctcgtgtagaccacggagaaggccatcatccggaaggagaagcacctggaggatgatgacggcgaggtggatggtgatgacgacgaggtcatctacaagatcgaggtcgccgccaataggtgagggaatcttggtgtagagataagcccatgccacagcagtgcagctctaattatctgaaacgaaccttgtttttttccctgttgatgattaattaggcttcgaattgaactggtatagtccctactgaagatctgcagtgagttcttcacgttttgtggcgtgggtgtgacatgatgattgactcctacttttgagtttttgatagagttataggttggttactgtgaattgttgttcccttggttgttataatgcttgtatctgctggttgatgctcgacagttgtttcaatgatagggaatttgttgttatttcaatccagaatttgtggcaattacaccagaagtcagaattctgtaataatgtgggactgtgtggagatcagcctcataacagataatgctgaatttctggttcctgattctgttcagcatctagctaataactgccctgcctaggtgttctctactttgattgattcagttgatatgctttttgcttcatggattcaatcttctgcattttataaactctggttgctggtaggagtttctctacttagattgattctgttgatatgctttttgcttcatggatgcaaatcttctgcatttggtaaactcttgttgttggtaggctgcttgttctctttttatctagttcatttcttcagtcaattaagagttatagtttgtaatattttttatgttttggataaaacaatgaaccattttttattctgctccatgctactattttctgtaatttttgtggctgaggcatgtagtataataacagagtttactttcttaggatccgcataagctgatatgactttatgcctttgcttgacatttcaatttggtgtatggatgggaatttgttttattcaataaccattgcctcattggttttctgtatatgcacttgaagggtcttgtttagcttctgggaaggacactttgacatctctaaacattacatgttaatgttcattgcaaatgcatgcaggtatgatttgttatgtcttgaaggattggcaagggccctccgcattttcactgggactgaagcgacccctatgtacaaaatttcttgcatccctcgcgattcaatgcttctgatgcatgttaaacctcaggtaacaaattgataggctattcccagtttttcatgttttaccttatatacctcttttttgtgcttcaagtcagtgattatggctatccattttgtttatgttgtgacatatttcaactttcaaataatattcttcaaaagatgtgaacagttgtcaaagttagaatttgctttatttggcagacttcacaaataaggccctatgtggtctgtgctgtccttagaggggtaactttcgatgaagcaagatataacagcttcatcgatcttcaagacaaactccatcaaaatatttgcaggtatagcctgtctaactgcccactgttaattttgctgtattgacttcactatcaccaagatattaactctgagcacttttatgatggaaaaaaggaagagaactctggtggccataggtacccacgatcttgacactctgaaaggacccttttcatatgaggtaaatgcaatgatgtattaaggcttgtttggttggatggtgactttacttttcttcacttattgaggcttccatttatagcccccaagaaagctcccatgcagtttcctttttttttttaccacaaaaatctatttgatctatgttctgttacctgattttctgacaatgtgaatgcccagagtgagttatctcattcttgttaactaacatgttgaccatgttgcccaggctctaccaccacaagagatcaactttgtcccattaaagcaggtaaaataatttaccaaatttaaccaagccatatactgtgccgatcttgcagattatttacagagcaatataacagtcttgttttatttgctgaggatttatactaatgttttatttgtgttctctttattgtatgtttcaggaggaaagcttcagggctgataaactgatggaattctataaagtaagcagccatatcgttttttagtgcccatgtagcaataactagtgccagacaagttttgaagtttataattaattacaggcactgaattttgattctatgataagtgttctatgtacatatttatttggttgctaatgttctatgctttctttgtgcagtcagacatgaagttgaagaagttcctgcatataattgagaattcgccagtatacccagttatttatgatagcaacaggtgaacttattgcatgctctgattatttgcacaccttgtttttttttccttaaatcctttatgatcttaatcagttagagaggacctagtgatcagtgtgtaaccattagctctttttgttacatttctcaaattctcaatgttacaacaaaaatcaactagaaaggacccattgccaatatctaatggtgatgcttccaccaggatatcagtattaaaaatatttatttgttaatgaaatggcctattttcagtcagcaatgcgatcatttctgtgtaaacttcaataattttcaggaccgtattgtctttaccaccaatcatcaatggtgcacattctgctatcactctgaagacaaggaatgtgtttattgagtgtaccgctactgaccttacaaaagcaaagattgttctcaatacaatggtaggtgcaatgtaactctctcccctaggtagaaattatctccttctggatgaagatcaaactgttgcatttatggtctggtttttatctgtataggtcacaatgttctctgagtactgcgaaaacaagtttgaagtggaaccagttgaagttgtgtcacatgatggaagcaaaaccatttaccctgacctttcatgctataaaatggaggtctcactatctgaggttgttggacccattggcatctccctagatgagacaaaggtattttccagacctcatctctatggtagttattgaataataactgagaaattgacatttaccttatcgtatttgaattgacaatgtactaactgccacattttttaatcgttctgtctgtagtttgagctaagttaaatggtattcactttggttaccgcttttgcttggatactctgaaattagatttgcatgcttgtgcaagtgaaatgacacagttgtgtgtgcaaaaatgcaggttatttcccttctgaacaaaatgcagttgcaagctgaaagttgtccatcaaaaggggaaccacgtatttcagtttctgtccctccaacaagaagtgacattctgcatgctcgtgatttggtggaggtaatacataattctctaccatagccttttccatagttgctaatcattgtttggataattttgtactcagttttcacttttgctgtgaaggatgttgctatagcttatggttacaacaatgtgccaaaatcaaagccaaagtgtatgacaataggaggaaggcaaccattaaaccgtttctctgataaacttcgtgctgaggtacttgagtctcttgtgatgtacctctggtttggcatatatcttttcaccaactgatatttctttgataaatgaaatatgtggggccaggttgcaagagctggttatatggaggtgctcacatttaccttgtgttcacgtgaagaaaactttgacatgttaaataggacacaggatgtaaataaagcagttattattgcgaatccacgcacttctgaatttgaggtaacaagaatttgttctagtcttctagatgttcaatgctcttccgctatgatttgttggatattgaattcaacttgcaatttattatgttcttggtttcatattttttctaagaggagtgtaaatgtaaatttatcatggtctaaatgttccattggtaaatatcctcgccagttcctttgttcctacattagaaatttttactttttcatacaagccaagttgtgaattgataccctggccaagctgttaacagatgaatctacatgacatttcaaatattcttttgtggttaacataaacaaatttcagatgttactacctccttgcacaaatgtatgacgttggttagttcaattttgagctaaccaacgtcaaacaaaaaaaatatggagggggtacaacttatctcttcacgttttcatttttttgtgtgcattttctgcacttaagtgtggccttttgtactttattgcccttctctatagagaaaagg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