Os06g0535300
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Structured Information
| Gene Name |
Os06g0535300 |
|---|---|
| Description |
Similar to AFL190Cp |
| Version |
NM_001064325.1 GI:115468381 GeneID:4341213 |
| Length |
7581 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0535300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:20912107..20919687 |
| Sequence Coding Region |
20912572..20915628 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:20912107..20919687 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggattgcaacaaagatgaggctgttaaggcaaaagctttggctgaaaaaaaaatgcgggagaaggatttcgctggtgcaaaaaggatgattaacaaggcacaaaatctctccaaagatgttgacagcaacatttcacaaatgttaactgtttgtgatattcattgtgcttctgcaacgaaggttaatggagagattgattggtatggtatacttcaagtacctgtcacagctgatgacacactaataaagaaacaatatcgtaagcttgctcttttgctacatccagacaagaacaattttgcaggtgcagaggcagcatttaaattagtgggagaagcaaacatgacgcttacagaccgctcaaaacgttctgtctatgacatgaaaagaaatgcctcagtcagaattggttctgcaagagttccttatcagcaatcaaggagaactgcacctgttagacctaccactacacctgtgaatctccataatgtgcatcaatcacaacagcataagccctcaaatccttcagactcacaaacattttggaccatatgcccaacttgtggcatgcgatatcaatactacctttcaatattgaagaaagctctccgttgtcagaattgcttgaagccctttgttgcacttgatttaaacgagcaagctgttccttctggggcaaatcagaggtctgctggggtgtggaaaagttcaggagcaccacaaaactttccaggttcacaagcaaatgtaggacagcaagctcagaattctgccaatccagtccatgctaattttggttctcataatgcacatgtagaaacaaagaggggagctgatggaaacgaggctggtgggctaaagaacaaaagaaaatttgctaaggcaacagggaattcttcaaaagcttcttcagttgctggatcaaaaaagcgcagaaaagctatgtttgaatctagtgaatctagcgcttcagacaccagcactgatagcgaagaagagattattgaagatggtcctgctgcaagtaatgtagggccagatcaacatccccgcagatcaagcaggcagaagcaagaagttaagtataatgaagatagcgatggtgacgacactgactgtcacggcaatggtgatgatggttttgtgagttctcccagtttgaaaaggttaaggaaaggcggtctgtttcatggtggtgaaaacaatgaaactaagttgaatgctgacacaactgggcctgggcatgatggtccaactaatggtgttaataattacaataatacagaagacatagagagaggctctgcttgtgctgagcaaatcaagagggaaacaatgtctggtggaggaaatagtgctgagaaagaaaaattatcccattctgtcagcaacaatggtctagagtcaaactctgatgatgctccaaatgaggttatttgtgcggattcagaattttttgacttcaatcaacttcgacatataaatcagtttaaagccaaccagatatgggcttgctatgatagtcaaagctgtatgccaagatactatgctcgaattacaaaagtaaaacatgtcccgaagtttatgttaaatttcatttggctggagtttgatcccaaaaataaagcagaggctgcttggtcttctggggacctaccagtgtcttgtggacgttttaagcatggagtgtcagatacagcaaaagagagcagtatgttctctcatgccattttctatgaaaaaaacaagacaagaaactcttatgaaatatatcctaggaaaggcgaagtatgggctcttttcaagggttgggatattgattggagtgcagatgctgacaaacacaaaaactatgagtatgaagttgttcaagtcctctctgatctcactagtagcactagcatcattgtcatgccacttgtaaagataaaaggctttgttagcttgtttattcagtctaaagaggcatccccatatgtgatacctcaggatgacacactaaggttttcacattgtgtccctcgtcatacgatgattggaaccgaaaaagaagggattccagaaggggctattgaacttgatcctgcggcgcttcctctgaactttggagtggcttttgcttctgttgttccagaaagctgctgttcagtgaaagtgcagggttctggtgctgaacacataggttcatccagtggaaataactgtcacaagggatcggtggatgttggggagagccaacatgctacatgcgcaaatacagggttcgctacaaggacaacaaaggcagagatcaatgagcacaacgctcgatctgcagtagaaggtacagatgatgacgaggaacctgatgattttgcccaagcagaagtactatatcctgaatcagaattctttgaattttcagaaataagatcgatccacaaatttcaacctgggcagatctgggctctctatagtgatgtagataagttccccaattactatgcctgcataaaaactgttgatgtcaagaataatgaactgcaagtaagatggcttgatgcttgcccacagagtgaagaggagagaagattggtaagagaagatctaacagttgcgtgcggaacctttaagatttccagtttccatggtattcaaacttacaatggtacagagtacttgtctcatcctgtacaggccaaacctggtagaagaaatgaatatgaaatagttccttgccaaggtgatatttgggctgttttcaagaactggaggactggatggaccgcaaaagattataagaaatgtgactatgaattggtggagatatttggccacactgattcatccatacaagttcagcttttaagaaaggtggatggttatagggcagtatttatgccagacagaagagagggagctgtgaagacaataaggaaagatgagtacccaaagttctctcaccagattccttgcttccatctgacaaatgaaagaggaggcaagcttcgaggttttttggagctcgatcctttgtcagtgccagagatgtttcttttcaccgaatcaatctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDCNKDEAVKAKALAEKKMREKDFAGAKRMINKAQNLSKDVDSN ISQMLTVCDIHCASATKVNGEIDWYGILQVPVTADDTLIKKQYRKLALLLHPDKNNFA GAEAAFKLVGEANMTLTDRSKRSVYDMKRNASVRIGSARVPYQQSRRTAPVRPTTTPV NLHNVHQSQQHKPSNPSDSQTFWTICPTCGMRYQYYLSILKKALRCQNCLKPFVALDL NEQAVPSGANQRSAGVWKSSGAPQNFPGSQANVGQQAQNSANPVHANFGSHNAHVETK RGADGNEAGGLKNKRKFAKATGNSSKASSVAGSKKRRKAMFESSESSASDTSTDSEEE IIEDGPAASNVGPDQHPRRSSRQKQEVKYNEDSDGDDTDCHGNGDDGFVSSPSLKRLR KGGLFHGGENNETKLNADTTGPGHDGPTNGVNNYNNTEDIERGSACAEQIKRETMSGG GNSAEKEKLSHSVSNNGLESNSDDAPNEVICADSEFFDFNQLRHINQFKANQIWACYD SQSCMPRYYARITKVKHVPKFMLNFIWLEFDPKNKAEAAWSSGDLPVSCGRFKHGVSD TAKESSMFSHAIFYEKNKTRNSYEIYPRKGEVWALFKGWDIDWSADADKHKNYEYEVV QVLSDLTSSTSIIVMPLVKIKGFVSLFIQSKEASPYVIPQDDTLRFSHCVPRHTMIGT EKEGIPEGAIELDPAALPLNFGVAFASVVPESCCSVKVQGSGAEHIGSSSGNNCHKGS VDVGESQHATCANTGFATRTTKAEINEHNARSAVEGTDDDEEPDDFAQAEVLYPESEF FEFSEIRSIHKFQPGQIWALYSDVDKFPNYYACIKTVDVKNNELQVRWLDACPQSEEE RRLVREDLTVACGTFKISSFHGIQTYNGTEYLSHPVQAKPGRRNEYEIVPCQGDIWAV FKNWRTGWTAKDYKKCDYELVEIFGHTDSSIQVQLLRKVDGYRAVFMPDRREGAVKTI