Os06g0103600

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Structured Information

Gene Name	Os06g0103600
Description	Similar to Aminoacyl-t-RNA synthetase precursor
Version	NM_001063078.1 GI:115465887 GeneID:4339847
Length	10838 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os06g0103600, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 6
Location	Chromosome 6:232787..243624
Sequence Coding Region	232825..233189,233259..233340,233430..233493,233636..233691,233901..233978 ,234133..234207,234436..234506,234710..234826,234915..235016 ,235196..235316,235451..235537,235708..235794,236237..236338 ,236629..236692,237581..237636,238185..238256,238540..238622 ,238953..239001,239335..239397,239633..239722,239823..239909 ,240072..240146,240222..240280,240511..240604,240681..240899 ,240998..241092,241504..241594,241663..241767,241847..241885 ,242263..242352,242538..242639,242837..242918,243075..243160 ,243264..243362
Expression	GEO Profiles:Os06g0103600
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008399:232787..243624 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008399:232787..243624 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atggcgggtttggctccccctcccctcctcctcctccccctctcctcctcactctctcctgccgccgcctcccaccacccaacctcccccccttctcgcacacgccgacgacgccgcctgctatccgccgtggcgtctgccgacggtgatgctccctccccagtctctgtctccgcctccgccgccaccaaggggccttcctcctcctccgtgctcaccttccagcaggccatccagcgcctccaggactactgggcctcagtggggtgtgccgtcatgcagtgcagcaatacagaggttggagcagggaccatgaatcccttgacattcctcagggttttaggccccgagccatggaacgttgcttatgtggagccaagtataagacccgacgacagccgctatggggacaatcctaataggcttcagcgtcatactcaatttcaggtaattttgaagcctgaccctggaaattcacaagacctctttctgcacagcctttcagcactaggtatcaatgtccgtgaacatgacatccgttttgttgaagacaactgggagagtccagttcttggtgcgtggggattaggctgggaggtttggatggatggcatggaaataacacagttcacatattttcagcagtcaggaagccttccattgctgcctgtttctgttgagataacatatggacttgaacgcatcctcatgtctcttcagggtgtagatcatttcaagaatatacaatacactaaaggaattacatatggagaactattccttgagaatgagaaagagatgagtgcatattatttggagcatgcaaatgttgataacattcaaaagcattttgatgattttgaagaagaggctcgctctttattatcactttggcttcctattcctgcgtacgatcatgttctgaaggcctctcatgcttttaatattttagattctagaggctttgttggtgtaaccgagcgtgcaagatattttggtcgcatgcggagtcttgctcgccagtgtgctcagctttgggtgaaaacaagagagaacctcggttatcctttgggcacttatcaagagtctaatcttatctatcctcatgtctctgaaaagcctagtagaaagggagttgtcggacagccacgagcatttgttcttgaaataggaacagaagagttgccacctcatgatgtgatagaagcaaccaaacagctggagaaatctttaattcaaatattggagaaacgaagactgagccatgggaaagtacgctcttatgggacaccaaggagattagcggttgttgttgaaaatcttaatatgaagcaaatggaggaagagattgaactacgtggtccacctgttgcaaaggcatttgaccaagaaggaagacccactaaggctgctgaaggattttgtcgaaagaataatgtcctgatagatagtctatatagaagaactgatggtaaaacagaatatatctacgctcgggtcaaagagtctgcacgttttgctgatgaggtactaactgaagatctaccgactattatatctggtatttcatttcccaagtctatgcgctggaactccaatattgtgtttagcaggccaatacgctggatctttgcccttcatggggatctcattgtgccattttgctttgctggcatatcaagtgggaatcagtcgtgtggccttcgtaactcctccttggctaactttaaggtggaagctgcagaattatatttacacaccctggagaaagctgggatcctgattgatatgcaggagcgcaaacaacgaatcttgcatgactctagtatattggctgagggtgttggcggtgatatcattgcacctgatagcttggtgcaggaggttatcaatcttgtggaggcgccgatgcccattattggtcgatacgatgtttccttcttagcacttccaaaggatgtattaataacggttatgcagaaacaccagaaatatttccctgtaacctccaagaccatgggcaatctgctaccatgtttcataactgttgccaatggtgccattaaggaagaagtagtccgcaaagggaatgaagctgtactcagggcacggtatgaggatgctaaattcttttataagatggatacgcagaagaaactttctgaattccgagatcagctcagcagcattctctttcatgaaagacttggtaccatgcttgacaaaatgaaacgtgttgagaacactgttgcagaagtggccctccttctcggaattaatgagaaaatgatcccagcaatcaaagatgcagctgcattggctatgtcagatcttgccactaatattgttactgaatttacttcacttgctggaattatggcacggcattatgctttgagagatggcctttcagaacagattgcagaagccctatttgagataacacttccaaggttctctggtgatgtgttcccaaaaacagatcctggcatagtccttgcagtcactgacagattggatagtctagtgggtctgtttggagctggatgccaaccaagttctacaaatgatccatttgggctaaggagaatttcctatggattggttcaaatattggttgagaacaagaagaactttgacctcacgaaggccttgaccttagtggcagaggagcagccaataacaatagatagtggtgttatagatgaggtagtacaatttgtcacgcggagattggagcaacttttggtggatgaaggaattaattgcgagatagtccgttcagtgcttatagagcgtgcaaactgcccttatctagcatcacaaacagcaattgaaatggaagcattttcaagaactgaagatttcccaaaaattgtcgaagcgtactcaaggcccgcgagaataatacgtggaaaagaaattgggtctgctttagaggttgatgcaagtgtatttgagaaagacgaagaaagagctttgtggagtgcctacttggaggttgcggataagattcatcctggtgttgacataaaagcctttgcggacgcttctctggaactgctgcaacccctagaagatttctttacaaatgtttttgtcatggcggaagacgagagagttcgtaacaatcggcttgcactgctaacgaaggttgcgagtctgccaaagggaattgccgacctgtcagttttaccagggttttag</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MAGLAPPPLLLLPLSSSLSPAAASHHPTSPPSRTRRRRRLLSAV ASADGDAPSPVSVSASAATKGPSSSSVLTFQQAIQRLQDYWASVGCAVMQCSNTEVGA GTMNPLTFLRVLGPEPWNVAYVEPSIRPDDSRYGDNPNRLQRHTQFQVILKPDPGNSQ DLFLHSLSALGINVREHDIRFVEDNWESPVLGAWGLGWEVWMDGMEITQFTYFQQSGS LPLLPVSVEITYGLERILMSLQGVDHFKNIQYTKGITYGELFLENEKEMSAYYLEHAN VDNIQKHFDDFEEEARSLLSLWLPIPAYDHVLKASHAFNILDSRGFVGVTERARYFGR MRSLARQCAQLWVKTRENLGYPLGTYQESNLIYPHVSEKPSRKGVVGQPRAFVLEIGT EELPPHDVIEATKQLEKSLIQILEKRRLSHGKVRSYGTPRRLAVVVENLNMKQMEEEI ELRGPPVAKAFDQEGRPTKAAEGFCRKNNVLIDSLYRRTDGKTEYIYARVKESARFAD EVLTEDLPTIISGISFPKSMRWNSNIVFSRPIRWIFALHGDLIVPFCFAGISSGNQSC GLRNSSLANFKVEAAELYLHTLEKAGILIDMQERKQRILHDSSILAEGVGGDIIAPDS LVQEVINLVEAPMPIIGRYDVSFLALPKDVLITVMQKHQKYFPVTSKTMGNLLPCFIT VANGAIKEEVVRKGNEAVLRARYEDAKFFYKMDTQKKLSEFRDQLSSILFHERLGTML DKMKRVENTVAEVALLLGINEKMIPAIKDAAALAMSDLATNIVTEFTSLAGIMARHYA LRDGLSEQIAEALFEITLPRFSGDVFPKTDPGIVLAVTDRLDSLVGLFGAGCQPSSTN