Os09g0244000

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Gene Name

Os09g0244000

Description

Reverse transcriptase, RNA-dependent DNA polymerase family protein

Version

NM_001069188.2 GI:297609093 GeneID:4346485

Length

6999 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os09g0244000, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:3890924..3897922

Sequence Coding Region

3890924..3891954,3892367..3892750,3892863..3892908,3894754..3894834,3894913..3894993
,3895068..3895169,3895248..3895337,3895420..3895500,3895576..3895677
,3895753..3895842,3895923..3896003,3896079..3896177,3896275..3896610
,3896697..3896783,3896873..3896965,3897051..3897284,3897344..3897588
,3897736..3897922

Expression

GEO Profiles:Os09g0244000

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggcgagggggccaagacgtctacggaagttgaacctagatgcacagagcgcaggacatgtgcaagctgaagaagaaaatttgctgtacaactttgaagctctagatgaagcagatgcacaattcaatgacgataatttgcatctcgaagctcaagatgcagggaatgtacaacccacagaagataggccaaatggggaggtacgacgggttctaggaaattttaatgtaaaaaacttggaccaactgaagcaaggaaaggtaattgtagagacggatgaacatggtattccaaatgatagatcaggttctgttctaggctcgtatcttggtaagcttgcacagaattcaacatttgcaccattggacattccaaaatgggaccatgacttatttgtgggaccaaaggagagcatagtcgctgacgtggagttattcatggtaaagatgaaatttgtgtacccttctgagacgaagcagcttacaagagactggattctaatgaaagctgataaagggtggagatcttacaaaagccgtttaaagggaagatactttaatcctgatgtgaggactctaaacgatatattaaaatatgtcccaaaaggtgtcaatggatatcaatggcgtggtcttgttaaaatatggtgtcaggataaacacaagaaattatgtgagaaaaactctgaaagcgcaaaacagcagaggaatccacatacaactggtagaaaaagccatgctaggctttgtaaagagatggaagcaaaagttaaagggaaggtccatgacattgacgtatgggatgaagcacataagaaaaaggatgagcgcattaaggcagtagtggaatcggcttaccatgaattagctaaaaagaaatctactagttgcagtggtctttcatccaaagattatgatgaagtttttcgacgtgtagttggaaaagagacaaaacttcgagggtactacgatcataagaattggagccaaataagggtttctcaaggactagatgttgttggacaatctgaggaatatgcaatgcttaagttacaaatgaatgcaatggaaaataaaatagaggctatgagtgttgatatgactctgatgcgtgccttcatagaacaaaaattccctggagaggattggagaaatattgtggttgcagaacaaaataaagaagttgatatttctgaacaagttggtaatgatatccaacatgaatccaatgttgaagaatcatgtgaacatgtacattctacaccagataatgtgcaggtgcagaagcatttaatcagttatattcctgctaaaaatggttgccacaaaccatctgtaccacatgaacacatgattgccaagcaatcaagcattggaagctttgctagaaggtctgaagctagtcagagatacatggaatcaactatggcacatgaccatggaactgataaggttgatatgtttgatcaagttgacattgactgtacaaatgaatttgataataactttgataattcatttgccaatacctatgctaagtcaaatcatgtgcaacaagtacattctattagttctgctaatggcaatggtcgtcgtttcaatccatctataccatatgaatgcacaaatgctaagcaactaagtggggaaagcttaggcaaaaggtccataacaagtcaaatgaatgtggaatcaatggtgccacgtgagaatgtgaccaatgaggcttatgtttctgaacaagatggtactgatattatgaatgggtttgttcacaaccgtgaggaaccacatgccaatgagaatgctataccaaataatgtgcagcaattatgttctgttagttcaactagagctaaagagaattgttctactaaagctttgccatctgaccacataactgcaaagcaatcaatcattaaaagctctgtcaaaaggactagaactaactgtgtggattcaattttaccacctgataaagccaaacaggatcgtcgaagcggggctgtgattgggactggtcatcgccgtaaagccaatcctgatacttctgttcctaacatgacaccttctcttgatgaattatctacacccactcctgctccatcaccaccactccctatatcacctttcccacatgtatacactcgtcccacacaacccagagagcatctatctactcctacctcctcggcaagtcctgacacccttgtttttgatgaatctaacactattgatgagtcacaggttggtcctaaatgtaatctacgagatcgaactactattgcagctcctgaccgattgggttttcctcatgtgagtgttgtcattccagagccatccacctaccagcaatcttctactattccagaatggcagcttgctatgtctgaggagctcgttgctcttgatcgtatagcggctgggttttcaccaagtgaacatgatcctgctttgtttattcatctctctccacgtggacgtactttgcttctcctatatgttgatgacatgttgattacgggcgatgatgttgaccacatttctcatgtgaagaggcaccttaatgagcaatttcaaatgactgatctgggtccccttagttacttcttgggaattgaggttttgcattcagcaaagggatattatctctctcaatccaaatacatacaagatcttattgtgcgttctggcattactgataataggacagttgcaacacctatggaccttcacttgcaacttcgtggtactgatggtacacctcttgaggatccttctcattatcatcatatagtaggcagccttgtttaccttaccgttactagacttgatattgctcatgccgtccatattttgagtcagtttgtgagtgctcctacttcagttcattttggacatttgcttcgtgtgctgcgatacttaaggggaatatcatctcagtgtttgttctatgctcgtgatagtccgcttcagctgcatgcttactcagactccacttgggcgagtgacccaacggatcgtcgttctgttacaggttattgcattcttcttggctcttcccctcttgcatggaaatccaagaagcaggcggttgtatctcgctctagtacagaggcaaaacttcaagcccttgccactaccacgtctgaaattgtatggcttcgatggttgttagttgactttggtattgtctgtggtgcccccacacctcttctttgtactggagccatacagattgctaatgatcctgtgaagcatgaacttacaaagcatattggtgttgatgcatccttcacccgatctcattgttatcagaaaacaattgctctccagtatgtgccctcagaactgcaagtcgcggactttttctctaaagcacaaactcgtgagcagcatcgtcttcacttgctcaaactcagtgctttagatcctctacttccgccttga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MARGPRRLRKLNLDAQSAGHVQAEEENLLYNFEALDEADAQFND DNLHLEAQDAGNVQPTEDRPNGEVRRVLGNFNVKNLDQLKQGKVIVETDEHGIPNDRS GSVLGSYLGKLAQNSTFAPLDIPKWDHDLFVGPKESIVADVELFMVKMKFVYPSETKQ LTRDWILMKADKGWRSYKSRLKGRYFNPDVRTLNDILKYVPKGVNGYQWRGLVKIWCQ DKHKKLCEKNSESAKQQRNPHTTGRKSHARLCKEMEAKVKGKVHDIDVWDEAHKKKDE RIKAVVESAYHELAKKKSTSCSGLSSKDYDEVFRRVVGKETKLRGYYDHKNWSQIRVS QGLDVVGQSEEYAMLKLQMNAMENKIEAMSVDMTLMRAFIEQKFPGEDWRNIVVAEQN KEVDISEQVGNDIQHESNVEESCEHVHSTPDNVQVQKHLISYIPAKNGCHKPSVPHEH MIAKQSSIGSFARRSEASQRYMESTMAHDHGTDKVDMFDQVDIDCTNEFDNNFDNSFA NTYAKSNHVQQVHSISSANGNGRRFNPSIPYECTNAKQLSGESLGKRSITSQMNVESM VPRENVTNEAYVSEQDGTDIMNGFVHNREEPHANENAIPNNVQQLCSVSSTRAKENCS TKALPSDHITAKQSIIKSSVKRTRTNCVDSILPPDKAKQDRRSGAVIGTGHRRKANPD TSVPNMTPSLDELSTPTPAPSPPLPISPFPHVYTRPTQPREHLSTPTSSASPDTLVFD ESNTIDESQVGPKCNLRDRTTIAAPDRLGFPHVSVVIPEPSTYQQSSTIPEWQLAMSE ELVALDRIAAGFSPSEHDPALFIHLSPRGRTLLLLYVDDMLITGDDVDHISHVKRHLN EQFQMTDLGPLSYFLGIEVLHSAKGYYLSQSKYIQDLIVRSGITDNRTVATPMDLHLQ LRGTDGTPLEDPSHYHHIVGSLVYLTVTRLDIAHAVHILSQFVSAPTSVHFGHLLRVL RYLRGISSQCLFYARDSPLQLHAYSDSTWASDPTDRRSVTGYCILLGSSPLAWKSKKQ AVVSRSSTEAKLQALATTTSEIVWLRWLLVDFGIVCGAPTPLLCTGAIQIANDPVKHE LTKHIGVDASFTRSHCYQKTIALQYVPSELQVADFFSKAQTREQHRLHLLKLSALDPL LPP</aaseq>

Gene Sequence

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External Link(s)

NCBI Gene:Os09g0244000, RefSeq:Os09g0244000