Os05g0353400
| Gene Name |
Os05g0353400 |
|---|---|
| Description |
Armadillo-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001061817.1 GI:115463364 GeneID:4338508 |
| Length |
4766 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0353400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:16674613..16679378 |
| Sequence Coding Region |
16676425..16678835,16678933..16679128 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgaatatcactcaaatcctgctatcagctcaatctgcagatggtaaccttcgggtagtagcagaagggaacctcaagcagttccaggagcagaatcttcccaacttccttctctccttgtcagtggaactttcggataatgaaaaaccaccagagtctagacgacttgctggtattatccttaagaactccttggatgcaaaggattctgcaaaaaaggaactactgattcagcaatgggtcagcctggatccatcaatcaaacagaagataaaggagtccttgctgataacgctaggatcttcggtgcatgatgctaggcatacctcatcacaagtcattgccaaggttgcatccattgagatcccccggcgtgaatggcaagaactcattgccaaattattgggcaacatgacacaacagggtgcacctgctccactaaagcaagcaactctagaggccttagggtatgtctgtgaggagatttctcctgaacacttggagcaggatcaggtgaatgctgttctaactgctgttgtccagggaatgaaccagacagagctaagccctgaagtccgtcttgcagcagttaaagccctatataatgctcttgattttgctgagagcaactttgcaaatgaaatggaaaggaattatatcatgaaggtaatttgtgatactgctgtatcgaaggaagtggagatcaggcaggcagcctttgaatgccttgttgcaattgcttccacatattatgtacacttggatccttatatgcaaaccattttcaacctgacagctaatgctgtcaaaggagatgaggaagcagttgcacttcaagctattgagttctggagcactatttgtgatgaagagattgagctccaagaagaatatgagggatctgatgatgctaattctactgtaaattatcgcttcattgagaaggccctcccttcacttgttccgatgctgctagaaactctgttaaagcaagaggaagatcaagatcaggatgataatgtatggaacatttccatgagtggtgggacatgccttgggctcattgctagaactgttggtgatgcgattgtgcctcttgtgatgccttttgttgagggtaacatcacaaaaccagattggcattgtcgtgaggcagctacttttgcatttggttctatccttgaaggtccatctgtggagaaacttgctcccctggtacaggctgggtttgacttcctgctgaacacaacaaaagacccgaatagtcaggtaagggacaccactgcatggactcttgggagggtatttgagctcctgcattctccagccagtgcaaatccaattataacaagcgcaaaccttactcgtatcatgactgtcttgctggaaagtagtaaggatgttccaaatgtggctgagaaagtctgtggagccatatattttcttgcccaaggttatgaagacgcagagtcgatttcatctgtgcttacaccttttcttcctaatctcattgctgctctcctttctgcggcggatcgtgctgataccacccacttcaggcttcgtgcatcagcttatgaagcattgaatgagattgtgagagtcagcaacatatctgaaacgtcaggcattataggtcagttactgcaggagatcatgaggagattgaatctgacgtttgatctccatatactttcatctggtgacaaggaaaagcaaagtgatcttcaggcattactgtgtggtgtactgcaggtcatcattcagaaattgagcagctcggatgctaagtcaataattgcccagactgctgatcagttgatgtttctgtttctgcatgtttttgcttgccacagctctactgtacacgaagaagcgatgcttgccatcggtgctcttgcttatgccactggtacagattttgtgaaatacatgcctgagtttttcaagtatctggaagctggcttgcagaattatgaagagtaccaagtctgttccatctctgttggagtggtgggtgatatttgccgtgccttggaagataaaattttgcccttctgtgatgggattatgactgttcttctcaaggacctgtcaaactcgatgcttaatcgttctgtgaagcctccgattttctcatgctttggagacattgctcttgctattggtgataattttgagaaataccttccttatgctatgccaatgcttcaaggagctgccgaacttcttgctgttttggaccatacagatgaggatatggttgattatggtaaccagctcagacggggaatctttgaagcttactctggcatactccagggtataaagggtgcaaaagctcagttgatgataccctatgcaagccatctattgcagttcactgaagctgtctacaaggaccgcagcagggatgagagcgtgacaaaggctgcagttgctgtcctgggggatcttgcggacacactcggctcaagctcaaaggatctgttcaaaagcaacctcttccatgttgagttcctgagggagtgccacgatttggatgatgaagttagggacaccgcgtcatgggcccagggaatgataaaccaagcactggtttcttaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MNITQILLSAQSADGNLRVVAEGNLKQFQEQNLPNFLLSLSVEL