Os06g0304600
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Structured Information
| Gene Name |
Os06g0304600 |
|---|---|
| Description |
Peptidase A1, pepsin family protein |
| Version |
NM_001064001.1 GI:115467733 GeneID:4340840 |
| Length |
7306 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0304600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:11554966..11562271 |
| Sequence Coding Region |
11555410..11555434,11556353..11556666,11559797..11559800,11562118..11562233 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:11554966..11562271 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>gctgggggatcaaaatggaggtgcttcttccccttctccttgcctgctctctcctcttcaccattgcaacccctatcagagacatcaccgacgtttgtgcctcacagatcagtggtttccagcccctgctcgccggcgccgctcccctccgacctccccttctccgccgtcgtcacccacgacgacgcccgcatcgcccacctcgcctcgcgcctcgccaacaaccacccgacatcgccgtcgtcatcgtctctcctccacggccaccgcaagaagaaggccggcggcgtcggcggctcgcaggcgtcgtcgtcgtccgtgccgctgacgccgggcgcgtcggtggccgtcggcaactacgtgacccgcctgggcctcggcacgccggcgacctcctacgtgatggtggtcgacacggggtcgtcgctcacctgcttcgccgccggcggctgcagctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>AGGSKWRCFFPFSLPALSSSPLQPLSETSPTFVPHRSVVSSPCS PAPLPSDLPFSAVVTHDDARIAHLASRLANNHPTSPSSSSLLHGHRKKKAGGVGGSQA SSSSVPLTPGASVAVGNYVTRLGLGTPATSYVMVVDTGSSLTCFAAGGCS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6838..6862#5606..5919#2472..2475#39..154#atactgaacttctctgaattgaagaagcttccagctgagctgggggatcaaaatggaggtgcttcttccccttctccttgcctgctctctcctcttcaccattgcaacccctatcagagacatcaccgacgtttgtgcctcacagatcagtggtatatatgcctgaccttgcttaattttctacatgtagttcagttcatctgttgctttctcgtcatttctttgctgttattcttctgttactgctgaagtattgtatgatcatgtgaattgttagattccttaatataattaaggaccaaaacatagtatgtccaatggattatgcccatatagatagagagaatagtttagtgcttagcttgaactgtcatgacagtttttgcaagcagagacagtgtaatcttcttgacaagtacagaattaacagattactggattctttccaaggctggtgttacatttagatgttttagtacaaaacagatggacaaaaaaaattaaaatacacagaaatcaacctatcttgtctccttttgcccttttctcctgagatcacgagtattagttccagcctgtttcttgcctgaaaggctgagacactgtgatccaattgaattggaagcagcggtgcttcattattacttcctgaatatttccacgacatccaaacacatacaaatttgcgtactactgatctcgtgaatccaattgctgccacctccaattcagttcatctctatttgctttgcacaagatggtcaagcctttttctcttgcttttggaaatatgaaggctaggagaggcaagaatccaagagagaactaaggaagtggtagatggcgcgtcaactgtcactagctaggtccacacacagtactgatctcttttcaatttagtgatatgattaattgagatgctattaatcatcatctttttgtccttttggtttgccatgataacagagatccgtatgaacctatcctatgcaatattgcattaatctctgtaaagaatttagcataggaatggcttcaggaggaaaaaaaaaacagagaaacaacgttaatcttgtaaatctattctagtaggctgtaattaactcctttttaacctgaataaattgccgatagatggtaattaatattgttctgagagtctgctatcagcagttccttttgcagtttcagcctttgagctgatcgatcttttaacatactaccttcgtcggttcgtagctaaaaagacactcttttaaaaaaggttggacactaaggacttaatgtcaatagttttaagaaagaagaagtaaatatttcttgtgagcgtcgacgagagtcgaacctgggccgatggggtgcagaacaaccatattagggcagtctcaacccataacactagacatagtttccataaactccacatcatcgataaactagtactagacactactcttccaatgcaaacaccactattccatatttcaatttaatgctagttatctcacatgatgtcttagatgttgtgtagaaaccatgtctcatgcaagacatggtttccttctctttcctcatttattcacttgccatatcattttttatcctaggtggcaacttatttaatgctatgaacaccttcctagtcattgggttgggaatgcccttatcagacaaagttaagagcaatgatgaacactacagcaaattagcctatcaatagccgacctgaaaaacatggagcttgtctttaggagcactgaatcaagtgatgctctgccccttttctttgaagctataaatagcagtggtccagctatgaattttccaaaccaaaccctatagaactcgacaaaatccagcaagtaccatggtccatggatgattaagttatttgatttaacaatttttggatgcttctaatatgatataaaaatattcgaaatgcgcactagtttctgcactatgtcaggcgttttttgggggtacgctacctgtaaaaaagtgaccatcatctacagagaagagtcaaccaatgacgtgtggcgaatagaccctcgcgtgcaccgattaaattctcttcttctgagtaatcaagtccacaaaattgtttggtttactcttgactccgcttgactcgttttgaccccaaccctctgttaacactctcttactatatattgtgtgttgttcactcaaaacgttttgtttaagaggagggaaaattaagaagactgatttctctctctttgttgttctgcataacacaaccaacggtttggtgttgatggatgatggatgaaaccaagcttaattataaaatatattttgaaagcacaaacaaatgaattaaatattagaaactttaaattttgatttataaagttttcttagaaataccaatgaaaagttcacttaaaattaatcgtaccgtttagaatattagaaaacgtgtccatgatatatattccgtgttccgttaatcaattaaaaataactgccctaaatatgaaattgtagtggtgatattttcaaacaagaacacatcaaaaaattattgaaaaacctgatctgatggatgatcgtccgacaattgcacccttattaaaaaaaaagaaagaacggccatggcaatatatattattccctccgtttctaaatatatatttgacgtcattgacttttttaaatatgtttgaccgttcgtcttattcaaaaaatttaagtaattattaattattttcatatcatttgattcattgttaaatatacttttatatatacatatagttttacatatttcacaaaagtttttgaataagacgaacggttaaacatgtgctaaaaagtcaagggtgttaaatatttagaaacgtagggagtatctgattaaggggggtgtgagtatgtgacacctgatgaaaatgtgacaaaatagatgcatactttcagttgtataatcatcgttttggaaattggaagcagacatgaagaacctagacataatatagctagctaggtcccaactccaaaaattcccattcgtgttaggacagattctgcactccgtggtccatgtatattgtactcaagtacatacaatcctgcaacaaatcattcacacgtgaccgtatgaccccacaccaacctaactttttttatttttttgagaacacacaccaacctatcgattatcgaacaatactgtgctacgcaacaatggcatctcgaatataatcaaacgtgacatttggtttggctttttctcgatggagtatatatatacaacattaattcgatagttttttttttaaaaaaaacttttaaatgtaagaatgtacttcatccatttcaggttataaaatattttgatgttggtcaaagttaaactgttttaagcttgaataagtttatagacaagtatagtaatatttacattaccaaattagttttattaaattaataattaaatatatttttataatatatttttattggttaaaaaatattactattttttctataaactttgtcaaacttaaactagtttgactttaatcaaagtcaaaacatctaataagctgaaacggaaggttatattgtaagtgaacttagattaagcaattaaggtccccatcatttggcttatttcctaataagccaaaacggcttattaggaaataaaaataaatttgtgggtaaaacttttataaatgtgttatttgtgacttaaaagccaatgttgaaaaagaaactatgttgaaaatatgtcaaaatcaatcttaaaattaagcttaaaaatttaaaatttggctttttctttggtttattaggctatccgacgaggctgtaagtgcagaaagtcgattagcaccacgagcatatgtgcgtgaggtcgtaggtgcaatcctcgcctcacgcgagcgcgcggcagaaattttatttcatatttgcatgaatcttaacactcctttgagagtttacaaagtgaaagctttttgatcaagctgtcagacaattttgtagcgattttcgttccttaattacatgaacgattataataaggctattcggccttcgtacctaaactatgctcacctatatatatccgctaatgccaaaatctgtgtcggctggccagtctgcctgtctgtccgagatcaatgcatctatacagatcggtgtctgattacttaatttgtttggctagcttaatctgcaacgtgttgcataccgcgacaagcttatcgatcaaaagctatatatacagacagattgatgtacgaccacaagtacgtacgtactggggtcaaatcgaggatgatatctgtacgtcgacagagagtattggacaggtgtagacagtcacatgcgtttgttcttgagaaagttcttcagaccagcgacttgttgatcgatcgatagctcggtgccgctgctcttgcatttggtggcgcatcactgtctcgtcgcattgtcgcacgatcgaccacaaataccagaactacttgtggcacaacacgattgtctccggccctacggccggcacctacctagctaggttaattagctgattagccagtggctactagccctatcctaaaatataataatttttaacatttaaaatttatcctaaaacttaataactttttcatgttcattttcttctcaaccaattataatcttatttcattcaaattttacagttattttttagtggtggttatagaggttttgagggtggcctttggattaccctatccgttaaatattttttttaaaaaagatgtaatttcgataaaatagatgtaaatttgatattatgcaatttcgaattatgggggtaggatcacccaatgaaaacttctagagccactgctactttcttgtcccatgctactttcttgtccctagcaatcacaatcttttcacatttaattccaca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