Os05g0571000

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os05g0571000

Description

Protein kinase-like domain containing protein

Version

NM_001062905.1 GI:115465540 GeneID:4339663

Length

7708 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os05g0571000, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:28526804..28534511

Sequence Coding Region

28527302..28527493,28527915..28527974,28528056..28528373,28528992..28529138,28530070..28530922
,28531471..28531628,28532297..28534003

Expression

GEO Profiles:Os05g0571000

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008398:28526804..28534511 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggcggggacgcatggttttcgtagggtaggcgtggtcgagatggaagcggcgacggcggctgaggtggccggtgccggcagcggcacggatggcgatttgcagattaaaggcagcaaggagaatggtcagactgcggagcagccggcggccagcgaggcgcttgagatgccctccactccgctcccgctcccgagggacatagattggtcggagcatttctccttcttcaattcggtgggcgggtttgggggcagcatggatggcgcgaggggcttgactagtgttggcctatctaattctgagtcgaggccggatagtgtaacccagatccagagctgtttgaacaatgcagacgagagggttgaggagctcacattgaaaaattgcatcagctccgatgcgcaacatgaggtttcagctggtggaagcacgagcagcggggagaagcctacagttatgaggggtctgtggggtaattttacaaggatgtcatggagagctagcgacgtggctaacagggaaaaattagcagcgaatcgtggtgacgttgcaaacttgagggtcggtgacatgcccatcagggaaaatttggcggtgagcttcggcaacaatatgatctcacgaaatgatgcatccaacaaggaaatgggaatgagccatggggatcatgcgaataacgagttcaatttgccgtttggtaatcagcagccttttctgtctccacggcctaatcagaatgagcagcgagttgaaagggagaatgctctcatagtgagtagcttttcagctagaattctggatcagatgaggagtaagaatgtaacaccttcgtctggggttcagagcttcccatttaagagtgtgttgaagggtaaaggtgttgtatatcaaggtgcacgagaggagatccaagttcaaggtaatgcaaggaccagagcccctatggataagattcgcaagatccctaacataccacaggattccatggctagaatggatggtacaatctttggcagtggtggaaatgttttagaaccacagtgcgagggaaccagcctaagggaactaattaagcctgcacgccaaacaatgagcaagtttgagaaaatgcacttctttaagcagattcttgatctcgtagacaaatctcatgcccagggttttagtttacagcatttgcgcccatcatactttactatctcagcctcaaaccaagtaaaatatattggttcttatggtacccaagatttatcagccccaagcaaactggatattgcgacggatgatattttcaatacaaaaagataccttgatcccaaagttgagtcccaagattctaatggcgataatgcttcaatcacaaagtatcaaaaagttggtgaacaaggatccattgctgtaaggcgaccagtgcataccttttgggctaatcacagagggggcaaccaaagtgaaggtgttgatcctggtgctttgtggcagggcaattcgagctgcactgtccgagaacgttttaaggctgcagaacctttctatggtggcagtatgccctatgctcaacgaccatcaagttctggcaaccaacagtcagtatttgaattgaggatgctggaggaaagctggtacagaagtccagaagagatcagtcagttgaaaggcatacttccatcaaacatctacagccttggggttcttttgtttgagctcttttgctgctgtgaaacatgggaggtacattgtgctgcaatgtcagatctccgtcatcgcattttgcccccaaattttctttcagaaagtcctaaagaagctggtttctgtctttggttactccatccagatccctgttctcggcctaaggcaagagatattctagggtgtgacttgataaatgagggtcgagatttgtccttgttagataataaaacaccagttgctgtcaatgaagaagacaccgaatctggtttgctactgggcttcctttctcaactcaaggaagaaaaggagatgcacgctgccaaattgtcagctgatcttgcgagcttggaaacagatatcgcagaggttgagaaaagacactcaatgaggatgggatttagtttagaggacatggatgtactggcaggttctaatgatctctcaggagcttctgcatgtgccctgggaggtgcatcactctcaggtttgccaccatctttgtgcagatcgagcatatatgaggagcgggtcatgagaaacttggagcagcttgaaaatgcatattactccatgaggtccaccattgacacatcggaggccaatataattaaacgagttgataatgatgctttaagggttcgtcaaaattttcacgagctgcatagtgatgctaatgctatcgatgagcaagcagacccccttggatggtttttcgatggcttatgcaagtatgcccggtatagtaggtttgaagtacggggaattctgaagaatgcagatatacttaactcaccaaatgtgatttgttcgttaagttttgatcgggatgaagaatattttgctgctgctggtgtttcaaagaaaattaaaatatttgaatttgatgcccttttaaatgatcgtgttgatattcattacccattgatagagatgcctagcaaatccaagcttagctgtgtctgttggaacagctacataaaaaattacttggcatcaacagactacgatggcactgttcagttgtgggatgcaagctcgggtcaaggattcacgcagtttacggagcaccgaaaaagagcttggtctgtaagtttctcagaggtggatccaactaaattggcaagtggaagtgatgattgctgcgtgaaagtttggagtattaaccagaaaaattgcactgataccatcagaaacgtggccaacgtgtgctgtgtacagttctccccatactcctctcgtatgttagcttttggctcggctgattataagatatactgttatgatctgaggaatacaagaatcccatggtgtactatttctgggcatggaaaagctgtcagctatgtacgattcttggatccagaaacacttatctctgcatcaactgataacaccttgaaaatatgggatctcaaccagactaattccagtggattatctactgatgcctgcagtatgacgttgagtggccataccaatgagaagaattttgtggggttatctgttcacgatggatacataacttgtggttctgaaaataatgaagtattttcttattacaaaacctttcccatgccaataacttctcacaagttcggttcaatcgacccaataactggacaagagacaaatgatgataaccaacaatttgtgtccagtgtttgctggcgagggaggtcgaacatggtagtggctgccaattctactggcagcattaaagtgcttgagcttgtgtga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAGTHGFRRVGVVEMEAATAAEVAGAGSGTDGDLQIKGSKENGQ TAEQPAASEALEMPSTPLPLPRDIDWSEHFSFFNSVGGFGGSMDGARGLTSVGLSNSE SRPDSVTQIQSCLNNADERVEELTLKNCISSDAQHEVSAGGSTSSGEKPTVMRGLWGN FTRMSWRASDVANREKLAANRGDVANLRVGDMPIRENLAVSFGNNMISRNDASNKEMG MSHGDHANNEFNLPFGNQQPFLSPRPNQNEQRVERENALIVSSFSARILDQMRSKNVT PSSGVQSFPFKSVLKGKGVVYQGAREEIQVQGNARTRAPMDKIRKIPNIPQDSMARMD GTIFGSGGNVLEPQCEGTSLRELIKPARQTMSKFEKMHFFKQILDLVDKSHAQGFSLQ HLRPSYFTISASNQVKYIGSYGTQDLSAPSKLDIATDDIFNTKRYLDPKVESQDSNGD NASITKYQKVGEQGSIAVRRPVHTFWANHRGGNQSEGVDPGALWQGNSSCTVRERFKA AEPFYGGSMPYAQRPSSSGNQQSVFELRMLEESWYRSPEEISQLKGILPSNIYSLGVL LFELFCCCETWEVHCAAMSDLRHRILPPNFLSESPKEAGFCLWLLHPDPCSRPKARDI LGCDLINEGRDLSLLDNKTPVAVNEEDTESGLLLGFLSQLKEEKEMHAAKLSADLASL ETDIAEVEKRHSMRMGFSLEDMDVLAGSNDLSGASACALGGASLSGLPPSLCRSSIYE ERVMRNLEQLENAYYSMRSTIDTSEANIIKRVDNDALRVRQNFHELHSDANAIDEQAD PLGWFFDGLCKYARYSRFEVRGILKNADILNSPNVICSLSFDRDEEYFAAAGVSKKIK IFEFDALLNDRVDIHYPLIEMPSKSKLSCVCWNSYIKNYLASTDYDGTVQLWDASSGQ GFTQFTEHRKRAWSVSFSEVDPTKLASGSDDCCVKVWSINQKNCTDTIRNVANVCCVQ FSPYSSRMLAFGSADYKIYCYDLRNTRIPWCTISGHGKAVSYVRFLDPETLISASTDN