Os05g0574800
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os05g0574800 |
|---|---|
| Description |
Protein prenyltransferase domain containing protein |
| Version |
NM_001062928.2 GI:297604952 GeneID:4339686 |
| Length |
5219 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0574800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:28714642..28719860 |
| Sequence Coding Region |
28714642..28717087,28717475..28717572,28719831..28719860 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:28714642..28719860 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008398:28714642..28719860 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgccgccaccgccagctagaacccacccgaaccctcccctcctccacctcctcgcctcccaccgcgcgccgcagccgctcccgctcacgccggcgcacggccacctcccgccgcggaagcgtccccgcggagtcggctccgcagcggcgccgccgccgccgcgtgccgccgcctccgcggaggccacctactctgaccggagcgccgcgctgcgggcgctctgtagccatggccagctggcgcaggcgctctggctcctcgagtcctccccggagccgcccgacgagggcgcctacgtcgcgctgttccggctctgcgagtggcgccgcgcggtcgacgccgggatgcgggcgtgcgcgcgcgccgacgccgagcacccgagcttcgggctccgcctcgggaacgctatgctcagcatgctcgtcaggttcggggagatatggcacgcgtggagggtgttcgccaaaatgcctgagagggacgtcttctcctggaacgtcatggtaggcgggtacggcaaggtgggcttcctcgaggaggcgctggacctgtactacaggatgctgtgggcagggatgaggccggatgtctacacgttcccctgcgtgctgcgtacctgcgggggcatccctgactggaggatggggagggaggtgcatgctcatgtgcttcgatttggttttggagacgaggtcgatgtattgaatgctctggtgaccatgtatgcaaaatgtggggatattgtggcggcgaggaaggtgtttgatggaatggccgtgacagactgcatatcatggaatgcgatgatagctgggcattttgagaatcatgagtgtgaggcagggttggagttgtttctcaccatgctggagaatgaggtacaaccgaatctcatgacaataaccagtgtgactgttgcatctggaatgttgtctgaagtgggttttgcaaaagaaatgcatgggtttgctgtaaagagaggtttcgccattgatgttgcattctgtaactcgttgattcagatgtacaccagtctcgggaggatgggggatgcaggtaaaatattctcaagaatggaaactaaagatgccatgtcatggactgcaatgatatcggggtatgagaaaaatggtttcccagataaagcccttgaagtttatgcactgatggaattgcataatgtaagtcctgatgatgttacaattgcaagtgcccttgctgcttgtgcctgcttggggaggttagatgtaggcatcaaattgcatgagcttgctcagaacaagggattcatcaggtatgttgtcgttgctaatgcgctccttgaaatgtatgctaaatccaagcacattgataaggctattgaagtatttaagttcatggctgagaaggatgtggtatcatggagttcaatgattgctggattttgctttaaccacaggagttttgaggctttgtactatttccggtatatgctaggacatgtaaaacccaattctgttacatttatagctgctctaagtgcttgtgctgctactggggctttgagatctggtaaggaaatccatgcatatgttttaaggtgtggtattggatctgaaggttatgtacccaatgctcttctagacttgtatgtgaaatgtggccagacaagctatgcttgggcacaattcagcgtgcatagtgaaaaggatgttgtctcttggaatataatgctttctggttttgtagctcatgggcttggagatattgctttatcactctttaaccaaatggtagaaatgggagagcatccggatgaagttacatttgttgctttattgtgtgcttgtagtagggctggaatggttattcaaggctgggagctttttcacatgatgactgagaaattttcaatagttccaaatctcaagcactatgcatgtatggtagatctattgagtcgtgttgggaaattaacagaagcttacaacctcataaatcgaatgcctatcaaacctgatgctgcagtgtggggagccttgttgaatggatgccggatccaccgacatgttgaacttggcgagcttgctgcaaaagttatccttgagttggaacctaatgatgttgcatatcatgttcttctgtgtgatttatatactgatgctggcaaatgggctcaagtggctagagtgagaaaaaccatgcgagagaagggattggagcaagataatggatgtagctgggttgaggttaagggagtaactcacgcatttcttacagatgatgaatcacatccacagataaaagaaataaatgttgttctacatggcatatatgagcgaatgaaagcatgtggttttgctcctgttgagtccttagaagataaagaagtatccgaggacgacatcttgtgcggtcacagtgaaagattagctgtagcttttggtttgatcaatactacacctggtttgtgcaagtattcagcttggtacatgacaaaaaatgttgaaaatctagctcagatactggcactccagcttttgtcatttcttattgcacagaagccttatgctcttacactcgccaagcattag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPPPPARTHPNPPLLHLLASHRAPQPLPLTPAHGHLPPRKRPRG