Os06g0162800
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Structured Information
| Gene Name |
Os06g0162800 |
|---|---|
| Description |
MADS box protein |
| Version |
NM_001063426.1 GI:115466583 GeneID:4340218 |
| Length |
6478 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0162800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:3161843..3168320 |
| Sequence Coding Region |
3162068..3162101,3162645..3162772,3163565..3163606,3163706..3163747,3163969..3164068 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:3161843..3168320 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggggcgagggaaagtagagctgaagcggatcgagaacaagataagccggcaggtgacgttcgcgaagaggaggaacgggctgctgaagaaggcgtacgagctgtccgtgctctgcgacgccgaggtcgccctcatcatcttctccacccgcggccgcctcttcgagttctccacctcctcctgtatgtacaagacactggagcgataccgcagttgcaactacaaccttaactcatgtgaagcatctgctgcactggaaactgaactaagcaattaccaagagtacttaaagttaaagacaagagttgagttcctacaaacaactcagagaaatcttcttggcgaggacttggttccacttagcttgaaggagctcgagcaacttgagaaccagatcgagatatccctcatgaatatcaggtcatcaaagaatcaacagttgcttgatcaagtatttgagctcaaacgtaaggaacaacaacttcaagatgctaataaagacttaaaaaggaagatacaagaaactagtggagaaaatatgcttcatatatcttgccaagatgtagggcccagtggccatgctagtgaagctaaccaagagtttctccatcatgcaatttgtgacccttccctgcatatagggtatcaagcttacatggatcacctcaaccaatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGRGKVELKRIENKISRQVTFAKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVA LIIFSTRGRLFEFSTSSCMYKTLERYRSCNYNLNSCEASAALETELSNYQEYLKLKTR VEFLQTTQRNLLGEDLVPLSLKELEQLENQIEISLMNIRSSKNQQLLDQVFELKRKEQ QLQDANKDLKRKIQETSGENMLHISCQDVGPSGHASEANQEFLHHAICDPSLHIGYQA YMDHLNQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6220..6253#5549..5676#4715..4756#4574..4615#4253..4352#4119..4180#3143..3227#125..309#aagactgcaagggagagggagagagagggaagcttgcaggctgcagctaactagctaggcaaggagagagaggagatagatcaagaagagattttgagaccgagagagagctagagagagatcgatggggcgagggaaagtagagctgaagcggatcgagaacaagataagccggcaggtgacgttcgcgaagaggaggaacgggctgctgaagaaggcgtacgagctgtccgtgctctgcgacgccgaggtcgccctcatcatcttctccacccgcggccgcctcttcgagttctccacctcctcctggtactactaataattctctcttgcaagctctcgccccttgcagagaattcatatatatctcgccctaattctaatgcaaagttagttaattagtttgcagccaagaaagactagttttctcgttatgagtttttgaagctccttgtgatttctgggctagctactgcccacctagctaccatgttctaattaatcatcagtccgtgtgtttaattaacatctcatgtttgtccgggaagttcttacacccagtcttttccctgctgctttgtttgtgtttaaaacatatatataccagcatttcgtttgtatttgttggaatttttaccaatctttctcaaagatcctgattttagttaatttttaccacctcgatcgtgatcatatacatgctcatagctgattaactaacctgttcctgttgttgttttggttaaagaaagagagacaggacagccgttctagtcacctgatggctgccgatctgtgtgtgtttgccgtcccctaattcctctttacggtttgcagttgccatagagactagtactctgtcaacagaatcaagcatgcaatctctccatgcttgcttccatttgtaggctagagctgcatgctagatatctctaagctgatctcttccatgcttgtctctctagctctttcattagtgcatgcaattttcagagtgaagtagatgagacccctccagatctgcacaagaacatggcatatagtactactagtacgcatattgcatcttaattctcatattgcacaagcacatatactaggctgcagtgccttttccaatggcaagttatttttgtcagatcttaattaggagcatcttttccaatggcaagttgggagggtttcttgctctggttttactgttccattgggaactcgcaacataggggttgttcttgggttccactgttccattgagtctctctctctttctctctagctaggtttctctctctacgtcttgtcaaatgtctcggctgtactagtgtgcatgcgattgcagctgcagaagcaagaggaaaagtagtaatgcagcagcaggaggaaaagtcgtaggagtactcgtggagataagcatctctgtatcgatcgtctcgtcggttgttatcctccctgtggatatgtacacggtccgtgtttagatccaaaataattcatcaaacttttaactttttcatcacatcaaaacttttctacacacataaacttttaacttttacgtcacatcgtttcaatttcaaccaaacttctaagggcccctttgaattggaggaaaaacataggaattttagaggatttcaatcctatagaaaaatttcctatgaagccctttgaaacaaatgattgaatcctatccaatcctttgaaattcctatggaatggacaatcctatagagattttggaggaaatttagcaagagcttcaacctcttgctaactttcctttgagtctatctctctcatctaattcctgcgtttttcctgcggttcaatcaaacggtcattcatgtgtttttcctgcgttttgcaatcctctgttttacacttacattcctaccaaaatcctacgtttttcctattcctacgttttttcaatcctgcgattcaaagggaccctaattttggtgtgaactaaacacagcctagttgtagttgtgtggtacgaaagatcgaattgatttctagctaggcgtggccggacacacacccaagttaattcactgcattcgtaatttcatactcctatgcgattcataatttcacatgcgatgatgcgaatagattgatttgatcatttgaacattgtcatatggtatgcaaacaacttatcgtgcgagaggcgtgcgtgtcgattgccaaaattttctgtcagcgcacagtacaggctagctagtctggaacgaggttgtgtcgatttacaaggcacagttactagctaccctaccgttagggtatgtagtaggagtacttgtgtaccaaaagtttggattggttgaattttccaagctcctagtcacaatgtactccctccttttccctccccaaaaaatatactccttctatccagtatccacaaagaaaataatgtaactctagcatttaaaagacaaattagcaagaagtaaaatgattgggagtgaaattgtggttgggggtaaaatagggatcataatttgaatgaggggggtggttgtagggaaaaatagtactgcactcctttagaattgcacttattttgaaacaaaatctgaatgttagttacaattgtttttttctaaaaaaacagagtacaattttctaataatttaacacaaatcaatcaaatatatacatgtttgtaagtgatagtgtttatagctccaaacagggtttgaaatttcggctcgaaatttcgcccccaccgaaatgttcatatctcgcccgaaactttcggttgtttgcaaatttttgtgaatttggtcaaattttattcaaatccattcaaaatcagtcaaaaattcaaaaaaaatcgtacgaaaaaaaaatctgaaattttggttatatcgcccacctgcggtagaaatccttctttcgaaatttaaaaccctggctccaaacttagggtgcgctgtgcacataccctagaaaatataactgatatatgctccattaattatgaaaggcaaaataaactgatcatgcatatgtaggaaaatcgggttgtatatacatgtatttaaacaacaaaatataatataacaactttaactgatactgcattgaaaatagttttgtggtccactgattttcttttttgtaacagtatgtacaagacactggagcgataccgcagttgcaactacaaccttaactcatgtgaagcatctgctgcactggaaactgaactagtaaccatctgattctgaatatgattgctgcatatgcaattcacctgtaataaactatggttccttaaactttttcaaagaattgaacttaatttggtcattagttgaaacatgaggatctatgtggccaagcatatttttagatctaatgaatcatctctatctgtgcagcaactgctgctagctgttaataaaggagaatcaggcttgttttggatataagttatgtaattaacacaatctggtatacgttgtgataggggctacaattattgtttacaaggaaatatcgatgtgtacactgccatacataatatttaataaaacgtatgtgatatcttaaaattttacataattctcatgttcgtgcatgatagatgtataatatgctagacatgataggttaattaatgtatattttaaacagacttgtcttttaaattacatttttacagtacattctgcgcagggtatattccccttttgaacagcagctatatatgtatatatcgaggacgaaacaagtattatccatgcatgcatgctacatatctactccctccgtttcatattataagactttttagcattgtccacattcattaacatctatatgaatgtgaataatgttagaaagtcttataatataaaacggaggaagtaacaaataagttctgttgtcaactaacacaacaattagcaatatgcagtatgtatatacttcatgatatgccattaccattttaagttttgtctattaattaattaattaatttctcatgtccaatttaattagttctatgccaggcatattccaactcatcaacttttacatagtaatcatgattttctttcaattaatatttggctgctaatttggcattcatatagagcaattaccaagagtacttaaagttaaagacaagagttgagttcctacaaacaactcagaggtatgcacgtgggatcttctcagaaagcttttctacatgttacacacatggactaactctgatcttatgcagaaatcttcttggcgaggacttggttccacttagcttgaaggagctcgagcaacttgagaaccagatcgagatatccctcatgaatatcaggtcatcaaaggtaattacatagtgaaatgaatcatattaatttcgacgcatatttagcttgattcccgcttgacacagtactttatacatcatatacaccatcttatatgttatatattacctatgctctgttttttttttttggttttgttacgcaagtattacatgaaacatcaaattttaacttgatcaaactttgctggtaaatcatttgtatatacatttttacagaatcaacagttgcttgatcaagtatttgagctcaaacgtaaggtaatccatgtgtgtgctgtctttgttttatgggtacgttttcgttaatcttttgactactatctagtccccagaaataataactgataagttttgcaggaacaacaacttcaagatgctaataaagacttaaaaaggaaggtaatatatacagattagtatatatactccatatgtgataaaactccaaacgttaattatattactctctctccggagctgctagccttgagcatgagtatgttatataatttccatgtgcctacgatcgagtcatatcctaca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|
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