Os05g0305300

From RiceWiki
Revision as of 10:15, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os05g0305300| Description = Protein prenyltransferase domain containing protein| Version = NM_001061683.1 GI:115463096 GeneID:4338363| Length = ...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os05g0305300

Description

Protein prenyltransferase domain containing protein

Version

NM_001061683.1 GI:115463096 GeneID:4338363

Length

3053 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os05g0305300, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:13773013..13776065

Sequence Coding Region

13773013..13775508,13775644..13775669,13776029..13776065

Expression

GEO Profiles:Os05g0305300

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008398:13773013..13776065 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008398:13773013..13776065 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggacatttacagtcacatgctcaggtggataatttctatgcttttgaacttgcctaaggcgataattgcttctggtcttctttctttgcccacaccattattgtcagtctcactgccagcattgccatccgaaccatttatatctccaagatctctgggtactggtgtcgtagcttcttatcttgcttgtggtgctaccgactatgctctcttggtgttggaacgtgttacaccgtcaccagctgtgtggtggaatctacttatccgagaacacatcaaacaaggccgccttgacagtgcaattaatgtctcttgccgcatgctgcgtgctggaactaggctggaccattttactctaccacatgtattaaaagcatgtggagagctaccttcataccgttgtggtagtgcattccatggattgatatgctgcaatggctttgagtccaatgtcttcatatgtaatgcgttggtggcaatgtattcccgttgtggttctttggaggaagccagcatgatctttgatgaaataactcagaggggtattgatgatgttatctcatggaactctattgtttcagcccatgttaaaagtagtaatgcttggactgcattggatctgttttcaaagatgacattgattgtccatgagaagcctacaaatgaaaggtcagacatcattagcattgtcaacatactccctgcatgtggttctctaaaggcagtacctcaaactaaagaagtccatggtaatgctattcgtaatggcacatttctagatgtttttgttggtaatgccctgattgatgcttacgctaagtgtggtttgatggaaaatgcggtaaaggttttcaacatgatggaattcaaagatgtggtttcttggaacgcaatggtggctgggtactcccaaagtggcaactttaaggcagcctttgagcttttcaagaacatgcgcaaggaaaatatcccattagatatggtaacatggactgctgtaattgcaggctattctcagaggggatgcagccatgaagcactcaatgtatttcgtcaaatgatattttctgggtccttgccaaattgtgtcacaatcatctctgtgttgtctgcctgcgcttctttgggagcattttctcagggtatggaaattcatgcctactccctaaagaactgtcttctaaccttggataatgattttggtggtgaggatgaggatcttatggtgtacaacgcgctaatagatatgtactcaaagtgcagaagcttcaaagctgcacgctccatatttgatgatatacctctggaggaacgcaatgttgtcacctggactgtcatgatcggggggcatgcacaatatggggactcaaatgatgccctcaagcttttcgtggagatgatttcggaaccatatggagtagccccaaatgcttatacaatttcgtgcattttgatggcctgtgcacatttggcagccatacgtataggtaagcagattcatgcttatgtgcttcgtcatcaccaatatgactcatctgcatactttgtggcgaactgcctcattaatatgtactcaaagtgtggggatgttgatacagctaggcatgtattcgatagcatgtctcaaaagagtgctatttcttggacatcaatgatgacagggtatggaatgcacggtcgtggtagtgaggccctggacatatttgacaagatgcggaaagcaggctttgttcctgacgatataaccttcctggttgttctttatgcttgtagtcattgtggaatggttgatcaaggtctatcgtactttgacagcatgagtgcagattatggtttgacacctcgggcagagcactatgcctatgctattgacttgctggcccgctttgggcgattagataaggcatggaaaacagttaaggatatgccaatggagcccaccgcagtagtttgggttgcattactgagtgcctgtagagtacattcaaatgttgaacttgctgaacatgctctgaacaaactggtcgagatgaatgctgaaaatgatggatcttacacgcttatctccaacatatatgccactgcagggcggtggaaggatgtagcgaggatcaggcacttgatgaagaaatcaggaattaagaagaggccaggatgcagctgggtccagggtcaaaagggcacagcatctttctttgtcggagatcgatcacacccactatccccacaaatttatgctcttctggagagtctaattgatcgcatcaaagctatgggatatgttcctgagacaaacttcgcattacatgatgttgatgaggaagagaaaaataatcttcttgttgagcacagtgagaaacttgctcttgcatatggtctcctcacaactttccctggttgcccaataaggatcacaaagaacctgcgtgtatgtggtgattgccatagcgcattcacctacatttccaagattgtggaccatgagatcgtagtgcgcgaccccagtcgttttcatcatttcaagaatggttcatgctcatgtggtggctattggtga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDIYSHMLRWIISMLLNLPKAIIASGLLSLPTPLLSVSLPALPS EPFISPRSLGTGVVASYLACGATDYALLVLERVTPSPAVWWNLLIREHIKQGRLDSAI NVSCRMLRAGTRLDHFTLPHVLKACGELPSYRCGSAFHGLICCNGFESNVFICNALVA MYSRCGSLEEASMIFDEITQRGIDDVISWNSIVSAHVKSSNAWTALDLFSKMTLIVHE KPTNERSDIISIVNILPACGSLKAVPQTKEVHGNAIRNGTFLDVFVGNALIDAYAKCG LMENAVKVFNMMEFKDVVSWNAMVAGYSQSGNFKAAFELFKNMRKENIPLDMVTWTAV IAGYSQRGCSHEALNVFRQMIFSGSLPNCVTIISVLSACASLGAFSQGMEIHAYSLKN CLLTLDNDFGGEDEDLMVYNALIDMYSKCRSFKAARSIFDDIPLEERNVVTWTVMIGG HAQYGDSNDALKLFVEMISEPYGVAPNAYTISCILMACAHLAAIRIGKQIHAYVLRHH QYDSSAYFVANCLINMYSKCGDVDTARHVFDSMSQKSAISWTSMMTGYGMHGRGSEAL DIFDKMRKAGFVPDDITFLVVLYACSHCGMVDQGLSYFDSMSADYGLTPRAEHYAYAI DLLARFGRLDKAWKTVKDMPMEPTAVVWVALLSACRVHSNVELAEHALNKLVEMNAEN DGSYTLISNIYATAGRWKDVARIRHLMKKSGIKKRPGCSWVQGQKGTASFFVGDRSHP LSPQIYALLESLIDRIKAMGYVPETNFALHDVDEEEKNNLLVEHSEKLALAYGLLTTF PGCPIRITKNLRVCGDCHSAFTYISKIVDHEIVVRDPSRFHHFKNGSCSCGGYW</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>558..3053#397..422#1..37#atggacatttacagtcacatgctcaggtggataatttgtaagcatcgcaatgctttagtgctacatagtacaagctttgggcatgaatattgtcactgggagttgacaattgatcttgcatgatgttaggttgttaaaaccccaataatccagataagaaggattttacaggatggtaggatactacaaactacctttgattctgcaaccctgatggatagcatgcctattcccctttgtgatctttgacttattcttcctttacattacattgttttgcattagattgatgtaatatgtatgatggcttttgctaattcagttatttttggtcatacagtgatgcaatggctgtttctttgaggattcattatgcataatggtattctactgcagctatgcttttgaacttgcctaaggcggtaaaaccaattggagtacggttcctttaaggtgcaagggcagcatgcgttggtgtagatgtttatcctagtcactttgcatccctattgaaggaatgcaagtctgcaaatacagttcatcaaattcaccaacagataattgcttctggtcttctttctttgcccacaccattattgtcagtctcactgccagcattgccatccgaaccatttatatctccaagatctctgggtactggtgtcgtagcttcttatcttgcttgtggtgctaccgactatgctctcttggtgttggaacgtgttacaccgtcaccagctgtgtggtggaatctacttatccgagaacacatcaaacaaggccgccttgacagtgcaattaatgtctcttgccgcatgctgcgtgctggaactaggctggaccattttactctaccacatgtattaaaagcatgtggagagctaccttcataccgttgtggtagtgcattccatggattgatatgctgcaatggctttgagtccaatgtcttcatatgtaatgcgttggtggcaatgtattcccgttgtggttctttggaggaagccagcatgatctttgatgaaataactcagaggggtattgatgatgttatctcatggaactctattgtttcagcccatgttaaaagtagtaatgcttggactgcattggatctgttttcaaagatgacattgattgtccatgagaagcctacaaatgaaaggtcagacatcattagcattgtcaacatactccctgcatgtggttctctaaaggcagtacctcaaactaaagaagtccatggtaatgctattcgtaatggcacatttctagatgtttttgttggtaatgccctgattgatgcttacgctaagtgtggtttgatggaaaatgcggtaaaggttttcaacatgatggaattcaaagatgtggtttcttggaacgcaatggtggctgggtactcccaaagtggcaactttaaggcagcctttgagcttttcaagaacatgcgcaaggaaaatatcccattagatatggtaacatggactgctgtaattgcaggctattctcagaggggatgcagccatgaagcactcaatgtatttcgtcaaatgatattttctgggtccttgccaaattgtgtcacaatcatctctgtgttgtctgcctgcgcttctttgggagcattttctcagggtatggaaattcatgcctactccctaaagaactgtcttctaaccttggataatgattttggtggtgaggatgaggatcttatggtgtacaacgcgctaatagatatgtactcaaagtgcagaagcttcaaagctgcacgctccatatttgatgatatacctctggaggaacgcaatgttgtcacctggactgtcatgatcggggggcatgcacaatatggggactcaaatgatgccctcaagcttttcgtggagatgatttcggaaccatatggagtagccccaaatgcttatacaatttcgtgcattttgatggcctgtgcacatttggcagccatacgtataggtaagcagattcatgcttatgtgcttcgtcatcaccaatatgactcatctgcatactttgtggcgaactgcctcattaatatgtactcaaagtgtggggatgttgatacagctaggcatgtattcgatagcatgtctcaaaagagtgctatttcttggacatcaatgatgacagggtatggaatgcacggtcgtggtagtgaggccctggacatatttgacaagatgcggaaagcaggctttgttcctgacgatataaccttcctggttgttctttatgcttgtagtcattgtggaatggttgatcaaggtctatcgtactttgacagcatgagtgcagattatggtttgacacctcgggcagagcactatgcctatgctattgacttgctggcccgctttgggcgattagataaggcatggaaaacagttaaggatatgccaatggagcccaccgcagtagtttgggttgcattactgagtgcctgtagagtacattcaaatgttgaacttgctgaacatgctctgaacaaactggtcgagatgaatgctgaaaatgatggatcttacacgcttatctccaacatatatgccactgcagggcggtggaaggatgtagcgaggatcaggcacttgatgaagaaatcaggaattaagaagaggccaggatgcagctgggtccagggtcaaaagggcacagcatctttctttgtcggagatcgatcacacccactatccccacaaatttatgctcttctggagagtctaattgatcgcatcaaagctatgggatatgttcctgagacaaacttcgcattacatgatgttgatgaggaagagaaaaataatcttcttgttgagcacagtgagaaacttgctcttgcatatggtctcctcacaactttccctggttgcccaataaggatcacaaagaacctgcgtgtatgtggtgattgccatagcgcattcacctacatttccaagattgtggaccatgagatcgtagtgcgcgaccccagtcgttttcatcatttcaagaatggttcatgctcatgtggtggctattggtga</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os05g0305300, RefSeq:Os05g0305300