VGSAAAPPPPRAAASAEATYSDRSAALRALCSHGQLAQALWLLESSPEPPDEGAYVAL FRLCEWRRAVDAGMRACARADAEHPSFGLRLGNAMLSMLVRFGEIWHAWRVFAKMPER DVFSWNVMVGGYGKVGFLEEALDLYYRMLWAGMRPDVYTFPCVLRTCGGIPDWRMGRE VHAHVLRFGFGDEVDVLNALVTMYAKCGDIVAARKVFDGMAVTDCISWNAMIAGHFEN HECEAGLELFLTMLENEVQPNLMTITSVTVASGMLSEVGFAKEMHGFAVKRGFAIDVA FCNSLIQMYTSLGRMGDAGKIFSRMETKDAMSWTAMISGYEKNGFPDKALEVYALMEL HNVSPDDVTIASALAACACLGRLDVGIKLHELAQNKGFIRYVVVANALLEMYAKSKHI DKAIEVFKFMAEKDVVSWSSMIAGFCFNHRSFEALYYFRYMLGHVKPNSVTFIAALSA CAATGALRSGKEIHAYVLRCGIGSEGYVPNALLDLYVKCGQTSYAWAQFSVHSEKDVV SWNIMLSGFVAHGLGDIALSLFNQMVEMGEHPDEVTFVALLCACSRAGMVIQGWELFH MMTEKFSIVPNLKHYACMVDLLSRVGKLTEAYNLINRMPIKPDAAVWGALLNGCRIHR HVELGELAAKVILELEPNDVAYHVLLCDLYTDAGKWAQVARVRKTMREKGLEQDNGCS WVEVKGVTHAFLTDDESHPQIKEINVVLHGIYERMKACGFAPVESLEDKEVSEDDILC GHSERLAVAFGLINTTPGLCKYSAWYMTKNVENLAQILALQLLSFLIAQKPYALTLAK H</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..2446#2834..2931#5190..5219#atgccgccaccgccagctagaacccacccgaaccctcccctcctccacctcctcgcctcccaccgcgcgccgcagccgctcccgctcacgccggcgcacggccacctcccgccgcggaagcgtccccgcggagtcggctccgcagcggcgccgccgccgccgcgtgccgccgcctccgcggaggccacctactctgaccggagcgccgcgctgcgggcgctctgtagccatggccagctggcgcaggcgctctggctcctcgagtcctccccggagccgcccgacgagggcgcctacgtcgcgctgttccggctctgcgagtggcgccgcgcggtcgacgccgggatgcgggcgtgcgcgcgcgccgacgccgagcacccgagcttcgggctccgcctcgggaacgctatgctcagcatgctcgtcaggttcggggagatatggcacgcgtggagggtgttcgccaaaatgcctgagagggacgtcttctcctggaacgtcatggtaggcgggtacggcaaggtgggcttcctcgaggaggcgctggacctgtactacaggatgctgtgggcagggatgaggccggatgtctacacgttcccctgcgtgctgcgtacctgcgggggcatccctgactggaggatggggagggaggtgcatgctcatgtgcttcgatttggttttggagacgaggtcgatgtattgaatgctctggtgaccatgtatgcaaaatgtggggatattgtggcggcgaggaaggtgtttgatggaatggccgtgacagactgcatatcatggaatgcgatgatagctgggcattttgagaatcatgagtgtgaggcagggttggagttgtttctcaccatgctggagaatgaggtacaaccgaatctcatgacaataaccagtgtgactgttgcatctggaatgttgtctgaagtgggttttgcaaaagaaatgcatgggtttgctgtaaagagaggtttcgccattgatgttgcattctgtaactcgttgattcagatgtacaccagtctcgggaggatgggggatgcaggtaaaatattctcaagaatggaaactaaagatgccatgtcatggactgcaatgatatcggggtatgagaaaaatggtttcccagataaagcccttgaagtttatgcactgatggaattgcataatgtaagtcctgatgatgttacaattgcaagtgcccttgctgcttgtgcctgcttggggaggttagatgtaggcatcaaattgcatgagcttgctcagaacaagggattcatcaggtatgttgtcgttgctaatgcgctccttgaaatgtatgctaaatccaagcacattgataaggctattgaagtatttaagttcatggctgagaaggatgtggtatcatggagttcaatgattgctggattttgctttaaccacaggagttttgaggctttgtactatttccggtatatgctaggacatgtaaaacccaattctgttacatttatagctgctctaagtgcttgtgctgctactggggctttgagatctggtaaggaaatccatgcatatgttttaaggtgtggtattggatctgaaggttatgtacccaatgctcttctagacttgtatgtgaaatgtggccagacaagctatgcttgggcacaattcagcgtgcatagtgaaaaggatgttgtctcttggaatataatgctttctggttttgtagctcatgggcttggagatattgctttatcactctttaaccaaatggtagaaatgggagagcatccggatgaagttacatttgttgctttattgtgtgcttgtagtagggctggaatggttattcaaggctgggagctttttcacatgatgactgagaaattttcaatagttccaaatctcaagcactatgcatgtatggtagatctattgagtcgtgttgggaaattaacagaagcttacaacctcataaatcgaatgcctatcaaacctgatgctgcagtgtggggagccttgttgaatggatgccggatccaccgacatgttgaacttggcgagcttgctgcaaaagttatccttgagttggaacctaatgatgttgcatatcatgttcttctgtgtgatttatatactgatgctggcaaatgggctcaagtggctagagtgagaaaaaccatgcgagagaagggattggagcaagataatggatgtagctgggttgaggttaagggagtaactcacgcatttcttacagatgatgaatcacatccacagataaaagaaataaatgttgttctacatggcatatatgagcgaatgaaagcatgtggttttgctcctgttgagtccttagaagataaagaagtatccgaggacgacatcttgtgcggtcacagtgaaagattagctgtagcttttggtttgatcaatactacacctggtaccactatttctgtcacaaagaaccgatacacttgccagagttgtcatgtgatattcaaggcaatttctgaaattgttcgaagagagataactgttagagacactaagcaattacactgctttaaggatggagattgttcatgtggagatataggatatggatgaaaaacttatagaaagagggctgtataacaatacaagatgtggccatgcattattatgcatctgctgcaagcactgctacagaaatcctttgcaacaacagttattaaccacgtctaacaatacaaatactcactagcagtttggatataggcatatagcaagaagccccagcaaccctgcatggatcaacaaagttaaaattttcagttatatgtattaggtttgtgcaagtattcagcttggtacatgacaaaaaatgttgaaaatctagctcagatactggcactccagcttttgtcatttcttattgcacagaaggtattgtcttttcggctctatttgttggatcacaaggagatcctttattgtttctcttacatttttagtgtttcttccttgcagtccccttaagtggtgcttcatgcagatgatctttgcgtccaataatgtccaaaagaaatatccaagtaagattagttttacagtgagaatattgtagcttttgtatgctactacctccttccctaaatatatgacgttggttagaactaaccagcatcatacaaaaaagacacggagggagttttttgttaaataggagtaacaacgctgtaatggttgtcagtgtcaactatagggctaaagaattttgcctgttccatgttagtgatagtgaatatatgtaactagagatattggcaaaatagcatgtgttagtgcttctttaaaatctttctacattcacacatataacaccggtatagctggcatagaaattgatttacaggatgtatttgaaggattcttttgcaggaaattcacagaacaattcaatttcagctttctaaacaggtgttaaaagtgccctgcctcctacttcgaaagatactacaagagtgcttgacttcctagctccaagggaacgatatgcatggttatcttggcgtcattactagtttactacaagacccaaactggccaaggtccaagggctctttcctgcttggaacaaactacgaacgcaaaaactcagctcctactttccccacttttttttttttgactgagcgttttgtacaagactgttaatctggaattttaagtttgtttgcacccttgggccttggccttgtatgcttgtattcttggctaagcaatgtgggactaaaaccacactctctcgtatgctcgtggatgttcatgactgaaaattcacgtatgttgtgtagatacaattttgtgtaggacatgtccgcctactgcatttttttttggtgcagtatgtgttttttctctcgaaatgagtagatctcttgtgctgccttttttcaggaacgtgttgcactttttcatgccctacagtttttcttttaaagtttttgaacaaatgtatatgtgcttatcgtttctgcagtgggaaatgtgttatgtgcagagtttgtgcacagatgtgcaaggtaaaaatgatctagtgaatatgtgcagaacattttatgtcaaatttgcagaaacattttgagtgaagtgtgcagaacattttgtgtgaaaatatggatggacatattcagatgtatcttttgtgggtgaaaatgtgcatatgtgttttctatggaaatgcacagatgttttccttttgaatgggaaagtgcacatatgtattttctttgtatgagaatggtgcatcaataatgtgtggattgtgcaacgaaaatgtgcaaacttttttggatatgcgcaactatgcaatggaatgtgcagttgccatagttgagcatatccaaaaaaaagtctgcacattttcattgcacaagatagaaatgtgcacttgtgcaatgtaaatgtacaaacatttttatgtgtagatgcattttaaaaaaatagtaatgtgacgtgtattttgtctttatggaaatacgaattttcatgaaagatgaatagatattttttgcaattataaaaattacatctttttttatgttatctgcaatataaatttccacgaaaatgcactcgtatttatttttgtatggaaatatgcaaatatgttttctttttgcaatcgtgcaaatatatttgtttggaatagaaaagtgcaaatataatcttccctctaaattagaaaatatttttttaattataaagctatgtggtaataacatttttagtaaatgcaaatctataccttttgtatagttgcaactcattgcatcctaaagtttaatatgcaaaaatgctacattattattcactaatatattatattacaatacgatattatcatgtgcattagagagtacagtgcactactttctctgtaaagcaaacaagaaaacaacaatcaatcatgaggatgaaactgcctttttggacaaagggagttcaaaaatcacaaagcacaatgaattgttttgatatgtgtggggtttgtagccagttgctgaaaatcggtttcctaattatcttctaaatttaacatagtaatcaatgtgatatttattatacatttcacaaaatctcaaagatctcctatgtacatagtaattaattatttatacgctaatggctcaccaacacagccttatgctcttacactcgccaagcattag</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
