Os06g0164000
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Structured Information
| Gene Name |
Os06g0164000 |
|---|---|
| Description |
Zinc finger, MIZ-type domain containing protein |
| Version |
NM_001063435.1 GI:115466601 GeneID:4340227 |
| Length |
10817 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0164000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:3249549..3260365 |
| Sequence Coding Region |
3249843..3250460,3251518..3252375,3252454..3252570,3252654..3252705,3253126..3253177 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:3249549..3260365 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008399:3249549..3260365 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgagcgcggcgccgctgccccccacgccgccgccatcgcagcagcagcagccgcagccgcagggcaaggagcagcagcagcagatggcggtggcgatgaacgcgcgccgcctggtgatgatcggggaccgcctcaggacccacttccgcggcggcggcgggaccgtcctcgagccgcccgacctcgcgcacctcgtctacgccttcgccagagggatcgatttcgctctttctagcggcgatgttcctaccgtggccagtgaaatacccagcattttgaagaaggtgtatctggtaggaaaagatcaatttctgcaatcttctgttatggtgctaatgatatcatgcaagaatgcttgttctgaaaaatggtttcaacccacagattgtactgaaattctcaggatggctaatgagctctctggcaaattctgcacgcctgtcagccagccagataatgacagcactgtgatccaaattatttcaacaataatgccaaggtactatcctcaattgaagtttgaacgtctagtcacttcgctggaagcaaaggttggatatgatgttttaatggccgattttttcatccataagaatgtgcctcgagaggaaaagattaatctaattgttgtgcaaaaggaagacttaaatgcctcatcatgtattgcaaacccgccacatgtgagctttttagtcaatggaaaaggcgtggacaagaggacaaatgtttcaatggaaacaggaccccagttccccactgatattactaggatgctcaaatacggggcaaacatcatccaagctataggatattttaatgctaactatatcatagctgttgcatttctgaataaattggagtcctttgacgctccaaacctaaatgattatgcacaaccagtcgctgctgatcctcctgattctgatttactcgaagggccatctagagtttccctgaagtgccccataagttttaggcgcataaaaactcccatcaaagggcgcctatgcaaacactatcagtgttttgattatgataattacatggagttgaacttgaggaagccgacttggcgctgtccattttgtaatacaccttcaaacttcactgacctacggattgatcaaaagatggtcaagatattacaagagactggagaagatactattgatgtccttgtgtttgctgatggatcttggaaagccatttcaactaatgatgagagatctgatagacattccagtgacgtcattcagcagagtagagatactatggacactgatgcgactgctgatgatgtcatagatctgataaatgaagacaatgatggtgatgtgccaatgagttttacctctgcatcagaagatgtgaagcctttcttgaattgtcaggatctatctgtggcagactatctttcggatttgcctatgaacacagtttcgcaggcagaagatctatatgcaggcggtgcaagccgtggaaacaatgaacgtggaaatgccacttcaacttctggccaaaattcatcactgccttctactggcggtctgggctctagttcattcgggactttggagtctattctgcctcataacattctgcaccctgttatcacagatgcagtctctccttctcttgatacctctaattctgtagttctgagacagcatgtagcacaaggaacacgttctgatattgtgccgtcgcaaccacgaatagatccacagcttagattagaaattgcaagacctcctataccaaggaatgtcgcgagagaacctacaggaattcaggctctgccagtgcaaccacagagagtgcgaccaaatatctacaattgtccacctcctttcccacaatccagtccagcttcagcatatcaagtacatcaggtgacaaacgcagatagtgtcattactgctatgagcactggtattggatcactatcaagggctccagatgctgctccgttattgcaacaccagtcaacacagcaggagattcgagccacgcaaaactatcatcaaggccagttcattgggcttactgctcctcaaaatttcatgggtacaagaccgccgccaggagtcccaggacaggctataggtgctaatgcccatggagctccccccgcacaacagtcccatcacgttcatcggctagtgagcaatctaatgaatcaacttggacaagctacagtggctcaaccttccacagctccacaggtcttgccatctcaaccaggcggcacaagtgcagtcaacccgcagatccgcggtcatcttttccctgcgcaacaacgcagccaagcaatgagaccacaagcagtgccccgacctacaatttctcaggcaccacctcgtgcacagtctcccttcttgccagctactgctcggcctccgagcacacctccccctatcggaacttccgatgatcttcaggagcttcctgtggatgaaagctggcgtcccacagggcagatgagagggagcctgactggtgaagcttacagcgtagcgattggacgctacaaccccagtgtgaacattgctggtcagcagacaagtcatgtgacaagtcaggctcggccagctggtccggatgcgcgcaggtaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASAAPLPPTPPPSQQQQPQPQGKEQQQQMAVAMNARRLVMIGD