Os06g0284200
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Structured Information
| Gene Name |
Os06g0284200 |
|---|---|
| Description |
Protein of unknown function DUF246, plant family protein |
| Version |
NM_001063933.1 GI:115467597 GeneID:4340767 |
| Length |
4891 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0284200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:10081205..10086095 |
| Sequence Coding Region |
10082328..10082571,10082757..10082914,10083035..10083239,10083368..10083657,10083789..10083954 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:10081205..10086095 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggggtggaaggcggccatggtggggggtaagttggccggcgtcggcggcgagaagctcaggtgcgccgcggcgcccgccgcggcggcgcggtcgcggatgaagctgtggatggtgcgcgccaccaccacggtgctcctctggacctgcgtcgtgcagctcaccgccgtcggcgacacctggggcccccgcgtgctcaagggctggccctcctgcatcacctcgcccgacgacgacgccgcctccgccacgctcgccgccgcccgcccggagcccgtcgtcgacaaggccgtgctaccgcccaaaagaatttataggaacaatggttatctgatggtctcatgtaatggtggacttaatcaaatgcgagctgcaatatgcgacatggttgtaattgcgagatatttgaatgtcactttggttgtgccagagttggataagacatcattttggaatgatccaagtgagttccaagatatattcgatgttgaacactttataacctctttaagagatgaagttcgcatattgagagaactgcctccaagggtaaaacgaagagttgaacatgggatgtaccactcaatgccaccaataagttggtctgatatctcctattaccataaccagattctccctttgatacggaagtacaaggttctccatttgaacagaactgatgctaggctagcaaacaatggtttacctatggagattcagaaactgcgttgccgagtaaactatgcctccttgagattcacttcgcaaattgaggagttgggaaagagagtaattaggatactccgccaaaatggccctttcttggttcttcacttacgttatgaaatggatatgctggctttctctggctgtacacaaggttgcagtaatgaagaagcagacgacctcacaagaatgaggtacgcttatccatggtggaaggagaaaattataaattcagaattgaaaagaaaggatggtctttgcccattgacgccagaggagactgcccttgtcctcagggcattggacatcgatagaagcatgcaaatatatattgcagctggagaaatatatggtggaaagcgcagaatgtctgctctcacttcagcgtatcctaatgtggtgaggaaagagacacttttggaaccttctgatctaatgttcttccagaaccactcatcacaaatggcagcactagattacttggtttctttggaaagtgacatctttgttcctacatatgatggcaatatggctaaagttgtcgagggtcatcggagatacatggggttcaagaagacaatcttgttagaccgaaaacttattgttgagctagtagatcaatacaacaacagttctttgcgatgggatgagttctctttaatgctcaaggctgcccatgcaaaccggatgggatcagcttcaaagaggacggtgattcttgacagacctaaggaagaggactatttttatgccaatccccaagaatgcctgcaagattctaatctcttacatacatcatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGWKAAMVGGKLAGVGGEKLRCAAAPAAAARSRMKLWMVRATTT VLLWTCVVQLTAVGDTWGPRVLKGWPSCITSPDDDAASATLAAARPEPVVDKAVLPPK RIYRNNGYLMVSCNGGLNQMRAAICDMVVIARYLNVTLVVPELDKTSFWNDPSEFQDI FDVEHFITSLRDEVRILRELPPRVKRRVEHGMYHSMPPISWSDISYYHNQILPLIRKY KVLHLNRTDARLANNGLPMEIQKLRCRVNYASLRFTSQIEELGKRVIRILRQNGPFLV LHLRYEMDMLAFSGCTQGCSNEEADDLTRMRYAYPWWKEKIINSELKRKDGLCPLTPE ETALVLRALDIDRSMQIYIAAGEIYGGKRRMSALTSAYPNVVRKETLLEPSDLMFFQN