Os06g0114000
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Structured Information
| Gene Name |
Os06g0114000 |
|---|---|
| Description |
Similar to 60 kDa chaperonin (Protein Cpn60) (groEL protein) (63 kDa stress protein) (GSP63) |
| Version |
NM_001063136.1 GI:115466003 GeneID:4339910 |
| Length |
5489 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0114000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:810047..815535 |
| Sequence Coding Region |
810283..810296,810398..810521,810974..811066,811144..811236,811410..811514 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:810047..815535 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008399:810047..815535 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcttcaacattcggtgccacttctacggttggcctcatggctgcgccaaccggaattgtatcagacaagaagccatcttctctatcttcggtgtcatctgtttctgttgccagccgaccacgcaatgcacgccttcagaggaagtgcaacttcagggtaaaagctgccaaggagttgtacttcaacaaggatggctcggctatcaagaagcttcagactggagtaaacaagcttgctgaccttgttggagttacactgggaccaaagggaaggaatgttgttttggagagcaagtatgggtcccctaggattgtcaatgatggtgttacagttgcaagagaggttgaactggaggatcctgttgaaaatattggagctaagttggttaggcaagcagcagcaaagaccaatgatttagctggagatggcacaactacttctgttgtgcttgctcaggggctgattgctgagggtgttaaggtcgttgcagctggtgccaatcctgtgcaaattacacgtggtatcgagaaaactgcgaaagcactagttgaagagctaaagaaattgtcaaaggaggttgaagacagtgagcttgcggatgttgctgcagtcagtgctggcaacaattatgaaatcggtaatatgatagcagaggctatgagcaaggttggcaggaagggtgtggttacccttgaagaagggagaagttctgagaataatctctatgttgtggagggaatgcagtttgaacgtggttatatctccccgtattttgtaactgacagcgagaaaatgtctgcagaatatgagaactgcaagcttcttttggtggacaaaaaaatcaccaacgcaagggatcttatcaatgttttggaggaggccataagaggtgcatacccaattctgataattgctgaggatattgagcaggaggctcttgctactcttgttgtcaacaagcttagagggtcattgaaaattgccgctatcaaagcccctggttttggtgagcgcaagacccagtacttggatgatattgccattctaactggagcaactgtaatcagggatgaagttgggctgtcacttgacaaggcagacaaatcagttttaggaacggctgcaaaggtggtccttaacaaagagtcaacaacaattgttggtgatggcagtacacaggaagaagtgactaagagggttgcacaaataaaaaatctcatcgaggctgccgaacaagaatacgagaaggaaaagctcaatgagaggattgcaaagcttgctggtggtgttgcagtcattcaggtgggagcacaaacagagaccgaactaaaagagaagaagttgagagttgaggatgccctaaatgctaccaaggctgctgttgaggaaggtattgttgttggtggagggtgcactcttctgagactggcagctagagttgacgccatcaaggacaacctggagaatgatgagcagaaggttggagctgaaattgtaaggagagcgctgagctacccgcttaaattgattgctaagaatgctggtgttaatggaagcgttgttaccgagaaggttctctctaacgataacttcaagtttggttacaatgctgcaactggacagtacgaggatttgatggctgctggtatcattgaccccactaaggtggtgagatgttgtcttgagcatgctgcgtcggtggccaagacattcctcacatcggatgtcgtcgtcgtcgagatcaaggagcctgagcctgcgcccgtcaccaacccgatggacaactccggctacgggtactga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASTFGATSTVGLMAAPTGIVSDKKPSSLSSVSSVSVASRPRNA RLQRKCNFRVKAAKELYFNKDGSAIKKLQTGVNKLADLVGVTLGPKGRNVVLESKYGS PRIVNDGVTVAREVELEDPVENIGAKLVRQAAAKTNDLAGDGTTTSVVLAQGLIAEGV