Os06g0167100
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Structured Information
| Gene Name |
Os06g0167100 |
|---|---|
| Description |
Armadillo-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001063453.1 GI:115466637 GeneID:4340249 |
| Length |
9825 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0167100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:3375577..3385401 |
| Sequence Coding Region |
3375766..3375809,3375907..3376209,3376308..3376449,3376825..3376998,3378048..3378227 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:3375577..3385401 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008399:3375577..3385401 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggacctcgccatcaaccccttctcctccggcacccgcctccgggacatgatacgggcgatacgcgcgtgcaagacggcggcggaggagcgggcggtggtgcggcgggagtgcgcggcgatacgggcggccatcagcgagggggaccaggactaccgccaccggaacatggccaagctcatgttcatccacatgctcgggtaccccacccacttcggccagatggagtgcctcaagctcatcgccgccgcgggcttccccgagaagcgcatcgggtacctcggcctcatgctgctgctcgacgagcggcaggaggtgctcatgctcgtcaccaactcgctcaagcaagatcttaaccactcgaaccagttcattgtggggcttgcactctgtgctcttggcaacatttgctccgctgaaatggcgcgtgatctgtcacctgaggtggagaggctattgcaaagtagggaaccaaataccaagaagaaggctgccttatgctctataaggatcgtacggaaggttccagatttggcagagaacttcatgggctctgctgtttcactactgaaggaaaaacatcacggggttctcatatctgctgttcagctctgcgcagaactttgtaaagcaagcaaagaggcattggagtacctgaggaagaactgccttgatggtttggtcagaatactgagagatgtgtccaatagttcatatgctcctgaatatgacattgctggaattacggatccgttcttgcatatcagagtgcttaagctcatgcgaattttgggtcaaggagatgcagattgcagtgagtttgtgaatgatattcttgctcaggttgcaacaaaaactgagtcaaataagaacgcaggaaatgctattttatatgaatgtgttgagactataatgggcatcgaagctactagtggtttacgtgtgctggcaatcaatatcttgggtagatttctgtccaaccgtgataataacatcagatatgttgctctgaacatgcttatgaaggccatggaggtagacacgcaagcagtgcagaggcatagagcaacaatattagagtgtgtcaaggatgctgatgtatctattcgcaaaagggcccttgaacttgtttaccttcttgtcaacgatgcaaatgcaaaatctttgaccaaggagcttgttgattacctggaagtaagtgatcaggacttcaaggacgacctcacagcaaagatatgctcaattgttgaaaagttttcccaagataaactttggtacttagaccagatgttcaaggttttatctctggctggaaattatgtgaaggacgatgtatggcatgctctaatagtcttaataagcaatgcatctgaactccaaggatactcagtgagatcattatacaaggcattgctagcttgcggtgaacaggaaagtttggttagggtagctgtatggtgcattggtgagtatggtgaaatgctggtgaacaatgttggtatgctggacatagaggaaccaatcacggtaacagaatctgatgccgtggatgctgtagaggtctctcttaaacgatactctgcagacgtgacaactcgggctatgtgtctagtatctctcttgaagctctcttcccgattcccaccgacttcagagaggataaaggaaatagttgcacagaataaagggaatactgtgcttgaactacaacagaggtcaattgaattcaactccattatacagaggcatcagtctataaaatcatctttgcttgagcggatgcctgtgatagatgaagctagttacttggctaagagagctgcttccacacaagcaactatttcatcagataaattagctgctgcagcaactcctggaagctcgcttaagcttccaaatggtgtagcaaagccaccaccggctcctctagctgatttgcttgatttaagttctgacgatgctcctgcgactacttccgcccctactacagcacctaatgatttcctacaggatcttttgggcataggcttgactgatacatctacagcaggtggagctccatcagcaagcacagatattctgatggatcttctatcaattggttcttctccagtacaaaatggcccaccaacagtatcaaactttagccttcctggtcaagctgagactaaagttgcacctgttacaccccaagttgtggatcttcttgatggtttgtcctcaagcacatctctttctgatgagaatacagcttacccgccaatcacagctttccagagtgcagctttgaagatcactttcaattttaagaagcagtctggaaaacctcaggagactacaattcatgctagctttacaaatttgacatctaatacattcacggatttcatctttcaggcagctgtaccaaagtttatccagttgcgtttggaccccgctagcagcaacacgcttcctgccagtggaaatgattctgttacacaaagcctcagtgtcacaaataaccaacatggacagaaaccccttgcgatgcgtatccggataacttacaaagtgaacggtgaggacaggctggagcaagggcaaatcaacaattttcctgctggattgtag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDLAINPFSSGTRLRDMIRAIRACKTAAEERAVVRRECAAIRAA