RLRTHFRGGGGTVLEPPDLAHLVYAFARGIDFALSSGDVPTVASEIPSILKKVYLVGK DQFLQSSVMVLMISCKNACSEKWFQPTDCTEILRMANELSGKFCTPVSQPDNDSTVIQ IISTIMPRYYPQLKFERLVTSLEAKVGYDVLMADFFIHKNVPREEKINLIVVQKEDLN ASSCIANPPHVSFLVNGKGVDKRTNVSMETGPQFPTDITRMLKYGANIIQAIGYFNAN YIIAVAFLNKLESFDAPNLNDYAQPVAADPPDSDLLEGPSRVSLKCPISFRRIKTPIK GRLCKHYQCFDYDNYMELNLRKPTWRCPFCNTPSNFTDLRIDQKMVKILQETGEDTID VLVFADGSWKAISTNDERSDRHSSDVIQQSRDTMDTDATADDVIDLINEDNDGDVPMS FTSASEDVKPFLNCQDLSVADYLSDLPMNTVSQAEDLYAGGASRGNNERGNATSTSGQ NSSLPSTGGLGSSSFGTLESILPHNILHPVITDAVSPSLDTSNSVVLRQHVAQGTRSD IVPSQPRIDPQLRLEIARPPIPRNVAREPTGIQALPVQPQRVRPNIYNCPPPFPQSSP ASAYQVHQVTNADSVITAMSTGIGSLSRAPDAAPLLQHQSTQQEIRATQNYHQGQFIG LTAPQNFMGTRPPPGVPGQAIGANAHGAPPAQQSHHVHRLVSNLMNQLGQATVAQPST APQVLPSQPGGTSAVNPQIRGHLFPAQQRSQAMRPQAVPRPTISQAPPRAQSPFLPAT ARPPSTPPPIGTSDDLQELPVDESWRPTGQMRGSLTGEAYSVAIGRYNPSVNIAGQQT SHVTSQARPAGPDARR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>9906..10523#7991..8848#7796..7912#7661..7712#7189..7240#6994..7092#6829..6913#6689..6737#6541..6608#5875..5940#4616..4667#3590..3672#3377..3442#1750..1815#488..560#133..347#gagccgagcatccatccaaattcccaaaagaggaaactacgctgcgccaccgactctctcgccgccgcaccctcctccctccctccctcgctcgcctccgccgccgcctccgctgcctctccggtgggggccatggcgagcgcggcgccgctgccccccacgccgccgccatcgcagcagcagcagccgcagccgcagggcaaggagcagcagcagcagatggcggtggcgatgaacgcgcgccgcctggtgatgatcggggaccgcctcaggacccacttccgcggcggcggcgggaccgtcctcgagccgcccgacctcgcgcacctcgtctacgccttcgccaggtacgccgcccaggggttcccggcttcgccccccccctccctccctccccttcttgtgattgttagggtttatggccggctaccgaggccgtttcgcgggaggcgattgtgtgacctattcgcgttgtttgcgcttgcagagggatcgatttcgctctttctagcggcgatgttcctaccgtggccagtgaaatacccagcattttgaagaaggtaagcgtgtctcctctaccagacaatttcccattgttttttttagttcgttcatcttaatatggacgtttattgtccaagtaggggagcaatggatgcgataattgaccgccgagagcttcattatttgcgcagaattgctattcttagtaacgatttaatgatttgaattcattatcgaagcaattatgaagtagctagagttcacatactatataaatggatgtttttaaatgtaataacttctacgtttcattgcatgctaattgttattgtgcccatggcccaatggtgaaccgcatagtaaaatgacatatcgatcagaatagcacattggaatttattgacgcatggtaggttggcaaaatcattctggaaccaccaaactatttctttaaaattgtcacagcatctgcagtgtgaggaaaattttatagctcatagttaaatattgacacgtatgataatatggagagagtctaacttggcaagtgaggtaataatttcccccctttaagcagtactacagctgagaaaactactttttttttaaagataacgagcaaacccttatgtttttattttctacgttcctaagaaactgttgtgtttttcttgtttatgtgattcttctgaactttaaaagatgaaggtatcctactatttgaatggatagcctccaaaagaatcaatacgacatattaatagttaaagcctcatttgtcactgctcgcaaaaacacacaattgtagaaatccttgtgttacatggcacctcctgatttcccatatctcaatttcctactccatgatttcccttggtacactatctggtacctgtgaaatctgtgatgccagctttttccctccaaggcagcactattttatttgatagtgccatctgcctagcatcacattccccttttacttgctgtcgtaaactagcattggctgcctgtctccttaaatgctaacgacctttaaagtagccggtaggacttaactgtttctgtactttccaactttgttatgtgaggcaatgaacaaattattagtgcaactaccacctttgagtttgaactgtttatttttggccttttgcacaaagagggctccattttttttagtgaagccaggtattccaatttaattgtgtgttattgatcggaagtttaatgtttatttaccaggtgtatctggtaggaaaagatcaatttctgcaatcttctgttatggtgctaatgatatcatgcaaggtaaatgcttcttctcagtcatagacgagctatggtaagagcttcttttagccaaaataatccagtcttttgatcttttttggtgtctgcatacataccaacagtttatttgtttcaaactttcaatccaatgtttgctctgctcagtggcgggggacggacaaaaaatgaggcatggcaaggccgtgagggctaaaatccttatcattcgagattgcacttataatagatcaaagttcatattatgaacatgaaacatatagcgaaaaaactacaaagtaataatatgatatcgaaaaagctgcacgctaaacgaaaacgcttgatgcaaatattgtggatggagacttagtaataatatgatatcgaaaaagctgcacgctaaacgaaaacgcttgatgcaaatattgtggatggagactttaaaagtaaacttttaataagaattttttaccataggttacctactgtaacaaccgacaccatgccgctagactgcagattctgcagtgtcatggtctttgggccgggcatcctaggcccattggataggattagggtttgttaggattagataaggtttgttaggattagattaaggagtcctccatctatataaggagggatcctatcctagatcagtgaagcattagatcaagatttatctcagtgcccatcggcctgccttctcagtgcgacggagaacgtcgcgccgtttaggttcaggaccattccttgttacttcatctactataatccaatctacccccattcatcccgattcttctccacaaatcctagatcgtgacatgcagctattctaatttctatgatatagtatatgattctgcatccaacttcaatatctactaatccatcaaatacatgaaatttggcaaactaccaatgttttatttaacagtgatagatggatgctagaaaattggggtcttgttcctctattccttgtttcgtttctttctttcatcgaaaaagctcccaactaagctactgctgcctagctccacacgtgagcgtggctcgtactgctagccgctgccgacttccgtcccagtctccaggatgcaggctcaccggaatgtacggcgccgtcgaagccatcgcgtcagccgccgtcacaacttgctcgatgagaaacattagacaaatacacgacacaagtggaccagcaatggtttatgatttggccgctgtggcccagcgggagcgcggtgagaggggctggtactcgtggtcgcggccggcacgaggtatggtgtgcgccatgcctcgccctaccgagcgctccgctgctggctctgcttactacctttaatgtctatacaacaataaccatcttagctgttagtcctacccatcaatgtatttgtttagtttccaaatgcatactcatgttttattgcgagatgtttcaacaaaaagttttatatgtgatcatatgcccaagttgtacaatttgtctttttgacctgatatctcccaatgtaatatatctgccacccaaaaaataaaatagtaacctgtgcttgctgttttgtagaatgcttgttctgaaaaatggtttcaacccacagattgtactgaaattctcaggatggctaatgaggtgtgtgaaatgttttatcccgttactattaattatgttgattctttgttatgatcactttcgttattttgagtttatgtttgttatggtaatggcatgtccttcagatattagcttgcttagtcataatttttgcttttcatgcagctctctggcaaattctgcacgcctgtcagccagccagataatgacagcactgtgatccaaattatttcaacaataatgccaaggtagtgactatatctttctttcacacacttgtgcatggataagaattttaaaaagagtaaatgcactttgggccacatattcttaccaaagtttcactttggactacccttatagtgatttttttcactttggaataggtagtgttaccaaatgttgtatttggaccgggtggccaacatgtcaatgagactaaccacctctctattgtccatttgtcacttacatgtgagccacccggtccaaagtgaacatttggcaacagtaactagtccaaagtgaaaataagaattgtaagggtggttcaaagtgaaactttggtaagaatatgcggcccaaagtgcaatttactctttgaaaaatatgttacaaatttcttatatggattttatatccaataatcaagatttttaaattcaaaatgacatgtgaaattttcttgttcaaggtgacgtgtcaaatcttcaataactgtttctttaaatgtattatggggctgactttttgatgtgacgtttgaccattcgtcgtattaaaaacttttgtacaaacatgcaaatatatgacatgcttaaagtaccttcgatgataaaacaagcctagttagtttttttttaataagaagaatggtcaaacatgatgtccaaaagtcaacagcatcatatatttaaaaacggaggtagtacttaagaagtacattgaaagaaacttggacttcaatatttgaatgcgaagtctatattccttttaaaatagaactagtatatttcaaaatttcgaagatattaaattgaaagttatattctgcgatctcagttaattaggtaattatgttagtattgagaagtaatctaaagtattttagtctgtttatgtacaatattttaattttcagttgaactaaggtgatcctgcttttatttctgttcctcaaaaatcctataggtactatcctcaattgaagtttgaacgtctagtcacttcgctggaagcaaaggtagtcaatctggtgttgaagacaaagtttcagaaattgatctgataaatgttgatgattcttttctatgcaccagttttttcgaattcttagatcctcaccatgggttaggtccatccctattttctggtgtaggatggttctat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