RKDEYPKFSHQIPCFHLTNERGGKLRGFLELDPLSVPEMFLFTESI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4060..7116#gtcttctcctgcgcgagagactcgaggactcccctcccccccctctccaaaccctcgcctcggctcccccgcagccgcgcacgccaccgccgtcgcctctcctctccaccgcctccccacccacccgctaggtttccgccgctgcccggggttctcgccgccgcgccgccctcccccacgctcgctctccgggtgggggtggtgccgcccctctcctcctccgtttccaggcgggtgccggccgggggggtctctcgccctcgtctcctctccccctggtcgtcggcaccggcggctgggaactcgccgacgcgtcgtttccccgcgaggccgccgcctagatctggaggagggggtttgggggtaagctcgtggcgattcttcaatgcccgttcgttccgtgctattttgtattattttttgggtggggggtatacggtttcatctgacgattcgtgcgggtttttgagtttttgtggggtgagctgcggtggttcgtctgttggtggtggctagttcatgaggtcgttgaaattagggttcgtgcagccgcattcgtcttgttagtaaagtgggctttaaccgtgcgagtgttaaatgctcgtataaaaagaaggctgcaacaattgcatgcaagctaatagtgcctgccacctctaattgtaatttccgaccaatatacggcatcagaaaagtgctatattaaaattattcatttcggattctggggaggtagattgagaaggggcaagttaatgacaaaacgcatgcgacgaataagctgaatccactagtaaatagtttggtcttttagtgtatgcaatgattacttaagtttactgaataatgttgcagtagcgaatgctaatgattttttcttctgtagttattagccagtgaaatttgtcagtatcttgtctatagctgttttgaaccatgctattgattttatttgagatttaataatatctgtttgtccttagaagaatgattttatttgttctgtttcgtttgccattgtacaccacctatacatgattagatacttgcctattctgttcatgtccagttcttttagtaatgcgaattgcatactctttttctgacatctgtagagtttagaatgcgtaacctactccccctgtttgagaatgtttgctgctaacaagtatgacgtgtcaatatggaataatcaaaagcttctaaattgtccacgacttttgaacagtttgagtatatgttattgccctcagacatttcgagaggaatatcctgtgccatcaccctgttgttttccggacgcccctcatagcttgttttcaggacatgtatttggagaacaacaggagatgcttccagaattttctttctaactgttcaagggcatgaaaaccaacctgaaccgcgtatcctcaaattggattaggtatctttgcctaactagaaatcaggatacttcaccattagccaatcttttggagttaatttactaatgttgagtgatgagtcttctgtgagcgtgtaaatggtcctaagtgatttggaactggtgattctatgaatgagccttcgttgcaagtatcaagtagcagaaggtcaattgtgtgggaacactttgaataggacttggtaatcattgatggtgtcccaaaggctatgtgtaaaactaacgtgcactcacccttctgactggaacagtggtttgtcatatagtctgaatattttgaagtgtgagcatgctgattttactgtatggtgtaagcattgtctaattcgaaaatatgacaagatatgcaagctataaagttttcccacttattttttctgatgcctgattgtgctcttgaatttttttcaggtaaaatactgtttgttagacaacaagattgagattctcaaacctgttggctggtgctatatcatttgcatttggttgaactcgaaaccaaaaggtactgtgaattgcaagaattgcaaacacttgttattctcttaatatgcaatgttagaagaatatggattggagttatattactgttgttttatttctgctgtttgccactgtatgacctaacacctatgcatgattagttacttgcctattctgttaatctacactctttttagtaatgtctaattgtgtactctctttcggacatatggagagtttagacctttgtctcctgtttgtgggtacttgttgttactaaatatgacatgacatcctggcatattagcaatgatatttggatagtttaagtatatgtggtttgggttggtttttatcctctcgtacagcctcaccctgttgttctccggatacacaaactcagagcttgttttcaggacatgtatttggagaataatagggtgatgctgccagaattttcttttgaactgtacagaggcataaaaccaacctgaaccacatatcctcgaattggatttggtatgtatctttgattaactgggatacttttccatgagccatgtcattttatggagttaatttgctagcgttgagtgatgcataagtatgcaagcatgtaaatttttcagaatgctttggaaccactgtcctgtgaatgagccttccttgcaagtatttagtagcaggaggtcaattgtgtgggaacactttgaacatgacttggtatcattgataatgtcccaaaggctgtggcaactactatgcactcagcttttttactagaagagtgatttgttgtataatctgtatattttgaactgtggtcatgctgattttactgtattgtaaccattgtctaatttgaaaatgtcacaagatatgcagtctataaagcttccccacttattctttctgattcttaattgtgctcttgatctctttcaggtgcaatactgttggccacataacactattcagattctcaaaccttttggctgatgctgtatcatttgcatttaattaaagttgaaaccaaaggtaatgcaaagtgcaaccaactgttagtcttgctgcatatattcctctttgtctgaaaagaagaaatttatctgtgttatatactagcaaatatacaatgcttttatctcctagatgtattattgatttcgctctttttttttggcccttggtcagcaattctctacagtactgaacactcaggggaaaaacacagaaattttaggggttttgtcaatccctattatacaaataataattttacgctcaccaagaaaatgctactcctttccataaggggggcatgatgcaggctaaaagattgtttaatcgtgttgaagttttatgttttgttcttgtaagtaggcctgctaatggtcttgaaaccgttctgaatccaaactacccaacaaggacagcttctcacccacaaatctattgatagaaaccaaaccaaaccattccagcccaagctcccaccctagccaaaccttcagtagtatgggtaacagcattacacccaattctcagcccgtttctaaccatggaatactttttatcaaaatgttgaagtaatcgaagcatctccagtcttcctataaggatatttttagtaatttgatctatgccaccactttaattacagttttggtttatgctgctacttttttggcaaattcagtctgccacacaaatgtgaaatttgtttgggccacactgaatttgttttggcaaacaatattgggacggatggagtattactaatggtgaagcgatattgctgtagatttagtttcttgagataggcaagaaggcctatttggcctttgttctactgtagtctgttatttatcaacaagtgtttttttggtccaaatggaaattcttaatcagagtcacttgttcaaattttgtgcaggctggcaacttgttaaaattggtgtaccatttgttatttgaagccatagcatatctcagctcctgaacaataaggtgctgtattcagcacagtttaagtgtgaaaaagaatggatagaaaaatcacactttgttgccactggtatgcttttgaaagaaattaggggtttggatctctatctattctagttacaatggattgcaacaaagatgaggctgttaaggcaaaagctttggctgaaaaaaaaatgcgggagaaggatttcgctggtgcaaaaaggatgattaacaaggcacaaaatctctccaaagatgttgacagcaacatttcacaaatgttaactgtttgtgatattcattgtgcttctgcaacgaaggttaatggagagattgattggtatggtatacttcaagtacctgtcacagctgatgacacactaataaagaaacaatatcgtaagcttgctcttttgctacatccagacaagaacaattttgcaggtgcagaggcagcatttaaattagtgggagaagcaaacatgacgcttacagaccgctcaaaacgttctgtctatgacatgaaaagaaatgcctcagtcagaattggttctgcaagagttccttatcagcaatcaaggagaactgcacctgttagacctaccactacacctgtgaatctccataatgtgcatcaatcacaacagcataagccctcaaatccttcagactcacaaacattttggaccatatgcccaacttgtggcatgcgatatcaatactacctttcaatattgaagaaagctctccgttgtcagaattgcttgaagccctttgttgcacttgatttaaacgagcaagctgttccttctggggcaaatcagaggtctgctggggtgtggaaaagttcaggagcaccacaaaactttccaggttcacaagcaaatgtaggacagcaagctcagaattctgccaatccagtccatgctaattttggttctcataatgcacatgtagaaacaaagaggggagctgatggaaacgaggctggtgggctaaagaacaaaagaaaatttgctaaggcaacagggaattcttcaaaagcttcttcag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|
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