DPFGLRRISYGLVQILVENKKNFDLTKALTLVAEEQPITIDSGVIDEVVQFVTRRLEQ LLVDEGINCEIVRSVLIERANCPYLASQTAIEMEAFSRTEDFPKIVEAYSRPARIIRG KEIGSALEVDASVFEKDEERALWSAYLEVADKIHPGVDIKAFADASLELLQPLEDFFT NVFVMAEDERVRNNRLALLTKVASLPKGIADLSVLPGF</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>39..403#473..554#644..707#850..905#1115..1192#1347..1421#1650..1720#1924..2040#2129..2230#2410..2530#2665..2751#2922..3008#3451..3552#3843..3906#4795..4850#5399..5470#5754..5836#6167..6215#6549..6611#6847..6936#7037..7123#7286..7360#7436..7494#7725..7818#7895..8113#8212..8306#8718..8808#8877..8981#9061..9099#9477..9566#9752..9853#10051..10132#10289..10374#10478..10576#ggagtccgtccaggtccaggtccagtgtagtcgtagccatggcgggtttggctccccctcccctcctcctcctccccctctcctcctcactctctcctgccgccgcctcccaccacccaacctcccccccttctcgcacacgccgacgacgccgcctgctatccgccgtggcgtctgccgacggtgatgctccctccccagtctctgtctccgcctccgccgccaccaaggggccttcctcctcctccgtgctcaccttccagcaggccatccagcgcctccaggactactgggcctcagtggggtgtgccgtcatgcagtgcagcaatacagaggttggagcagggaccatgaatcccttgacattcctcagggttttaggccccgagccatggaacgttgcgtaagtagaagacttcccttccttgtattctggactactcctccatttctcactgtattattcttctagttatgtggagccaagtataagacccgacgacagccgctatggggacaatcctaataggcttcagcgtcatactcaatttcaggtaaatgtttctaccataccatatccatcctatatatttagctcattgctgctgccttcctccgttatttaatctttcttttccgataggtaattttgaagcctgaccctggaaattcacaagacctctttctgcacagcctttcagcactaggtatttcactactgctttctcttttttttcatcataaaatgcacgccgatattcttctgtttctaccttctcatttatttatttcctttcctaatacattgttgtgaatacaaaatgttgtatataaatgtttgcatcacaggtatcaatgtccgtgaacatgacatccgttttgttgaagacaactgggagagtccagtgaagttcctcctcttttactctttccttcttaaaatatcaaccaatgcaatcattgaaccaaagtgtatctggttacaaaaagccggatcgttatttcaatataatgatctttcctttaaaaaagtctatctggttaagtcatcataattgcaactgaatatctctaattcattaccttgttcatgtttcttcccattgatggacaggttcttggtgcgtggggattaggctgggaggtttggatggatggcatggaaataacacagttcacatattttcagcaggtacaggcgttagctaaaacaattcacatatttttagtgcattatgttgactgctttggcatcacagtatttttttgacacttgatgtgtgtattatccccttctaatccttggaaaattttaagacagtttttcttaatgctaattactgtagtcaggaagccttccattgctgcctgtttctgttgagataacatatggacttgaacgcatcctcatgtctcttcaggtgagcctagtagtgttgttatctaccttagtagttttttatgagttagaagatgagcaaacgattaacaaactacctattgattttgttgattgtgtatattgcaccctttatgttcagagtctcgtataaatcttagtggactttcttttgcgaatattttctaccctactggatcatataccctttgaaagagctgaccttactttgatttagatgttttgacagggtgtagatcatttcaagaatatacaatacactaaaggaattacatatggagaactattccttgagaatgagtatgtatcttcttgaaagttctaggagctttgtgtaccttttcttcttctttagcatcttgcctgcaatgtgccatttctttcccatcctctttttactacattaagtagaacaatttcgtgatatatttctgttgtcttttattgattataaataattatatgcttaggctcaatactatatatctggtttgttgattcaggaaagagatgagtgcatattatttggagcatgcaaatgttgataacattcaaaagcattttgatgattttgaagaagaggctcgctctttattatcactttggcttcctattcctgcgtatgtttgattgatgcactcatttcttggctttcatgttttatttgttaagaattgacaagctgaccttcgattggcaatggattaggtacgatcatgttctgaaggcctctcatgcttttaatattttagattctagaggctttgttggtgtaaccgagcgtgcaagatattttggtcgcatgcggaggtgtggacctacataccttgatttttttccctatgccttttctcatcatggaatcctggttttgttgacttgatttatttatttaccagttattagctttacttttttcagttgttcttgtttctagcttctacgtaaagttaagatgtaattctcatactgtcgatgctcttgagcagtcttgctcgccagtgtgctcagctttgggtgaaaacaagagagaacctcggttatcctttgggcacttatcaagagtctaatcttatctatcctcatgtctctgaaaagcctagtagaaaggtatttcatttacatgaccatgtactattacttgtgttattttaatatttgaacccaatgggtgtggatggcttatgtcataacttctgcaaaagcacacccatttttacttatctttggtgctttttgtttagggagttgtcggacagccacgagcatttgttcttgaaataggaacagaagagttgccacctcatgatgtgatagaagcaaccaaacaggtaaaccaaacttcctccttcacccttataagatgagaagaattttgaacctaacattggcaaaatgatgtcaccttttggtcatatttgtttttttatggaatttatacttcaattctaggtggaatgacttttgcttttttcacctttgaatctttgacatcctccagctggagaaatctttaattcaaatattggagaaacgaagactgagccatgggaaagtacgctcttatgggacaccaaggagattagcggtatcagtttaacctttgttgtctcacatgagttttttttttcctagcgaagtctcacatttgtttctatactatcgcaagcttcctcatatattcttgccagttatgcatctcttgtgtctaggtgtgtgtttggaaaagctggccagtcctaacattccggaggcctggtgcagaacaacaaactgtaataatagtctaccaagtgcaaaacacatgatggagagatatctaatattaatcagtaggttccctataggtttgttagtaggaatggtagataaaactgtctgaaaatacaaaaaagaaatcacataatgatgcaccatatttaattgaagatatatcttggtaatgcgtcttttatgcttggtaactgacaattcttttaacatgctttactctggtctgaatctataagaagaccttctttgatttgtaggttgttgttgaaaatcttaatatgaagcaaatggaggaagagattgaactacgtggtccacctgttgcaaaggcatttgaccaagaaggaagacccactaaggttagctatccaaaaaggagctggactttcctctgctcttctgctattgcttatttttagggctttccatatcacttatgaagaaaatggtaaggtacttcaagtatgcagaaagtcatgctgaaagtaacatctattccattaaattacaaaaactgcacactgtttattatttttctccgttcttattaatgctgttgaagggcttttgtttctttgattttcttccttctattctcatgacaggctcttgatatttttttgtggaataattttctactcttattcaggctgctgaaggattttgtcgaaagaataatgtcctgatagatagtctatatagaagaactgatggtacgcgacatggttccctagaatttgtattgcccacttccatctcaatgtgttttgtcatcactgctacagtgcgtgttggttactcaatggtgatctgataccatctccatttcttgttacaatttgttgttcgaatcattatgtggagtcccatgtagaaacgaatccacccttataattaatgatatgaaggtctcccattgttctacagtcccatgtagattggccttccttgggtcaatctcctttgcttgctgcaccagtcgtgtgcagcttgttcctgtcacatgtgcatatgctgcactggcctctcttgcatatcttattctggtatttgatttaattagctagatatggaagatatactcatatgcatgggtgatggcctatatatgtaggcggtatgttcaatcgatactggcatgattaaaaacatgtgttaagaaacgacctatggtgggcgggccctcgtgtacgggttaggggcctcaaagcacgggttaaggcccgaacgatggggggcaggtctgcgtgtcaaggggccagggtttgtggcatttcttgaccggcttttgctgaggtttcttcttagcgcaatgccgtgggggtggtctttcccccgtcagtcgagttctttcttttttttaattatttatgctgtcaataagattcaattctcaattgcttatgctgcata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External Link(s)	NCBI Gene:Os06g0103600, RefSeq:Os06g0103600