Os06g0332700
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Structured Information
| Gene Name |
Os06g0332700 |
|---|---|
| Description |
Tesmin/TSO1-like, CXC domain containing protein |
| Version |
NM_001064082.2 GI:297605750 GeneID:4340928 |
| Length |
6242 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0332700, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:13250524..13256765 |
| Sequence Coding Region |
13250524..13250699,13251544..13251858,13252598..13252701,13253313..13253404,13253622..13253978 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:13250524..13256765 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgcccacgccgaggccgtggccagtggccttcatccctccgaagccggtggctgaaattaagagtactccttcaacaaagagaaagaaacattgtaattgcaaaaattcacaatgtctaaagctgtactgcgagtgttttgcagcaggtctttattgtgatggctgccattgtaaacaatgtggaaactatgttgggaatgaaagtgctaggcaggaggccattaacagtacgaagcaacggaatccaaaagccttccaacctaagattgaaaatggttcaaatgcacttaatcttagaaaggatgatgctggagcaccagcctcacttccaaagcataataaaggttgccattgcaagaagtcaggatgtctcaagaagtactgtgaatgctttcaagcaaatatcctttgctccaagaattgtaaatgccaggattgcaagaattttgaaggaagcgaggagctacggcttataactcaaggggacaactcatcagatcgaaataacattcaacatgctgccaatgttgctttgaatggtgcaattggatcctcagggtatagatattctccagtgcgtaggaaaaggcctccagaagatcatctttatcagaaactaaatggtgaaggaagcacgatgcaaacacagtttcaagaggctaaccatgtggactcttcagaaattacttcttcgactggactcgaagggtgttatagtaactaccagagtagatctaacgtggtctataggtctgcgttagcaaacactatcagccctacggatgctactggtctagccaagcatttggtgattgtatgcagaaaggcagcagacgcattcctgacgacagctgaaaacaaaggggagatggaagtagaaagggaaatccacacagattctgatggtgcaaccaatatggatcagcaaaatggaggtgattttggtccttgctgtaacagcctagaggattctaggccagcctctccaggaacacaagcattgatgtgtgatgagcaagatagtacatttggaacggattatagaatttcatttccagtggcattgcatgatcaagacacttcagaactaaatgctcagcaagaaaaagcagtgttgacagggtttcgagactacctccggacagtcatcacacgtggaaaaataaatgaagccaacaggtcatcagaggcggcaatgcagttggatactcgaaaacatgatgaatcagccacaattttacccccactaaatgctgtggaaaaagaaaaactcaaagttcctgatggccctgaaagtcctaaagcaagtccatcagcatcgaattgcggtggtcaagctagttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPTPRPWPVAFIPPKPVAEIKSTPSTKRKKHCNCKNSQCLKLYC ECFAAGLYCDGCHCKQCGNYVGNESARQEAINSTKQRNPKAFQPKIENGSNALNLRKD DAGAPASLPKHNKGCHCKKSGCLKKYCECFQANILCSKNCKCQDCKNFEGSEELRLIT QGDNSSDRNNIQHAANVALNGAIGSSGYRYSPVRRKRPPEDHLYQKLNGEGSTMQTQF QEANHVDSSEITSSTGLEGCYSNYQSRSNVVYRSALANTISPTDATGLAKHLVIVCRK AADAFLTTAENKGEMEVEREIHTDSDGATNMDQQNGGDFGPCCNSLEDSRPASPGTQA LMCDEQDSTFGTDYRISFPVALHDQDTSELNAQQEKAVLTGFRDYLRTVITRGKINEA NRSSEAAMQLDTRKHDESATILPPLNAVEKEKLKVPDGPESPKASPSASNCGGQAS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6067..6242#4908..5222#4065..4168#3362..3453#2788..3144#1453..1630#778..861#1..41#atgcccacgccgaggccgtggccagtggccttcatccctccgtgagtaaatttcgtttcttttttttgagttttgaatccacttgctgcgatttgtcttgtgttggtagctcaatcgaggagctttgagttttatctatctgtctagtgaacttctttcaaaagtttttttatgtggtttcatagatatatataatatagtaggaacccaagtaggaggagaagaatcgaggtcaaaatcagatagtttcttttttgggagggactagatagtcctgtggaagtgtagaattagacgcattacttcttgacagtgctttgcttgttactatcgagtttgtcatgtactattatcatggtctcgctgttctgtttttagtgctgttagatgtttcagcattttcaaatttgaattcctatgaatgtcagtgtaagtatgctatatgtcattcaccttgatgtatttgctaccgctatatctagttatctactgcatttcattttgagagcatgggtctttgttgtacagagttatctttgtggctcttacacctcaaagtgcatatggagaaaatctcactatgctacaatagagacatatgtatattctccaaatttactggaaatgaacttccatggtatactagttgcttgtgaaaaccattttatttcttgattcatatgtcatgttacctcctgtttggagataacaagagcaagcacaatattacatttttaaacaactccatttactgatgttccttttgttttctttcaggaagccggtggctgaaattaagagtactccttcaacaaagagaaagaaacattgtaattgcaaaaattcacaatgtctaaagctgtgagtttactagcacatgaaagtttacttagacattcctatgaaatattgaaaagaaaacatgtaagttaatagcacgcatacgtgtacattacattagcatggaaagaatgttgtcattgcgtcaagattaatttcaatgacttctgtttgaataaaaattaagttgattatcacgatcaattaatgttagagcatgctccagcatccttgacctttttactggacaaatagatcaattgtatgggtaagatccattatatgtgcactttctaataaagctagccccgggcttgtgccatgcccaagtagccagcgccttctgatccaaaatggtgctttagagtccttggttaatttgaattataaaaagtatctcatgctttggtagtaagaatatcaataaaattttaatatataattttgaaacaaaaattgcagatttatctctttggtttatactatcatatattcaaggtttcttgtttcatggggtgagttgatggatctggtttaatgtataaaataaggtcatttattttcaaacagttcatcatgtgaatagatcactaatggtgttttatctgttaggtactgcgagtgttttgcagcaggtctttattgtgatggctgccattgtaaacaatgtggaaactatgttgggaatgaaagtgctaggcaggaggccattaacagtacgaagcaacggaatccaaaagccttccaacctaagattgaaaatggttcaaatgcacttaatcttagaaaggtactacatgctttcctctaatagaatgttaatgtgcatcatgtatttttgcaacatccaataggggaatagcttacacacaacagtagataccctctaagataaagtaggtaataaaacttatacaacatattagttctacatttctgctttcatatttattatgtaccctacaagacgatgctaatgaagccggctataagttggaagaaatcctagagcaagagtacgaggacagtctgctttctgaaccttctaagatgaagctagaatctcacgaatagccctataatggctgctagcctcttttgtaacctcaataaattttcatctacagcctttcttgccaggctggcaaaaaaaattggaaaaggaaaagctatgtagcaactaaacatctcatcggttgcattaaaacatatcatttgatgcaataatatttatatttatgtgtttctatgctaataataaaagctagtcaattaatattacctattaaacaaaactaaactaataataaaatggtcatctataagtttgcaagtcctggacagaatttccgcatttgaccaatagtttgcagaaaatgaacgttctatctgtatctagaaacaccacacattgaaccagagatacataacagcaacagcctatagttaaaaattccacttttgctttatcaagtgaaatttagttttttaaaaaatggaatcacttgaaatatatcataccatgtaatctgaaatcttgcttttgcacatttttacactaaacagtagtttatttacaaaatgattgctgaaggactcgctgatcttgtttaggactctctgcacagcgtattatacttgttcctcaattgtagcaaactatttgatcagttcctgcacattctagaatgtgtgtaggtgactaatagaaagatttcatggtatcaaccactaatagaccaaatggctaatagctcacattttttattttgcaatctatgttgtttataaactaaactcttctgcactgcccaccatgttaaaccagttatattttgcttagtgtttcttttgaattttcaaactcattttgtttggtagatttatatacaacattctcttcatgtgatatttttatgcatttgattaatcttaactgcacaccaggatgatgctggagcaccagcctcacttccaaagcataataaaggttgccattgcaagaagtcaggatgtctcaagaagtactgtgaatgctttcaagcaaatatcctttgctccaagaattgtaaatgccaggattgcaagaattttgaaggaagcgaggagctacggcttataactcaaggggacaactcatcagatcgaaataacattcaacatgctgccaatgttgctttgaatggtgcaattggatcctcagggtatagatattctccagtgcgtaggaaaaggcctccagaagatcatctttatcagaaactaaatggtgaaggaagcacgatgcaaacacagtttcaagaggtattgtccacttgggctggttccatgataaataacctgttagattaaattctggtatagtgtaacacattttgtttctcggtagtatagttttgcttctggatagttctttaaactcaaaacatagttggctgttcatcaacttcacgctgctatgattttgtgtaactttagctgtgaatttcctggaatcgtaactgtttcttgttttctacaggctaaccatgtggactcttcagaaattacttcttcgactggactcgaagggtgttatagtaactaccagagtagatctaacgtggtctataggtaagtaaaaccatgttggattgttgtactagataaactaagaaaaaaacagatatgaactccatagccaaattatatccagaataaattgatggccaaaggattataaagaaaggatggccagcaccatctcagcttctttgtggcagtgacctcctgtgttcaagtcatcaagtggtcaggaatggcaactcacaaggcttgtgattttaaaaaaagtacccctttggcatcaacttcttatggttttgccatctagaggttctactagccacacagttaatgttaaaatactgaagcgttgattttatctgttcatgaaaacatgtttggaaatcaactgatcttaaaaatatcatttggactactaatttgaagcatgataataacatactgcaaaaatatatcatcatggaagtattctgatttgctgtattgaatatattaatattaagaaaatgttcgtttacctatgtcagtagccaaaatttgaacagtttggctgcatgctaacaaatataggcactacttcctggacatgcttgttaacagaaattgctgcagttgtgtaccttgatacttattttgtttacttatcaaatattttttaggtctgcgttagcaaacactatcagccctacggatgctactggtctagccaagcatttggtgattgtatgcagaaaggcagcagacgcattcctgacgacagctggtacacgattttattgttctcctttaactgatctaatttcagaacttccatgaatgaacatgcaaaatagataaattactctgtatttaaatatatgaggctgttaactttattcggtctatggtgcgcaattttgaccactattttctattagaatataacgataatgcctaaataatataatattgcaaaagtacatataatgaaaaaaataatctacccatatgatttctatgttttcaaactaaatattttgagaactattgatggttaagtttcaaaagtttgaccaagtcatagtcgaagcatcatataagaaaaatacattcatgatggaaaggtggactacctcggtgatcagaaagacattatccttcctgtgtttttagttgcatgttacttggctggtcaaaatgttaactgaacatggatggaggactccagatgcctgcatatatttttataaactattaataagaaaaatggaatatgtcttgcatgagtgttttgcaatacaattagtatgagtgtgtcaatagacattctgtttgctattttcaatttgaaaattatgtgcctacagaagatagctttgtctcattaagttgcgtgtccattgcaaactatcactttggtgcaaactttagtatacattaatttatttatatagtttgagcaccaaatgctgatggagtactgttactgtatttttattaaaaaaatattttcgattttgc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|
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