ISEGDQDYRHRNMAKLMFIHMLGYPTHFGQMECLKLIAAAGFPEKRIGYLGLMLLLDE RQEVLMLVTNSLKQDLNHSNQFIVGLALCALGNICSAEMARDLSPEVERLLQSREPNT KKKAALCSIRIVRKVPDLAENFMGSAVSLLKEKHHGVLISAVQLCAELCKASKEALEY LRKNCLDGLVRILRDVSNSSYAPEYDIAGITDPFLHIRVLKLMRILGQGDADCSEFVN DILAQVATKTESNKNAGNAILYECVETIMGIEATSGLRVLAINILGRFLSNRDNNIRY VALNMLMKAMEVDTQAVQRHRATILECVKDADVSIRKRALELVYLLVNDANAKSLTKE LVDYLEVSDQDFKDDLTAKICSIVEKFSQDKLWYLDQMFKVLSLAGNYVKDDVWHALI VLISNASELQGYSVRSLYKALLACGEQESLVRVAVWCIGEYGEMLVNNVGMLDIEEPI TVTESDAVDAVEVSLKRYSADVTTRAMCLVSLLKLSSRFPPTSERIKEIVAQNKGNTV LELQQRSIEFNSIIQRHQSIKSSLLERMPVIDEASYLAKRAASTQATISSDKLAAAAT PGSSLKLPNGVAKPPPAPLADLLDLSSDDAPATTSAPTTAPNDFLQDLLGIGLTDTST AGGAPSASTDILMDLLSIGSSPVQNGPPTVSNFSLPGQAETKVAPVTPQVVDLLDGLS SSTSLSDENTAYPPITAFQSAALKITFNFKKQSGKPQETTIHASFTNLTSNTFTDFIF QAAVPKFIQLRLDPASSNTLPASGNDSVTQSLSVTNNQHGQKPLAMRIRITYKVNGED RLEQGQINNFPAGL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>190..233#331..633#732..873#1249..1422#2472..2651#2998..3152#3942..4032#4456..4619#5224..5278#5377..5499#5593..5688#6139..6266#6840..6944#7040..7329#7560..7670#7751..7828#7920..8092#8625..8729#9450..9545#ggcctcttcgcaaatcgcaattcccaccaccaccaccaccaccaccatcgccaccgcctactcctcctcctcccagatccacccggccgccgccgccgccgccgccgccccccacgccccgcggcggcgagatccctcccccgtcgccccaccctggattccgtcgagaagatcgtcgaggacttcgccatggacctcgccatcaaccccttctcctccggcacccgcctccggttagccctctccccctcgcctcggatggatcaccacccgcgtctcctctcgtatcccctcctattcctcagatccgcgcgcgtggttgtggtgcagggacatgatacgggcgatacgcgcgtgcaagacggcggcggaggagcgggcggtggtgcggcgggagtgcgcggcgatacgggcggccatcagcgagggggaccaggactaccgccaccggaacatggccaagctcatgttcatccacatgctcgggtaccccacccacttcggccagatggagtgcctcaagctcatcgccgccgcgggcttccccgagaagcgcatcgggtacctcggcctcatgctgctgctcgacgagcggcaggaggtgctcatgctcgtcaccaactcgctcaagcagtatccacccatactatacttatgctccatatctgttttgatttttcttagaatgctatgttctgctttgagcatttggtagtacttaacgcggacagagatcttaaccactcgaaccagttcattgtggggcttgcactctgtgctcttggcaacatttgctccgctgaaatggcgcgtgatctgtcacctgaggtggagaggctattgcaaagtagggaaccaaataccaagaagaaggtatatgtttactttagacttgatgttatagtttctactgaagtctgtttttagcatgatgtcagtatgtccattccatgagtcttgttctgtgtttattagtacttgtaaatcgtaataatgtaatgtgataggttaatagctcatagcatatgctctgggtaagttagcaaaggtcaatttgaactcaaacaatcattctttgttttgtgggtgttgtcgtctataccatcattattcaaagcttattacatgtcgagccttttatttccctgtcgtttcaccctgcaaaggtgtcttgcctttgttgtttttggttctgaaatacttgaggtgaattgtcatactaattgtacaggtttggctgttttgtaggctgccttatgctctataaggatcgtacggaaggttccagatttggcagagaacttcatgggctctgctgtttcactactgaaggaaaaacatcacggggttctcatatctgctgttcagctctgcgcagaactttgtaaagcaagcaaagaggcattggagtacctgaggaaggtacgatgcattctaggaaccgttatattttttccttggacaatgctgcctattaccttctgtttgcattctcaaagttactatgtaacaaattacttattttcatctcctctttccatattaacgcataccctttcagtaaagcccttggaataataccaaactgtcttatttgtttcagtttttttgctcttaccaatcatcagattcttgatatctaattactgccagctgccactctactgtctccgatgcccaaattactgacttgaaacttatacctttttgaacgtatcaagttaaaatcatacgagtattgttgatttagtcttgttgaaccatttgttgctttcccagtgtggtatttatgatgtttgaacatccaaacatccatgtgtaggcacaaatagtagataatagggtttctggtgatgtgtctgttgaggcgttgacacacttgctgtatatcttttaactgtacaaaaaatcctttgtccgatggttttatgatgtttggtgggaaagctgggaatgcagtacagtccccaagttcctgtggtcgtggttgataggaagactagagatgatgtttgccgaatactggaagtgcagagtttggtgattttattcgtttcttctgaataatgaattattccggctaaaggttggaatcaccaccatagaattttcagatccatcagactagttaacagttgggacttgggactaataacctatggctaaatccctgcttatttagcatcctatatattccaaactgtcaaccccaattcctgctcctcataattcatttgatgatgcattgagccattgacactacagagtcgtttaaaagcattagtataatagttaatcattgtttatgtatgtgacacttgacccaataccatgttcattgaaagaggcaggatttttttgtgttctatcgcatagtgtgttcactttgttggttgctgatacctacaatatcatatcaaactaatgtattcatttgcggcagtacttctgataaaattttcgttctacagaactgccttgatggtttggtcagaatactgagagatgtgtccaatagttcatatgctcctgaatatgacattgctggaattacggatccgttcttgcatatcagagtgcttaagctcatgcgaattttgggtcaaggagatgcagattgcagtgagtttgtgaatgatattcttgctcaggtgaattgtttgtttttattttatacacaacagaaatttcactatgcaaatcacatctgttctgatcattttgtagacagttcatgatcattacaccctcacaaattgcattattattaatgtattgtaaatcgaaatgagcgtcttcagtggtactaatcccagatatttatttaggtcttgtagcattgttagtttgttactcttggattaagaactcagtgatatgattatgtttttctcattgttgaattattcttttagtaaaccatgttttttgttgaagtcttctttcccgcagctgtgctctgtatcttatatcgaattatttgcattgcatttccaggttgcaacaaaaactgagtcaaataagaacgcaggaaatgctattttatatgaatgtgttgagactataatgggcatcgaagctactagtggtttacgtgtgctggcaatcaatatcttgggtagatttctgtccaaccgtgataataacatcaggtaattcactcttttctcttggacaactgatgttcaagcctcttaacttttgtgaataaagggtttaaagtaaaagtttgctagttaattttcttgtaattcaatgggttacttaccctgagcattgttccaaacttcaaggtactactgcttggtgcttatgattgactatgaattggactattacttttgtactccctcatattataggagtaagttgtactatgaattggaccaagtttctatactcctttaaaagaccctaattgtggtggtgagtggtgaatctgccaccacctaccaccactaccttgtgggtccccaaatagtgagataggtggacttttatcccttccccaaccagaagccatcacacaaggaaaatttattttaaagtgatatacaaaatgatgaaaaatatgatgtgaatgatttacaatgggaccattttatttaatgtttgaggttttaaagtcttcttttaattcccgttgcaacgcatgggcattcagctagtataggaaaacgtagcaacattccgtacccaaaaaagtatactacaaaaatatattcaatggtggatttagtggaactaatttggttttgtagattttactacattttcctataaacttggtcagacttcaagaagtttgacttaggacaaacctaaaatgccttctaatatgaaatggagggaataacacatttgtatgatttaggtgttttgactagtaaaatattcttccatatgagagataattctcagtgtgcatactgtgctttcagatatgttgctctgaacatgcttatgaaggccatggaggtagacacgcaagcagtgcagaggcatagagcaacaatattagagtgtgtcaaggtaaattctccagttaatgtgctctggatttattctcattcctctagggaagtaaaataatgctcatgtatgtaaaattctgagacacacctatggtagcttcctgaaagtatactgtttatttccgcacttcttgagactacagctaatcataactagtgacaagtgcagaccatcctcctttcttgcatttctagtcaggtttagccgagtgcattaaggaaaatttcttctgcttgatcccgtagtaaatgatgattgcatgatcattttaaagaaaaaaacagcattgccatagtttttatgtctactgcagtttgcgttgttgatgtgcctactattcactttcactttattgttaccagatttcttgttccttttcttttacacttcaataattcgtaactgctgatgtttttccaggatgctgatgtatctattcgcaaaagggcccttgaacttgtttaccttcttgtcaacgatgcaaatgcaaaatctttgaccaaggagcttgttgattacctggaagtaagtgatcaggacttcaaggacgacctcacagcaaagatatgctcaattgttgaaaagtaagacttgacgtagcataaccccctccttatctttttttttactgaccgacttgattcagggtcaatttttcgtggatgtcatctctactagttttgtaagaactcttagttgcatattctgtaaatgtttcaaaggtcctttgtatcctgttgttacatgc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