Os06g0171600
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Structured Information
| Gene Name |
Os06g0171600 |
|---|---|
| Description |
Tetratricopeptide-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001063470.1 GI:115466671 GeneID:4340267 |
| Length |
7649 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0171600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:3587218..3594866 |
| Sequence Coding Region |
3587399..3587537,3587931..3588040,3588131..3588196,3588302..3588419,3588508..3588563 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:3587218..3594866 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MYKGGILWFHNLTEFPHGSSGLVFPTLVAGLHYLNIQIAFHGTH TKHYPGIFGVLAKYYRVYLEILTIPLFLIGYVIPQGSLVYWTTNGLITVAQQLSLKND AVKKVLGLPDTRAHQKFPRVGHKMMQERPLEDAHMHTNLTSTNNETANNIMEGKVSAS SSPEELLEQALQHLETGNQDQAIPLIRTAIEKDSSLYVALIGMGQTLFSNRLFPEATV CFEHAIPKIEEQDPLLVLACYGAGLSRMRQGDSKMAIENLQRLAELKEPEKPINKKCY YQGLVALGSILINEGRKSEAVKFVQRAVAYDPNCEIYLKECDDTTEDKPKSAEH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7330..7468#6827..6936#6671..6736#6448..6565#6304..6359#6092..6211#5823..5921#5368..5415#4440..4505#3387..3446#2696..2797#1891..1899#acgacaaaccacatggcgcttccgcttcgcctcctcggccgcctcgccggcggcggcggcggcggcggtcggcgcctcccgcggccgctggccgtgctccaccaccaccacctctccgcctcggatccaagccccaccacccgcgcgccgctgctcccgtcaccccctcgcttgccgccgctgctagtccctttcgctgccgtccccgcgcgaagcttctcctggtacccccgctcgccgccgccggccggccccgccgcggcggagaaggctcccgaggaggacgtgcgcgccgagggggaaggcgcgtacctgcacgacgcgggtggtgctgatttcggggaagtggtcgccaccagcgcggcgtcggcggatgcagccggagtagccgccgcaggagatggcggaagcgcgtcggggttcgctgtcagctcgctgattgacatcctcgacggatttcataacctcaccgggatcccatggtatgcgtccttcgctgtcgttactgctcttgctgcaattggttggaactctaggccccatttgaaatgtgggagctctccggtttagtaatgggggaaactgatatgtttgctgtaaatttcgtacattttaaatgagctcttcattggtttagttggtttgaatacctctgatgtagtgtgctttgtttttttttaaaaaaattctctcatatagtgtgttgtggtgaaagggaatcatactcaatctctagttctctacttagttctgtttctaccttttatctccaaatgacacgggtataccaattgtatatttgtattccgtgaagtcttgatcacaaatgttatatcaaagcaactaggttgttctgttccctccaaaaaaaaaactaggtggttctggtgttttgaatcactgtaccttgtttggtatttgcaagtgttgtgatttcgtacatcttgaattgagtattctggatcctttattgtaggtggataacaatttctctgtcaactgtggccatgagactgttgatacttccagtacttataacacaaattaagaaggctgctaaaattggcaaactattaccagaatgtaagttctaaatttgttttgcaaactgcaaactgtgctttctcatatcatagtaaaatcattacaatatactccctctgtcccaaaatataaaagattttggttggatgagacatattctgtccaaattcgtagtactataaatatgtcccatccaactaaaatcccttatattttggaacaaagggagtattgtctagcttatccctgtaacgtatatgattaaatggttcttttttctttgagaaatttatttctaaatttccaattgattcatctacgtttaccatatccaacaaaatactttatgaatactaaactcttccagctgtaatagtgattattctattctatgtcaaaatgcttattttaggtttgccagagccttcattttagtcatacagctgcccattgaactcatattctttacatttcttgcttgtgtttgtgtctgattccactcatatatgtccttttaaagtgcctcctccattcccacctcctctatcaggaaggagctttcgtgaccagttctctctctatcagaagaaaaggcgagaacttggttgcccttcctttctttggaactgggcctacttttcaatccaggtaatgattaaaaaaatgttaaaaggtcttctatccttgatattgtctaataatagctacgaatcttacattggcatcataatttgttttccgaattgttcattattgtttgttgtatacgcagttcccgtgctttatactgtggatgtcaacaataaggactatgtgtttgagcaatcaccctggactagataatgtatgtacaaggtattttttttattatattacacatttgtactagcagctatactttattatatgtagtgttcccccctgttttataaccattcatgagctacgctcatttttagtattgttttgatgctttaaattccattgccgaaggtcctttataatttcatatgctaaaaaaacatttctattaattaaaattatgatgcgtctttttagaattttaatagaataaaaactttgtaatatttttttggctatgcctttggcatgtttgccggatcaaatggaatacagttaacaaatgctgtcacacatgcattgggtcatttagccctgaaaaattaaaatgcgatgtggaattgcaaagaacgttatttgtactatattgtccaaggtgacttagactattctttcaaaagagctagagcacataatatctatttaagttgtgatacaaataggtactggtgacattgtgagtcagaagtacatttcaccatttttataaaagcagcaaatgagttgttttcatgtttaaataaaggaaaccttgtgaacagagcatggtaagtaaatggccattaaacttggtaaatttgttttttttttgttgccataagagaagtttaattttctttcccatttctatgaatcagatgcacaattgcaaatgttcaaggtttctggttcttaatacaatagatatattcacattcttatactgtctactccattttaatttatttattttattttgaccttcttcaggtttaaccttttgttttcattttttttgacaattatacagggtggtattctgtggtttcataacttgaccgagtttccacatggttcttcgggccttgtttttcctaccctagttgcaggtctccattacttaaatattcaggtattctccgtgcagtttttgtttcatatgtcgtgtttaatatttttttctttttctagtgtgaccttttatcatgtaagtctaatgcctaactaatagaagttataaaaggctgatgaagtaaagactatgcttgcttgcttctatttccttctcgtaggctttcattttgtcataattgatttgatgttgcatatatcatactgagtcgtgcaaacacccaaagctgatgatatccttctgcaaagttggtataaaccatcaagaccaaaaagaggttactgagaatagttgatatagctgcccaataggacaaaattcaaatttaaatctacaaatctgcaactgctctaataaatatagggatttccattttttgtacattaggggcttcaaataatgctgttgctgattttaatttctgattggttgctgacttcatctgtcttatggtggatggagcacaatgtagtttgagaaataagtctgaagtcccactatgaattgacctagagctacttagttttgatcatgttgatgaagctacatattttgatcatgttgatgactgtttggtttgttgtctcagattgcctttcatggaacccataccaagcattatccaggtatttttggcgtactggcaaaggtatgctcctaaaaccattgatataatgcacgtaagctgtagttgtcacaagttccccagtaaattactagcataggaaactggcttgttatcaagatcctgtcatagtaacatcggagattgaaaactcaatcagaaaatttcatggtattttacttgtttggtggaaaccagtggtggataaatgcatacagttgtgtggtttaattggtgaatataccaaaaatataccaagaggttttcttctgtagttagatcatacagtgtcgaaattctcagtgcacccattcactgtcaaacggcacaattgttataactgtacaatggatgttatattggcgtgtgcatgttggctttgcctctgtactggttcttcctagtgggtgctggtagtatgttgttgattaattgatttgggtggtgtttgttattaaatgttgtttggggttagaaattgtaggatgtgtaaatcagatacagagaaaggtaattttgatttaaactgaccagttaccatcaagtaacagagagaagcgattttattcataccaaccagttgaccacagtgtaattggccaggttttgaaactgatgagtactgggaaaaaaactgcaaatcggttattgcaaccctgtatgggctaacacgcttactggaaacctttgcacactgggaagaactgcatatcgatttttgcaacctgtactggcacatgctagttttgtatttgacaggtctttactttcttgtcaaattataagtgagaacaagttatgctgctatctctaaagattcttgagaggcattaggcatgaattatgtttggtagtttagtggtcctgaacttggtagctacaatagggcatcaacaatattttatttggtccaataatgttcatcaaaatactgtgaatttagttccacgacaattgttatattctagctgctgtttccttttctccttctgaatgtattgctatttttatttgcagtactacagggtataccttgaaatcctgactatccctttgtttcttattgggtatgtgattcctcaggtcagtttcttgcaaattgttttatttatttacagatgaatatcatggcatcatgcacatcagaatatcagattgataaatatgtgcaaggttcgactttctttatgctacgttttgatttagattgatgagattaaatcaaatttgcttaactattttcttggaggttgttaactgctgcaaattttgagtgtcagaatagtgattagtagcttcacttaatcctacttgctgtcagcctgtcacaagcaaaccgggaaaaatgtagcccatgggatgaattaagatattgcaatggtaccatgtgcaagcatgatattggattacttttcaaactaatataagcacg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