TLKIWDLNQTNSSGLSTDACSMTLSGHTNEKNFVGLSVHDGYITCGSENNEVFSYYKT FPMPITSHKFGSIDPITGQETNDDNQQFVSSVCWRGRSNMVVAANSTGSIKVLELV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>7019..7210#6538..6597#6139..6456#5374..5520#3590..4442#2884..3041#509..2215#tttaatcctctcccccttcttcctcgtccctctgctgctgccgctgctgcttctcccccttccttctgtgccacacactcgcgaggagaggagagaagaggaggaggcgaagaaaaaaaaaacctaagcgcttttccctttcgggaaattccgcgcgctcgcctcccccgccgcggcgccaccgccgccgcccccgccgcggattcgccgccttcctcaggcggcgcagcgtgccgcgcaggcgtcgtcgtctcggtaacgtgtggctctaattcgtttttttttttgggtaggaatgtcgctgttaggggtcgacgagttctaatccgtggtctaaccctacaggtaatcgcgcgaggggtcgtggtcgctctgggatggggttgtggcgctgagatggtggtgggcggcgcgaggttgtgttcgccgtgaggtatggttcccaaccgctgaaatttgggggggcgcggaggatggtccggcgaggggtgatctcattgcgagcaggatggcggggacgcatggttttcgtagggtaggcgtggtcgagatggaagcggcgacggcggctgaggtggccggtgccggcagcggcacggatggcgatttgcagattaaaggcagcaaggagaatggtcagactgcggagcagccggcggccagcgaggcgcttgagatgccctccactccgctcccgctcccgagggacatagattggtcggagcatttctccttcttcaattcggtgggcgggtttgggggcagcatggatggcgcgaggggcttgactagtgttggcctatctaattctgagtcgaggccggatagtgtaacccagatccagagctgtttgaacaatgcagacgagagggttgaggagctcacattgaaaaattgcatcagctccgatgcgcaacatgaggtttcagctggtggaagcacgagcagcggggagaagcctacagttatgaggggtctgtggggtaattttacaaggatgtcatggagagctagcgacgtggctaacagggaaaaattagcagcgaatcgtggtgacgttgcaaacttgagggtcggtgacatgcccatcagggaaaatttggcggtgagcttcggcaacaatatgatctcacgaaatgatgcatccaacaaggaaatgggaatgagccatggggatcatgcgaataacgagttcaatttgccgtttggtaatcagcagccttttctgtctccacggcctaatcagaatgagcagcgagttgaaagggagaatgctctcatagtgagtagcttttcagctagaattctggatcagatgaggagtaagaatgtaacaccttcgtctggggttcagagcttcccatttaagagtgtgttgaagggtaaaggtgttgtatatcaaggtgcacgagaggagatccaagttcaaggtaatgcaaggaccagagcccctatggataagattcgcaagatccctaacataccacaggattccatggctagaatggatggtacaatctttggcagtggtggaaatgttttagaaccacagtgcgagggaaccagcctaagggaactaattaagcctgcacgccaaacaatgagcaagtttgagaaaatgcacttctttaagcagattcttgatctcgtagacaaatctcatgcccagggttttagtttacagcatttgcgcccatcatactttactatctcagcctcaaaccaagtaaaatatattggttcttatggtacccaagatttatcagccccaagcaaactggatattgcgacggatgatattttcaatacaaaaagataccttgatcccaaagttgagtcccaagattctaatggcgataatgcttcaatcacaaagtatcaaaaagttggtgaacaaggatccattgctgtaaggcgaccagtgcataccttttgggctaatcacagagggggcaaccaaagtgaaggtgttgatcctggtgctttgtggcagggcaattcgagctgcactgtccgagaacgttttaaggctgcagaacctttctatggtggcagtatgccctatgctcaacgaccatcaagttctggcaaccaacagtcagtatttgaattgaggatgctggaggaaagctggtacagaagtccagaagagatcagtcagttgaaaggcatacttccatcaaacatctacagccttggggttcttttgtttgaggtatgccaattgctttcatcacatatcctgaagtagtcctccaaacactttgtagtgttagaaaagtaaagtgacattgtgcaaatgctatttattttcttaccccatgaggttgtttgtggatgatttttactcttaagccatttgatgaggagttcatgctgtttttatggttccacttatgagtagctgaaaaattgggacatgtatagtgcagagtttcctacttatcctactcaataataagtatatgagtatgctgtctcccttatttgtttagcagcagttggattgctgaaatgatcggttactattatcataattgtatttctacgaatttgagatatacctgattgagatgtgcaattctgactgacacaatgcaacagtcttcttgtttgatgaaataatattgtttgcttatctaagctgcatgggcatattattattcttttttttaacatattcagtaaaatctaatctagccttaactagtacagaaggtctacaggatattccattaatagacttcgcatgtgcacgcacagacaatagattatgatggctactggaaatcacattgaattttatcatttctagtttccgtggaattctttggtgctatcttaagcctggcttgtagttgacaacattctctttcctaccagctcttttgctgctgtgaaacatgggaggtacattgtgctgcaatgtcagatctccgtcatcgcattttgcccccaaattttctttcagaaagtcctaaagaagctggtttctgtctttggttactccatccagatccctgttctcggcctaaggcaaggtgagcatgcttgtctctctcagcggtcatcagaaagcaagatacttggtgattaattggataggatcaaatattcatagggttacattttggcaatttcgtaagttacacttcatactctaggcagttcatttggctggtggagtgaaaggatgagatctcaaggcataattaattaattattagtttgttgtacctggttacttaatgctcctggctcctgtattaacttagcttgcttctattttttttaatatagatacactgctagggctggtattttgttgaatgttgaatgttgagctttattcatagaataatagaggacattgagcatgaacaaaatacgaagttcatggaaaagtgctgatcccggtctaaataatagaaatcctttatttgttcattgcacaaggcaattatacataatcatttcattagcattacttttttttccctacgtggatgatttttattttccatctgcagactttgaataatacttccaaaccaatttatgcctgatggacattttgcttttttgtcagagatattctagggtgtgacttgataaatgagggtcgagatttgtccttgttagataataaaacaccagttgctgtcaatgaagaagacaccgaatctggtttgctactgggcttcctttctcaactcaaggaagaaaaggagatgcacgctgccaaattgtcagctgatcttgcgagcttggaaacagatatcgcagaggttgagaaaagacactcaatgaggatgggatttagtttagaggacatggatgtactggcaggttctaatgatctctcaggagcttctgcatgtgccctgggaggtgcatcactctcaggtttgccaccatctttgtgcagatcgagcatatatgaggagcgggtcatgagaaacttggagcagcttgaaaatgcatattactccatgaggtccaccattgacacatcggaggccaatataattaaacgagttgataatgatgctttaagggttcgtcaaaattttcacgagctgcatagtgatgctaatgctatcgatgagcaagcagacccccttggatggtttttcgatggcttatgcaagtatgcccggtatagtaggtttgaagtacggggaattctgaagaatgcagatatacttaactcaccaaatgtgatttgttcgttaagttttgatcgggatgaagaatattttgctgctgctggtgtttcaaagaaaattaaaatatttgaatttgatgcccttttaaatgatcgtgttgatattcattacccattgatagagatgcctagcaaatccaagcttagctgtgtctgttggaacagctacataaaaaattacttggcatcaacagactacgatggcactgttcaggtatctatcttatggccgaatataagaggtctatctgctattgtcaagttgctatattttcattcttgcagtttctgctagcttccattcaacaaaactgttcatctgattcagttaggtttataaatatattcagataatttggttattttgctatctaggatactgttgatctgcaaaattggtttatatagtgaacatcacctcaatatttagcaaatgttctactgcagtgcagtgccatgtcctcataattttagctttggggctgataatataatagtagtatgttcttttttttttgggtgcccattttttttgttaccattatgataatgatccaaaagataccacaagtgcacatgtaggttagtatttggagaaagtgctctgaaggtgaaatttccgagcttctgattaaggttatctgtaggaaactgaaaacgatgaatatggttgagaaaacat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External Link(s)

NCBI Gene:Os05g0571000, RefSeq:Os05g0571000