SDNEKPPESRRLAGIILKNSLDAKDSAKKELLIQQWVSLDPSIKQKIKESLLITLGSS VHDARHTSSQVIAKVASIEIPRREWQELIAKLLGNMTQQGAPAPLKQATLEALGYVCE EISPEHLEQDQVNAVLTAVVQGMNQTELSPEVRLAAVKALYNALDFAESNFANEMERN YIMKVICDTAVSKEVEIRQAAFECLVAIASTYYVHLDPYMQTIFNLTANAVKGDEEAV ALQAIEFWSTICDEEIELQEEYEGSDDANSTVNYRFIEKALPSLVPMLLETLLKQEED QDQDDNVWNISMSGGTCLGLIARTVGDAIVPLVMPFVEGNITKPDWHCREAATFAFGS ILEGPSVEKLAPLVQAGFDFLLNTTKDPNSQVRDTTAWTLGRVFELLHSPASANPIIT SANLTRIMTVLLESSKDVPNVAEKVCGAIYFLAQGYEDAESISSVLTPFLPNLIAALL SAADRADTTHFRLRASAYEALNEIVRVSNISETSGIIGQLLQEIMRRLNLTFDLHILS SGDKEKQSDLQALLCGVLQVIIQKLSSSDAKSIIAQTADQLMFLFLHVFACHSSTVHE EAMLAIGALAYATGTDFVKYMPEFFKYLEAGLQNYEEYQVCSISVGVVGDICRALEDK ILPFCDGIMTVLLKDLSNSMLNRSVKPPIFSCFGDIALAIGDNFEKYLPYAMPMLQGA AELLAVLDHTDEDMVDYGNQLRRGIFEAYSGILQGIKGAKAQLMIPYASHLLQFTEAV YKDRSRDESVTKAAVAVLGDLADTLGSSSKDLFKSNLFHVEFLRECHDLDDEVRDTAS WAQGMINQALVS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1813..4223#4321..4516#ctagccgcctccgccgcctcctcccccctcaaatccccccacctcctcgcttccccccttcctccgcccgccggagcagagttccttctccttccatccattccgttcgggaatcaggcgagcgcgtcagcatccccctcctcctcctctcgcggccgccttcgtcgcaggcatcgccgtgctctgaccggagggcacttgttctttccttcgtcagagcggaggggagcggaggagcggagccggagatccagatctgcacgggaaggtatctcccgctggtacggtctacttctctctttgacggattgaatccgccgtgccatgatttttttttcttcttcttcttctcattggggggggggggggggcgggggggggggagtttaccctaatccgttttctcttcacttgcgcgcgctgtgagctacggcactcgaatcttctgctttcggtaaaatggaaacgctggttttgcagttcgcctgggattcactgccgtatattgtggggattatctcgctggttgaaggagggaagggtggggtttaaccttgtttttgcttatttatgctagtataagcattcctgtgggtaggttactatcatgttatatatttcgcggtaggcgtgttgcaagtgattttgccctagttggaagggaggggaaggggtgctcattttgacggttttagatgttaagatttaggtcaacatgtgctgcggaagtgtgtatggattcactttgacctaattttttctcttcattgttgcaagaaaggtaatacagatctttctgcaatattccatccactaagtttgtgtagatgagcgcccgctatttgattgggcctattttaccccctttgattttctgatgaccttgcactgaatatactgttccatctcttattgttggtcttcagggcacgagatgtcattgtatactgcccaggtctacctgcgcttgtgctagctgtttaggttattttgtgttttttgttatgtgagttgcttctgggtggtgctgttcagtgtaaacataatacctgtggatgtccaaggtctggttattgtggctattcacatgcttatgttgtgcctatgttgtgtggaccggtttttttttataccacagcatatatgtttgcttttcttatggttgattgataacaaactgatttggcctgttcaagatcctgatactaatagcatattcacctattcaacctgtttactttggtttagtaatttcttcattgtatgtcagggtgttgcccttttatttggttattcatattttatctaatgtgttccgctgacttagtgtacttgtgcagctgcctgttgaatatctaattgcccacagcatagttagtctaattgagctttgcattgttaattgtacttagcttggttcccttgtttagatgaaactcatggccaaatgaggtgcttatccaactgtttaactgagtaacttgattttcttatgggaaacaatcaatttttaagtaagggtaaattaaatttgaataatctttagcagagcttaactgtgttgctaatgtggataacataaatgttgcatggtgatagttctacatcttgtaaccataatttgcaagtatctgtggatggaaaggaattctgaaggaccctaagctaggtcaaactggcccaacggcctttagttgctaggattgttaattgatgtgccttttcattaagtttgtgtaattgtttttcgcttaacatgattaacagctaaaatctgtttctttgatgtctgctaggacagttggtacagccatgaatatcactcaaatcctgctatcagctcaatctgcagatggtaaccttcgggtagtagcagaagggaacctcaagcagttccaggagcagaatcttcccaacttccttctctccttgtcagtggaactttcggataatgaaaaaccaccagagtctagacgacttgctggtattatccttaagaactccttggatgcaaaggattctgcaaaaaaggaactactgattcagcaatgggtcagcctggatccatcaatcaaacagaagataaaggagtccttgctgataacgctaggatcttcggtgcatgatgctaggcatacctcatcacaagtcattgccaaggttgcatccattgagatcccccggcgtgaatggcaagaactcattgccaaattattgggcaacatgacacaacagggtgcacctgctccactaaagcaagcaactctagaggccttagggtatgtctgtgaggagatttctcctgaacacttggagcaggatcaggtgaatgctgttctaactgctgttgtccagggaatgaaccagacagagctaagccctgaagtccgtcttgcagcagttaaagccctatataatgctcttgattttgctgagagcaactttgcaaatgaaatggaaaggaattatatcatgaaggtaatttgtgatactgctgtatcgaaggaagtggagatcaggcaggcagcctttgaatgccttgttgcaattgcttccacatattatgtacacttggatccttatatgcaaaccattttcaacctgacagctaatgctgtcaaaggagatgaggaagcagttgcacttcaagctattgagttctggagcactatttgtgatgaagagattgagctccaagaagaatatgagggatctgatgatgctaattctactgtaaattatcgcttcattgagaaggccctcccttcacttgttccgatgctgctagaaactctgttaaagcaagaggaagatcaagatcaggatgataatgtatggaacatttccatgagtggtgggacatgccttgggctcattgctagaactgttggtgatgcgattgtgcctcttgtgatgccttttgttgagggtaacatcacaaaaccagattggcattgtcgtgaggcagctacttttgcatttggttctatccttgaaggtccatctgtggagaaacttgctcccctggtacaggctgggtttgacttcctgctgaacacaacaaaagacccgaatagtcaggtaagggacaccactgcatggactcttgggagggtatttgagctcctgcattctccagccagtgcaaatccaattataacaagcgcaaaccttactcgtatcatgactgtcttgctggaaagtagtaaggatgttccaaatgtggctgagaaagtctgtggagccatatattttcttgcccaaggttatgaagacgcagagtcgatttcatctgtgcttacaccttttcttcctaatctcattgctgctctcctttctgcggcggatcgtgctgataccacccacttcaggcttcgtgcatcagcttatgaagcattgaatgagattgtgagagtcagcaacatatctgaaacgtcaggcattataggtcagttactgcaggagatcatgaggagattgaatctgacgtttgatctccatatactttcatctggtgacaaggaaaagcaaagtgatcttcaggcattactgtgtggtgtactgcaggtcatcattcagaaattgagcagctcggatgctaagtcaataattgcccagactgctgatcagttgatgtttctgtttctgcatgtttttgcttgccacagctctactgtacacgaagaagcgatgcttgccatcggtgctcttgcttatgccactggtacagattttgtgaaatacatgcctgagtttttcaagtatctggaagctggcttgcagaattatgaagagtaccaagtctgttccatctctgttggagtggtgggtgatatttgccgtgccttggaagataaaattttgcccttctgtgatgggattatgactgttcttctcaaggacctgtcaaactcgatgcttaatcgttctgtgaagcctccgattttctcatgctttggagacattgctcttgctattggtgataattttgagaaataccttccttatgctatgccaatgcttcaaggagctgccgaacttcttgctgttttggaccatacagatgaggatatggttgattatggtaaccagctcagacggggaatctttgaagcttactctggcatactccagggtataaagggtgcaaaagctcagttgatgataccctatgcaagccatctattgcagttcactgaagctgtctacaaggaccgcagcaggttaatgtcatgcacattgcaatttatgttgtattatattggtaagtttttacctgcttagcgcttacatacattacatttgtgtttatactttcagggatgagagcgtgacaaaggctgcagttgctgtcctgggggatcttgcggacacactcggctcaagctcaaaggatctgttcaaaagcaacctcttccatgttgagttcctgagggagtgccacgatttggatgatgaagttagggacaccgcgtcatgggcccagggaatgataaaccaagcactggtttcttaagaggggattattttgttttgtcagttattggggaggtttcttttgtggctgtgccaagaccatttgccacagattgaacgaaaggataccaacatatatgtagcgtcagtcgtaggctgcttctgtgcttttgtcgtcagtctgtcaagtcagtttatgcgtcgcatttggcgtgggtggattctggcattgaatgtcttgaacagctaaacctgttaatgttaatgtattctacctgtggtgtttatcc</dnaseqindica> |
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