HSSQMAALDYLVSLESDIFVPTYDGNMAKVVEGHRRYMGFKKTILLDRKLIVELVDQY NNSSLRWDEFSLMLKAAHANRMGSASKRTVILDRPKEEDYFYANPQECLQDSNLLHTS </aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>3525..3768#3182..3339#2857..3061#2439..2728#2142..2307#1952..2040#1785..1852#421..727#gcttctcctcccactctccccctctctctcctctctcctctctcctccccccgagatccgctccggccacccgccggcgaggccgccccccgccccgcccgccttgcgatcttgggacagtgcggcgcgtcccggaacgccggttcttggccggtcgaggtggtggtggtggtgataaacggtgcggtgtctgaggagtgggcggttgctgccgtgcccggaggagctaggaggcggcggcgggagagcactgttcttggaggctgcttttgaggtggggtgggggggaggcgttcgttcgccgccggcgccggtggcgtgcggtcgtgggcgggaggtggtggtggtggtgctgctgcattgggtgcgtcgtgggtggattcggatggttgcttggtaggatttcccttttcatggtcgatggggtggaaggcggccatggtggggggtaagttggccggcgtcggcggcgagaagctcaggtgcgccgcggcgcccgccgcggcggcgcggtcgcggatgaagctgtggatggtgcgcgccaccaccacggtgctcctctggacctgcgtcgtgcagctcaccgccgtcggcgacacctggggcccccgcgtgctcaagggctggccctcctgcatcacctcgcccgacgacgacgccgcctccgccacgctcgccgccgcccgcccggagcccgtcgtcgacaaggccgtgctaccgcccaaaagtgagtacacacattagtcggtttcgtccggtcgcttgctcgctttcgctcgcgctgttggaaaatgccgtgtctttgggttgatgtttgctcccaacgacattgacacccggccagcctgcatgttggtgccgcatcgtcgccatgttcacttggaaaaatttcctcaaacttgcgatgaatttgaccggtggttggtgtgaattgctagtaaatttgcgcaacttaacctgcttcatgtggatgtaattctgagttaatgtcggcttgtgtgttctatgtaggattagggaatttggtcatgccttttcatcttttctgcgttcttgaactgataaattgattttgtgctgaatggattgtctcaaattctcaatgatgtttgagaatcagcgatgtgggattttcctcctttttttttttgctcggccgatcaagagttttgctgttctggtgattgaatttttatttttggttatttccatgttaggatcatactttttaggtgatctatgagtgctgtgatgagtagcaatcattgattacttaacggatgtttttgtccttcacaatttcttaccatttttcacttggataacaaatgagatgccttatcatcttctgggtaactgtaccgatatttctgtgtggaccttttatagcatttactttttagtgaaaataaatgttgatttgttcagctacatggtaatttagctttacaacacagtataattcaacaaagaagaattgcttagctttccttatacagcagattaatagcatggttgcctttttttcagagactatttttgcttaaactcaacattagggagttactactgggctgtaaaaatagtggtacctctaggcacctcctggtgttaatttgtggtatcttccgctagtaccaccttcctttggttgaatgtcgagggttgtcacactagaaggctcgtaaaagagctctttgtttgatcacctttttttctatagtgtgatacatgccttaatttctgttcacttgtactgatgttatgtggtcgttgtctaccaggaatttataggaacaatggttatctgatggtctcatgtaatggtggacttaatcaaatgcgagctgcagtaagataccagaaaatccttatttgtgaaatttcatcgggaatgtgctttacaagttctgactcttaacatggtcttctgctcattctctttcatcagatatgcgacatggttgtaattgcgagatatttgaatgtcactttggttgtgccagagttggataagacatcattttggaatgatccaaggtgcattttggggctttgatcctaatttacttcgcttaatataagctagcggctctgcttacgttctggatattgacttcggcaaccattctatcttgcagtgagttccaagatatattcgatgttgaacactttataacctctttaagagatgaagttcgcatattgagagaactgcctccaagggtaaaacgaagagttgaacatgggatgtaccactcaatgccaccaataagttggtctgatatctcctattaccataaccaggtaagcttcatattccattctgttaaggctgttttgtatcgtgacattttattgaataagctaatagttgattaaattgttgtattacagtatgtatagattaagctaatagttgatcaaatttgaaccagattctccctttgatacggaagtacaaggttctccatttgaacagaactgatgctaggctagcaaacaatggtttacctatggagattcagaaactgcgttgccgagtaaactatgcctccttgagattcacttcgcaaattgaggagttgggaaagagagtaattaggatactccgccaaaatggccctttcttggttcttcacttacgttatgaaatggatatgctggctttctctggctgtacacaaggttgcagtaatgaagaagcagacgacctcacaagaatgaggtgacattttgtaatctgctgttggatttgtttttcttaattctttcacttgaatctgtctaaacacctgtcaactttgtatgcttttccaagttagataacaattctcaaactactctttgattcaggtacgcttatccatggtggaaggagaaaattataaattcagaattgaaaagaaaggatggtctttgcccattgacgccagaggagactgcccttgtcctcagggcattggacatcgatagaagcatgcaaatatatattgcagctggagaaatatatggtggaaagcgcagaatgtctgctctcacttcagcgtatcctaatgtggtatgggcacaactaaacatgctataaatatttgtattacatgtaatactataaaatcttttaagatctcatctttcaatctccttactgatcaagttttctgcttgcaatgatgtctaggtgaggaaagagacacttttggaaccttctgatctaatgttcttccagaaccactcatcacaaatggcagcactagattacttggtttctttggaaagtgacatctttgttcctacatatgatggcaatatggctaaagttgtcgagggtcatcggaggtgtgtattccatatttttaaaacacagaattcacttgtgccgtccaaaactgcctgctaatcgtattatcatttcttctcgtattccttttttaaagccaataaatatttgatatatttcttttgcaatccacatagtttttattactggttaattaaatctcttattatgttgctcgatgcagatacatggggttcaagaagacaatcttgttagaccgaaaacttattgttgagctagtagatcaatacaacaacagttctttgcgatgggatgagttctctttaatgctcaaggctgcccatgcaaaccggatgggatcagcttcaaagaggacggtgattcttgacagacctaaggaagaggactatttttatgccaatccccaagaatgcctgcaagattctaatctcttacatacatcatgatatccactatgttaatatttcatccacgctatactgttccattctttcgtaaatgcaactgtgaatcaagagttggggtcctcgctattttgaagtgaaaaggcggctcggcctcaagcttgagccatagatgaattcaaactcaaggacaagggaggtaaggggggtgttgtttgtagttggtaaatacacataatagaaatggaggcagatttgtttattccacaaaataaagagtaacactctttgtatagatggttgatagaatctaccatgaaggccaaggtaatttaaagagagatgctggatccccatctcggatctcgggtggtgtaacatagcaattgttcttggtagccccccctccctccccatcggcaaaaattttgtccaccaaagttgttggaaaaagaattatatatacactgtttattgaatcgatacagcctttatgaagatatatggtaacttgtgcagaatgtttctaccacttgtaatttgtaatgctgctcttgcattgatttcctacatggaggttgctttgttaacctgtgaattggtgatctatgttctgatgcaggataaataaataggatcggtgcaagctaagagcacccggtgttgtttgccttctttaatccatgaactccctccatttcacaatgcaagtcattctagcatttcccatattcatattaatgttaatgaatctagacatatatctatctagatttattaacatcaatatgcatatggaaaatattagaatgacttacattgtgaaacgggggaagtatcaattaggagagttctaacggtttggcggtgattagccgttatgagaaacgaacaaaagctgcagatttgcagtttttttcttcttttttgaacaaattgcgggttagtactttatggttgaagttgatattagtatgatgtgctcatcagtcatcagttctgacttgtgccccagatttctatctttttgcttgtgtcctttgcgtttcttcttttctttttcttttaatcactggctcagtagtcagcaggtattagttttggttgttgtcacaactattatgtgccactcttttaaagaaattcggcatacttcattttctcg</dnaseqi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