KVVAAGANPVQITRGIEKTAKALVEELKKLSKEVEDSELADVAAVSAGNNYEIGNMIA EAMSKVGRKGVVTLEEGRSSENNLYVVEGMQFERGYISPYFVTDSEKMSAEYENCKLL LVDKKITNARDLINVLEEAIRGAYPILIIAEDIEQEALATLVVNKLRGSLKIAAIKAP GFGERKTQYLDDIAILTGATVIRDEVGLSLDKADKSVLGTAAKVVLNKESTTIVGDGS TQEEVTKRVAQIKNLIEAAEQEYEKEKLNERIAKLAGGVAVIQVGAQTETELKEKKLR VEDALNATKAAVEEGIVVGGGCTLLRLAARVDAIKDNLENDEQKVGAEIVRRALSYPL KLIAKNAGVNGSVVTEKVLSNDNFKFGYNAATGQYEDLMAAGIIDPTKVVRCCLEHAA SVAKTFLTSDVVVVEIKEPEPAPVTNPMDNSGYGY</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5240..5253#5015..5138#4470..4562#4300..4392#4022..4126#3804..3875#3602..3679#3157..3326#2795..3029#2462..2704#2198..2293#1954..2091#1397..1522#1083..1301#cccaaacccctcctcacccgcagcgccccaacccaaccctccccgaggtcgcagccttatcctctcctctcccctccgcgaggtcaggtgagctcaaaccctatcccctcctcctccacctccgccgctcctccccgccccggggcgctgggttctccctcttccggtggcgacgtggtggggtgtggtgtgttgacccccgcacgattcggttgccgcgtggttggaggattcggtggatagttctcgccgcgcgattcgtggggggcggagagctcgaggtcgcgccccccgcttggttttgaggggggccttttgatggttgctcgtgcgggctaattttgcgctagaactgttatatcagtggaaattgttggtttagttagcacggggactacagaatgtatcagtggaaattgttggtttagttagcacggggactacagaatgttgttggctccagcgttctgttcgtctggttgtgacttttggcatggggtgttctaattcagccaagtagagtggagtaggagggtgcatgcgatattctgtttggcagttggaatgctagtgttttcatgtatgctagtgatggccagccatttgaagctgacgtaactgttagggtggttgaatggcaaacatttaaatttgaaggtgtagtttcaagtgctagaatgtattggttggccattcatgatattcgagaaggaatcctggcagcagagatgctttagttggtctctttttcgttcagttttagctatctcatacatatgcaggttatcaactcactgtaatataccctgaagtccagttgttaattaatcttctaccttgacactgtaagagatgtagtcaatgataatatgtggtaatatgcagagagagcacaaaactatgtttagcttggaaaatacatttgcacagaatgcacaacaattttaagctcttagctttggttggcaatacatgaactttcatgtgggacctccacctcagcttccattttctgaatagaagcttaagcatgcttatgattgttgctccatgttaatgttgtcattgctgaacaggaaatcatggcttcaacattcggtgccacttctacggttggcctcatggctgcgccaaccggaattgtatcagacaagaagccatcttctctatcttcggtgtcatctgtttctgttgccagccgaccacgcaatgcacgccttcagaggaagtgcaacttcagggtaaaagctgccaaggagttgtacttcaacaaggatggctcggctatcaagaagcttcaggtgagctccaaagttcttggacacatcttatcaaattttggtcactatgattcttagccttgaccaggcactcattagttatttctacatgtcagactggagtaaacaagcttgctgaccttgttggagttacactgggaccaaagggaaggaatgttgttttggagagcaagtatgggtcccctaggattgtcaatgatggtgttacagttgcaagagaggtatattacagtgtttattgcgtcaaatagcattgaatttccttacaatttgcttgtttgctgtatgctatacttccacagaaaaaaaatgtttgttttgaaaagtaaaacagtctgcacatttgctcacaagtttcatgcgcaagtgtatttctgtttactattgctggttgcatttttgcacaccatgttctatcataattacctttgtgggttctaatatatgatcctctgacaagatgaactaaagtttgatagctggtcattgacttaactatagtgattgtgcaccatttgttttagtcatgatataaagaatttttcaattttattttcttattgaacaagtcaactggaggtttctggattatctgtgtaacctagttccagaatttgagcagaattttcaagtaacgatctctgtactgcaggttgaactggaggatcctgttgaaaatattggagctaagttggttaggcaagcagcagcaaagaccaatgatttagctggagatggcacaactacttctgttgtgcttgctcaggggctgattgctgagggtgttaaggtatgctattagttgagacatgagacctctattacttgtatggtcaatctgttaagagtcgttaatttgtgaactaagtgaaaataattcatttgctctttttcaggtcgttgcagctggtgccaatcctgtgcaaattacacgtggtatcgagaaaactgcgaaagcactagttgaagagctaaagaaattgtcaaaggaggtaaaataatcgtcaggctctaatgctttcagaatgttttagttgtggttgtggcaacctggtgtttgttgcaacaatgcttagctagactgagtcaaatcagatgatttatctatgtagtatatgcttttttttgttctacttataaaaaacattttcttgctttaggttgaagacagtgagcttgcggatgttgctgcagtcagtgctggcaacaattatgaaatcggtaatatgatagcagaggctatgagcaaggttggcaggaagggtgtggttacccttgaagaagggagaagttctgagaataatctctatgttgtggagggaatgcagtttgaacgtggttatatctccccgtattttgtaactgacagcgagaaaatgtctgcagaatatgagaactgcaaggtagcttcagcctgagcacacatacccctgctgtatgctgctttaatctgtttcagtttcttattgcactatgtttccactatttttcagcttcttttggtggacaaaaaaatcaccaacgcaagggatcttatcaatgttttggaggaggccataagaggtgcatacccaattctgataattgctgaggatattgagcaggaggctcttgctactcttgttgtcaacaagcttagagggtcattgaaaattgccgctatcaaagcccctggttttggtgagcgcaagacccagtacttggatgatattgccattctaactggaggtgaggtggacttgcgatctggtgcatttggttgggtgatcattaatgctgcttatttatgatgattctggagcatctggctggatgattaatgctgcttatttataatgattttttttctctgcagcaactgtaatcagggatgaagttgggctgtcacttgacaaggcagacaaatcagttttaggaacggctgcaaaggtggtccttaacaaagagtcaacaacaattgttggtgatggcagtacacaggaagaagtgactaagagggttgcacaaataaaaaatctcatcgaggtatgttatatctgtttaccatggttaatttggcacaatagtgcctcgcaaatttttttttttggcacaatagtggttctatattccaccatttctttaatctagttatagactgtacatatctggaaatgtagcttgattggttacatgcttcatctggtttcaaactgaaagctttctctattatgaggctgtatattgaatgtgttgtttgtacaagaaaagaaaagcatcagtcctgctcctgattgcttttttatctatccaatttgcaggctgccgaacaagaatacgagaaggaaaagctcaatgagaggattgcaaagcttgctggtggtgttgcagtcattcaggtataataagaaatggacaaaatgccatgttatctgtatctgttctttttcttggttctttgtttggaaagatagatagatgtggttatgtgggtcgtaatccaagttttgttacttttgataggtgggagcacaaacagagaccgaactaaaagagaagaagttgagagttgaggatgccctaaatgctaccaaggttagtctgttgttataactgctttgagatagaaatagattaatgtttgcttcttaaggaagaaaaattaaggtagtttgttgctcactgagttgatatcaacgttcttctggctttggatctttaaaccgcttcctctttgtcaggctgctgttgaggaaggtattgttgttggtggagggtgcactcttctgagactggcagctagagttgacgccatcaaggacaacctggagaatgatgagcagaaggtttacaaccatgatctactttattcattgtttttgttcgagtgttctataaacctcatctctcaaaagttctgtttttgtgcctgctactatgtatatgggttagaaatgaccatctcgaatttgttgtcctttctaattgacttgttgtatgtattgcttgaactttttaggttggagctgaaattgtaaggagagcgctgagctacccgcttaaattgattgctaagaatgctggtgttaatggaagcgttgttaccgagaaggttagatcttgttcactaacagaaaatcatatgttcacatgtacatctgaataacataaaagatgatgttttaccaggttctctctaacgataacttcaagtttggttacaatgctgcaactggacagtacgaggatttgatggctgctggtatcattgaccccactaaggtctgttgctccccattgatttccgatatttttgcataaaaatttagattggtggattccctatattttagctgaaataattatagcagtgtggactgtgcagttacttttgtgttcacccttcagttcttacacatacagccattgttttgtgttgatgttagtagtttctaatgaaggttctagatccaaggcttagtgttgtggtcctagaaagattgaattggatgcaccatacaatttgctaggtttgatttagttactgcaaga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