Os05g0305100
| Gene Name |
Os05g0305100 |
|---|---|
| Description |
Similar to Transcription factor IIIB 90 kDa subunit (TFIIIB90) (hTFIIIB90) (B- related factor 1) (BRF-1) (hBRF) (TATA box-binding protein-associated factor, RNA polymerase III, subunit 2) (TAF3B2). Splice isoform 2 |
| Version |
NM_001061682.1 GI:115463094 GeneID:4338362 |
| Length |
9508 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0305100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:13750214..13759721 |
| Sequence Coding Region |
13750744..13750805,13750970..13751051,13751133..13751208,13751284..13751369,13751562..13751638 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MYCSHCQDNCPVVKDPDKNYTCCGLCGKVLDDQVYDGEPTFQKG ADGQARLAGSILSSIESGNSVSHERTINKGREEIRQIVSSLHVAGGDTIISMAHRYYT LAVDKNFTRGRRTTHVAAACLYIACRQSKKAYLLIDFSDHLQISVYVLGAVFLQLCQV LLLAEHPVIQKLIDPSLFIHRFTERLLGKRDNAVSDTALRIVASMKRDWMQTGRKPSG LCGAALYIAALSHGYDYTKADIVAVVHVCEATLTKRLIEFENTDSGSLTIEEFLAKAD EQVLVTKISPKSGEVLCKHKDKAEHFAHGLCEKCYNKFMKLSGGLEGGSDPPAFQRAE KQRLEAAKNAKGTAASKEAALESVCEARESDVENNITTPPKNIIGDKHSTIPSVKVAG DSVATEDPEGEGKNDKADEGPESLSDIDDAEVDGYLHNEEETQYKKIIWEEMNKEYLE EQAAKAALAAELAARGVVVEEGKRKRRRHNEDGKNATPAQTPAEATQNMLKRKRLGSK INDEAVNKLYNTKDEDGKADKEMDFNDEYGQDTGDGETFEGGYDYPDYNYDGYGDGAY GDYDGVDF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>531..592#757..838#920..995#1071..1156#1349..1425#2193..2249#2321..2433#3236..3310#3381..3472#3658..3738#4803..4940#5017..5202#6709..6793#6905..6963#7094..7174#7256..7330#7416..7499#8613..8660#9072..9239#aaagccgccgagccgcgcggccgagtgcaaaaaggaaaaatatcggtccccgcgagctagggtttaccacccccccctcgtccacctctctctctctccgggtgcccacgccggcggcgagctctcctcaactgcgccgccgagagcccccccgccccccctgttcgtgggggaagtacaggttcgcagtgccaccctctgtgtctactagtgaagtttcagttttggactatgattttgttattatgctccattatgttgggagattgggattggggaattgaaacagtcacgtgaatccaattaggcaactaaaaaaacaaaaacaaagagagtacaaaatagggaaaggcgaaaaattgagaggcaccgcactggggatgtttgattgcttataattcaatggctgatctgtaaatgttagccatttcggcttggaaatgagtggaaaaagctaattaatcggaattttttcgcaggctgatcttagttgggggggtatactctgcggtctacttgctactccagcaatgtattgttctcactgtcaagataactgccccgtcgtaaaggaccctgacaaaaactacacgtgaggcctcccttcctgtcttttttctccttccatttcgatgcaaaatcagctagtacaaattgtttataagcatggccttgttggtcactcttaaatttctgtgtaccagctctaacacttttgtgcgcgtgtcattatgtaatttttcatatggtgatcagatgttgtggtttgtgtgggaaggttcttgatgatcaggtttacgatggtgagccaactttccaaaagggcgccgacgggcaggttgatctttcactttgcttctaatttggtttggtttatttatttttcacttctcatgttggttgttttggagctttacaggcccggttggctggtagtattctatcaagcattgagagtggtaattcagtatcccatgaaagaactataaataaaggtacgactttgaggtcattcctctatctcattttgctgccactttgtgggctaatttcatgctttgtttttccaggaagagaggagattaggcagattgtcagcagcttacatgtggctggtggagatactattattagcatggctcatcgctattatacagtatgtatctttgttactactacctccgtcccaaaatataacaacttttagctttgaatctggacacacagttgtccagattcatagctaaaaatgcttatattttgggacggagggagtagtcagtagcttataatttctaaaataatatggtacatggtgatgctgatgtttattcttgttgaagtttagctagctgttgacaagaattttacaaggggccgtcgaacaactcatgttgctgctgcttgcctttatattgcctgccggtatgctaccacctaattactttgttgatttattgaaagtcttctcactcattgtacttgttttttttctcaagcagtacctttcaatagaattatttcttgagcatgattcttttctttgtcattgaacttataaaatgcctaaactataacacagctaagctattccagactatagagcatgcatggtgaacatttgtgatgggtttgtttaatacatatatattttaccaagcacacaatctgaacattgccatgcatggccctcaaatatatcttccatgtggaaaggaatgctgtgtcctaaattttcaagcgcagagtacttaatggcctggttatgctatatctcatttttccctttaggagaacataatactccctgtaattgcaaaacaaatcctaggatttgacaccggccaaactttttaacccttgatcaatggtcatattggaaaaaataacttccatttctctagagaacatataacatccatgattgtctttatccatagaaatacatgagcatgtaggtggttatagaaactagcagtcaatgtggctcattgtagattatgtccatgtcccagatggtgtgctatatttgcaatcataggtcgtacacagtattttcattagttattgctgttcttaagttgtccagcattattttttttcctattagttcccttggatatctgttgtcaagtttcaaacttttgttgatattcattcctgacattcattatacctaatttgtgtgctaggcaaagtaaaaaggcatatcttcttattgatttctcggaccatttgcagataagtgtgtaagtgccccattctcctgcccttatcttgtagcccttagtgacatggctcatctggatttttctttcagttatgtcctaggtgctgtttttctgcagctttgccaagttttgctacttgcggaacatccagttatccaaaagctcatcgaccccagccttttcatacatcgttttacagaacgtaagccacactaaattgtattatttaaatttagcggctgaaaacacatgtgccatttcttgtgtacatctctacatttccatgcactttgaatatgcacatttggtttcttcaatgtggggagggggattgttcatgtcatgcaattataagaggctgggccaggctgttccaatgttggtacctgccacatttgccatggagaacatgttggagtgcaattctgtttggaaattgcaattacaacatgaattctgattcttaaatcataggcgctgtttgattgatttgcagaattggatcgaaattgtggtattcgagtcctgaatcaaattttactcgaaacagtcataggctcttgcatttacaccccagtgagaagtggactgatggatggaccatttgataattcttgcacaaagatttatgtagcttttgactaatttcttcaccttaatttatctaatctattcaacgtgcttttacattcttgtgaaaaaatatataacaattatttaaaatcacatatgatatttattttgaactatttgatagatttgtatatggtagagtcatgtgtagtagtcagactggggcatactatagtcaaactatctcctcgcttgtgttgctcatgtgaaggagttcaattgcaatgcaagctccatccttttatcccccccttttctgagatctttgcaaggcaatgccagaaggcaattgcttgggttagtaaggaaaccaaacatgtttagtctgattatttttgttttttgtgtcactttgttggttttatctgtaggtttactggggaagagggacaatgccgtatcagatacggctttacgcattgtagctagcatgaagcgagactggatgcaggctagcatatttttctccttccttctttaggttcttttttgtgattgtaataacttgacttatgttgcagactgggaggaaaccaagtggattgtgtggtgcagcactatatatcgctgctctctctcatggatatgattataccaaggcagatattgtaagcccaagtacttttgtctgatatacttatttagaattgtattctgaagtcttatgccctccttctgtatcagttagcatgtatcgggcacatgctacattttgtattttttataattggacatgaatatgattctatgctacagcatataatgacataaatttctgttttatgttttttaggttgctgttgtgcatgtttgcgaggcaacactaactaagcgcttgatagagtttgaaaatacagattcgggtagcttaacggtatggattctctctccaggaaattgccaaattcataggcgctgttacttaccgcatacagatgaaaatttgttgcaacgatgtatttgtaataaagatgggaatgacagcgctaagttgattgttggtacaacttttccctctgaaagtcattcttaagctgtctatgctgaaacatattgtaattactatcagtgtatggtgtctgttatggtgcaagtatttgacattactcatgacactaaagcaactattgacctaagcaagtactgattagggcagggcagcccatgtcaactagacatgcattcactttctttaccctgtccatagagctagttttaggtgcttatttttacccgttggttcagcatggtctatctggcaaaaaaattgggtattgccccctttcatgtctgttttttcatgtcatcaattcatcatccacaactgttatctactactccctccgtcccagaatataagaagttttagggttgaacacggttattaagaaagtaggtagaagtgagtggtggagggttgtgattggatgagtagtgaaggtaggtgggaaaagtgaatggtggagggttgtgattggttgggaagagaatgttggtggagaagttgtcatattttgggacggagggagtatatgaatattctttaagcaaatgaaatagtattatgctagattgtaaacgaaaatggtccttgaggtgtaaatgtgtcattgtgaagcccattaggggtccatgcaatgggcgaaggatgctgcctctgcccactactgcctaagcactgttcatggtgccttgtgctagttttatttagtttaaaaataagatgagattgaattatttatcggtttgtttccttagttttagagcaaagggcaaagggtttttgcctctatcatgcacagtacatcaggattaggattagaggtgtcttcatttcatacttaagtgattggacacatttccagctcgcattcaacgtattgtatccatgccaatttgcatttgattaaacattatat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