Os05g0345400
| Gene Name |
Os05g0345400 |
|---|---|
| Description |
Tetratricopeptide-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001061791.1 GI:115463312 GeneID:4338480 |
| Length |
11968 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0345400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:16230945..16242912 |
| Sequence Coding Region |
16231079..16231780,16232063..16232323,16233746..16233792,16233952..16234090,16234411..16234529 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:16230945..16242912 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MASKFGLAGGIPERRVRPIWDAVDSRQYKAALKLCTALLAKHPT SPYVLALKGLILERMGKPDEALSVCLNAKEQLYSDNIFHFDDLTLSTLQIVFQRLERL DLATSCYEYACTKYPNNLELMMGLFNCYVREYSYVKQQHTAIKMYKTVGEERFLLWAI CSIQLQVHFSIGGEKLLPLAEALLKKHITSHSLHEPEALALYISILEQQSKYDAALEV LSGDLGSLMGREEDKLRLQGRLLAQACNYTAASEIYQKILESCPDDWESFLHYLGCLL EHDVNLPKSRTSEHPSSLPVDSALALKTSLSDELVESRLASALSFVQKLQVNDTSDCV RGPHLASIEIERQRCRSGNPTDRKFIEALINYFHRFGHLSCAASDVEIYLHMLSSDET TELLDTISRSFDASSLSVKGLGLAITTFKVQELLGTFFSKSTTELQHIAKGMVEAFYK NLPLSRDLDPQESMHGEELLCMASSILVQLFWRTRNLGYLIEAILVLEFGLTVRKYVW QYKVMLVHLYSYLGALPLAHRWYVTLEVKNILLESASHHILPQMLNSPLLQQTADLVK DYLKFMDDHLKESADLTCLAYRHRTYSKVIEFVQFKERLQHSMQYLSVRSDSIILSLK QKAESLDEVESILENVNHGARLVELSNEDNVKRFTFNEDLQARPWWTPTTSVNFLSEP FDEGSTPACFRAKACEHKSTEKDDSKIKYAERKALLPRLVYLSMHGCASSLRETQLNG SGLDTDATEMKPLLLKYARSIGYSIDDALSVILGMSSGKKSVKDFTPDIVSWMSFAVF INAWNLWSNESVVPRADESSPSSWQIVDSLVKICVEEQLIDANRILTSPGNNIPVLVQ MITEPISWHLVVIQSCVRSMAPQGKKKKKGGPSERPNVPRLQAIQRSVQCMIDTLRSV QSWLSDQMRPEEQALDILLSYLQGGNEDGPGQISCILEENSARHNPELGERIAQSLET WSSAGVVRRIVGAEKELLVELKKICDSKLKLLASVSASLSSALH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>11133..11834#10590..10850#9121..9167#8823..8961#8384..8502#8095..8288#7455..7529#6948..7024#6307..6437#5986..6185#4796..4971#4554..4701#3633..3703#2924..3042#2740..2833#2071..2145#1863..1981#1622..1778#131..277#gcggcgtctctctccctttctctccccctcccttcccttcccatcaccgccgcggaacgcgccgccgccagaaaccctaaccctagatcgcgaggggtggtgggtggccgggccggcggggggtggggggatggcaagcaagttcgggctcgccgggggcatcccggagaggcgggtgcggccgatctgggacgccgtcgactcgcgccagtacaaggctgcgctcaagctctgcaccgcgctcctcgccaagcacccgacctccccttacgtcctcgtgagtggacctctaccctccccctccctcgctcggtttgtttctggagtagctttggttgcggttttgatgaatctggcgcgccaatgggctaagtcggtggttgtttaatcagcagccgcggtcactgtcgccgcgcctggtttgtgcttagatggtttatcggagtgttttttttggatcaatggataccttactagttttagagatagtaagctggatgattagttttgcattgcatctgatttatggctagttgaccaacttgcttgaactagtttttaactgcttgtaaggacttatgttctcattttgcctacattacaatttggaaatagctgtgtagttcatatttgattgcattagtgtctggttgggacgaaaatccaatagcaggagcatgtgagcagtcctatgaaacaaacagtttggatcaactgaagaaaccactggcatttttgaagccatagtagctcacattaatccttgatccaaattgcattgccacaaggtcttcaacccctttcttggtaggaagttcgctatcactttttttcaaccaggttgctgcttacaaggtgatgaaaggatatgataggctaggactggagtaataattcatttggttacgaagttaggatacgtggttaaaaaggttcatgaccattggaaggaacatgagatgaacttgacatgaaaccaggagggtgcaggctagaggggcagggagcagcagagtactgttaggacaagcagagttaatattttctttggagatgttattaattatcttgtaggaaataacaaacaggttatttctagtgactagtaaggcagatttaatatcccaaatggcagagatttcatatttggattaattcataaataccagacagcaggtatttgggcttgaatttggtttatttcatcattttcaagccgagcctagcagcaaactgaaattttatcacaatttcaaagcaaatggcctattcctagcagtcggcaaggtgttagcttttgatttgtggcaacaagttaatgcattgttttgataattcagagatgtataatcaggcattgaatgtattttattctgacactataaattcttgattcactttggatgctgagaaactgacaaattatctatttggtttatgtgcctaatgtaagtgccattgatttgttcccttcgtgactgttatagatctgatatgaaaacctgtcttcttttgttgctatgcttttggcccaagggattagctcaggctttttacaggattttatgctcgctgtatagagaatgcgatttaactgtacttttgaattatctcatttcaggctctcaagggtcttattttggaaaggatgggaaagcctgatgaagcactcagtgtgtgtttgaatgccaaggagcagttgtattctgacaacatctttcattttgatgatctcactcttagcaccctgcagatagtatttcaaaggcttgagcgatgtacgtttgcacttggtcttttgattatatctccttagcatcttatttttttccctgaattatttatgcatatgtttgtaccagtggatcttgctacttcatgctatgagtatgcttgtacaaagtaccccaataacttggagttaatgatgggcctttttaattgctatgtcagagagtactcatatgtgaagcagcaacatgtatgatgatatttttcctgctagtttgttaatttttttttgtgctttcttgttcaattcttgaccaccctgttttgtatcttctgcagacagcaataaaaatgtacaaaaccgttggagaagaaaggtttttgctctgggctatttgcagtattcaactgcaggtgggacattgtagtttgttatatctcgactaatgatgagatctgcatctgcatttatagatccagtactgtataaagacactgctatgctttttattacggaaaaaaagggaacactctaggtagaaacaataatttccttgaatatacgggtaaaatgattgttctagatgcatggcccaagccgccaaggagatgctcttcagggcaggtgagagggagtatagagggagtggagatggctatttgtgcaggacagaaatgtatgagagagggggaagggagagatggagagggagagggagtttttcatctggtgcattacaatttacactaccagaagtatagagatgacaattcttgaacatgtttagcaccttggtactaacttatccctgccatgacccttgctattcattgaaaaagacattgaattagaaatctagtagcagtacttgcaatgccgtaggcccgtagctactagcttgaacaagtccatcgagaatgcgtctgctgtattattgaccaggattatcttcattaatcttctttatgtgttattgtgcaagtaacttatccttttgcccatgacaggtacactttagcattggaggtgagaagttattaccactggctgaagcgttgcttaaaaaacacataacttctcatagtttacatgagccagaaggtattttatatttatctgaagtgctgcgttcaccattttttttttgcatgcataaatgctctcttttgacgtaatttgaacttcatgcagcactggcactctatatttcaattctggaacagcagtcaaaatatgatgctgctttggaagttctttctggagacttggggtctcttatgggaagggaggaggacaagcttcgtctgcaggtaacttacttttgttcttgtacatatctgaaatacatattaatgttaagtagttcattacatatgcctttccaaattcaaaattctgttatataattgtatattagaacatctagaaattgcaagtcattgtagttcatgactgaattctgcatttatgtcatagtaatatctgaattgaatccttagcttgctcactgctcttcatgtgctaaaaatctacataaagttatcatgaacatgaagttaaactgttaaagcaactaataaaaaaagtggtttttagaactgatcatgtgcagcttactgctctgcttgcatggagaatgtacggtctatttatttcttgataaaggataactacattgaacatggggttaaagctgttcattaaaatgtgtttttagcaaataattatcccttttgtttgcgttgttgagtgttgatttccagaaaaagtactatttggccaagtcagctatatctccagcacattcatatgcttgtgtagaaaatacaacttcaaattacaatccttcgttttttcccttcctacccacttacattattacctgacttcaagttgacagggacggcttcttgctcaagcatgcaactacactgctgcttccgagatatatcaaaagatccttgaatcttggtaatgtttccataattggctttgtacaattttcatttactctagttcttttgattggccatgcattgttgcttaatcatagtcaatcaataaatatgttctgtgaattgtagtaatatatgtatctcaggttctacccacaaacacttgttgagatgcactttaccaagtatcaactatttggttcataagtacatgtttcgatatgcataatatattggtgtcctgcaagctcaccgtagaaattcttatgtaggggtttacacaatttcatttatatcatcagagtctttcgatctactgctgccttttttcctttaaaaatggtaaactttgtttttgtacactagcccctcagagctttagagcctgatcacttcaatatatgttttactagaaaaaatgcccgtgcgttgcaatgggcgaaggttattttaaccttgttattgttatactgtttagttaaggtgaaattcactattggaattcgcttggatatatatttttctagaaaatcacgagctgcaattagggtgaccatctcaagttagcatgtgagtattttaaagagatatcttatacaactcctgtatttccaaaagcgaacgaactgaaaacccgactcaaatacagatttgtatttccaaaatcgaacaaaattaaaaactgactcatacacggatgacgtaccgaagtatcagcaaaagcatcttcaatttttataatagtagagatttgttcctcattcctcaatttatttaagcatatttcacctgtgttaatcaaactatggaaaattgctcttgtgattagtttttgataattgtcctctctttctttgactgggcagtcctgatgactgggagtcctttctccattatttaggctgcttgctggagcatgatgtgaacttgcctaaatcaaggacaagtgaacacccttcttcattacctgtagattctgctctggcccttaagacttctttaagcgacgagctggtacttgctacacttaataataagtttcttttagtatatattacttatgttagtgataacatgcatgttattta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